Burxolderiya - Burkholderia

Burxolderiya
Burkholderia pseudomallei 01.jpg
B. pseudomallei a ustidagi koloniyalar qonli agar plastinka.
Ilmiy tasnif
Qirollik:
Bakteriyalar
Filum:
Proteobakteriyalar
Sinf:
Betaproteobakteriyalar
Buyurtma:
Burkholderiales
Oila:
Burkholderiaceae
Tur:
Burxolderiya

Yabuuchi va boshq. 1993[1][2]
Tur turlari
Burkholderia cepacia
(Palleroni va Xolms 1981) Yabuuchi va boshq. 1993
Turlar

Matnni ko'ring.

Burxolderiya - bu Proteobakteriyalar uning patogen a'zolariga quyidagilar kiradi Burkholderia cepacia murakkab, odamlarga hujum qiladigan va Burkholderia mallei, javobgar bezlar, asosan kasallik paydo bo'ladi otlar va tegishli hayvonlar; Burkholderia pseudomallei, qo'zg'atuvchisi melioidoz; va Burkholderia cepacia, muhim patogen bilan og'rigan odamlarda o'pka infektsiyalari kistik fibroz (CF).[3]

The Burxolderiya (ilgari qismi Pseudomonas ) jins nomi deyarli hamma joyda mavjud bo'lgan guruhni anglatadi Gram-manfiy, majburiy ravishda aerobik, novda shaklida bo'lgan bakteriyalar harakatchan bitta yoki bir nechta qutb yordamida flagella, bundan mustasno Burkholderia mallei, bu harakatsiz. Jinsga mansub a'zolar qobiq yoki hosil qilmaydi protez va foydalanishga qodir poli-beta-gidroksibutirat O'sish uchun (PHB). Turga hayvon va o'simlik ham kiradi patogenlar, shuningdek, ba'zi ekologik ahamiyatga ega turlar. Jumladan, B. xenovorans (ilgari nomlangan Pseudomonas cepacia keyin B. cepacia va B. qo'ziqorin) katalaz musbatligi bilan tanilgan (bemorlarga ta'sir qiladi) surunkali granulomatoz kasallik ) va uning xlororganik pestitsidlarni parchalash qobiliyati va poliklorli bifenil. Konservalangan RNK tuzilishi anti-gemB RNK motifi ushbu turdagi barcha ma'lum bakteriyalarda mavjud.[4]

Ularning tufayli antibiotiklarga qarshilik va ular bilan bog'liq kasalliklardan o'lim darajasi yuqori, B. mallei va B. pseudomallei salohiyatli hisoblanadi biologik urush agentlari, chorva mollari va odamlarga qaratilgan.

Tarix

Jins nomi berilgan Valter H. Burkholder, o'simlik patologiyasi Kornell universiteti. Jinsga joylashtirilgan birinchi turlar transfertlar edi Pseudomonas, turli xil biokimyoviy testlar asosida.[1][2]

Yaqin vaqtgacha jins Burxolderiya barchani qamrab olgan Paraburxolderia turlari.[5] Biroq, jins Paraburxolderia filogenetik jihatdan ajralib turadi va barchadan ajralib turishi mumkin Burxolderiya har bir tur uchun noyob topilgan molekulyar imzolar asosida turlar.[6]

Taksonomiya

Burxolderiya turlari a monofiletik ichida guruh Burkholderiales tartibi Betaproteobakteriyalar. Hozirgi vaqtda to'g'ri nomlangan 48 turni qarindosh avlodlardan ajratish mumkin (ya'ni. Paraburxolderia ) va boshqa barcha bakteriyalar saqlangan imzo indellari turli xil oqsillarda.[6] Ushbu indellar hamma uchun umumiy bo'lgan yagona nasabni anglatadi Burxolderiya turlari.

Jins uchta aniq xususiyatga ega monofiletik klasterlar. Bir guruhga tegishli barcha turlardan iborat Burkholderia cepacia murakkab, yana bir qoplama o'z ichiga oladi B. pseudomallei va chambarchas bog'liq turlar, va oxirgi to'qnashuv ularning ko'p qismini qamrab oladi fitogen turkumdagi turlar, shu jumladan B. glumae va B. gladioli.[6] Konservalangan imzo indellari ushbu juda katta va xilma-xil tur vakillarini ajratishda yordam beradigan turkumdagi ushbu kichik guruhlarning har biri uchun xosdir.[6][7]

Tadqiqot

Yaqinda tadqiqot Burxolderiya turlar bir qator mavzular va xususiyatlarni, shu jumladan antibiotiklarga metabolomik ta'sirni, bakteriyalar jamoalari o'rtasidagi aloqaga bog'liq o'zaro ta'sirni va foydali mahsulotlar ishlab chiqarish uchun genomik potentsialni o'rganib chiqdi.[8][9][10]

Yilda Burxolderiya turlari, ba'zi bir antibiotiklar juda ko'p miqdorni keltirib chiqaradi va ularni tartibga soladi metaboloma kabi trimetoprim ichida 100 dan ortiq jim sekonder metabolit gen klasterlarini keltirib chiqarish Burkholderia thailandensis.[8] Ushbu global faollashtiruvchilar patogen bakteriyalar turlarining metabolomlari antibiotik stressiga qanday ta'sir qilishini va ularga javoban bakteriyalar turlarining qanday turlicha bo'lishini tekshirish manbai sifatida foydalanishlari mumkin.[8] Yaqindan bog'liqligi ko'rsatilgan kistik fibroz - aloqador Burxolderiya turlar trimetoprimga turli xil ifoda darajalari bilan javob beradi ikkilamchi metabolitlar, tegishli bakterial shtammlarda metabolomikaning shaxsiy xususiyatini ta'kidlab.[11]

Tadqiqot yordamida bakteriyalararo signalizatsiya yo'naltirilgan Burxolderiya buni ko'rsatdi kontaktga bog'liq bo'lgan o'sishni inhibe qilish hujayraning hujayra aloqasiga vositachiligida muhim rol o'ynaydi B. taylandensis.[9] Ushbu o'zaro ta'sirda hujayralar atrofdagi muhitga oqsil toksinlarini chiqaradi va faqat tegishli himoya oqsiliga ega bo'lganlar (odatda bir xil shtammdagi bakteriyalar) uning o'sishini to'xtatmaydi yoki o'lmaydi. Bundan tashqari, tegishli oqsilga ega bo'lgan retsipient hujayralar gen ekspressioni va fenotipida o'zgaradi, bu esa jamiyat shakllanishiga yordam beradi. biofilmlar. Bu, agar qabul qiluvchi hujayra ushbu tizimning ahamiyatini ko'rsatadigan bir xil bakterial shtammda bo'lmagan bo'lsa ham sodir bo'ladi.[9] Protein toksinlarini va kontaktga bog'liq bo'lgan inhibisyon tizimining qolgan qismini kodlaydigan genlar a shaklida harakatchan bo'lishi mumkin. transpozon hujayralar o'rtasida o'tkazilishi mumkin va tizimning umumiy jihati uchun juda muhimdir.[12] Shunday qilib, kontaktga bog'liq signalizatsiya bakterial o'zini tan olish va jamiyatni shakllantirishda muhim rol o'ynaydi.[9][12]

Burxolderiya turlarining antimikrobiyal va. kabi foydali mahsulotlarning potentsial manbai ekanligi isbotlangan biosurfaktanlar.[10][13] Bilan bog'liq jins Pseudomonas, Burxolderiya deb nomlangan ma'lum bir biosurfaktant sinfini sintez qilishi mumkin ramnolipidlar. Tomonidan sintez qilingan ramnolipidlar Burxolderiya turli xil kimyoviy xususiyatlarga ega (sintez qilinganlarga nisbatan Pseudomonas) va shu bilan yangi dasturlar uchun potentsial mavjud.[13][14]

Turlar

Turlarning ro'yxati:[15]

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

  1. ^ a b Yabuuchi E, Kosako Y, Oyaizu H, Yano I, Xotta H, Xashimoto Y va boshq. (1992). "Burkholderia gen. Nov. Ning taklifi va Pseudomonas homology II guruhining etti turini yangi turga o'tkazish, Burkholderia cepacia turiga (Palleroni va Holmes 1981) taroq. Nov." Mikrobiologiya va immunologiya. 36 (12): 1251–75. doi:10.1111 / j.1348-0421.1992.tb02129.x. PMID  1283774.
  2. ^ a b "IJSBdan tashqarida ilgari samarali nashr etilgan yangi ismlar va yangi kombinatsiyalarning nashr etilishini tasdiqlash - 45-sonli ro'yxat". Int J Syst Bacteriol. 43 (2): 298–399. 1993. doi:10.1099/00207713-43-2-398.
  3. ^ Woods DE, Sokol PA (2006). "Jins Burxolderiya"Dworkin M, Falkow S, Rozenberg E, Shleifer KH, Stackebrandt E (tahr.). Prokaryotlar - Bakteriyalar biologiyasi bo'yicha qo'llanma (3 nashr). Nyu-York: Springer-Verlag. pp.848 –860. doi:10.1007/0-387-30745-1_40. ISBN  978-0-387-25495-1.
  4. ^ Weinberg Z, Barrick JE, Yao Z, Roth A, Kim JN, Gore J va boshq. (2007). "CMfinder qiyosiy genomika quvur liniyasidan foydalangan holda bakteriyalarda 22 nomzod tuzilgan RNKlarni aniqlash". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 35 (14): 4809–19. doi:10.1093 / nar / gkm487. PMC  1950547. PMID  17621584.
  5. ^ Oren A, Garrity GM (sentyabr 2017). "Oldindan samarali bo'lgan, ammo haqiqiy bo'lmagan yangi nomlar va yangi kombinatsiyalar ro'yxati". Xalqaro sistematik va evolyutsion mikrobiologiya jurnali. 67 (9): 3140–3143. doi:10.1099 / ijs.0.000317. PMC  5817221.
  6. ^ a b v d Savana A, Adeolu M, Gupta RS (2014). "Molekulyar imzolar va Burxolderiya naslining filogenomik tahlili: bu turni patogen organizmlarni o'z ichiga olgan va yangi Paraburkholderia gen. Nov. Atrof-muhit turlarini o'z ichiga olgan burkholderiya turiga ajratish bo'yicha taklif". Genetika chegaralari. 5: 429. doi:10.3389 / fgene.2014.00429. PMC  4271702. PMID  25566316.
  7. ^ Gupta RS (2016 yil iyul). "Genomikaning mikrob evolyutsiyasi va tasnifini tushunishga ta'siri: Darvin qarashlarining tasnifga ahamiyati". FEMS Mikrobiologiya sharhlari. 40 (4): 520–53. doi:10.1093 / femsre / fuw011. PMID  27279642.
  8. ^ a b v Okada BK, Vu Y, Mao D, Bushin LB, Seyedsayamdost MR (avgust 2016). "Burkholderia thailandensis trimetoprim ta'sirida ikkilamchi metabolizmini xaritalash". ACS kimyoviy biologiyasi. 11 (8): 2124–30. doi:10.1021 / acschembio.6b00447. PMC  6786267. PMID  27367535.
  9. ^ a b v d Garsiya EC, Perault AI, Marlatt SA, Cotter PA (iyul 2016). "Burkholderia kontaktga bog'liq bo'lgan o'sishni oldini olish tizimi oqsillari orqali bakteriyalararo signalizatsiya". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 113 (29): 8296–301. doi:10.1073 / pnas.1606323113. PMC  4961174. PMID  27335458.
  10. ^ a b Kunakom S, Eustáquio AS (iyul 2019). "Burkholderia tabiiy mahsulotlar manbai sifatida". Tabiiy mahsulotlar jurnali. 82 (7): 2018–2037. doi:10.1021 / acs.jnatprod.8b01068. PMC  6871192. PMID  31294966.
  11. ^ McAvoy AC, Jaiyesimi O, Threatt PH, Seladi T, Goldberg JB, da Silva RR, Garg N (may, 2020). "Burkholderia spp. Antibiotik trimetoprim ta'siridan keyin bakteriyalar metabolizmasi". ACS yuqumli kasalliklari. 6 (5): 1154–1168. doi:10.1021 / acsinfecdis.9b00513. PMID  32212725.
  12. ^ a b Ocasio AB, Cotter PA (yanvar 2019). Blokesch M (tahrir). "Burkholderia thailandensis tizimining CDI / CDS kodlovchi genlari transpozonning yangi sinfini belgilaydigan mobil genetik elementda joylashgan". PLoS Genetika. 15 (1): e1007883. doi:10.1371 / journal.pgen.1007883. PMC  6350997. PMID  30615607.
  13. ^ a b Wittgens A, Santiago-Schuebel B, Henkel M, Tiso T, Blank LM, Hausmann R va boshq. (2018 yil fevral). "Pseudomonas putida-da Burkholderia glumae-dan uzoq zanjirli ramnolipidlarni heterologik ravishda ishlab chiqarish - bu maxsus tayyorlangan ramnolipidlarga bir qadam". Amaliy mikrobiologiya va biotexnologiya. 102 (3): 1229–1239. doi:10.1007 / s00253-017-8702-x. PMID  29264775.
  14. ^ Viktor IU, Kviensien M, Tripati L, Cobice D, McClean S, Marchant R, Banat IM (avgust 2019). "Burkholderia thailandensis E264 da ramnolipid biosurfaktant ishlab chiqarishni ko'paytirish uchun potentsial maqsad sifatida kvorumni aniqlash". Amaliy mikrobiologiya va biotexnologiya. 103 (16): 6505–6517. doi:10.1007 / s00253-019-09942-5. PMC  6667413. PMID  31222386.
  15. ^ "Nomenklaturada turgan prokaryotik nomlar ro'yxati". Olingan 21 oktyabr 2016.

Tashqi havolalar