FASTKD5 - FASTKD5

FASTKD5
Identifikatorlar
Taxalluslar	FASTKD5, dJ1187M17.5, FAST kinaz domenlari 5
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 614272 MGI: 2139469 HomoloGene: 36400 Generkartalar: FASTKD5
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	20-xromosoma (odam)
Oxiri	3,159,865 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 2 (sichqoncha)
Oxiri	130,630,027 bp
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• protein kinaz faolligi; • rRNK bilan bog'lanish; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • RNK bilan bog'lanish;
Uyali komponent	• ribonukleoprotein granulasi; • mitoxondriyal nukleoid; • mitoxondriya;
Biologik jarayon	• uyali nafas olish; • oqsil fosforillanishi; • mRNKni qayta ishlash; • mitoxondriyali RNKni qayta ishlash;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	60493
	380601
	ENSG00000215251
	ENSMUSG00000079043
	Q7L8L6
	Q7TMV3
	NM_021826
	NM_001146084; NM_198176; NM_001377124; NM_001377125
	NP_068598
	NP_001139556; NP_937819; NP_001364053; NP_001364054
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

FAST kinaz domenini o'z ichiga olgan protein 5 (FASTKD5) bu a oqsil odamlarda kodlanganligi FASTKD5 gen 20-xromosomada.^[5]^[6] Ushbu protein FASTKD oilasining bir qismi bo'lib, uning energiya balansini tartibga solish bilan mashhur mitoxondriya stress ostida.^[7]^[8] FASTKD5, shuningdek, RNK granulalari uchun tRNAlar tomonidan yonma-yon bo'lmagan mRNKlarni qayta ishlash uchun kerak.^[9]

Tuzilishi

FASTKD5 FASTKD oilasining tarkibiy xususiyatlarini, shu jumladan mitoxondriyali aminokerminal maqsadli domenni va uchta C-terminali domenlar: ikkita FAST kinaza o'xshash domenlar (FAST_1 va FAST_2) va RNK bilan bog'langan domen (RAP).^[7]^[8] Mitokondriyali maqsadli domen FASTKD5 ni mitoxondriyaga import qilishga yo'naltiradi. C-terminal domenlarining funktsiyalari noma'lum bo'lsa ham, RAP trans-spliching paytida RNKni bog'laydi.^[7] Ushbu oqsil aniqlanmagan oqsillar bilan 103 kDa protein kompleksini hosil qiladi.^[9]

Funktsiya

FASTKD oilasining a'zosi sifatida, FASTKD5 energiya muvozanatini modulyatsiya qilish uchun mitoxondriyalarga joylashadi, ayniqsa stress sharoitida. FASTKD5 hamma to'qimalarda keng tarqalgan bo'lsa-da, skelet mushaklari, yurak mushaklari va mitoxondriyada boyitilgan boshqa to'qimalarda ko'proq ko'rinadi.^[7] FASTKD5 shuningdek tarkibida membranasiz jismlar bo'lgan RNK donachalarini lokalizatsiya qiladi mRNAlar va tegishli RNK bilan bog'langan oqsillar, bu erda transkripsiyadan keyin RNKni qayta ishlashni osonlashtiradi. Ushbu oqsil yonma-yon bo'lmagan kashshof mRNKlarning pishishi uchun zarurdir tRNKlar, va shuning uchun kanonik mRNA pishib etish yo'li bilan ishlov berilmaydi.^[9]

Klinik ahamiyati

FASTKD5 bilan bog'lanish xarakterli bo'lmagan bo'lsa-da, g'ayritabiiy RNK granulalarining to'planishi ba'zi bir narsalarga olib kelishi mumkin neyrodejenerativ kasalliklar.^[9]

O'zaro aloqalar

FASTKD5 ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan:

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000215251 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000079043 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ UniProt: Q7L8L6
^ "Entrez Gen: FAST kinaz domenlari 5".
^ ^a ^b ^v ^d Simarro M, Gimenez-Kassina A, Kedersha N, Lazaro JB, Adelmant GO, Marto JA, Ri K, Tisdeyl S, Danial N, Benarafa C, Orduña A, Anderson P (oktyabr 2010). "Tez kinaz domenini o'z ichiga olgan oqsil 3 - bu hujayra nafasi uchun zarur bo'lgan mitoxondriyal oqsil". Biokimyoviy va biofizik tadqiqotlari. 401 (3): 440–6. doi:10.1016 / j.bbrc.2010.09.075. PMC 2963690. PMID 20869947.
^ ^a ^b Yeung KT, Das S, Zhang J, Lomniczi A, Ojeda SR, Xu CF, Neubert TA, Samuels HH (iyun 2011). "FASTKD2 ni tartibga solish orqali ko'krak saratoni hujayralarining apoptozini tanlab modulyatsiya qiladigan yangi transkripsiya kompleksi". Molekulyar va uyali biologiya. 31 (11): 2287–98. doi:10.1128 / MCB.01381-10. PMC 3133243. PMID 21444724.
^ ^a ^b ^v ^d ^e ^f ^g Antonicka H, Shoubridge EA (Fevral 2015). "Mitokondriyal RNK granulalari posttranskripsiya qilingan RNKni qayta ishlash va ribosoma biogenezi markazlari". Hujayra hisobotlari. 10 (6): 920–932. doi:10.1016 / j.celrep.2015.01.030. PMID 25683715.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000215251 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000079043 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[uniprot-5] UniProt: Q7L8L6

[entrez-6] "Entrez Gen: FAST kinaz domenlari 5".

[pmid20869947-7] v ^d Simarro M, Gimenez-Kassina A, Kedersha N, Lazaro JB, Adelmant GO, Marto JA, Ri K, Tisdeyl S, Danial N, Benarafa C, Orduña A, Anderson P (oktyabr 2010). "Tez kinaz domenini o'z ichiga olgan oqsil 3 - bu hujayra nafasi uchun zarur bo'lgan mitoxondriyal oqsil". Biokimyoviy va biofizik tadqiqotlari. 401 (3): 440–6. doi:10.1016 / j.bbrc.2010.09.075. PMC 2963690. PMID 20869947.

[pmid21444724-8] Yeung KT, Das S, Zhang J, Lomniczi A, Ojeda SR, Xu CF, Neubert TA, Samuels HH (iyun 2011). "FASTKD2 ni tartibga solish orqali ko'krak saratoni hujayralarining apoptozini tanlab modulyatsiya qiladigan yangi transkripsiya kompleksi". Molekulyar va uyali biologiya. 31 (11): 2287–98. doi:10.1128 / MCB.01381-10. PMC 3133243. PMID 21444724.

[pmid25683715-9] v ^d ^e ^f ^g Antonicka H, Shoubridge EA (Fevral 2015). "Mitokondriyal RNK granulalari posttranskripsiya qilingan RNKni qayta ishlash va ribosoma biogenezi markazlari". Hujayra hisobotlari. 10 (6): 920–932. doi:10.1016 / j.celrep.2015.01.030. PMID 25683715.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]