C11orf52 - C11orf52
| C11orf52 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatorlar | |||||||||||||||||||||||||
| Taxalluslar | C11orf52, 11-xromosoma ochiq o'qish doirasi 52 | ||||||||||||||||||||||||
| Tashqi identifikatorlar | MGI: 1914202 HomoloGene: 12059 Generkartalar: C11orf52 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortologlar | |||||||||||||||||||||||||
| Turlar | Inson | Sichqoncha | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ansambl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNA) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (oqsil) | |||||||||||||||||||||||||
| Joylashuv (UCSC) | Chr 11: 111.92 - 111.93 Mb | Chr 9: 50.74 - 50.75 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed qidirmoq | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Vikidata | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
C11orf52 xarakterlanmagan oqsil bu ichida homo sapiens tomonidan kodlangan C11orf52 gen.
Gen
Manzil
C11orf52 11-xromosomada 11q23.1 da joylashgan bo'lib, 111908620 da boshlanib, 112064278 da tugaydi.[5] C11orf52 155658 taglik juftini qamrab oladi va ijobiy ipga yo'naltirilgan. C11orf52 geni 14kDa molekulyar og'irligiga ega va to'rtta o'z ichiga olgan 7,995 bp oqsil kodlash genidir. exons. Kodlash mintaqasi 1168 bpdan iborat.[6]
Gen mahallasi
Genlar HSPB2, CRYAB, 11-xromosomadagi OLAT va PPIHP1 qo'shnisi C11orf52.
Ifoda
C11orf52 yuqori darajada ifodalangan qalqonsimon bez, talmus, gipofiz, platsenta va prostata, buyrak, yurak va skelet mushaklari.[7] Biroq, estrogen retseptorlarida alfa-jim MCF-7 ko'krak bezi saratoni hujayralari, bu nazorat to'qimalariga nisbatan juda past darajada ifoda etilgan.[8]
Stenogramma
C11orf52 RNKning bitta varianti mavjud. The mRNA ketma-ketligi 1140 tayanch juftiga teng.[6] Yuqori oqim mavjud kodonni to'xtatish nukleotidlarda joylashgan 65 - 67. 23-amino kislotalar orasida o'zgarib turadi treonin va arginin.[6]
Oqsil
123 ta aminokislota zanjiri noma'lum funktsiya sohasidir.[9] Uning molekulyar massasi 13,9 kDal va izoelektrik nuqtasi 9,74 ga teng [6] C11orf52 yadroga yo'naltirilgan bo'lishi taxmin qilinmoqda.
C11orf52 tomonidan kodlangan oqsilning izoformalari mavjud emas.
Tuzilishi
LYS19-22 mintaqasi oqsil tuzilishining tashqi sohasidir.[6]
Gomologiya
Ortologlar
C11orf52 genlar oilasining faqat bitta a'zosi bor va hech qanday qo'shilish yo'q izoformlar Geospiza fortisga qaytib boradigan joyni topish mumkin Homo Sapiens C11orf52 ketma-ketligi. Genlarning takrorlanishi taxminan 324,5 million yil oldin sudralib yuruvchilar va qushlarda sodir bo'lgan. C11orf52 geni uchun paraloglar mavjud emas.
| Turlar | Umumiy ism | Kirish # | Tartib uzunligi | mRNA identifikatori% | Tartibga o'xshashlik% |
|---|---|---|---|---|---|
| Homo sapiens | Inson | NP_542390.2 | 123 | 100 | 100 |
| Saimiri boliviensis boliviensis | Qora qalpoqli sincap maymuni | XP_010332875.1 | 126 | 87 | 89 |
| Equus caballus | Ot | XP_001916914.1 | 124 | 82 | 82 |
| Oryctolagus cuniculus | Evropa quyoni | XP_002708495.1 | 126 | 75 | 83 |
| Erinaceus europaeus | Evropa kirpi | XP_007539796.1 | 124 | 59 | 69 |
| Leptonixotlar weddellii | Weddell muhri | XP_006733365.1 | 130 | 48 | 59 |
| Pelodiscus sinensis | Xitoy Softshell toshbaqasi | XP_006111270.1 | 123 | 44 | 59 |
| Anolis karolinensis | Karolina Anol | XP_008119278.1 | 125 | 42 | 57 |
| Alligator mississippiensis | Amerika timsoli | XP_006271409.1 | 118 | 39 | 54 |
| Python bivittatus | Birma pitoni | XP_007422684.1 | 160 | 38 | 59 |
| Haliaeetus albicilla | Oq dumli burgut | XP_009915555.1 | 118 | 46 | 60 |
| Pseudopodoces humilis | Tuproq titasi | XP_005531117.1 | 118 | 46 | 58 |
| Cariama cristata | Qizil oyoqli Seriema | XP_009702852.1 | 118 | 44 | 58 |
| Apaloderma vittatum | Bargli Trogon | XP_009868605.1 | 118 | 44 | 59 |
| Anas platyrhynchos | Mallard | XP_005030930.1 | 139 | 43 | 58 |
| Tinamus guttatus | Oq tomoqli tinamou | XP_010217725.1 | 118 | 42 | 57 |
| Ficedula albicollis | Yoqilgan Flycatcher | XP_005058859.1 | 122 | 38 | 52 |
| Geospiza fortis | O'rta zamin finch | XP_005427571.1 | 117 | 36 | 52 |
Klinik ahamiyati
Ba'zi bolalardagi C11orf52 genidagi noodatiy DNK metilatsiyasini prenatal tutun ta'siriga kiritish mumkin.[10]
C11orf52 o'pka saratonida ham rol o'ynashi mumkin. C11orf52 o'pkada ifodalanadi va hujayraning o'pka saraton o'smalarida fosforillanish kuchayishi bilan bog'liq. Haddan tashqari ko'payishning oldini olish uchun fosforillanishni inhibe qilishi kerak bo'lgan oqsillarni va yo'llarni kuchaytiradigan fosforillanish mexanizmlari mavjudligiga dalillar mavjud. C11orf52 - bu fosforillanish saraton hujayralari va normal to'qima o'rtasida sezilarli darajada farq qiladigan gen.[11]
Qo'shimcha o'qish
- Varjosalo M, Keskitalo S, Van Drogen A, Nurkkala H, Vichalkovski A, Aebersold R, Gstaiger M (aprel 2013). "Inson CMGC kinaz guruhining oqsil bilan o'zaro ta'sir landshafti". Hujayra hisobotlari. 3 (4): 1306–20. doi:10.1016 / j.celrep.2013.03.027. PMID 23602568.
- Olax J, Vincze O, Virok D, Simon D, Bozso Z, Tokesi N, Horvat I, Xlavanda E, Kovach J, Magyar A, Szũcs M, Orosz F, Penke B, Ovadi J (sentyabr 2011). "Patologik belgilarning o'zaro ta'siri: protein / p25, beta-amiloid va alfa-sinukleinni rivojlantiruvchi tubulin polimerizatsiyasi". Biologik kimyo jurnali. 286 (39): 34088–100. doi:10.1074 / jbc.M111.243907. PMC 3190826. PMID 21832049.
Adabiyotlar
- ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000149300 - Ansambl, 2017 yil may
- ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000032062 - Ansambl, 2017 yil may
- ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
- ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
- ^ "NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Olingan 2015-05-08.
- ^ a b v d e "Human hg19 chr11: 111,789,601-111,797,595 UCSC Genome Browser v384".
- ^ "AceView: Gen: HSPB2andC11orf52, mRNA yoki ESTsAceView yordamida odam, sichqon va gijja genlarining to'liq izohi".
- ^ "NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Olingan 2015-05-08.
- ^ "NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Olingan 2015-05-08.
- ^ Nilsen CH, Larsen A, Nilsen AL (Fevral 2016). "Onaning sigareta chekishining prenatal ta'siriga javoban DNK metilatsiyasining o'zgarishi: onaning turmush tarzidan sog'liqqa doimiy epigenetik ta'sir?". Toksikologiya arxivi. 90 (2): 231–45. doi:10.1007 / s00204-014-1426-0. PMID 25480659. S2CID 15196038.
- ^ Wu CJ, Cai T, Rikova K, Merberg D, Kasif S, Steffen M (Noyabr 2009). "O'pka saratonini bashorat qiluvchi fosforillanish imzosi". PLOS ONE. 4 (11): e7994. Bibcode:2009PLoSO ... 4.7994W. doi:10.1371 / journal.pone.0007994. PMC 2777383. PMID 19946374.