Ankilorbin - Ankycorbin
| Rai14 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatorlar | |||||||||||||||||||||||||
| Taxalluslar | 1700008J19Rik1700020L11RikAnkycorbinNorpegmKIAA1334retinoik kislota 14 ta induktsiyalangan | ||||||||||||||||||||||||
| Tashqi identifikatorlar | HomoloGene: 9199 Generkartalar: [1] | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortologlar | |||||||||||||||||||||||||
| Turlar | Inson | Sichqoncha | |||||||||||||||||||||||
| Entrez |
| ||||||||||||||||||||||||
| Ansambl |
| ||||||||||||||||||||||||
| UniProt |
| ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNA) |
| ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (oqsil) |
| ||||||||||||||||||||||||
| Joylashuv (UCSC) | Chr 15: 10.57 - 10.71 Mb | n / a | |||||||||||||||||||||||
| PubMed qidirmoq | [1] | n / a | |||||||||||||||||||||||
| Vikidata | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ankilorbin bu ankirin takrorlang va o'ralgan lasan o'z ichiga olgan domen oqsil odamlarda kodlanganligi RAI14 gen. U odamning turli xil to'qimalarida ifodalanadi va ektoplazmik ixtisoslashuvni aktin bilan boshqarishda, sperma qutblanishini va sperma yopishqoqligini o'rnatishda muhim rol o'ynaydi. Shuningdek, u Sertoli hujayralarining qon moyagi to'sig'idagi zich birikmalarining yaxlitligini oshirishi mumkin.
Gen
Manzil
RAI14 tarkibida 15 ta exons ning ortiqcha plyonkasida joylashgan 5-xromosoma 5p13.2 pozitsiyasida. Bu 5068 ta tayanch juftliklari 34 656 328 pozitsiyadan 34 832 612 gacha.[2]
Genlar mahallasi
Genlar TTC23L va LOC105374721 qo'shni RAI14 5-xromosomada.
Ifoda
RAI14 inson to'qimalarining keng doiralarida ifodalanadi. TPM tomonidan yuqori ekspressionning ba'zi joylariga endometrium, silliq mushak, bachadon bo'yni, bachadon bo'yni, moyak va taloq to'qimalari kiradi. Inson miyasi ichida RAI14 ekspressioni miya sopi atrofida juda ko'p medulla. Eng yuqori ifoda darajalari mielensefalon, keyinchalik medulla oblongatasiga aylanadigan embrional miyaning mintaqasi.[3]
Gomologiya
Paraloglar
RAI14 da yo'q paraloglar.
Ortologlar
Ankilorbin oqsilining butun ketma-ketligining aksariyati sutemizuvchilar va umurtqali hayvonlar.[4] Uzoqroq bog'liq ortologlar, masalan, akulalar o'xshashligini yo'qotishni boshlaydi va kamroq saqlanib qoladi C-terminali oqsilning oxiri. Ankycorbin umurtqasizlar, masalan, mercan ichida umuman yaxshi saqlanib qolmaydi. Oqsilning oxirgi yarmi asosan yo'q bo'lib ketgan va konservatsiyaning ba'zi bir ko'rinishini saqlaydigan yagona qism - bu ankirin takrorlanadigan domeni bilan bog'langan N-uchi yaqinidagi maydon.
| Tur va turlar | Umumiy ism | Ajralish sanasi (dan.) Homo sapiens) | NCBI-ga kirish Raqam | Tartib uzunligi (Aminokislotalar) | Tartib Shaxsiyat |
|---|---|---|---|---|---|
| Homo sapiens | Inson | NP_001138992.1 | 980 | 100% | |
| Castor canadensis | Shimoliy Amerika qunduzi | 88 MYA | XP_020026070.1 | 980 | 92% |
| Delphinapterus leucas | Beluga kiti | 94 MYA | XP_022455298.1 | 980 | 90% |
| Pelecanus crispus | Dalmatian pelikan | 320 MYA | XP_009485865.1 | 977 | 69% |
| Python bivittatus | Birma pitoni | 320 MYA | XP_007432514.1 | 992 | 66% |
| Ksenopus laevis | Afrika tirnoqli qurbaqa | 353 MYA | XP_018100022.1 | 971 | 53% |
| Rhincodon typus | Kit Shark | 465 MYA | XP_020373853.1 | 719 | 46% |
| Stilofora pistillatasi | Marjon | 685 MYA | XP_022783988.1 | 653 | 31% |
Oqsil
Transkriptlar
Ankilorbin to'rt xilga ega izoformlar (A, B, C va D) asosan bir-biridan farq qiladigan bir yoki bir nechta qo'shilish variantlarini o'z ichiga olgan izoformalarning ko'pi bilan 5 'UTR. Isoform D 983 ta aminokislotada ma'lum bo'lgan eng uzun izoformdir, ammo izoform A (980 ta aminokislotalar) oqsilning eng ustun turidir.[5]
Umumiy xususiyatlar
RAI14 oqsilining taxmin qilingan vazni 110,0 kDal va izoelektrik nuqtasi 5,87 ga teng. Bundan tashqari, 914-978 nukleotidlari orasida glutaminga boy mintaqa borligi, aks holda glitsin va fenilalaninga kambag'al bo'lganida, lytsin, glutamat va seringa boyligi taxmin qilinmoqda.[6] Bu eruvchan oqsil.[7]
Tuzilishi va domenlari
Ankilorbin tarkibida an ankirin ga yaqin joylashgan takroriy mintaqa N-terminali[8] 6 ta ankirin takrorlanishidan iborat. Protein asosan alfa spirallardan va beta-varaq tuzilmalari bo'lmagan spiral-spiral domenlardan iborat.
Translatatsion modifikatsiyani joylashtiring
RAI14 - yuzlab bashorat qilingan fosforillanish joylari bo'lgan yuqori darajada fosforillangan oqsil. U yadro oqsili bo'lishi taxmin qilinmoqda va 3 ta yadroviy lokalizatsiya signallarini o'z ichiga oladi.
Funktsiya
RAI14 hujayra hujayralarining yopishish joylarida, xususan hujayra hujayralarining o'zaro ta'sirida rol o'ynashi taxmin qilinmoqda Sertoli hujayralari moyak ichidan. Sertoli hujayralari yaratilishida ishtirok etadi qon moyagi to'sig'i va doirasida ixtisoslashgan, muhofaza qilinadigan muhitni ta'minlaydi seminifer tubulalar moyaklar jinsiy hujayralar rivojlanish.[9]
Adabiyotlar
- ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
- ^ "RAI14 retinoik kislota induktsiyalangan 14 [Homo sapiens (odam)]". 2018 yil 4-fevral. Olingan 19 fevral, 2018.
- ^ "Allen Brain Atlas: Inson miyasi". Allen Brain Atlas.
- ^ "NCBI: oqsil portlashi". Olingan 2 mart, 2018.
- ^ "ankikorbin izoform a [Homo sapiens]". NCBI. 2017 yil 2-oktabr. Olingan 19 fevral, 2018.
- ^ "SAPS". EMBL-EBI.
- ^ Xirikava, T .; Boon-Chieng, S .; Mitaku, S. "SOSUI: membrana oqsillarini tasnifi va ikkilamchi tuzilishini bashorat qilish tizimi".
- ^ "PSORT II". PSORT: Aminokislotalar ketma-ketligida oqsillarni saralash va lokalizatsiya joylarini taxmin qilish. Olingan 27 aprel, 2018.
- ^ Martin CM, Kleid JJ (2015). "Psevdofuziya kardiostimulyatorning ishdan chiqishi bilan maskaradlash". Elektrokardiologiya jurnali. 7 (2): 179–81. doi:10.1016 / S0022-0736 (74) 80028-2. PMID 4822540.