Sitoplazmatik poliadenilatsiya elementi - Cytoplasmic polyadenylation element

The sitoplazmatik poliadenilatsiya elementi (CPE) - bu ketma-ketlik elementi 3 'tarjima qilinmagan mintaqa ning xabarchi RNK. Sitoplazmatik poliadenilatsiyani tartibga soluvchi bir nechta ketma-ketlik elementlari ma'lum bo'lsa-da, CPE eng yaxshi xarakterlanadi.[1] Eng keng tarqalgan CPE ketma-ketligi UUUUAU hisoblanadi, ammo boshqa variantlar ham mavjud.[2] Majburiy CPE bog'laydigan oqsil (CPEB ) ushbu mintaqaga mavjud bo'lganlarning kengayishiga yordam beradi poliadenin quyruq va umuman, uchun mRNKning faollashishi oqsillarni tarjima qilish. Ushbu cho'zish mRNA yadrodan sitoplazma ichiga eksport qilinganidan keyin sodir bo'ladi. Uzunroq poli (A) quyruq mRNK va ribosomani birlashishga undaydigan boshqa bir qancha sitoplazmatik oqsillar bilan o'zaro ta'sir qiluvchi ko'proq sitoplazmatik poliadenin bilan bog'langan oqsillarni (PABP) o'ziga jalb qiladi.[1] Poli (A) dumining uzayishi mRNKning translyatsion samaradorligini oshirishda muhim rol o'ynaydi. Poliadenin quyruqlari taxminan 40 taglikdan 150 tagacha cho'zilgan.[2]

Sitoplazmatik poliadenilatsiyani yadrodan ajratish kerak poliadenlyatsiya; sitoplazmatik poliadenilatsiya sitoplazmada o'ziga xos mRNKlarda sodir bo'ladi, aksincha yadroda uchraydi va deyarli barcha ökaryotik mRNKlarga ta'sir qiladi.[3] Boshqa funktsiyalar qatorida CPE uchun muhim rol aniqlandi oogenez, spermatogenez, mitoz va yangi sinapslarning o'sishi[4][5][6] CPE ning roli birinchi navbatda Xenopus oositlari va embrionlarida tavsiflangan, ammo so'nggi tadqiqotlar somatik hujayralardagi CPE uchun rollarni aniqladi.[1][7] Ba'zi proto-onkogen mRNKlarida CPE borligi isbotlangan. Bunday genlardan biri Myc. Turli CPEB oqsillarini ishlab chiqarish darajasi Myc shish paydo bo'lishiga olib keladi.[8] O'simta supressor geni TP53 shuningdek, CPE tomonidan tartibga solinishi ko'rsatilgan. CPEB ishlab chiqarmaydigan hujayra chiziqlari oqsilning past darajasini ko'rsatadi p53 va ko'rsatish o'rniga o'lmas bo'lib qoling qarilik.[9]

ECPE va C-CPE embrionlar tarkibida joylashgan yana ikkita sitoplazmatik poliadenilatsiya elementidir. Eng keng tarqalgan eCPE ketma-ketligi UUUUUUUUUUUUU bo'lib, C-CPE ketma-ketligi odatda vaqti-vaqti bilan U bilan juda C ga boy mintaqadir. Ushbu CPElarning barchasi umumiy (po) (A) dumining kengayishidagi samaradorligi ularning bog'liqligiga bog'liq. poly (A) signaliga yaqinlik.[1] Optimal ravishda ular 25 nukleotid ichida bo'lishi kerak, lekin poli (A) signalidan 100 nukleotidgacha bo'lishi mumkin.[10] Shu bilan bir qatorda, CPE ketma-ketligi repressiyani keltirib chiqarishi mumkin, agar ikkita CPE ketma-ketligi 3 'UTR ichida bir-biridan 50 nukleotid ichida joylashgan bo'lsa.[1] Repressiyaning eng yuqori miqdori ikkita CPE bir-biridan 10 dan 12 gacha nukleotid bo'lganida ko'rinadi. Agar CPE konsensussiz ketma-ketlikka ega bo'lsa, translyatsion faollashtirish natijasi bo'lishi uchun yaqin atrofdagi Pumilio-bog'lovchi element (PBE) zarur. Agar CPE konsensus ketma-ketligiga ega bo'lsa, PBE borligi natijada tarjima aktivatsiyasini ikki baravar oshirishi mumkin.[10] CPE alternativ poliadenilatsiya (APA) signallari, microRNA maqsadli uchastkalari va AUga boy elementlar (ARE) sifatida 3'UTR ishlov berishni tartibga soluvchi yagona cis ta'sir etuvchi element emas, shuningdek poli (A) dumining uzunligini aniqlashda rol o'ynaydi.[11]

Tadqiqot

CPE bo'yicha tadqiqotlar uning tarjimaviy tartibga solishdagi o'rni va rivojlanishdagi rolini yanada yoritishga qaratilgan. Aplysia neyronlari bo'yicha olib borilgan tadqiqotlar shuni ko'rsatdiki, CPE xotira shakllanishini boshqarishda muhim rol o'ynaydi. Uzoq muddatli xotiralar hosil bo'lganda, neyronal aktin mRNKlarida topilgan CPElar bu oqsilning yuqori regulyatsiyasiga imkon beradi. Aktin kontsentratsiyasining ortishi yangi sinapslarning o'sishiga imkon beradi, bu esa xotirani saqlashga imkon beradi.[12]

Drozofilada oogenez paytida mRNK regulyatsiyasi bo'yicha o'tkazilgan tadqiqot shuni ko'rsatdiki, CPE va CPE biriktiruvchi oqsillar rivojlanish jarayonida oqsillarni ishlab chiqarish vaqtini boshqarishga yordam beradi. Oositlar bir vaqtning o'zida mRNKning katta qismini transkripsiya qiladi va oqsil ishlab chiqarish vaqtini aniqlash uchun boshqa boshqarish mexanizmlariga tayanadi. Tadqiqot shuni ko'rsatdiki, CPEB WISP-ning maqsadi bo'lgan mRNAlar polyA dumining kengayishini ko'rsatmoqda, ammo mRNA transkriptlarining ko'paygan soni emas.[13]

Adabiyotlar

  1. ^ a b v d e Charlzort, Amanda; Meijer, Xedda A .; de Moor, Cornelia H. (2013-07-01). "Sitoplazmatik poliadenilatlanishning o'ziga xos omillari". Wiley fanlararo sharhlari: RNK. 4 (4): 437–461. doi:10.1002 / wrna.1171. ISSN  1757-7012. PMC  3736149. PMID  23776146.
  2. ^ a b Ivshina, Mariya; Lasko, Pol; Rixter, Joel D. (2014 yil 11 oktyabr). "Rivojlanish, sog'liq va kasallikdagi sitoplazmatik poliadenilatsiya elementini bog'laydigan oqsillar". Hujayra va rivojlanish biologiyasining yillik sharhi. 30 (1): 393–415. doi:10.1146 / annurev-cellbio-101011-155831. PMID  25068488.
  3. ^ Xant, Artur G.; Xu, Ruqian; Addepalli, Balasubrahmanyam; Rao, Suryadevara; Forbes, Kevin P.; Meeks, Liza R.; Sin, Denxuy; Mo, Min; Chhao, Hongwei (2008-01-01). "Arabidopsis mRNA poliadenilatsiya apparati: oqsil va oqsillarning o'zaro ta'sirini har tomonlama tahlil qilish va genlarning ekspression profilatsiyasi". BMC Genomics. 9: 220. doi:10.1186/1471-2164-9-220. ISSN  1471-2164. PMC  2391170. PMID  18479511.
  4. ^ de Moor, C.H .; Rixter, JD (1999). "Sitoplazmatik poliadenilatsiya vositasi B1 mRNA siklinini maskalash va maskalash vositasi". EMBO J. 18 (8): 2294–2303. doi:10.1093 / emboj / 18.8.2294. PMC  1171312. PMID  10205182.
  5. ^ Luitjens, C; Gallegos, M; Kreemer, B; Kimble, J; Vikens, M (2000). "CPEB oqsillari C. elegansdagi spermatogenezning ikkita asosiy bosqichini boshqaradi". Genlar Dev. 14 (20): 2596–609. doi:10.1101 / gad.831700. PMC  316992. PMID  11040214.
  6. ^ Villalba, Ana; Koll, Olga; Gebauer, Fatima (2011). "Sitoplazmatik poliadenilatsiya va tarjima nazorati". Genetika va rivojlanish sohasidagi dolzarb fikrlar. 21 (4): 452–457. doi:10.1016 / j.gde.2011.04.006. PMID  21536428.
  7. ^ Rutledge, Sharlot E.; Lau, Xo-Tak; Mangan, Hazel; Xardi, Linda L.; Sunnotel, Olaf; Guo, muxlis; MacNicol, Angus M.; Uolsh, Kolum P.; Lis-Merdok, Diane J. (2014-02-20). "Dnmt1-ning samarali tarjimasi sitoplazmik poliadenilatsiya va Musashining biriktiruvchi elementlarini talab qiladi". PLOS ONE. 9 (2): e88385. doi:10.1371 / journal.pone.0088385. ISSN  1932-6203. PMC  3930535. PMID  24586322.
  8. ^ Chen, Yun; Tsay, Ya-Xuy; Tseng, Sheng-Xong (2016-11-01). "Saraton kasalligini davolash uchun sitoplazmatik poliadenilatsiya elementi bilan bog'lovchi oqsillarni ifodalashni tartibga solish". Saratonga qarshi tadqiqotlar. 36 (11): 5673–5680. doi:10.21873 / anticanres.11150. ISSN  0250-7005. PMID  27793888.
  9. ^ Berns, Devid M.; Rixter, Joel D. (2008-12-15). "Insonning hujayrali yoshini, energiya almashinuvini va p53 mRNA tarjimasini CPEB tartibga solish". Genlar va rivojlanish. 22 (24): 3449–3460. doi:10.1101 / gad.1697808. ISSN  0890-9369. PMC  2607074. PMID  19141477.
  10. ^ a b Pike, Mariya; Lopes, Xose Manuel; Foissak, Silveyn; Gigo, Roderik; Mendez, Raul (2008). "CPE-vositachilik qilingan translyatsion nazorat uchun kombinator kod". Hujayra. 132 (3): 434–448. doi:10.1016 / j.cell.2007.12.038. PMID  18267074.
  11. ^ Chjan, Syaokan; Virtanen, Anders; Kleyman, Frida E. (2010-11-15). "Poliadenilat yoki dedenilatga". Hujayra aylanishi. 9 (22): 4437–4449. doi:10.4161 / cc.9.22.13887. ISSN  1538-4101. PMC  3048043. PMID  21084869.
  12. ^ Liu, Jinming; Shvarts, Jeyms H. (2003-01-03). "Aplyziya neyronlaridagi xabarchi RNKning bog'lovchi oqsil va poliadenilatsiyasining sitoplazmatik poliadenilatsiya elementi". Miya tadqiqotlari. 959 (1): 68–76. doi:10.1016 / s0006-8993 (02) 03729-0. ISSN  0006-8993. PMID  12480159.
  13. ^ Kyu, iyun; Sarteyn, Karolin V.; Pleys, Jeffri A.; Volfner, Mariana F. (2013-11-01). "Sitoplazmatik poliadenilatsiya - Drozofilada oogenez va tuxum faollashishi paytida asosiy mRNA regulyatori". Rivojlanish biologiyasi. 383 (1): 121–131. doi:10.1016 / j.ydbio.2013.08.013. PMC  3821703. PMID  23978535.