Okeandan namunalar olish bo'yicha global ekspeditsiya - Global Ocean Sampling Expedition
The Okeandan namunalar olish bo'yicha global ekspeditsiya (GOS) - bu okeanni o'rganish genom loyihasi kimning maqsadi baholash genetik xilma-xillik yilda dengiz mikroblari jamoalari va ularning tabiatning asosiy jarayonlaridagi rolini tushunish. Bu boshlandi Sargasso dengizi 2003 yil avgust oyida namunaviy loyihalarni sinovdan o'tkazish loyihasi; Kreyg Venter to'liq ekspeditsiyani 2004 yil 4 martda e'lon qildi.[iqtibos kerak ] Kreyg Venterning shaxsiy yaxtasidan foydalangan ikki yillik sayohat kelib chiqqan Galifaks, Kanada, aylanib chiqdi 2006 yil yanvar oyida dunyoda va AQShda tugatilgan. Ekspeditsiya suvdan namuna oldi Galifaks, Yangi Shotlandiya Sharqiy tropikka tinch okeani. 2007 yil davomida namuna olish Shimoliy Amerikaning g'arbiy qirg'og'i bo'ylab davom etdi.
Ma'lumotlarni tahlil qilish
GOS ma'lumotlar to'plamlari ikkalasiga ham taqdim etildi NCBI[1] va Ilg'or dengiz mikroblari ekologiyasini tadqiq qilish va tahlil qilish uchun jamoat kiberinfrastrukturasi (CAMERA), dengiz uchun yangi onlayn-resurs metagenomika tomonidan moliyalashtiriladi Gordon va Betti Mur jamg'armasi tomonidan ishlab chiqilgan JCVI va mezbon San-Diego UC ning bo'limi Kaliforniya telekommunikatsiya va axborot texnologiyalari instituti (Kalit2). CAMERA asboblar to'plami JCVI tomonidan ishlab chiqilgan va GOS ma'lumotlar to'plamlarining dastlabki nashrida ishlatiladigan vositalarni aks ettiradi.
Moliyalashtirish
Sehrgar II harakati quyidagi mablag 'bilan moliyalashtirildi:
- The Gordon va Betti Mur jamg'armasi (ketma-ketlik va tahlil)[2]
- The Amerika Qo'shma Shtatlari Energetika vazirligi, Ilmiy bo'lim (ketma-ketlik va tahlil)[2]
- The J. Kreyg Venter instituti (kemaning ishlashi)[2]
- Mur Foundation Foundation etti yillik 24,5 million dollar, grant (KAMERA )[2]
Kema
| Tarix | |
|---|---|
| Ism: | Sehrgar II |
| Quruvchi: | Kukson |
| Ishga tushirildi: | 1998 |
| Shiori: | – |
| Umumiy xususiyatlar | |
| Uzunlik: | 28.95 m (95.0 fut) |
| Nur: | 7.08 m (23.2 fut) |
| Qoralama: | 2.84 m (9 fut 4 dyuym) |
| Harakatlanish: | Bittasi Cummins 300 ot kuchi |
Sehrgar II, 95 fut bema'ni, genetik ketma-ketlik va kataloglashtirish uchun dengiz suvidagi mikroblarning namunalarini yig'adigan o'rta kengliklarda Yer sharini aylanib chiqadigan 2 yillik ilmiy ekspeditsiyani yakunladi. U nafaqat dunyo bo'ylab sayohat yaxtasi, balki ekvatorial issiqlik va namlikdan 60-70 daraja kenglikgacha bo'lgan kengliklarda ishlov berishga qodir bo'lgan odam sifatida ishlab chiqilgan. SORCERER II konstruktsiyasi kevlar va E shisha laminatlari, epoksi biriktiruvchi va puxta tanlangan yadro materiallari bilan ishlash uchun engil, ammo juda kuchli.
Kema tomonidan ishlab chiqilgan Nemis Frers va 2400 litr (630 AQSh gal) suv tashiydi.
Nashrlar
Quyidagi ro'yxat loyihaning rasmiy nashrlari va J. Kreyg Venter instituti.
- Venter, JK; Remington, K; Heidelberg, JF; Halpern, AL; Rusch, D; Eyzen, JA; Vu, D; Polsen, men; va boshq. (2004 yil 2 aprel). "Sargasso dengizining atrof-muhit genomini o'qotar qurol bilan ketma-ketligi". Ilm-fan. Nyu-York, Nyu-York: Amerika ilm-fanni rivojlantirish bo'yicha assotsiatsiyasi. 304 (5667): 66–74. Bibcode:2004Sci ... 304 ... 66V. doi:10.1126 / science.1093857. ISSN 0193-4511. PMID 15001713.
- Yooseph, S; Satton, G; Rusch, JB; Halpern, AL; Uilyamson, SJ; Remington, K; Eyzen, JA; Heidelberg, KB; va boshq. (2007 yil 13 mart). "Sehrgar II global okeandan namuna olish ekspeditsiyasi: oqsilli oilalar olamini kengaytirish". PLoS biologiyasi. AQSH: Ilmiy jamoat kutubxonasi. 5 (3): e16. doi:10.1371 / journal.pbio.0050016. ISSN 1544-9173. PMC 1821046. PMID 17355171.
- Kannan, N; Teylor, SS; Zhai, Y; Venter, JK; Manning, G (2007 yil 13 mart). "Mikrobial kinomning tarkibiy va funktsional xilma-xilligi". PLoS biologiyasi. AQSH: Ilmiy jamoat kutubxonasi. 5 (3): e17. doi:10.1371 / journal.pbio.0050017. ISSN 1544-9173. PMC 1821047. PMID 17355172.
- Rusch, JB; Halpern, AL; Satton, G; Heidelberg, KB; Uilyamson, S; Yooseph, S; Vu, D; Eyzen, JA; va boshq. (2007 yil 13 mart). "Sehrgar II global okeandan namuna olish ekspeditsiyasi: Shimoliy G'arbiy Atlantika, Sharqiy Tropik Tinch okeani orqali". PLoS biologiyasi. AQSH: Ilmiy jamoat kutubxonasi. 5 (3): e77. doi:10.1371 / journal.pbio.0050077. ISSN 1544-9173. PMC 1821060. PMID 17355176.
- Yutin, N; Suzuki, MT; Tishlash, H; Weber, M; Venter, JK; Rusch, JB; Beja, O (2007 yil 1-iyun). "Global Ocean Sampling ekspeditsiyasi metagenomlaridan foydalangan holda Atlantika va Tinch okeanlarining er usti suvlaridagi aerob anoksigenik fototrofik bakteriyalarning xilma-xilligi va biogeografiyasini baholash". Atrof-muhit mikrobiologiyasi. Angliya: Blackwell Science. 9 (6): 1464–75. doi:10.1111 / j.1462-2920.2007.01265.x. ISSN 1462-2912. PMID 17504484.
- Sharon, men; Tzahor, S; Uilyamson, S; Shmoish, M; Man-Aharonovich, D; Rusch, JB; Yooseph, S; Zeydner, G; va boshq. (2007 yil 1 oktyabr). ": Virusli fotosintetik reaktsiya markazining genlari va dengiz muhitidagi transkriptlari". ISME jurnali. Angliya: Tabiatni nashr etish guruhi. 1 (6): 492–501. doi:10.1038 / ismej.2007.67. ISSN 1751-7362. PMID 18043651.
- Uilyamson, SJ; Rusch, JB; Yooseph, S; Halpern, AL; Heidelberg, KB; Shisha, JI; Endryus-Pfannkoch, C; Fadrosh, D; va boshq. (2008 yil 23-yanvar). Xoll, Nil (tahrir). "Sehrgar II global ummondan namuna olish ekspeditsiyasi: suv mikroblarining namunalarida viruslarning metagenomik xarakteristikasi". PLOS ONE. AQSH: Ilmiy jamoat kutubxonasi. 3 (1): e1456. Bibcode:2008PLoSO ... 3.1456W. doi:10.1371 / journal.pone.0001456. ISSN 1932-6203. PMC 2186209. PMID 18213365.
- Shou, AK; Halpern, AL; Beeson, K; Tran, B; Venter, JK; Martiny, JBH (2008 yil 10 sentyabr). "Bularning barchasi nisbiy: suvdagi bakterial jamoalarning xilma-xilligi reytingi". Atrof-muhit mikrobiologiyasi. Angliya: Blackwell Science. 10 (9): 2200–10. doi:10.1111 / j.1462-2920.2008.01626.x. ISSN 1462-2912. PMID 18637951.
Shuningdek qarang
Izohlar
- ^ J. Kreyg Venter institutida Global Okean namunalari ekspeditsiyasi loyihasi, ID ID 13694, Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, veb-saytga 2007 yil 17-martda kirilgan
- ^ a b v d Olti milliondan ortiq yangi genlar, minglab yangi oqsilli oilalar va sehrgarning ikkinchi bosqichidan topilgan mikroblar xilma-xilligining ajoyib darajasi II Jahon okeanidan namuna olish ekspeditsiyasi, 2007 yil 13 mart, Press-reliz, J. Kreyg Venter instituti
