Caenorhabditis nigoni - Caenorhabditis nigoni

Caenorhabditis nigoni
Ilmiy tasnif tahrirlash
Qirollik:Animalia
Filum:Nematoda
Sinf:Xromadorea
Buyurtma:Rhabditida
Oila:Rabditidae
Tur:Caenorhabditis
Turlar:
C. nigoni
Binomial ism
Caenorhabditis nigoni
Feliks, Braendle va Cutter, 2014 yil
Suşlar
  • JU1325
  • JU1422
  • KK-2011
  • MAF-2010
Sinonimlar

Caenorhabditis sp. 9

Caenorhabditis nigoni turkumining Elegans guruhiga kiruvchi erkak-urg'ochi turidir Caenorhabditis, birinchi bo'lib aniqlangan va "deb ta'riflanganCaenorhabditis 9 "yoki" turlariC. sp. 9 "[1] nomini o'zgartirishdan oldin "C. nigoni".[2] Maxsus epitet - bu hurmat Viktor Nigon birinchi bo'lib kim o'qigan Caenorhabditis elegans bilan laboratoriyada Ellsworth Dougherty 1940-yillarda (Nigon, 1949).[3] Izolyatsiyalar Kongo Demokratik Respublikasi va Kerala, Hindiston.

C. briggsae duragaylar tadqiqotlari

C. nigoni diqqatga sazovordir, chunki u germafroditik turlar bilan chambarchas bog'liq, C. briggsae. O'rtasidagi sezilarli farqlarga qaramay C. nigoni va C. briggsae ularning jinsiy ko'payish rejimlarida (50: 50% ayol: erkak 99: 1% germafroditga nisbatan: erkak), ularning genom kattaligi (129 Mb va 108 Mb),[4] va ularning oqsillarni kodlovchi genlari soni (mos ravishda 22,313 ga nisbatan 29,167),[5] bu ikki tur nafaqat hayotga yaroqli erkak va urg'ochi duragay avlodlarini, balki qisman unumdor urg'ochi duragay avlodlarini hosil qilish uchun bir-biriga aralashishi mumkin.[6]

Shunga qaramay, ushbu ikki tur o'rtasidagi duragaylar Xaldey qonuniga bo'ysunadi: heterogametik nasllar (erkaklar) ayollarga qaraganda ancha kam hayotga ega. Uchun gibrid mos kelmaydigan joylarning batafsil xaritasi C. briggsae genom 2015 yilda yaratilgan.[7] Erkaklarning gibrid ko'rinmasligi, birinchi navbatda, embrional rivojlanish jarayonida namoyon bo'ladi va eng past o'sish haroratida namoyon bo'ladi.[8] Bundan tashqari, omon qolish C. nigoni/C. briggsae gibrid erkaklar steril. Ushbu sterillik hech bo'lmaganda qisman ikkita X-xromosomali ketma-ketlikning mavjudligi tufayli kelib chiqadi C. briggsae, ulardan ikkitasi ham g'ayritabiiy transkripsiyaviy regulyatsiya bilan bog'liq C. nigoni spermatogen funktsiyalarni kodlovchi autosomal genlar; ushbu regulyatsiya regulyatsiya qilingan spermatogenenik genlarga qaratilgan 22G RNKlar to'plamining duragaylarida g'ayritabiiy regulyatsiya bo'lishi mumkin.[9]

Yin va boshq. (2018) uchinchi avlod genomini ishlab chiqardi C. nigoni, qaysi genlar ikkala tur o'rtasida farqlanishini aniqlash va ushbu farqlarning funktsional ta'sirini tavsiflashni boshlash uchun foydalangan.[10] Ularning ta'kidlashicha, genlar orasidagi farqning ko'pi o'rtasida C. nigoni va C. briggsae bu yo'qolgan genlar kodlangan so'nggi turlardagi genlarning yo'qolishi bilan bog'liq C. nigoni) nomutanosib ravishda yuqori oqsillar, erkaklar tomoniga asoslangan RNK-seq ekspressioni, yo'qolgan genlar tarkibiga uchta Male Secreted Short (mss) genlar va transgenik tiklanish mss-1 va mss-2 dan C. nigoni ga C. briggsae sabablari C. briggsae reproduktiv raqobatda erkaklar ancha samarali bo'lishlari (boshqa erkaklarga qarshi ham, germafroditik o'z-o'zini urug'lantirishga qarshi ham).

Genom kattaligidagi farqlar takrorlanadigan DNKdagi katta o'zgarishlarga bog'liq emas, chunki ikkala genomda ham takrorlanadigan elementlarning bir-biriga o'xshash o'xshash qismlari mavjud (C. nigoni 27% ga nisbatan C. briggsae 25%).[11] Biroq, sun'iy yo'ldosh DNKlarining yuqori qismi mavjud C. nigoni ga qaraganda C. briggsae, ko'proq sun'iy yo'ldosh DNK oilalari bilan birga C. nigoni.[12]

Parallel ravishda mustaqil ishlab chiqarilgan uchinchi avlod genom to'plamidan foydalangan holda C. nigoni, Ren va boshq. (2018) ning xromosomalarining butun genomga to'g'ri kelishi tahlil qilindi C. nigoni ga C. briggsae;[13] ular ikki genomning keng xromosoma sinteniyasiga ega ekanligi, shu bilan birga ko'plab ichki va xromosomalar ketma-ketligini qayta tashkil etishlari haqida xabar berishadi. Ushbu qayta tuzilishlar, ehtimol, ikki turning xromosomalari orasidagi meiotik rekombinatsiyaga to'sqinlik qilishi va shuningdek, turlararo duragaylarning qisman ko'rinmasligi va bepushtligini keltirib chiqarishi mumkin.

Adabiyotlar

  1. ^ Kiontke, Karin S.; Feliks, Mari-Enn; Ailion, Maykl; Rokman, Metyu V.; Braendle, nasroniy; Penigo, Jan-Batist; Fitch, Devid H. A. (2011-11-21). "Kanorabdit uchun filogeniya va molekulyar shtrix-kodlar, chirigan mevalardan ko'plab yangi turlari bilan". BMC evolyutsion biologiyasi. 11: 339. doi:10.1186/1471-2148-11-339. ISSN  1471-2148. PMC  3277298. PMID  22103856.
  2. ^ Feliks, Mari-Enn; Braendle, nasroniy; To'sar, Asher D. (2014). "Kanorabditda turlarni tashxislashning soddalashtirilgan tizimi (Nematoda: Rhabditidae) 15 ta aniq biologik turga nomlari bilan". PLOS One. 9 (4): e94723. doi:10.1371 / journal.pone.0094723. ISSN  1932-6203. PMC  3984244. PMID  24727800.
  3. ^ Nigon, Viktor (1949). "Les modalites de la reproduction et le determinisme du sexe chez quelques nematodes libres". Annales de Sciences Naturelles - Zool. Biol. Anim. 11: 1–132.
  4. ^ Yin, Da; Shvarts, Erix M.; Tomas, Kristel G.; Felde, Rebekka L.; Korf, Yan F.; Kesuvchi, Asher D.; Shartner, Kaitlin M.; Ralston, Edvard J.; Meyer, Barbara J. (2018). "O'z-o'zini serhosil nematodada genomning tez qisqarishi sperma raqobatdosh oqsillarini ochib beradi". Ilm-fan. 359 (6371): 55–61. doi:10.1126 / science.aao0827. ISSN  1095-9203. PMC  5789457. PMID  29302007.
  5. ^ Yin, Da; Shvarts, Erix M.; Tomas, Kristel G.; Felde, Rebekka L.; Korf, Yan F.; Kesuvchi, Asher D.; Shartner, Kaitlin M.; Ralston, Edvard J.; Meyer, Barbara J. (2018). "O'z-o'zini serhosil nematodada genomning tez qisqarishi sperma raqobatdosh oqsillarini ochib beradi". Ilm-fan. 359 (6371): 55–61. doi:10.1126 / science.aao0827. ISSN  1095-9203. PMC  5789457. PMID  29302007.
  6. ^ Woodruff, Gavin C.; Eke, Onyinyechi; Baird, Scott E.; Feliks, Mari-Enn; Haag, Erik S. (2010). "Caenorhabditis nematodalarining turlararo duragay duragaylaridan turlarning xilma-xilligi va germafroditizm evolyutsiyasi to'g'risida tushunchalar". Genetika. 186 (3): 997–1012. doi:10.1534 / genetika.110.120550. ISSN  1943-2631. PMC  2975280. PMID  20823339.
  7. ^ Bi, Yu; Ren, Syaoliang; Yan, Cheung; Shao, Jiaofang; Xie, Dongying; Zhao, Zhongying (2015). "Caenorhabditis briggsae va C. nigoni o'rtasidagi genom bo'yicha gibrid nomuvofiqlik manzarasi". PLOS Genetika. 11 (2): e1004993. doi:10.1371 / journal.pgen.1004993. ISSN  1553-7404. PMC  4334894. PMID  25692300.
  8. ^ Bundus, Joanna D.; Aley, Ravin; To'sar, Asher D. (2015). "Gameta tanlovi, rivojlanish traektoriyalari va Haldane qoidasidagi tashqi heterojenlik". Evolyutsiya; Organik evolyutsiya xalqaro jurnali. 69 (8): 2005–2017. doi:10.1111 / evo.12708. ISSN  1558-5646. PMID  26102479.
  9. ^ Li, Runsheng; Ren, Syaoliang; Bi, Yu; Xo, Vinsi Ving Sze; Xsie, Chia-Ling; Yosh, Amanda; Chjan, Tsixon; Lin, Tingting; Zhao, Yanmei (2016). "X-xromosoma introressiyasi bilan bog'liq bo'lgan gibrid steril erkaklarda 22G RNK tomonidan yo'naltirilgan spermatogenez genlarining o'ziga xos regulyatsiyasi". Genom tadqiqotlari. 26 (9): 1219–1232. doi:10.1101 / gr.204479.116. ISSN  1549-5469. PMC  5052035. PMID  27197225.
  10. ^ Yin, Da; Shvarts, Erix M.; Tomas, Kristel G.; Felde, Rebekka L.; Korf, Yan F.; Kesuvchi, Asher D.; Shartner, Kaitlin M.; Ralston, Edvard J.; Meyer, Barbara J. (2018). "O'z-o'zini serhosil nematodada genomning tez qisqarishi sperma raqobatdosh oqsillarini ochib beradi". Ilm-fan. 359 (6371): 55–61. doi:10.1126 / science.aao0827. ISSN  1095-9203. PMC  5789457. PMID  29302007.
  11. ^ Yin, Da; Shvarts, Erix M.; Tomas, Kristel G.; Felde, Rebekka L.; Korf, Yan F.; Kesuvchi, Asher D.; Shartner, Kaitlin M.; Ralston, Edvard J.; Meyer, Barbara J. (2018). "O'z-o'zini serhosil nematodada genomning tez qisqarishi sperma raqobatdosh oqsillarini ochib beradi". Ilm-fan. 359 (6371): 55–61. doi:10.1126 / science.aao0827. ISSN  1095-9203. PMC  5789457. PMID  29302007.
  12. ^ Subirana, Xuan A.; Messeguer, Xaver (2017-11-28). "Tandem evolyutsiyasi bir-biriga chambarchas bog'liq bo'lgan ikkita Caenorhabditis turida takrorlanadi. Hermafroditlarda sun'iy yo'ldoshlarning kamayishi". Genlar. 8 (12): 351. doi:10.3390 / genlar8120351. ISSN  2073-4425. PMC  5748669. PMID  29182550.
  13. ^ Ren, Syaoliang; Li, Runsheng; Vey, Syaolin; Bi, Yu; Xo, Vinsi Ving Sze; Ding, Tsyutao; Xu, Tszhao; Chjan, Tsixon; Xsie, Chia-Ling (2018-02-16). "Caenorhabditis briggsae va C. nigoni o'rtasidagi duragayda rekombinatsiyani bostirishning genomik asoslari". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 46 (3): 1295–1307. doi:10.1093 / nar / gkx1277. ISSN  1362-4962. PMC  5814819. PMID  29325078.

Tashqi havolalar