AXIN1 - AXIN1 - Wikipedia

AXIN1
Protein AXIN1 PDB 1dk8.png
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarAXIN1, AXIN, PPP1R49, axin 1
Tashqi identifikatorlarOMIM: 603816 MGI: 1096327 HomoloGene: 2614 Generkartalar: AXIN1
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 16 (odam)
Chr.Xromosoma 16 (odam)[1]
Xromosoma 16 (odam)
AXIN1 uchun genomik joylashuv
AXIN1 uchun genomik joylashuv
Band16p13.3Boshlang287,440 bp[1]
Oxiri352,723 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
PBB GE AXIN1 212849 da fs.png
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez
Ansambl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_003502
NM_181050

NM_001159598
NM_009733

RefSeq (oqsil)

NP_003493
NP_851393

NP_001153070
NP_033863

Joylashuv (UCSC)Chr 16: 0,29 - 0,35 MbChr 17: 26.14 - 26.2 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Oxin-1 a oqsil odamlarda kodlanganligi AXIN1 gen.[5]

Funktsiya

Ushbu gen sitoplazmatik oqsilni kodlaydi, u tarkibida G-oqsil signalizatsiyasi (RGS) domenining regulyatsiyasi va parishon va axin (DIX) domeni. Kodlangan oqsil adenomatoz polipozis koli bilan o'zaro ta'sir qiladi, katenin (kaderin bilan bog'liq protein) beta 1, glikogen sintaz kinaz 3 beta, oqsil fosfataza 2 va uning o'zi. Ushbu oqsil qanotsiz MMTV integratsiya saytlari oilasining salbiy regulyatori sifatida ishlaydi, a'zosi 1 (WNT ) signalizatsiya yo'li va apoptozni keltirib chiqarishi mumkin. Ushbu oqsilning bir qismining kristalli tuzilishi yakka o'zi va boshqa oqsillar bilan kompleksda hal qilindi. Ushbu gendagi mutatsiyalar gepatotsellulyar karsinoma, gepatoblastomalar, tuxumdonlar endometrioid adenokarsinomalari va medulloblastomalar bilan bog'liq. Ushbu gen uchun alohida izoformlarni kodlovchi ikkita transkript variantlari aniqlandi.[6]

Tuzilishi

To'liq uzunlikdagi odam oqsilida 862 aminokislotalar (taxmin qilingan) molekulyar massasi 96 kDa ni tashkil qiladi. N-terminalli RGS domeni, Axin1 ning o'zaro ta'sir qiluvchi GSK3 kinaz peptidi va C-terminal DIX domenlarining gomologlari atom rezolyutsiyasida hal qilindi. WNT-ni tartibga soluvchi yirik markaziy hududlar biofizik eksperimentlar va bioinformatik tahlillar natijasida ichki tartibsizligi bilan ajralib turardi.[7] Katlanmış RGS domenining biofizik stabilizatsiyasi ichki tartibsiz mintaqalarni ochadigan va mahalliy darajada konsentrlaydigan nanoagregatlar hosil bo'lishiga olib keladi, bu esa o'z navbatida Wnt signalizatsiyasini noto'g'ri tartibga soladi. Boshqa ko'plab yirik IDP-lar (ichki tartibsiz oqsillar) misens mutatsiyalaridan ta'sirlanishadi, masalan BRCA1, Adenomatoz polipoz koli, CREB bilan bog'langan oqsil / (CBP) va shunga o'xshash tarzda ularning katlanmış domenlarining noto'g'ri mutatsiyalari ta'sir qilishi mumkin.[8]

O'zaro aloqalar

AXIN1 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan:

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000103126 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000024182 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ Zeng L, Fagotto F, Zhang T, Hsu V, Vasicek TJ, Perry WL, Lee JJ, Tilghman SM, Gumbiner BM, Costantini F (Avgust 1997). "Sichqonchaning birlashtirilgan joyi embrion o'qi shakllanishini tartibga soluvchi Wnt signalizatsiya yo'lining inhibitori Axinni kodlaydi". Hujayra. 90 (1): 181–92. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80324-4. PMID  9230313. S2CID  10565695.
  6. ^ "Entrez Gen: AXIN1 axin 1".
  7. ^ Noutsou M, Duarte AM, Anvarian Z, Didenko T, Minde DP, Kuper I, de Ridder I, Oikonomou C, Fridler A, Boelens R, Ryudiger SG, Maurice MM (2011). "Axin1 o'simta supressorining tanqidiy iskala mintaqalari tabiiy ravishda ochilgan". J Mol Biol. 405 (3): 773–86. doi:10.1016 / j.jmb.2010.11.013. PMID  21087614.
  8. ^ Anvarian Z, Nojima H, van Kappel EC, Madl T, Spit M, Viertler M, Jordens I, Low TY, van Sherpenzeel RC, Kuper I, Rixter K, Heck AJ, Boelens R, Vinsent JP, Ryudiger SG, Moris MM ( 2016). "Oxin saraton mutantlari Wnt signalizatsiya tarmog'ini qayta tiklash uchun nanoagregatlar hosil qiladi". Nat Struct Mol Biol. 23 (4): 324–32. doi:10.1038 / nsmb.3191. PMID  26974125. S2CID  30761541.
  9. ^ a b v Nakamura T, Hamada F, Ishidate T, Anai K, Kawahara K, Toyoshima K, Akiyama T (iyun 1998). "Axin, Wnt signalizatsiya yo'lining inhibitori, beta-katenin, GSK-3beta va APC bilan o'zaro ta'sir qiladi va beta-katenin darajasini pasaytiradi". Gen hujayralari. 3 (6): 395–403. doi:10.1046 / j.1365-2443.1998.00198.x. PMID  9734785. S2CID  10875463.
  10. ^ Hocevar BA, Mou F, Rennolds JL, Morris SM, Cooper JA, Howe PH (iyun 2003). "Nogironlar-2 (Dab2) tomonidan Wnt signalizatsiya yo'lini tartibga solish". EMBO J. 22 (12): 3084–94. doi:10.1093 / emboj / cdg286. PMC  162138. PMID  12805222.
  11. ^ a b v Zhang Y, Qiu VJ, Chan SC, Xan J, Xe X, Lin SC (may 2002). "Kazein kinaz I va kazein kinaz II Wnt va JNK yo'llarida aksin funktsiyasini differentsial ravishda tartibga soladi". J. Biol. Kimyoviy. 277 (20): 17706–12. doi:10.1074 / jbc.M111982200. PMID  11884395.
  12. ^ a b Kim MJ, Chia IV, Kostantini F (noyabr 2008). "S terminalidagi SUMOylation maqsadli joylari Axinni hamma joyda himoya qiladi va oqsil barqarorligini beradi". FASEB J. 22 (11): 3785–94. doi:10.1096 / fj.08-113910. PMC  2574027. PMID  18632848.
  13. ^ Li L, Yuan H, Weaver CD, Mao J, Farr GH, Sussman DJ, Jonkers J, Kimelman D, Wu D (avgust 1999). "Axin va Frat1 dvl va GSK bilan o'zaro aloqada bo'lib, LEF-1ni Wnt vositachiligida tartibga solishda Dvlni GSK ga bog'laydi". EMBO J. 18 (15): 4233–40. doi:10.1093 / emboj / 18.15.4233. PMC  1171499. PMID  10428961.
  14. ^ a b Mak BC, Takemaru K, Kenerson HL, Moon RT, Yeung RS (2003 yil fevral). "Tuberin-hamartin kompleksi beta-katenin signalizatsiya faoliyatini salbiy tartibga soladi". J. Biol. Kimyoviy. 278 (8): 5947–51. doi:10.1074 / jbc.C200473200. PMID  12511557.
  15. ^ Mao J, Vang J, Liu B, Pan V, Farr GH, Flinn S, Yuan H, Takada S, Kimelman D, Li L, Vu D (aprel, 2001). "Lipoprotein retseptorlari bilan bog'liq bo'lgan past zichlikdagi protein-5 Axin bilan bog'lanib, kanonik Wnt signalizatsiya yo'lini tartibga soladi". Mol. Hujayra. 7 (4): 801–9. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00224-6. PMID  11336703.
  16. ^ Chjan Y, Neo SY, Xan J, Lin SC (2000 yil avgust). "Dimerizatsiya tanlovi axinning qobiliyatini boshqaradi va disheveled c-Jun N-terminal kinaz / stress bilan faollashtirilgan protein kinazni faollashtirish uchun". J. Biol. Kimyoviy. 275 (32): 25008–14. doi:10.1074 / jbc.M002491200. PMID  10829020.
  17. ^ Yamamoto H, Xinoi T, Michiue T, Fukui A, Usui H, Yanssens V, Van tuyoq C, Goris J, Asashima M, Kikuchi A (iyul 2001). "Protein fosfataza 2A PR61 subbirligidan Wnt signalizatsiya yo'lining inhibatsiyasi". J. Biol. Kimyoviy. 276 (29): 26875–82. doi:10.1074 / jbc.M100443200. PMID  11297546.

Qo'shimcha o'qish

Tashqi havolalar