DDX5 - DDX5

DDX5
DEAD BOX 5.png
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarDDX5, G17P1, HLR1, HUMP68, p68, DEAD-box helikaz 5
Tashqi identifikatorlarOMIM: 180630 MGI: 105037 HomoloGene: 6797 Generkartalar: DDX5
Gen joylashuvi (odam)
17-xromosoma (odam)
Chr.17-xromosoma (odam)[1]
17-xromosoma (odam)
DDX5 uchun genomik joylashuv
DDX5 uchun genomik joylashuv
Band17q23.3Boshlang64,498,254 bp[1]
Oxiri64,508,199 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
Ps.Bng da PBB GE DDX5 200033

Ps.Bng da PBB GE DDX5 200034 s
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez
Ansambl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_004396
NM_001320595
NM_001320596
NM_001320597

NM_007840
NM_001355676
NM_001355677

RefSeq (oqsil)

NP_001307524
NP_001307525
NP_001307526
NP_004387

n / a

Joylashuv (UCSC)Chr 17: 64.5 - 64.51 MbChr 11: 106.78 - 106.79 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Ehtimol, ATPga bog'liq bo'lgan RNK helikaz DDX5 shuningdek, nomi bilan tanilgan O'lik quti oqsili 5 yoki RNK helikaz p68 bu ferment odamlarda kodlanganligi DDX5 gen.[5]

Funktsiya

O'lik quti konservalangan Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD) motifi bilan tavsiflangan oqsillar mantiqiydir RNK helikazlari. Ular RNK ikkilamchi tuzilishini o'zgartirishni o'z ichiga olgan bir qator hujayrali jarayonlarga, masalan, tarjimani boshlash, yadro va mitoxondriyali qo'shilish, ribosoma va splitsozomalar birikmalariga aloqador. Ularning tarqalish uslublariga asoslanib, ushbu oilaning ba'zi a'zolari embriogenez, spermatogenez,[6] va uyali o'sish va bo'linish. Ushbu gen RNKga bog'liq bo'lgan ATPaza bo'lgan O'LGAN quti oqsilini va shuningdek, simian virusi 40 ta o'simta antijeni bilan reaksiyaga kirishgan proliferatsiyaga bog'liq yadro antigenini kodlaydi. Ushbu gen 13 ekszondan iborat bo'lib, bir nechta intron ketma-ketlikni o'z ichiga olgan muqobil ravishda birlashtirilgan transkriptlar aniqlandi, ammo ushbu transkriptlar bilan kodlangan izoformalar aniqlanmadi.[5]


O'zaro aloqalar

DDX5 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan:

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000108654 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000020719 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ a b "Entrez Gen: DDX5 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) qutisi polipeptidi 5".
  6. ^ Legrand, JMD; Chan, AL; La, HM; Rossello, FJ; Enko, ML; Fuller-Pace, FV; Xobbs, RM (2019 yil 23-may). "DDX5 spermatogoniyani saqlash va ishlashida muhim transkripsiya va transkripsiyadan keyingi rol o'ynaydi". Tabiat aloqalari. 10 (1): 2278. doi:10.1038 / s41467-019-09972-7. PMID  31123254.
  7. ^ Akileswaran L, Taraska JW, Sayer JA, Gettemy JM, Coghlan VM (may 2001). "AKAP95 A-kinazga biriktirilgan oqsil yadro matritsasiga yo'naltirilgan va p68 RNK helikaz bilan bog'langan". J. Biol. Kimyoviy. 276 (20): 17448–54. doi:10.1074 / jbc.M101171200. PMID  11279182.
  8. ^ Ogilvie VC, Wilson BJ, Nicol SM, Morrice NA, Saunders LR, Barber GN, Fuller-Pace FV (mart 2003). "O'xshash o'lik quti RNK p68 va p72 helikazlari hujayralarda heterodimer sifatida mavjud". Nuklein kislotalari rez. 31 (5): 1470–80. doi:10.1093 / nar / gkg236. PMC  149829. PMID  12595555.
  9. ^ Uilson BJ, Giguere V (2007). "Oncomine metaanaliz orqali p68 va p72 RNK helikazlarining yangi yo'ldoshlarini aniqlash". BMC Genomics. 8: 419. doi:10.1186/1471-2164-8-419. PMC  3225811. PMID  18005418.
  10. ^ Endoh H, Maruyama K, Masuxiro Y, Kobayashi Y, Goto M, Tai H, Yanagisava J, Metzger D, Xashimoto S, Kato S (1999 yil avgust). "Inson estrogen retseptorlari a ning faollashishi uchun xos bo'lgan transkripsiya koaktivatori vazifasini bajaradigan p68 RNK Helicazani tozalash va aniqlash". Mol. Hujayra. Biol. 19 (8): 5363–72. doi:10.1128 / MCB.19.8.5363. PMC  84379. PMID  10409727.
  11. ^ Rossow KL, Janknecht R (yanvar 2003). "P68 RNK helikaza va CBP va p300 transkripsiya koaktivatorlari o'rtasidagi sinergizm". Onkogen. 22 (1): 151–6. doi:10.1038 / sj.onc.1206067. PMID  12527917.
  12. ^ Nicol SM, Causevic M, Preskott AR, Fuller-Pace FV (iyun 2000). "O'lik yadro qutisi RNK-helikaz p68 nukleolyar oqsil fibrillarin bilan o'zaro ta'sir qiladi va telofaza paytida yangi paydo bo'lgan nukleolalarda kokalizatsiyalanadi". Muddati Hujayra rez. 257 (2): 272–80. doi:10.1006 / excr.2000.4886. PMID  10837141.
  13. ^ Uilson BJ, Bates GJ, Nikol SM, Gregori DJ, Perkins ND, Fuller-Pace FV (2004 yil avgust). "P68 va p72 DEAD box RNK helikazlari HDAC1 bilan o'zaro ta'sir qiladi va transkripsiyani promouterga xos tarzda bosadi". BMC mol. Biol. 5: 11. doi:10.1186/1471-2199-5-11. PMC  514542. PMID  15298701.
  14. ^ a b v Vatanabe M, Yanagisawa J, Kitagava H, Takeyama K, Ogawa S, Arao Y, Suzava M, Kobayashi Y, Yano T, Yoshikava H, Masuhiro Y, Kato S (mart 2001). "RNK bilan bog'langan DEAD-quti oqsillarining subfamilasi RNK koaktivatori, SRA bilan N-terminal faollashuvi sohasi (AF-1) orqali estrogen retseptorlari a koaktivatori vazifasini bajaradi". EMBO J. 20 (6): 1341–52. doi:10.1093 / emboj / 20.6.1341. PMC  145523. PMID  11250900.
  15. ^ Bates GJ, Nicol SM, Wilson BJ, Jacobs AM, Bourdon JC, Wardrop J, Gregori DJ, Lane DP, Perkins ND, Fuller-Pace FV (2005 yil fevral). "O'LGAN quti oqsili p68: p53 o'simta supressorining yangi transkripsiyaviy koaktivatori". EMBO J. 24 (3): 543–53. doi:10.1038 / sj.emboj.7600550. PMC  548656. PMID  15660129.
  16. ^ Yao H, Brick K, Evrard Y, Xiao T, Camerini-Otero RD, Felsenfeld G (2010). "Dead-box RNK bilan bog'langan oqsil p68 va steroid retseptorlari RNK faollashtiruvchisi SRA tomonidan CTCF transkripsiyali izolyatsiyasining vositachiligi". Genlar Dev. 24 (22): 2543–2555. doi:10.1101 / gad.1967810. PMC  2975930. PMID  20966046.

Qo'shimcha o'qish