GLIPR1 - GLIPR1

PDB 3q2r zanjir bilan bo'yalgan va old tomondan ko'rib chiqilgan.
GLIPR1
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarGLIPR1, CRISP7, GLIPR, RTVP1, GLI patogenezi bilan bog'liq 1
Tashqi identifikatorlarOMIM: 602692 MGI: 1920940 HomoloGene: 21357 Generkartalar: GLIPR1
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 12 (odam)
Chr.Xromosoma 12 (odam)[1]
Xromosoma 12 (odam)
GLIPR1 uchun genomik joylashuv
GLIPR1 uchun genomik joylashuv
Band12q21.2Boshlang75,480,753 bp[1]
Oxiri75,503,863 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
PBB GE GLIPR1 214085 x da fs.png

Ps.Bng da PBB GE GLIPR1 204222 s

PBB GE GLIPR1 204221 x da fs.png
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez

11010

73690

Ansambl

ENSG00000139278

ENSMUSG00000056888

UniProt

P48060

Q9CWG1

RefSeq (mRNA)

NM_006851

NM_028608

RefSeq (oqsil)

NP_006842

NP_082884

Joylashuv (UCSC)Chr 12: 75.48 - 75.5 MbChr 10: 111.99 - 112 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Glioma patogeneziga bog'liq oqsil 1 a oqsil odamlarda kodlanganligi GLIPR1 gen.[5][6][7]

Funktsiya

Ushbu gen oqsilni ikkalasiga o'xshashligi bilan kodlaydi patogenezga bog'liq oqsil (PR) superfamily va sisteinga boy sekretor oqsil (CRISP) oilasi.[7]

Kashfiyot

RTVP1 (GLIPR1) ning p53 maqsadli geni sifatida o'smani bostiruvchi funktsiyalari bilan topilganligi tadqiqotlarni genom miqyosida boshlashga undadi. ketma-ketlik gomologiyasi RTVP1 / GLIPR1 ga o'xshash (GLIPR1L) genlarni qidirish.[8] p53, o'smani bostiruvchi gen inson saratonida eng ko'p mutatsiyaga uchragan gen hisoblanadi.[8] P53 genidagi mutatsiya, masalan, uyali ishlamay qolishiga olib kelishi mumkin zararli o'sish va metsastatis.[9][10][11] Inson GLIPR1 dastlab odamda aniqlangan glioblastoma va GLIPR1 (glioma patogeneziga bog'liq oqsil 1) deb nomlangan[12] yoki RTVP1 (moyaklarga xos, vespid va patogenez oqsili 1 bilan bog'liq).[13] Bundan tashqari, u miyelomotsitik farqlanishning belgisi sifatida aniqlandi makrofag.[14] RTVP-1 klaster oqsillari (PR) superfamily va CRISP Family proteinlari a'zolari bilan muhim ketma-ketlikdagi homologiyani baham ko'radi.[8]

Tuzilishi

Oqsillar tarkibi: GLIPR1 ikkita izomerik shaklda, identifikator: P48060-1 va P48060-2, 266 (30,366 da) va 236 (26, 919 Da) aminokislotalarni kodlaydi.[15] [2] GLIPR1 oqsillari quyidagilarni o'z ichiga oladi domenlar:

• SCP: SCP ga o'xshash hujayradan tashqari oqsil sohasi • CAP: Sisteinga boy sekretor oqsillar oilasi

Ushbu transmembranali domenlar a ularni sutemizuvchilarning CAP oqsillariga xos qiladi va boshqa GLIPR1 izoformalarida mavjud emas.[16] CAP domeni 15 KDa tarkibida saqlanib qolgan sistin tarixan SCP deb nomlangan boy domen, NCBI cd00168 pr Pfam00188.[8][15]

Gen joylashuvi

GLIPR1L va Glipr1l genlari RTVP1 yaqinida 170 kb oralig'ida joylashgan, odamda u 12q21 xromosomada va xromosoma Sichqonchada 10D1 (1A va 1B-rasmlar).[8] Insonda GLIPR1 geni 71500001-75700000 tayanch juftligidan 12-xromosomaning uzun (q) qo'lida joylashgan (GRCh37 / hg19 tuzish)(xarita)[17]

Gen ifodasi

GlIPR1 yuqori mRNK bilan yuqori darajada to'qimalarga xos bo'lib, GLIPR1L1 ekspressioni moyaklarda juda yuqori mRNA darajasiga ega, ammo siydik pufagida ozgina izlar, so'ngra prostata, buyrak, o'pka va suyak iligida aniqlanmaydi.[8] GLIPR1L2 ifodasi GLIPR1L1 ga o'xshash edi.[8]

Klinik ahamiyati

Tadqiqot shuni ko'rsatdiki, GLIPR1 ekspressioni prostata saratoni to'qimalarida yuqori darajada metillangan bo'lib, normal prostata to'qimalariga nisbatan GLIPR1 ekspression darajasi pasaygan. Shunday qilib, GLIPR1 o'simtani bostiruvchi vazifasini bajarishi taklif qilingan epigenetik prostata saratonida inaktivatsiya.[18][15]GLIPR1-ning ushbu noyob xususiyati boshqarish uchun samarali bo'lishi mumkin xavfli kasalliklar.[19] Klinikadan oldingi tadqiqotlar AdGLIPR1ni prostata saratoniga to'g'ridan-to'g'ri AOK yordamida yuborilganda o'smaning o'sishini sezilarli darajada bostiradi. immunokompetent ortotopik sichqoncha modeli.[19]

O'simliklarni himoya qilish mexanizmi bilan gomologiya

GLIPR1 o'simliklarni himoya qilish mexanizmida muhim ahamiyatga ega bo'lgan pomidor patogenezi bilan bog'liq bo'lgan (PR) oqsil P14a bilan 35% aminokislotalar ketma-ketligini aniqlaydi.[20] Ushbu ikkita oqsilni taqqoslash GliPR raqamida His-69, Glu-88, Glu-110 va His-127 aminokislota qoldiqlarining to'rtta aminokislota qoldig'ining keng tarqalgan qisman erituvchi ta'siridagi fazoviy klasterini aniqlashga olib keladi. inson immuniteti va o'simliklarni himoya qilish tizimi o'rtasida funktsional bog'lanishni ta'minlaydigan GliPR va PR-1 oqsillari uchun sayt.[20]

Saraton turlari / SNP pozitsiyalari

Saraton turi va saraton turiga ta'sir ko'rsatadigan pozitsiyalar sonining va aminokislota ketma-ketligida postiitonning grafik tasviri havolada keltirilgan.[3]

Saraton turlari soni va aminokislota ketma-ketligidagi holat
Saraton turlariga va saraton turlariga ta'sir ko'rsatadigan pozitsiyalar soni

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000139278 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000056888 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ Murphy EV, Zhang Y, Zhu V, Biggs J (iyun 1995). "Inson glioma patogenezi bilan bog'liq oqsil tizimli ravishda o'simlik patogeneziga bog'liq oqsillar bilan bog'liq va uning geni miya shishi tarkibida aniq ifoda etilgan". Gen. 159 (1): 131–5. doi:10.1016 / 0378-1119 (95) 00061-A. PMID  7607567.
  6. ^ Rich T, Chen P, Furman F, Huynh N, Isroil MA (Noyabr 1996). "RTVP-1, turli xil genlar bilan ketma-ket o'xshashliklarga ega bo'lgan insonning yangi geni, glial emas, balki neyron kelib chiqishi bo'lgan o'simta hujayralari chiziqlarida ifodalanadi". Gen. 180 (1–2): 125–30. doi:10.1016 / S0378-1119 (96) 00431-3. PMID  8973356.
  7. ^ a b "Entrez Gen: GLIPR1 GLI patogeneziga bog'liq 1 (glioma)".
  8. ^ a b v d e f g Ren S, Ren CH, Li L, Goltsov AA, Tompson TC (avgust 2006). "RTVP1 / GLIPR1 ga o'xshash genlarni aniqlash, tavsifi, yangi p53 maqsadli gen klasteri". Genomika. 88 (2): 163–72. doi:10.1016 / j.ygeno.2006.03.021. PMID  16714093.
  9. ^ Hollshteyn M, Sidranskiy D, Vogelshteyn B, Xarris CC (iyul 1991). "inson saratonidagi p53 mutatsiyalar". Ilm-fan. 253 (5015): 49–53. Bibcode:1991Sci ... 253 ... 49H. doi:10.1126 / science.1905840. PMID  1905840.
  10. ^ Stapleton AM, Timme TL, Gousse AE, Li QF, Tobon AA, Kattan MW, Slawin KM, Wheeler TM, Scardino PT, Thompson TC (Avgust 1997). "P53 mutatsiyasini saqlaydigan prostata saratonining birlamchi odam hujayralari metastazlarda klonal ravishda kengayadi". Klinik saraton tadqiqotlari. 3 (8): 1389–97. PMID  9815823.
  11. ^ Tompson TC, Park SH, Timme TL, Ren C, Eastham JA, Donehower LA, Bredli A, Kadmon D, Yang G (mart 1995). "P53 funktsiyasini yo'qotish ras + myc tomonidan boshlangan sichqon prostata saratoni metastaziga olib keladi". Onkogen. 10 (5): 869–79. PMID  7534899.
  12. ^ Murphy EV, Zhang Y, Zhu V, Biggs J (iyun 1995). "Inson glioma patogenezi bilan bog'liq oqsil tizimli ravishda o'simlik patogeneziga bog'liq oqsillar bilan bog'liq va uning geni miya shishi tarkibida aniq ifoda etilgan". Gen. 159 (1): 131–5. doi:10.1016 / 0378-1119 (95) 00061-a. PMID  7607567.
  13. ^ Rich T, Chen P, Furman F, Huynh N, Isroil MA (Noyabr 1996). "RTVP-1, turli xil genlar bilan ketma-ket o'xshashliklarga ega bo'lgan insonning yangi geni, glial emas, balki neyron kelib chiqishi bo'lgan o'simta hujayralari chiziqlarida ifodalanadi". Gen. 180 (1–2): 125–30. doi:10.1016 / s0378-1119 (96) 00431-3. PMID  8973356.
  14. ^ Gingras MC, Margolin JF (yanvar 2000). "Supressiv subtraktiv duragaylash orqali aniqlangan U937 hujayrasi va makrofaglar differentsiatsiyasi paytida kutilmagan genlarning differentsial ifodasi". Eksperimental gematologiya. 28 (1): 65–76. doi:10.1016 / s0301-472x (99) 00126-5. PMID  10658678.
  15. ^ a b v Gibbs GM, Roelants K, O'Bryan MK (dekabr 2008). "CAP superfamilasi: sisteinga boy sekretor oqsillar, antigen 5 va patogenezga bog'liq 1 ta oqsil - ko'payish, saraton va immunitetni himoya qilishdagi rollari". Endokrin sharhlar. 29 (7): 865–97. doi:10.1210 / er.2008-0032. PMID  18824526.
  16. ^ Asojo OA, Koski RA, Bonafé N (oktyabr 2011). "Inson glioma patogenezi bilan bog'liq oqsil 1 ning tarkibiy tadqiqotlari". Acta Crystallographica bo'limi D. 67 (Pt 10): 847-55. doi:10.1107 / S0907444911028198. PMC  3176621. PMID  21931216.
  17. ^ Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi [1]
  18. ^ Ren C, Li L, Yang G, Timme TL, Goltsov A, Ren C, Ji X, Addai J, Luo H, Ittmann MM, Tompson TK (2004 yil fevral). "RTVP-1, prostata bezi saratonida metilasyon natijasida inaktivatsiya qilingan o'simta supressori". Saraton kasalligini o'rganish. 64 (3): 969–76. doi:10.1158 / 0008-5472. mumkin-03-2592. PMID  14871827.
  19. ^ a b Tompson TK (iyul 2010). "Glioma patogeneziga bog'liq oqsil 1: o'simta-supressor faoliyati va terapevtik salohiyati". Yonsei tibbiy jurnali. 51 (4): 479–83. doi:10.3349 / ymj.2010.51.4.479. PMC  2880257. PMID  20499410.
  20. ^ a b Szyperski T, Fernández C, Mumenthaler C, Vyutrix K (mart 1998). "Insonning glioma patogenezi bilan bog'liq oqsil GliPR va o'simliklarning patogeneziga bog'liq P14a oqsillarini tuzilishini taqqoslash inson immuniteti va o'simliklarni himoya qilish tizimi o'rtasidagi funktsional aloqani ko'rsatadi". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 95 (5): 2262–6. Bibcode:1998 yil PNAS ... 95.2262S. doi:10.1073 / pnas.95.5.2262. PMC  19313. PMID  9482873.

Qo'shimcha o'qish