Kaldokokk - Caldococcus

Kaldokokk
Ilmiy tasnif
Domen:
Arxeya
Qirollik:
Krenarxeota
Filum:
Krenarxeota
Sinf:
Termoprotei
Buyurtma:
Dezulfurokokkallar
Tur:
Kaldokokk
Turlar
Sinonimlar
  • "Caldococcus" Aoshima va boshq. 1996

Kaldokokk a tur Arxeyaning tartibida Dezulfurokokkallar.[1]

Xususiyatlari

Kaldokokk sinfda uchraydigan arxeylar turkumi Dezulfurokokkallar. Jins a'zolari qat'iy ravishda anaerob, gipertermofil kokklar bo'lib, ular sulfidni kamaytiradi va oltingugurtni oksidlaydi. Ular gipertermik teshiklarda va Yelloustoun milliy bog'idagi kabi issiq buloqlarda bo'lishi mumkin[2][3]

Turlar

Caldococcus noboribetus

Izotsitrat dehidrogenaza tadqiqotlari

Caldococcus noboribetus izotsitrat dehidrogenaza ajdodlari oqsilining xususiyatlarini tushunish uchun genlar mutatsiyaga uchragan. Mutant izotsitrat dehidrogenaza genlari tarkibida ifodalangan ajdodlar ketma-ketligini o'z ichiga oladi E. coli hujayralar. Ushbu genlarning ifodasi natijasida aminokislotalar ketma-ketligi bo'lgan oqsillar paydo bo'ldi, bu esa gipertermofil universal ajdod bilan aloqalarni isbotladi. Tozalangan fermentlarning termostabilliklari yovvoyi turdagi izotsitrat dehidrogenazaga qaraganda katta issiqlik barqarorligiga ega edi. Bu so'nggi universal umumiy ajdodimiz termofil yoki gipertermofil bo'lgan degan farazni qo'llab-quvvatlaydi. Ushbu topilma boshqa oqsillarning evolyutsion tarixini tushunishga, shuningdek eksperimental yoki sanoat maqsadlarida oqsil termostabilligini muhandis qilishga ta'sir qiladi.[4]

Izotsitrat dehidrogenaza (ICDH) uchun kodlovchi gen klonlangan Caldococcus noboribetus va ketma-ketlikda. ICDH ning aminokislotalar ketma-ketligi ikkalasida ham mavjud bo'lgan bakterial ICDH genlariga o'xshashligini ko'rsatdi Vibrio va E. coli turlari. Ikkinchisining ketma-ketliklari ICDH arxeologik bilan taxminan 50% identifikatsiyani bo'lishdi. Gen ichida ifodalangan E. coli uni T7 promouteriga bog'lab, hosil bo'lgan gen mahsulotining molekulyar og'irligi 48000 ga yaqin edi. Ushbu taxmin chiqarilgan aminokislotalar ketma-ketligi taxminiga mos edi. Gen mahsuloti, shuningdek, 80 ° C da ishlash uchun NADP ga bog'liqligini ko'rsatdi. ICDH geni ajratilgan C. noboribetus ICDH dan olingan xostdan yuqori termostabillikni namoyish etdi.[5] Ushbu ma'lumotdan ushbu tur ajdodlarning gipertermofili haqida ma'lumot berishi mumkinligi shubhasizdir. Bunday ma'lumotlar gipertermofil arxeabakteriyalarning to'liq filogenetik daraxtini yaratishga yordam beradi.

Caldococcus litoralis

Caldococcus litoralis bilan GC tarkibidagi 14% sezilarli farqga asoslanib, yangi turdagi vakil sifatida nashr etildi Thermococcus celer, ning yagona vakili Termokokk o'rganish 1987 yilda amalga oshirilgan paytda ma'lum bo'lgan. C. litoralis 0,7-2,1 µm gacha bo'lgan tartibsiz shakldagi kokklar. Bu tur Hot Plyajdagi issiq vulqon teshiklaridan ajratilgan Kunashir oroli, Yaponiya Bu dengiz va o'ta termofil arxebakteriy bo'lib, u 55-100 ° S gacha, eng yaxshi harorat esa 88 ° S ga teng. Shuningdek, u pH qiymatlari 5.9 -7.0 gacha, pH 6.4 da tegmaslik bilan o'sishga qodir. Optimal sharoitda naslning hosil bo'lish vaqti 44 minutni tashkil qiladi, litri uchun 6 g pepton va elementar oltingugurt va elektron akseptori mavjud.

C. litoralis monopolyar filamentli to'plamlarga ega va qat'iy ravishda anaerob hisoblanadi. U peptidlardan uglerod va energiya manbai sifatida foydalanadi; u elementar oltingugurt ishtirokida o'sadi, uni H ga kamaytiradi2S.

C litoralis vankomitsin, levomitsetin, benzilpenitsillin, streptomitsin va rifampitsinga chidamli. Uning RNK polimerazasi qarshi antitellar bilan reaksiyaga kirishmaydi Desulfurokokk RNK polimeraza. Uning tarkibidagi GC miqdori 41,0 ± 0,2 mol% ni tashkil qiladi. GC-tarkibi va uning morfologik va fiziologik xususiyatlari tufayli asl izolyatsiya yangi turga ajratilgan, Kaldokokk gen. nov., turi shtamm bilan C. litoralis sp. nov.; turdagi shtamm Z-1301.[6]

Taklif qilindi C. litoralis sifatida qayta tasniflanishi Thermococcus litoralis Z-1301. " T. litoralis - bu asl tadqiqot o'tkazilgan paytda ma'lum bo'lmagan yaqinda nashr etilgan tur.[7] Ushbu taklif ikkala turga mansubligini ko'rsatuvchi immunoblotirovka tahlillari bilan qo'llab-quvvatlanadi. Qo'shimcha qo'llab-quvvatlash DNK-DNK gibridlanishidan keyin ikki shtamm o'rtasida 96% gomologiyani o'z ichiga oladi.[8]

Adabiyotlar

  1. ^ Ga qarang NCBI Caldococcus-dagi veb-sahifa. Dan olingan ma'lumotlar "NCBI taksonomiyasi resurslari". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi. Olingan 2007-03-19.
  2. ^ http://www.rcn.montana.edu/resources/organisms/organisms.aspx?nav=11&tid=1&did=1
  3. ^ Mikroorganizmlarning Brok Biologiyasi (10-nashr). Madigan, MT, Martinko, JM va Parker, J. 2003. Prentice Hall. 467p
  4. ^ https://www.researchgate.net/publication/8045357_Thermostability_of_ancestral_mutants_of_Caldococcus_noboribetus_isocitrate_dehydrogenase
  5. ^ Aoshima, M., Yamagishi, A. va Oshima, T. "Arxeondan evakteriya tipidagi izotsitrat dehidrogenaza: klonlash, sekanslash va gipertermofil arxebakteriydan Caldococcus noboribetus dan izotsitrat dehidrogenazani kodlovchi gen ekspresiyasi". Arch. Biokimyo. Biofiz. (1996) 336: 77-85.
  6. ^ SVETLICHNYI V, A va boshq. "Caldococcus-Litoralis yangi-yangi turlari, yangi oltingugurtni elementar oltingugurtni kamaytiradigan juda termofil arxebakteriyasi." Mikrobiologiya 56.5 (1987): 831-838. Biologik tezislar 1969 yil - hozirgi kunga qadar. Internet. 2013 yil 23-noyabr.
  7. ^ Noyner va boshq. "Thermococcus Litoralis Sp. Noyabr: Juda termofil dengiz arxebakteriyalarining yangi turlari." Arch Microbiol (1990): 205-07. Chop etish
  8. ^ Kostyukova va boshqalar. "Thermococcales hujayra konvertlarining tuzilishi va antigenik imkoniyatlarini o'rganish va Caldococcus Litoralis Z-1301 ni qayta tasniflash." Ekstremofillar 3 (1999): 239-45. Chop etish.

Qo'shimcha o'qish

Ilmiy jurnallar

Ilmiy kitoblar

Ilmiy ma'lumotlar bazalari

Tashqi havolalar