Katelitsidin - Cathelicidin

LAMP
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarLAMP, IPR001894, CAP-18, CAP18, CRAMP, HSD26, gen FALL39, gen LL37, FALL39, LL37, FALL-39, katelitsidin antimikrobiyal peptid, katelitsidinlar
Tashqi identifikatorlarOMIM: 600474 MGI: 108443 HomoloGene: 110678 Generkartalar: LAMP
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 3 (odam)
Chr.Xromosoma 3 (odam)[1]
Xromosoma 3 (odam)
Genomic location for CAMP
Genomic location for CAMP
Band3p21.31Boshlang48,223,347 bp[1]
Oxiri48,225,491 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
PBB GE CAMP 210244 at fs.png
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez
Ansambl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_004345

NM_009921

RefSeq (oqsil)

NP_004336

NP_034051

Joylashuv (UCSC)Chr 3: 48.22 - 48.23 Mbn / a
PubMed qidirmoq[2][3]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Katelitsidin antimikrobiyal peptidlari (Lager) LL-37 va FALL-39 bor polipeptidlar asosan saqlanadigan lizosomalar ning makrofaglar va polimorfonükleer leykotsitlar (PMNlar); odamlarda LAMP gen kodlaydi peptid kashshofi CAP-18, bu LL-37 va FALL-39 faol shakllariga bo'linadi.[4][5]

Katelitsidinlar sutemizuvchilarning tug'ma immunitetni invaziv bakterial infeksiyadan himoya qilishida hal qiluvchi rol o'ynaydi.[6] Peptidlarning katelitsidinlar oilasi quyidagicha tasniflanadi mikroblarga qarshi peptidlar (AMP). AMP oilasiga quyidagilar kiradi defensinlar. Defensinlar umumiy tuzilish xususiyatlariga ega bo'lishiga qaramay, katelitsidin bilan bog'liq peptidlar juda xilma-xildir.[6] Antimikrobiyal polipeptidlarning katelitsidinlar oilasi a'zolari yuqori konservalangan mintaqa (katelin domeni) va juda o'zgaruvchan katelididin peptid domeni bilan ajralib turadi.[6]

Katelitsidin peptidlari turli xil turlaridan ajratib olingan sutemizuvchilar. Katelitsidinlar dastlab topilgan neytrofillar, ammo keyinchalik ko'plab boshqa hujayralarda topilgan epiteliy hujayralar va makrofaglar bakteriyalar, viruslar, zamburug'lar yoki gormon tomonidan faollashgandan keyin 1,25-D, bu gormonal faol shakl D vitamini.[7]

Antimikrobiyal ta'sir mexanizmi

Katelitsidin ta'sirini qo'zg'atadigan mexanizmning umumiy qoidasi, boshqa antimikrobiyal peptidlar singari, peptid faol bo'lgan organizmlarning hujayra membranalarining parchalanishini (shikastlanishi va teshilishi) o'z ichiga oladi.[8] Katelitsidin mikroblarning o'ralgan lipoprotein membranalarini tezda yo'q qiladi fagosomalar bilan birlashgandan keyin lizosomalar yilda makrofaglar.

Xususiyatlari

Katelitsidinlar hajmi 12 dan 80 gacha aminokislota qoldiqlari va turli xil tuzilmalarga ega.[9] Katelitsidinlarning aksariyati 23-37 aminokislota qoldig'iga ega bo'lgan chiziqli peptidlar bo'lib, amfipatik bo'lib katlanadilar. a-spirallar. Bundan tashqari, katelitsidinlar bir yoki ikkita disulfid bog'lanishlari bilan stabillashtirilgan, beta-soch tolasi tuzilmalari bo'lgan kichik o'lchamdagi molekulalar (12-18 qoldiq) bo'lishi mumkin. Bundan ham kattaroq katelisidin peptidlari (39-80 aminokislota qoldiqlari) mavjud. Ushbu kattaroq katelitsidinlar takrorlanib turadi prolin motiflari kengaytirilgan poliprolin tipidagi tuzilmalarni shakllantirish.[6]

Katelitsidinlar oilasi birlamchi ketma-ketlik homologiyasini sistatin[10] sistein proteinaz inhibitörleri oilasi, ammo bunday proteaz inhibisyonunda muhim deb hisoblangan amino kislotalar qoldiqlari odatda etishmaydi.

Odam bo'lmagan orloglar

Katelitsidin peptidlari odamlarda, maymunlarda, sichqonlar, kalamushlar, quyonlar, dengiz cho'chqalari, pandalar, cho'chqalar, qoramollar, qurbaqalar, qo'ylar, echkilar, tovuqlar va otlarda topilgan.

Hozirgi vaqtda aniqlangan katelitsidin peptidlari quyidagilarni o'z ichiga oladi:[6]

  • Inson: hCAP-18 (LL-37 va FALL-39 ga ajralgan)
  • Rhesus maymuni: RL-37
  • Sichqonlar: CRAMP-1/2, (katelitsidinga bog'liq mikroblarga qarshi peptid[11]
  • Sichqonlar: rCRAMP
  • Quyonlar: CAP-18
  • Gvineya cho'chqasi: CAP-11
  • Cho'chqalar: PR-39, Prophenin, PMAP-23,36,37
  • Qoramol: BMAP-27,28,34 (Sigir Miyeloid Antimikrobiyal Peptidlar); Bac5, Bac7
  • Qurbaqalar: katelitsidin-AL (topilgan Amolops loloensis )[12]
  • Tovuqlar: to'rtta katelitsidin, fowlicidin 1,2,3 va katelitsidin Beta-1 [13]
  • Tasmaniyalik iblis: Saha-CATH5 [14]
  • Salmonidlar: CATH1 va CATH2

Klinik ahamiyati

Bemorlar rosacea katelitsidinning yuqori darajalariga va yuqori darajalariga ega stratum corneum triptik fermentlari (SCTE). Katelitsidin mikroblarga qarshi peptidga ajraladi LL-37 ikkalasi tomonidan kallikrein 5 va kallikrein 7 serin proteazlari. LL-37 ning haddan tashqari ishlab chiqarilishi barcha subtipalarda sabab bo'lgan deb taxmin qilinadi Rosacea.[15] Antibiotiklar o'tmishda rosacea kasalligini davolash uchun ishlatilgan, ammo antibiotiklar faqat ba'zi SCTE'larni inhibe qilganligi sababli ta'sir qilishi mumkin.[16]

Odam katelididin antimikrobiyal oqsilining yuqori plazmadagi darajasi (hCAP18 ) infektsiyadan o'lim xavfini sezilarli darajada kamaytiradi diyaliz bemorlar. Ushbu oqsilning yuqori darajasi bo'lgan bemorlarda buyrak dializidan bir yil davomida o'limga olib keladigan infektsiyasiz omon qolish ehtimoli 3,7 baravar ko'p bo'lgan.[17] Katelitsidin ishlab chiqarilishi tartibga solinadi D vitamini.[18][19]

SAAP-148 (a sintetik amikroblarga qarshi va antibiofilm peptid) - bu LL-37 bilan taqqoslaganda mikroblarga qarshi ta'sirni kuchaytirgan LL-37 ning o'zgartirilgan versiyasi. Xususan, SAAP-148 fiziologik sharoitda bakteriyalarni yo'q qilishda samaraliroq edi.[20]

LL-37 rol o'ynaydi deb o'ylashadi toshbaqa kasalligi patogenez (boshqa mikroblarga qarshi peptidlar bilan birgalikda). Psoriazda shikastlangan keratinotsitlar boshqa hujayralardan o'z genetik moddasi (DNK yoki RNK) bilan komplekslar hosil qiladigan LL-37 ni chiqaring. Ushbu komplekslar rag'batlantiradi dendritik hujayralar (antigen taqdim etuvchi hujayraning bir turi), so'ngra interferon a va b ni ajratib chiqaradi, bu esa T hujayralarining farqlanishiga va yallig'lanishning davom etishiga yordam beradi.[21] LL-37, shuningdek, toshbaqa kasalligida keng tarqalgan avto-antigen ekanligi aniqlandi; O'rta va og'ir toshbaqa bilan kasallangan bemorlarning uchdan ikki qismida qon va terida LL-37 ga xos bo'lgan T-hujayralar topilgan.[21]

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000164047 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  3. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Entrez Gen: CAMP katelitsidin antimikrobiyal peptid".
  5. ^ UniProt kirish: P49913 Olingan 29 Noyabr 2019
  6. ^ a b v d e Zanetti M (2004 yil yanvar). "Katelitsidinlar, tug'ma immunitetning ko'p funktsiyali peptidlari". Leykotsitlar biologiyasi jurnali. 75 (1): 39–48. doi:10.1189 / jlb.0403147. PMID  12960280. S2CID  14902156.
  7. ^ Liu PT, Stenger S, Li H, Venzel L, Tan BH, Krutzik SR, Ochoa MT, Schauber J, Vu K, Meinken C, Kamen DL, Vagner M, Bals R, Shtaynmeyer A, Zyugel U, Gallo RL, Eyzenberg D , Hewison M, Hollis BW, Adams JS, Bloom BR, Modlin RL (mart 2006). "D vitamini vositachiligida odamning antimikrobiyal reaktsiyasini qo'zg'atuvchi tolli retseptorlari". Ilm-fan. 311 (5768): 1770–3. Bibcode:2006 yil ... 311.1770L. doi:10.1126 / science.1123933. PMID  16497887. S2CID  52869005.
  8. ^ Kościuczuk EM, Lisowski P, Jarczak J, Strzalkowska N, Jówwik A, Horbachzuk J, Krzyżewski J, Zwierzchowski L, Bagnicka E (dekabr 2012). "Katelitsidinlar: mikroblarga qarshi peptidlar oilasi. Ko'rib chiqish". Molekulyar biologiya bo'yicha hisobotlar. 39 (12): 10957–70. doi:10.1007 / s11033-012-1997-x. PMC  3487008. PMID  23065264.
  9. ^ Gennaro R, Zanetti M (2000). "Katelitsidindan olingan mikroblarga qarshi peptidlarning tuzilish xususiyatlari va biologik faolliklari". Biopolimerlar. 55 (1): 31–49. doi:10.1002 / 1097-0282 (2000) 55: 1 <31 :: AID-BIP40> 3.0.CO; 2-9. PMID  10931440.
  10. ^ Zaiou M, Nizet V, Gallo RL (may 2003). "Inson katelitsidinining antimikrobiyal va proteaz inhibitiv funktsiyalari (hCAP18 / LL-37)". Tergov dermatologiyasi jurnali. 120 (5): 810–6. doi:10.1046 / j.1523-1747.2003.12132.x. PMID  12713586.
  11. ^ Gallo RL, Kim KJ, Bernfield M, Kozak CA, Zanetti M, Merluzzi L, Gennaro R (may 1997). "CRAMPni aniqlash, embrion va kattalar sichqonchasida ko'rsatilgan katelin bilan bog'liq mikroblarga qarshi peptid". Biologik kimyo jurnali. 272 (20): 13088–93. doi:10.1074 / jbc.272.20.13088. PMID  9148921.
  12. ^ Hao X, Yang X, Vey L, Yang S, Chju V, Ma D, Yu X, Lay R (avgust 2012). "Amfibiya katelitsidin umurtqali hayvonlardagi katelitsidinning evolyutsion bo'shliqni to'ldiradi". Aminokislotalar. 43 (2): 677–85. doi:10.1007 / s00726-011-1116-7. PMID  22009138. S2CID  2794908.
  13. ^ Achanta M, Sunkara LT, Dai G, Bommineni YR, Jiang V, Zhang G (may 2012). "Tovuq katelisidin mikroblarga qarshi peptidlarining to'qimalarining ekspressioni va rivojlanishini tartibga solish". Hayvonot fanlari va biotexnologiya jurnali. 3 (1): 15. doi:10.1186/2049-1891-3-15. PMC  3436658. PMID  22958518.
  14. ^ Peel E, Cheng Y, Djordjevich JT, Fox S, Sorrell TC, Belov K (oktyabr 2016). "Tasmaniya iblisidagi katelitsidinlar (Sarcophilus harrisii)". Ilmiy ma'ruzalar. 6: 35019. Bibcode:2016 yil NatSR ... 635019P. doi:10.1038 / srep35019. PMC  5057115. PMID  27725697.
  15. ^ Reinholz M, Ruzicka T, Schauber J (may 2012). "Katelitsidin LL-37: yallig'lanishli teri kasalliklarida roli bo'lgan mikroblarga qarshi peptid". Dermatologiya yilnomalari. 24 (2): 126–35. doi:10.5021 / ad.2012.24.2.126. PMC  3346901. PMID  22577261.
  16. ^ Yamasaki K, Di Nardo A, Bardan A, Murakami M, Ohtake T, Coda A, Dorschner RA, Bonnart C, Descargues P, Hovnanian A, Morhenn VB, Gallo RL (Avgust 2007). "Serin proteazining faolligi va katelitsidin rosaceada terining yallig'lanishiga yordam beradi". Tabiat tibbiyoti. 13 (8): 975–80. doi:10.1038 / nm1616. PMID  17676051. S2CID  23470611.
  17. ^ Gombart AF, Bhan I, Borregaard N, Tamez H, Camargo CA, Koeffler HP, Thadhani R (2009 yil fevral). "Katelisidin antimikrobiyal peptidning plazmadagi past darajasi (hCAP18) gemodializga uchragan bemorlarda yuqumli kasalliklar o'limining ko'payishini taxmin qiladi". Klinik yuqumli kasalliklar. 48 (4): 418–24. doi:10.1086/596314. PMC  6944311. PMID  19133797.
  18. ^ Zasloff M (2002 yil yanvar). "Ko'p hujayrali organizmlarning mikroblarga qarshi peptidlari". Tabiat. 415 (6870): 389–95. Bibcode:2002 yil natur.415..389Z. doi:10.1038 / 415389a. PMID  11807545. S2CID  205028607.
  19. ^ Kamen DL, Tangpricha V (may, 2010). "D vitamini va immunitet tizimidagi molekulyar harakatlar: tug'ma va otoimmunitetni modulyatsiya qilish". Molekulyar tibbiyot jurnali. 88 (5): 441–50. doi:10.1007 / s00109-010-0590-9. PMC  2861286. PMID  20119827.
  20. ^ Breij, Anna de; Riool, Martijn; Kordfunke, Robert A.; Malanovich, Nermina; Bur, Leonie de; Koning, Roman I.; Ravensbergen, Elisabet; Franken, Marnix; Heijde, Tobias van der (2018-01-10). "Antimikrobiyal peptid SAAP-148 dorilarga chidamli bakteriyalar va biofilmlar bilan kurashadi". Ilmiy tarjima tibbiyoti. 10 (423): eaan4044. doi:10.1126 / scitranslmed.aan4044. ISSN  1946-6234. PMID  29321257.
  21. ^ a b Rendon, Adriana; Schäkel, Knut (2019 yil 23 mart). "Psoriaz patogenezi va davolash". Xalqaro molekulyar fanlar jurnali. 20 (6): 1475. doi:10.3390 / ijms20061475. PMC  6471628. PMID  30909615.

Qo'shimcha o'qish

Tashqi havolalar

  • Da mavjud bo'lgan barcha tarkibiy ma'lumotlarga umumiy nuqtai PDB uchun UniProt: P49913 (Inson katelitsidini) PDBe-KB.