ACD (gen) - ACD (gene) - Wikipedia

ACD
Protein ACD PDB 2i46.png
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarACD, PIP1, PTOP, TINT1, TPP1, adrenokortikal displazi gomologi, Shelterin kompleksi subunit va telomeraza ishga qabul qilish koeffitsienti, ACD Shelterin kompleksi subunit va telomeraza yollash faktori
Tashqi identifikatorlarOMIM: 609377 MGI: 87873 HomoloGene: 23391 Generkartalar: ACD
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 16 (odam)
Chr.Xromosoma 16 (odam)[1]
Xromosoma 16 (odam)
ACD uchun genomik joylashuv
ACD uchun genomik joylashuv
Band16q22.1Boshlang67,657,512 bp[1]
Oxiri67,660,815 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
Ps.Bng da PBB GE ACD 204617 s
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez
Ansambl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001082486
NM_001082487
NM_022914

NM_001012638
NM_001348349

RefSeq (oqsil)

NP_001075955
NP_075065

NP_001012656
NP_001335278

Joylashuv (UCSC)Chr 16: 67.66 - 67.66 MbChr 8: 105,7 - 105,7 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Adrenokortikal displazi oqsil homologi a oqsil odamlarda kodlanganligi ACD gen.[5][6][7]

Funktsiya

Ushbu gen telomer funktsiyasida ishtirok etadigan oqsilni kodlaydi. Ushbu oqsil telomer uzunligini saqlab turish va telomer uchlarini himoya qilish vazifasini bajaradigan telosoma / Shelterin telomerik kompleksidagi oltita asosiy oqsillardan biridir. Ushbu protein boshqa tarkibiy qismlar bilan o'zaro ta'siri natijasida ushbu kompleksni yig'ish va barqarorlashtirishda muhim rol o'ynaydi va u telomerazaning telomerga kirishida vositachilik qiladi. Ushbu gen uchun turli xil izoformlarni kodlovchi bir nechta transkript variantlari topildi. TPP1 deb ham ataladigan ushbu gen tripeptidil-peptidaza I ni kodlovchi 11-xromosomadagi aloqasi bo'lmagan TPP1 genidan ajralib turadi.[7]

IES 1 telomerlarga xos komponent hisoblanadi panterin murakkab, bu ikki simli telomerik DNK yo'llarining ko'payishini osonlashtiradi va telomerik uchini tartibga solinmagan DNKni tiklash harakatlaridan himoya qiladi. TPP1 asosan telomeraza yollash, faollashtirish va tartibga soluvchi sifatida ishlaydi.[8] Garchi TPP1 dastlab ko'prik omili sifatida tavsiflangan bo'lsa-da TRF1 va TRF2 bilan ishtirok etadigan yo'l POT1 telomerazga bog'liq telomer uzunligini boshqarishning salbiy regulyatori sifatida, [9] yaqinda o'tkazilgan tadqiqotlar shuni ko'rsatadiki, TPP1 to'g'ridan-to'g'ri telomerda telomeraza faolligini oshirishi mumkin.[10] TPP1 oligonukleotid / oligosakkarid bilan bog'laydigan (OB) katlamning bir qismi TEL patch telomerazning katalitik birligi bilan o'zaro ta'sir qiladi, hTERT, telomerazni faollashtirish uchun muhim ekanligi isbotlangan.[11] TPP1 shuningdek, telomerazni xromosoma uchlariga qo'shilishi uchun zarur bo'lgan yagona yo'l sifatida namoyish etilgan va hESClarda telomer uzunligi gomeostazini belgilaydi.[11]

O'zaro aloqalar

ACD (gen) ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan POT1[5][6][12] va TINF2.[5][6]

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000102977 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000038000 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ a b v Ye JZ, Xokkeychi D, Krutchinskiy AN, Loayza D, Xuper SM, Chait BT, de Lange T (iyul 2004). "POT1 bilan o'zaro ta'sir qiluvchi oqsil PIP1: POT1ni TIN2 / TRF1 kompleksiga jalb qiladigan telomer uzunligini regulyatori". Genlar Dev. 18 (14): 1649–54. doi:10.1101 / gad.1215404. PMC  478187. PMID  15231715.
  6. ^ a b v Liu D, Safari A, O'Konnor MS, Chan DW, Laegeler A, Qin J, Songyang Z (2004 yil iyul). "PTOP POT1 bilan o'zaro ta'sir qiladi va uning telomerlarga joylashishini tartibga soladi". Nat Cell Biol. 6 (7): 673–80. doi:10.1038 / ncb1142. PMID  15181449. S2CID  11543383.
  7. ^ a b "Entrez Gen: ACD adrenokortikal displazi gomologi (sichqoncha)".
  8. ^ Karlseder J (sentyabr 2014). "Zamonaviy genom tahriri telomerlarga javob beradi: TPP1 ning ko'p funktsiyalari". Genlar va rivojlanish. 28 (17): 1857–8. doi:10.1101 / gad.250316.114. PMC  4197952. PMID  25184673.
  9. ^ Xokkeychi D, Palm V, Else T, Daniels JP, Takai KK, Ye JZ, Keegan Idoralar, de Lange T, Hammer GD (2007 yil avgust). "Pot1 sutemizuvchi hayvonlar tomonidan telomerlarni himoya qilish Tpp1 bilan o'zaro aloqani talab qiladi". Tabiatning strukturaviy va molekulyar biologiyasi. 14 (8): 754–61. doi:10.1038 / nsmb1270. PMID  17632522. S2CID  84294729.
  10. ^ Nandakumar J, Bell CF, Weidenfeld I, Zaug AJ, Leinwand LA, Cech TR (dekabr 2012). "Telomer oqsili TPP1 ning TEL patchi telomerazni ishga olish va ishlashga vositachilik qiladi". Tabiat. 492 (7428): 285–9. Bibcode:2012 yil natur.492..285N. doi:10.1038 / tabiat11648. PMC  3521872. PMID  23103865.
  11. ^ a b Sexton AN, Regalado SG, Lay CS, Cost GJ, O'Neil CM, Urnov FD, Gregori PD, Jaenisch R, Collins K, Hockemeyer D (sentyabr 2014). "Telomeraza ta'sirida insonning uchta TPP1 funktsiyasini genetik va molekulyar identifikatsiya qilish: ishga olish, faollashtirish va gomeostazni belgilashni tartibga solish". Genlar va rivojlanish. 28 (17): 1885–99. doi:10.1101 / gad.246819.114. PMC  4197946. PMID  25128433.
  12. ^ Rual JF, Venkatesan K, Xao T, Xirozane-Kishikava T, Drikot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Gedehoussou N, Klitgord N, Saymon S, Boxem M, Milshteyn S, Rozenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Vong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Ducette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (oktyabr 2005). "Odamning oqsil va oqsil bilan o'zaro aloqasi tarmog'ining proteom miqyosli xaritasi tomon". Tabiat. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 yil. Nat. 437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  13. ^ Takai KK, Hooper S, Blackwood S, Gandi R, de Lange T (yanvar 2010). "Shelterin tarkibiy qismlarining in vivo stokiometriyasi". Biologik kimyo jurnali. 285 (2): 1457–67. doi:10.1074 / jbc.M109.038026. PMC  2801271. PMID  19864690.
  14. ^ Nandakumar J, Bell CF, Weidenfeld I, Zaug AJ, Leinwand LA, Cech TR (dekabr 2012). "Telomer oqsili TPP1 ning TEL patchi telomerazni ishga olish va ishlashga vositachilik qiladi". Tabiat. 492 (7428): 285–9. Bibcode:2012 yil natur.492..285N. doi:10.1038 / tabiat11648. PMC  3521872. PMID  23103865.
  15. ^ Xokkeychi D, Palm V, Else T, Daniels JP, Takai KK, Ye JZ, Keegan CE, de Lange T, Hammer GD (2007 yil avgust). "Sutemizuvchi Pot1 tomonidan telomerlarni himoya qilish Tpp1 bilan o'zaro aloqani talab qiladi". Tabiatning strukturaviy va molekulyar biologiyasi. 14 (8): 754–61. doi:10.1038 / nsmb1270. PMID  17632522. S2CID  84294729.
  16. ^ a b v O'Konnor MS, Safari A, Xin X, Lyu D, Songyang Z (2006 yil avgust). "Yuqori darajali telomerik komplekslarni yig'ishda TPP1 va TIN2 o'zaro ta'sirining hal qiluvchi ahamiyati". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 103 (32): 11874–9. Bibcode:2006 yil PNAS..10311874O. doi:10.1073 / pnas.0605303103. PMC  1567669. PMID  16880378.
  17. ^ Zaug AJ, Podell ER, Nandakumar J, Cech TR (mart 2010). "Telomer oqsili TPP1 va telomeraza o'rtasidagi funktsional ta'sir o'tkazish". Genlar va rivojlanish. 24 (6): 613–22. doi:10.1101 / gad.1881810. PMC  2841338. PMID  20231318.

Tashqi havolalar

  • Inson ACD genom joylashuvi va ACD gen tafsilotlari sahifasida UCSC Genome brauzeri.
  • Inson IES genom joylashuvi va IES gen tafsilotlari sahifasida UCSC Genome brauzeri.
  • PDBe-KB inson Adrenokortikal displazi oqsil homologi uchun PDB-da mavjud bo'lgan barcha tuzilish ma'lumotlari haqida umumiy ma'lumot beradi

Qo'shimcha o'qish