CFTR inhibitori omili - CFTR inhibitory factor

Tasma diagrammasi dan Cif dimerining P. aeruginosa PA14. Kimdan PDB: 3KD2​.

The CFTR inhibitori omili (Cif) oqsil hisoblanadi virulentlik omili tomonidan yashiringan Gram-manfiy bakteriyalar Pseudomonas aeruginosa[1] va Acinetobacter nosocomialis.[2] Kashf etilgan Dartmut tibbiyot maktabi, Cif tanlangan odam savdosini o'zgartirishi mumkin ABC transportyorlari ökaryotik epiteliya hujayralari kabi kistik fibroz transmembran o'tkazuvchanlik regulyatori (CFTR),[1] va P-glikoprotein[3] mezbon deubiquitinatsiya mexanizmiga aralashish orqali.[4] Targ'ib qilish orqali hamma joyda - CFTR, Cif ning degradatsiyasi fenokopiya qilishga qodir kistik fibroz hujayra darajasida.[1][5] The cif gen 3 genning bir qismi sifatida transkripsiyalanadi operon, uning ifodasi CifR tomonidan salbiy tartibga solinadi, a TetR oilaviy repressor.[6]

Uyali ta'sir mexanizmi

Cif birinchi marta kulturalash orqali topilgan P. aeruginosa inson nafas yo'llari epiteliya hujayralari bilan va natijada xlorid ionlarining oqishiga polarizatsiyalangan monolayer orqali ta'sirini kuzatish. Birgalikda o'stirilgandan so'ng CFTR ga xos xlorid ionli oqim keskin kamayganligi aniqlandi.[5] Bunga ushbu hujayralarning apikal yuzasida CFTR darajasining pasayishi sabab bo'lganligi aniqlandi. Keyinchalik bu ta'sir tomonidan ishlab chiqarilgan bitta sekretsiya qilingan oqsil natijasi ekanligi aniqlandi P. aeruginosa, bu boshlang'ich uchun CFTR inhibitori omili deb nomlangan fenotip. Cif tomonidan chiqarilgan P. aeruginosa Eriydigan oqsil sifatida PA14, shuningdek ichiga qadoqlangan tashqi membrana pufakchalari (OMV).[7] Cif, etkazib berish samaradorligi tufayli, ehtimol OMVlarda qo'llanilganda ancha kuchliroqdir. Tozalangan, rekombinant Cif oqsili sutemizuvchilar hujayralarining qutblangan monolayerlariga qo'llanilishi va CFTR ning chiqarilishiga yordam beradi.[1][8] va P-glikoprotein[3] dan apikal membrana. Cif buni mezbon deubiquitylation tizimiga aralashish orqali amalga oshiradi.[4]

Epoksid gidrolaza fermenti mexanizmi

Cifning faol joyi C ning izi bilan kul rangda ko'rsatilgan va katalizda rol o'ynaydigan tanlangan qoldiqlarning yon zanjirlari tayoqcha sifatida ko'rsatilgan. Kimdan PDB: 3KD2​.

Cif - bu epoksid gidrolaza (EH) noyob substrat selektivligi bilan.[8] Cif - bu virusli kasallik sifatida xizmat qiladigan EHning birinchi namunasidir. Strukturaviy taqqoslash asosida ferment Asp129, Glu153 va His297 qoldiqlarining katalitik uchligidan foydalanadi, aksincha His177 va Tyr239 qoldiqlari epoksid kislorodini halqa ochish paytida muvofiqlashtiradi. Cif, shuningdek, kanonik Tyr-Tyr juftligini emas, balki epoksid substratini muvofiqlashtirish uchun His-Tyr juftligini ishlatadigan EHning birinchi misoli.[9] Tavsiya etilgan fermentlar mexanizmida Asp129 substratning epoksid qismidagi uglerodga nukleofil ravishda hujum qiladi va ester bilan bog'langan ferment-asil oraliq moddasini hosil qiladi. Uglerodga hujum qilish afzalligi substratga qarab farq qiladi. Reaktsiyaning ikkinchi bosqichida suv molekulasi His297-Glu153 zaryad o'rni bilan faollashadi va Asp129 ning Cγ ga nukleofil hujumiga uchraydi. Bu efir guruhini gidrolizlaydi, gidroliz mahsulotini vikinal diol sifatida chiqaradi.[8]

Tuzilishi

Cif tegishli a / b gidrolaza oilasi oqsillar. Uning tuzilishi rentgen-kristallografiyasi bilan aniqlangan va kontsentratsiyali eritmada homo-dimerizatsiya qilish uchun foydalanadigan qopqoq sohasi bo'lgan kanonik a / b gidrolaza katlamidan iborat. Faol joy oqsilning ichki qismiga a / b gidrolaza yadrosi bilan qopqoq o'rtasidagi oraliqda ko'milgan.[8][10]

Adabiyotlar

  1. ^ a b v d MacEachran DP, Ye S, Bomberger JM, Hogan DA, Swiatecka-Urban A, Stanton BA, O'Toole GA (2007). "Pseudomonas aeruginosa salgılanan oqsil PA2934 kist fibröz transmembran iletkenlik regülatörünün apikal membrana ta'sirini kamaytiradi". Immunitetni yuqtirish. 75 (8): 3902–3912. doi:10.1128 / IAI.00338-07. PMC  1951978. PMID  17502391.
  2. ^ Bahl CD, Hvorecny KL, Bridges AA, Ballok AE, Bomberger JM, Cady KC, O'Toole GA, Madden DR (2014). "Imzo motiflari epoksid gidrolaza faolligi bilan Acinetobacter Cif virulentlik omilini aniqlaydi". J Biol Chem. 289: 7460–7469. doi:10.1074 / jbc.M113.518092. PMC  3953260. PMID  24474692.
  3. ^ a b Ye S, MacEachran DP, Hamilton JW, O'Toole GA, Stanton BA (2008). "Doksorubitsinning xemotoksikligi va P-glikoprotein (MDR1) ning sirt ekspressioni Pseudomonas aeruginosa toksini Cif tomonidan tartibga solinadi". Am J Physiol hujayra fizioli. 295 (3): C807-18. doi:10.1152 / ajpcell.00234.2008. PMC  2544439. PMID  18650266.
  4. ^ a b Bomberger JM, Ye S, Maceachran DP, Koeppen K, Barnaby RL, O'Toole GA, Stanton BA (2011). Rohde J (tahrir). "Uy egasi ubikuitin proteolitik tizimini o'g'irlaydigan Pseudomonas aeruginosa toksini". PLoS Pathog. 7 (3): e1001325. doi:10.1371 / journal.ppat.1001325. PMC  3063759. PMID  21455491.
  5. ^ a b Swiatecka-Urban A, Moreau-Marquis S, Maceachran DP, Connolly JP, Stanton CR, Su JR, Barnaby R, O'toole GA, Stanton BA (2006). "Pseudomonas aeruginosa insonning qutblangan havo yo'llari epiteliya hujayralarida CFTR ning endotsitik qayta ishlashini inhibe qiladi". Am J Physiol hujayra fizioli. 290 (3): C862-72. doi:10.1152 / ajpcell.00108.2005. PMID  16236828.
  6. ^ MacEachran DP, Stanton BA, O'Toole GA (2008). "Cif TetR oilaviy repressor CifR tomonidan salbiy tartibga solinadi". J bakteriol. 76 (7): 3197–3206. doi:10.1128 / IAI.00305-08. PMC  2446692. PMID  18458065.
  7. ^ Bomberger JM, Maceachran DP, Coutermarsh BA, Ye S, O'Toole GA, Stanton BA (2009). Ausubel FM (tahrir). "Pseudomonas aeruginosa tashqi membrana pufakchalari orqali bakterial virusli omillarni uzoq masofaga etkazib berish". PLoS Pathog. 5 (4): e1000382. doi:10.1371 / journal.ppat.1000382. PMC  2661024. PMID  19360133.
  8. ^ a b v d Bahl CD, Morisseau C, Bomberger JM, Stanton BA, Hammock BD, O'Toole GA, Madden DR (2010). "Kist fibrozis transmembran o'tkazuvchanlik regulyatori inhibitori omilining kristalli tuzilishi epoksid gidrolaza virulentlik omilining yangi faol xususiyatlarini ochib beradi". J bakteriol. 192 (7): 1785–1795. doi:10.1128 / JB.01348-09. PMC  2838060. PMID  20118260.
  9. ^ Bahl CD, Madden DR (2012). "Pseudomonas aeruginosa Cif a / b epoksid gidrolazalarining aniq sinfini uning halqasini ochadigan juftidan foydalanib aniqlaydi". Proteinli Pept Lett. 19 (2): 186–193. doi:10.2174/092986612799080392. PMC  3320240. PMID  21933119.
  10. ^ Bahl CD, MacEachran DP, O'Toole GA, Madden DR (2010). "Pseudomonas aeruginosa tomonidan ajratilgan virulentlik omili bo'lgan Cifni tozalash, kristallanish va dastlabki rentgen difraksiyasini tahlil qilish". Acta Crystallogr. F66 (1): 26–28. doi:10.1107 / S1744309109047599. PMC  2805529. PMID  20057063.