Btk tipidagi sink barmoq - Btk-type zinc finger

Btk motifi
PDB 1bwn EBI.jpg
ph (1,3,4,5) p4 bilan kompleksda bruton tirozin kinaz mutant e41k dan ph domeni va btk motifi
Identifikatorlar
BelgilarBTK
PfamPF00779
InterProIPR001562
AqlliBTK
SCOP21 milliard / QOIDA / SUPFAM

Yilda molekulyar biologiya, Btk tipidagi sink barmoq yoki Btk motifi (BM) a saqlanib qolgan rux bilan bog'laydigan motif konservalanganni o'z ichiga oladi sisteinlar va a histidin bu aniq mavjud ökaryotik signal berish oqsillar. Motif nomlangan Bruton tirozin kinazasi (Btk), an ferment bu juda muhimdir B xujayrasi pishib etish odamlar va sichqonlar.[1][2] Btk oqsillarning Tec oilasiga kiradi tirozin kinazalari (PTK). Bular kinazlar N-terminal orasidagi saqlangan Tec homologiyasi (TH) domenini o'z ichiga oladi pleckstrin homologiyasi (PH) domeni va Src homologiyasi 3 (SH3) domeni. TH domenining N-terminali yuqori darajada saqlanib qolgan va Btf motifi sifatida tanilgan, TH domenining C-terminal mintaqasida esa prolin - boy mintaqa (PRR). Btk motifida konservalangan Uning va uchta Cys mavjud qoldiqlar shakllanadigan a rux barmoq (garchi ular ma'lum bo'lgan sink barmoqlari topologiyalaridan farq qilsa ham), PRRlar odatda ishtirok etadi oqsil-oqsil bilan o'zaro aloqalarni o'z ichiga olgan G oqsillari.[3][4] TH domeni har xil funktsional ahamiyatga ega bo'lishi mumkin signalizatsiya yo'llari boshqacha turlari.[1] Btk va PRR mintaqalarini o'z ichiga olgan to'liq TH domeni Tec oilasidan tashqarida topilmadi; ammo Btk motifi o'z-o'zidan boshqa oqsillarda uchraydi, odatda PH domenidagi C-terminal (e'tibor bering, Btk motifi har doim ham PH domenida C-terminali bo'lib turadi, ammo hammasi ham PH emas domenlar ortidan Btk motivi) keladi.

The kristalli tuzilmalar Btk dan olingan ma'lumotlarga ko'ra, Btk tipidagi sink barmog'i tsirkon ioni bilan tutashgan uzun tsikldan hosil bo'lgan globular yadroga ega va Btk motifi PH domeniga o'ralgan.[1] Sinkni biriktiruvchi qoldiqlar - histidin va uchta sistein bo'lib, ular Btk motifida to'liq saqlanib qolgan.[5]

Oqsillar Btk tipidagi sink barmog'ini o'z ichiga olganligi ma'lum:

  • Sutemizuvchi Bruton tirozin kinazasi (Btk), tirozin kinaz oqsili turli xil modulyatsiyada ishtirok etadi uyali jarayonlar. Mutatsiyalar Btkga ta'sir qilish X-ga bog'langan agammaglobulinemiya (XLA) ning sababidir odamlar va X bilan bog'liq immunitet tanqisligi sichqonlar.
  • Sutemizuvchi Tex, BMX va It tirozin bo'lgan oqsillar oqsil kinazalari Tec subfamily.
  • Drosophila uchun zarur bo'lgan Btk29A tirozin-oqsil kinazasi rivojlanish kattalar hayoti uchun zarur bo'lgan halqa kanallari va erkaklar jinsiy a'zolari.
  • Ras GTPazni faollashtiruvchi sutemizuvchilar (RasGAP ) faol bo'lmagan YaIMga bog'liq aktivatsiyani tartibga soluvchi Ras YaIMni GTP ga aylantirish orqali.

Adabiyotlar

  1. ^ a b v Vihinen M, Nilsson L, Smit CI (1994 yil avgust). "PH domeniga ulashgan Tec homologiyasi (TH)". FEBS Lett. 350 (2–3): 263–5. doi:10.1016/0014-5793(94)00783-7. PMID  8070576.
  2. ^ Lindvall JM, Blomberg KE, Valiaho J, Vargas L, Heinonen JE, Berglof A, Mohamed AJ, Nore BF, Vihinen M, Smith CI (fevral 2005). "Bruton tirozin kinazasi: hujayra biologiyasi, ketma-ketlikni saqlash, mutatsion spektri, siRNK modifikatsiyasi va ekspression profilatsiyasi". Immunol. Vah. 203: 200–15. doi:10.1111 / j.0105-2896.2005.00225.x. PMID  15661031.
  3. ^ Vihinen M, Nore BF, Mattsson PT, Backesjo CM, Nars M, Koutaniemi S, Watanabe C, Lester T, Jones A, Ochs HD, Smith CI (avgust 1997). "Btkning TH domenidagi konservalangan sistein juftiga ta'sir qiluvchi Missense mutatsiyalari". FEBS Lett. 413 (2): 205–10. doi:10.1016 / S0014-5793 (97) 00912-5. PMID  9280283.
  4. ^ Jiang Y, Ma V, Van Y, Kozasa T, Xattori S, Xuang XY (oktyabr 1998). "G oqsili G alfa12 Brutonning tirozin kinazasini va rasGAPni konservalangan PH / BM domeni orqali rag'batlantiradi". Tabiat. 395 (6704): 808–13. Bibcode:1998 yil Natur.395..808J. doi:10.1038/27454. PMID  9796816.
  5. ^ Hyvonen M, Saraste M (iyun 1997). "Bruton tirozin kinazasidan PH domeni va Btk motifining tuzilishi: X-bog'langan agammaglobulinemiya uchun molekulyar tushuntirishlar". EMBO J. 16 (12): 3396–404. doi:10.1093 / emboj / 16.12.3396. PMC  1169965. PMID  9218782.
Ushbu maqola jamoat domenidagi matnlarni o'z ichiga oladi Pfam va InterPro: IPR001562