Genetiplar - Genetypes - Wikipedia
Genetiplar har qanday ta'rif berish uchun 2010 yilda taklif qilingan taksonomik tushunchadir genetik ketma-ketliklar dan namunalar.[1][2] Ushbu nomenklatura birlashtiriladi molekulyar sistematikasi va ishlatilgan atamalar biologik taksonomiya. Ushbu nomenklatura turdagi namunalardan olingan genetik ketma-ketliklarni belgilash yoki belgilash uchun mo'ljallangan. Genetiplar nomenklaturasi a dan kelib chiqadigan genetik ketma-ketlikni taklif qiladi holotip "hologenetype" ("holotip" va "genetip" dan) deb nomlanishi kerak, topotipdan ketma-ketliklar "topogenetip" va boshqalar bo'lishi kerak. Bundan tashqari, genetik marker Amaldagi (lar) nomenklaturaga kiritilishi kerak (masalan, paragenetype ND2).
Genetiplar nomenklaturasi tizimi "oltin standart" ketma-ketliklarni belgilash uchun ishlatilishi mumkin edi, bu ularning namunalari bilan bevosita aloqasi tufayli turlarni identifikatsiyalash muammoli bo'lishi mumkin bo'lgan standart ketma-ketliklarga qaraganda ancha ishonchli bo'ladi. Noto'g'ri identifikatsiyalash ko'plab ketma-ketliklarga duch kelmoqda GenBank[iqtibos kerak ] namunalar bilan bog'langan ba'zi bir ketma-ketliklarga ega bo'lish noto'g'ri aniqlashni topish va boshqarish va taqqoslash uchun ijobiy aniqlangan "oltin standart" ketma-ketliklarini yaratishga yordam beradi. Ushbu nomenklaturadan tipdagi namunalardan ketma-ketlikni namoyish qiluvchi yoki muhokama qiladigan nashrlarda va ma'lumotlar bazalarida foydalanish tavsiya etiladi.[3][2]
Genetiplarning namunalariga quyidagilar kiradi:
- Leptoderma makrofitalum mitogenom gogenetipi - AP011500 [4]
- Mileringa bruksi Paragenetype COI - HM590595[5]
- Mililyera bruksi paragenetype NDI - HM590607[5]
Genetiplar kontseptsiyasini GenSeq kontseptsiyasi, 2013 yilda tadqiqotchilar orasida genetiplar teng bo'lgan ba'zi chalkashliklar tufayli taklif qilingan ism qo'yadigan turlari.[6][tushuntirish kerak ]
Shuningdek qarang
Adabiyotlar
- ^ Chakrabarti, Prosanta (2010). "Genetiplar: molekulyar sistematikani va an'anaviy taksonomiyani birlashtirishga yordam beradigan tushuncha" (PDF). Zootaxa. 2632: 67–68.
- ^ a b Harrison, I. J .; Chakrabarti, P .; Freyhof, J .; Kreyg, J. F. (2011 yil may). "To'g'ri nomenklatura va voucher materiallari va genetik ketma-ketlikni saqlash va kataloglashtirish bo'yicha tavsiyalar". Baliq biologiyasi jurnali. 78 (5): 1283–1290. doi:10.1111 / j.1095-8649.2011.02979.x. PMID 21539541.
- ^ "Mualliflarga JFB ko'rsatmasi". Baliq biologiyasi jurnali.[doimiy o'lik havola ]
- ^ Byrkjedal, Ingvar; Yan Yde Poulsen; Jon Galbrayt (2011). "Leptoderma makrofitalami n.sp., O'rta Atlantika tizmasidan silliq boshli yangi tur (Otocephala: Alepocephalidae) " (PDF). Zootaxa. 2876: 49–56.
- ^ a b Chakrabarti, Prosanta (2010). "Milyeringidae (Teleostei: Gobiiformes) ning holati va filogeniyasi, Avstraliyadan kelgan yangi ko'r-g'or-baliq ta'rifi bilan, Mililyera bruksi, n. sp " (PDF). Zootaxa. 2557: 19–28.
- ^ Chakrabarti, Prosanta; Uorren, Melani; Sahifa, Lourens; Bolduin, Kerol (2013). "GenSeq: yangilangan nomenklatura va tur va turdagi manbalardan olingan genetik ketma-ketliklar reytingi". Hayvonot bog'i tugmachalari (346): 29–41. doi:10.3897 / zookeys.346.5753. PMC 3821064. PMID 24223486.