Autointegratsiya omiliga to'siq 1 - Barrier to autointegration factor 1

BANF1
Mavjud tuzilmalar
PDB	Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	1QCK, 2ODG, 1CI4, 2BZF, 2EZY, 2EZZ, 2EZX
Identifikatorlar
Taxalluslar	BANF1, BAF, BCRP1, D14S1460, NGPS, autointegratsiya omiliga to'siq 1, BAF yadro yig'ish faktor 1
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 603811 MGI: 1346330 HomoloGene: 2866 Generkartalar: BANF1
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 11 (odam)
Oxiri	66,004,149 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 19 (sichqoncha)
Oxiri	5,367,168 bp
RNK ekspressioni naqsh
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• DNK bilan bog'lanish; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • oqsilni S-terminal bilan bog'lash; • fermentlarni bog'lash; • oqsilni homodimerizatsiya qilish faoliyati; • oqsilni N-terminus bilan bog'lash; • LEM domenini bog'lash; • bir xil protein bilan bog'lanish;
Uyali komponent	• sitoplazma; • hujayra tashqari ekzozoma; • quyuqlashgan xromosoma; • hujayra yadrosi; • xromosoma; • nukleoplazma; • sitozol; • yadroviy konvert;
Biologik jarayon	• mitotik yadro konvertini qayta yig'ish; • virusga javob; • mitotik yadro konvertini demontaj qilish; • DNK integratsiyasi; • integral proviral kechikishni o'rnatish; • GO: 0022415 virusli jarayon; • yadroviy transport; • virusli genom replikatsiyasining salbiy regulyatsiyasi; • xromosomalarning ajratilishi; • xromosoma kondensatsiyasi;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	8815
	23825
	ENSG00000175334
	ENSMUSG00000024844
	O75531
	O54962
	NM_003860; NM_001143985
	NM_001038231; NM_001286608; NM_011793
	NP_001137457; NP_003851
	NP_001033320; NP_001273537; NP_035923
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

To'siqdan avtointegratsiya omili a oqsil odamlarda kodlanganligi BANF1 gen.^[5]^[6] Bu a'zosi avtointegratsiya to'sig'i oqsillar oilasi.

Funktsiya

Ushbu gen tomonidan kodlangan oqsil himoya qobiliyati bilan aniqlandi retroviruslar molekula ichidagi integratsiyadan va shuning uchun xujayra genomiga molekulalararo integratsiyani rag'batlantiradi. Proteinning endogen funktsiyasi noma'lum. Oqsil homodimer hosil qiladi, u yadroga joylashadi va xromosomalar bilan maxsus bog'liqdir mitoz. Ushbu protein DNK bilan o'ziga xos bo'lmagan tarzda bog'lanadi va kemiruvchilarda olib borilgan tadqiqotlar shuni ko'rsatadiki, u ham bog'lanadi laminaga bog'liq bo'lgan polipeptid 2, ning tarkibiy qismi yadro qatlami.^[6] Bundan tashqari, u oqsillarni o'z ichiga olgan LEM domeni bilan bog'lanadi LAP2, Emerin va MAN1. Proteinning DNK bilan bog'lanish qobiliyati ATP konsentratsiyasi bilan modulyatsiya qilinadi.^[7]

O'zaro aloqalar

Autointegratsiya omiliga to'siq 1 ko'rsatilgan o'zaro ta'sir qilish bilan Timopoetin.^[8]

Klinik ahamiyati

Ushbu gendagi mutatsiyalar irsiy xususiyatga ega ekanligi isbotlangan progeroid sindromi.^[9]

Shuningdek qarang

Retrovirusli integratsiya

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000175334 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000024844 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Li MS, Kreygi R (Mar, 1998). "Oldin aniqlanmagan xost oqsili retrovirus DNKni avtointegratsiyadan himoya qiladi". Proc Natl Acad Sci U S A. 95 (4): 1528–33. doi:10.1073 / pnas.95.4.1528. PMC 19075. PMID 9465049.
^ ^a ^b "Entrez Gen: avtointegratsiya omiliga BANF1 to'sig'i".
^ Sridharan S, Kurzawa N, Verner T, Gyuntner I, Helm D, Xuber V, Bantscheff M, Savitski MM (mart 2019). "Proteom miqyosida eruvchanlik va termal barqarorlikni profillash ATP uchun alohida tartibga soluvchi rollarni ochib beradi". Tabiat aloqalari. 10 (1): 1155. doi:10.1038 / s41467-019-09107-y. PMC 6411743. PMID 30858367.
^ Furukava K (1999 yil avgust). "LAP2 bog'laydigan oqsil 1 (L2BP1 / BAF) LAP2-xromatin ta'sirining nomzod vositachisidir". J. Cell Sci. 112 (Pt 15): 2485-92. PMID 10393804.
^ Puente XS, Kuesada V, Osorio FG, Cabanillas R, Cadiñanos J, Fraile JM, Ordónez GR, Puente DA, Gutieres-Fernández A, Fanjul-Fernández M, Levy N, Freije JM, Lopes-Otin C (may). "Exome sekvensiyasi va funktsional tahlil BANF1 mutatsiyasini irsiy progeroid sindromining sababi sifatida aniqlaydi". Am. J. Xum. Genet. 88 (5): 650–6. doi:10.1016 / j.ajhg.2011.04.010. PMC 3146734. PMID 21549337.

Qo'shimcha o'qish

Goldberg M, Harel A, Gruenbaum Y (2000). "Yadro qatlami: molekulyar tashkilot va xromatin bilan o'zaro ta'sir". Krit. Vahiy Eukaryot. Gen Expr. 9 (3–4): 285–93. doi:10.1615 / critreveukargeneexpr.v9.i3-4.130. PMID 10651245.
Segura-Totten M, Uilson KL (2004). "BAF: xromatin, yadro tuzilishi va retrovirus integratsiyasidagi rollari". Hujayra biolining tendentsiyalari. 14 (5): 261–6. doi:10.1016 / j.tcb.2004.03.004. PMID 15130582.
Van Maele B, Debyser Z (2005). "OIV-1 integratsiyasi: OIV-1 integrazasi, uyali va virusli oqsillar o'rtasidagi o'zaro bog'liqlik". OITS bo'yicha sharhlar. 7 (1): 26–43. PMID 15875659.
Van Maele B, Busschots K, Vandekerckhove L va boshq. (2006). "OIV-1 integratsiyasining uyali omillari". Biokimyo tendentsiyalari. Ilmiy ish. 31 (2): 98–105. doi:10.1016 / j.tibs.2005.12.002. PMID 16403635.
Li MS, Kreygi R (1994). "Retrovirusli DNKni autointegratsiyadan himoya qilish: uyali omilni jalb qilish". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 91 (21): 9823–7. doi:10.1073 / pnas.91.21.9823. PMC 44909. PMID 7937898.
Hurmatli PH, Bankier AT, Piper MB (1998). "Inson xromosomasi 14 ning yuqori aniqlikdagi metrik HAPPY xaritasi". Genomika. 48 (2): 232–41. doi:10.1006 / geno.1997.5140. PMID 9521877.
Lynch RA, Piper M, Bankier A va boshq. (1999). "Bachadon leiomiyomasida 14 t (12; 14) to'xtash nuqtasi klaster mintaqasi xromosomasining genomik va funktsional xaritasi". Genomika. 52 (1): 17–26. doi:10.1006 / geno.1998.5406. PMID 9740667.
Cai M, Huang Y, Zheng R va boshq. (1998). "Retrovirusli DNKni autointegratsiyadan himoya qilish uchun javobgar bo'lgan BAF hujayra omilining eritma tuzilishi". Nat. Tuzilishi. Biol. 5 (10): 903–9. doi:10.1038/2345. PMID 9783751. S2CID 857675.
Furukava K (1999). "LAP2 bog'laydigan oqsil 1 (L2BP1 / BAF) LAP2-xromatin ta'sirining nomzod vositachisidir". J. Cell Sci. 112 (15): 2485–92. PMID 10393804.
Zheng R, Girlando R, Li MS va boshq. (2000). "To'siqdan avtointegratsiya omili (BAF) DNKni alohida, yuqori darajadagi nukleoprotein kompleksida ko'prik qiladi". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 97 (16): 8997–9002. doi:10.1073 / pnas.150240197. PMC 16810. PMID 10908652.
Umland TC, Vey SQ, Kreygi R, Devis DR (2000). "DNKni to'siqdan avtointegratsiya omili bilan ko'priklashining strukturaviy asoslari". Biokimyo. 39 (31): 9130–8. doi:10.1021 / bi000572w. PMID 10924106.
Xarris D, Engelman A (2001). "Bariyer-avtointegratsiya omilining tuzilishi ham, DNK bilan bog'lanish funktsiyasi ham in vitro OIV tipidagi integratsiyani tiklashga yordam beradi". J. Biol. Kimyoviy. 275 (50): 39671–7. doi:10.1074 / jbc.M002626200. PMID 11005805.
Li KK, Haraguchi T, Li RS va boshqalar. (2002). "Emerinda bog'langan lamin A va DNK-ko'prikli BAF oqsilidagi aniq funktsional domenlar". J. Cell Sci. 114 (Pt 24): 4567-73. PMID 11792821.
Xaraguchi T, Koujin T, Segura-Totten M va boshqalar. (2002). "BAF isloh qilinayotgan yadro konvertiga zumrad yig'ilishi uchun talab qilinadi". J. Cell Sci. 114 (Pt 24): 4575-85. PMID 11792822.
Segura-Totten M, Kovalski AK, Kreygi R, Uilson KL (2002). "To'siqdan avtointegratsiya omili: xromatin dekondensatsiyasi va yadro yig'ilishidagi asosiy rollar". J. Hujayra Biol. 158 (3): 475–85. doi:10.1083 / jcb.200202019. PMC 2173821. PMID 12163470.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH va boshq. (2003). "15000 dan ortiq to'liq uzunlikdagi odam va sichqonchani cDNA sekanslarini yaratish va dastlabki tahlil qilish". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Holaska JM, Li KK, Kovalski AK, Uilson KL (2003). "Transkripsiyaviy repressor jinsiy hujayrasiz (GCL) va avtointegratsiya omiliga to'siq (BAF) in vitro ravishda euminga ulanish uchun raqobatlashadi". J. Biol. Kimyoviy. 278 (9): 6969–75. doi:10.1074 / jbc.M208811200. PMID 12493765.
Lin CW, Engelman A (2003). "To'siqni avtointegratsiyalash omil - bu funktsional inson immunitet tanqisligi virusi 1-turdagi preintegratsiya komplekslarining tarkibiy qismi". J. Virol. 77 (8): 5030–6. doi:10.1128 / JVI.77.8.5030-5036.2003. PMC 152146. PMID 12663813.