HMG20B - HMG20B

HMG20B
Mavjud tuzilmalar
PDB	Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	2CRJ
Identifikatorlar
Taxalluslar	HMG20B, BRAF25, BRAF35, HMGX2, HMGXB2, PP7706, SMARCE1r, SOXL, pp8857, yuqori harakatlanish guruhi 20B
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 605535 MGI: 1341190 HomoloGene: 74949 Generkartalar: HMG20B
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 19 (odam)
Oxiri	3,579,088 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 10 (sichqoncha)
Oxiri	81,350,480 bp
RNK ekspressioni naqsh
	; ;
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• oqsillarni heterodimerizatsiya qilish faoliyati; • DNK bilan bog'lanish; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • giston deatsetilaza faolligi; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 DNK bilan bog'laydigan transkripsiya omilining faolligi, RNK polimeraza II ga xos;
Uyali komponent	• hujayra yadrosi; • nukleoplazma; • xromosoma; • yadro tanasi;
Biologik jarayon	• skelet mushaklari hujayralarining farqlanishi; • hujayra aylanishi; • oqsil sumoylanishining salbiy regulyatsiyasi; • qon koagulyatsiyasi; • transkripsiyani tartibga solish, DNK-andozalari; • neyronlarning farqlanishini ijobiy tartibga solish; • transkripsiya, DNK-andozali; • giston deatsetilatsiyasi; • xromatin moddasi; • RNK polimeraza II promotoridan transkripsiyani tartibga solish;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	10362
	15353
	ENSG00000064961
	ENSMUSG00000020232
	Q9P0W2
	Q9Z104
	NM_006339
	NM_001163165; NM_001163166; NM_010440
	NP_006330
	NP_001156637; NP_001156638; NP_034570
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

SWI / SNF bilan bog'liq matritsa bilan bog'liq aktringa bog'liq bo'lgan xromatin subfamily E a'zosi 1 ga tegishli regulyator a oqsil odamlarda kodlanganligi HMG20B gen.^[5]^[6]

O'zaro aloqalar

HMG20B ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan:

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000064961 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000020232 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Sumoy L, Karim L, Escarceller M, Nadal M, Gratacs M, Pujana MA, Estivill X, Peral B (iyun 2000). "HMG20A va HMG20B insonning 15q24 va 19p13.3 xromosomalari xaritasida joylashtirilgan va hamma joyda ifodalangan HMG-box genlarining alohida sinfini tashkil qiladi". Sitogenetika va hujayra genetikasi. 88 (1–2): 62–7. doi:10.1159/000015486. PMID 10773667. S2CID 22921110.
^ "Entrez Gen: HMG20B yuqori harakatchanlik guruhi 20B".
^ ^a ^b ^v ^d ^e Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J, Lane WS, Mandel G, Shiekhattar R (may 2002). "Giston deatsetilaza o'z ichiga olgan yadro-BRAF35 kompleksi neyronlarga xos genlarning repressiyasida vositachilik qiladi". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 99 (11): 7420–5. doi:10.1073 / pnas.112008599. PMC 124246. PMID 12032298.
^ Marmorshteyn LY, Kinev AV, Chan GK, Bochar DA, Beniya H, Epstein JA, Yen TJ, Shiekattar R (yanvar 2001). "DNKni biriktiruvchi tarkibiy qismini o'z ichiga olgan insonning BRCA2 kompleksi hujayra tsiklining rivojlanishiga ta'sir qiladi". Hujayra. 104 (2): 247–57. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00209-4. PMID 11207365. S2CID 5822368.
^ Hakimi MA, Dong Y, Leyn WS, Speicher DW, Shiekhattar R (fevral 2003). "X-ga bog'liq bo'lgan aqliy zaiflik geni - bu histon deatsetilaza o'z ichiga olgan komplekslarning yangi oilasining tarkibiy qismi". Biologik kimyo jurnali. 278 (9): 7234–9. doi:10.1074 / jbc.M208992200. PMID 12493763.
^ Li YM, Kim V (sentyabr 2003). "BRCA2 bilan bog'liq omil 35 bilan inson kinesin superfamily oqsil a'zosi 4 assotsiatsiyasi". Biokimyoviy jurnal. 374 (Pt 2): 497-503. doi:10.1042 / BJ20030452. PMC 1223617. PMID 12809554.
^ Iwase S, Januma A, Miyamoto K, Shono N, Honda A, Yanagisawa J, Baba T (sentyabr 2004). "BRAF-HDAC kompleksidagi BHC80 ning xarakteristikasi, neyronlarga xos gen repressiyasida ishtirok etadi". Biokimyoviy va biofizik tadqiqotlari. 322 (2): 601–8. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.07.163. PMID 15325272.

Qo'shimcha o'qish

Wattler F, Wattler S, Kelly M, Skinner HB, Nehls M (sentyabr 1999). "Yuqori harakatchan 365 guruhli genlar oilasining yangi a'zosi Smarce1 bilan bog'liq murinni klonlash, xromosoma joylashuvi va ekspression tahlili". Genomika. 60 (2): 172–8. doi:10.1006 / geno.1999.5913. PMID 10486208.
Marmorshteyn LY, Kinev AV, Chan GK, Bochar DA, Beniya H, Epstein JA, Yen TJ, Shiekattar R (yanvar 2001). "DNKni biriktiruvchi tarkibiy qismini o'z ichiga olgan insonning BRCA2 kompleksi hujayra tsiklining rivojlanishiga ta'sir qiladi". Hujayra. 104 (2): 247–57. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00209-4. PMID 11207365. S2CID 5822368.
Li YM, Shin H, Choi V, Ahn S, Kim V (aprel 2002). "Odamning SMARCE1r yuqori harakatchanlik guruhi oqsilining xarakteristikasi". Biochimica et Biofhysica Acta (BBA) - Genlarning tuzilishi va ifodasi. 1574 (3): 269–76. doi:10.1016 / s0167-4781 (01) 00373-6. PMID 11997092.
Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J, Lane WS, Mandel G, Shiekhattar R (may 2002). "Giston deatsetilaza o'z ichiga olgan yadro-BRAF35 kompleksi neyronlarga xos genlarning repressiyasida vositachilik qiladi". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 99 (11): 7420–5. doi:10.1073 / pnas.112008599. PMC 124246. PMID 12032298.
Vang S, Makkarti IM, Balazs L, Li Y, Shtayner MS (iyul 2002). "BRCA2 bilan bog'liq 35-faktorning muqobil ravishda qo'shilgan oqsilini kodlovchi cDNA-ni klonlash". Biokimyoviy va biofizik tadqiqotlari. 295 (1): 129–35. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 00624-1. PMID 12083779.
Vang S, Makkarti IM, Balazs L, Li Y, Shtayner MS (iyul 2002). "BRAF25 ni prostata bezining o'smasi va saraton namunalarida immunohistologik aniqlash". Biokimyoviy va biofizik tadqiqotlari. 295 (1): 136–41. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 00625-3. PMID 12083780.
Hakimi MA, Dong Y, Leyn WS, Speicher DW, Shiekhattar R (fevral 2003). "X-ga bog'liq bo'lgan aqliy zaiflik geni - bu histon deatsetilaza o'z ichiga olgan komplekslarning yangi oilasining tarkibiy qismi". Biologik kimyo jurnali. 278 (9): 7234–9. doi:10.1074 / jbc.M208992200. PMID 12493763.
Li YM, Kim V (sentyabr 2003). "BRCA2 bilan bog'liq omil 35 bilan inson kinesin superfamily oqsil a'zosi 4 assotsiatsiyasi". Biokimyoviy jurnal. 374 (Pt 2): 497-503. doi:10.1042 / BJ20030452. PMC 1223617. PMID 12809554.
Iwase S, Januma A, Miyamoto K, Shono N, Honda A, Yanagisawa J, Baba T (sentyabr 2004). "BRAF-HDAC kompleksidagi BHC80 ning xarakteristikasi, neyronlarga xos gen repressiyasida ishtirok etadi". Biokimyoviy va biofizik tadqiqotlari. 322 (2): 601–8. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.07.163. PMID 15325272.
Rual JF, Venkatesan K, Xao T, Xirozane-Kishikava T, Drikot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Gedehoussou N, Klitgord N, Saymon S, Boxem M, Milshteyn S, Rozenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Vong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Ducette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (oktyabr 2005). "Odamning oqsil va oqsil bilan o'zaro aloqasi tarmog'ining proteom miqyosli xaritasi tomon". Tabiat. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Tashqi havolalar

HMG20B Inson genlarining joylashuvi UCSC Genome brauzeri.
HMG20B Inson geni tafsilotlari UCSC Genome brauzeri.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 19 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000064961 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000020232 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid10773667-5] Sumoy L, Karim L, Escarceller M, Nadal M, Gratacs M, Pujana MA, Estivill X, Peral B (iyun 2000). "HMG20A va HMG20B insonning 15q24 va 19p13.3 xromosomalari xaritasida joylashtirilgan va hamma joyda ifodalangan HMG-box genlarining alohida sinfini tashkil qiladi". Sitogenetika va hujayra genetikasi. 88 (1–2): 62–7. doi:10.1159/000015486. PMID 10773667. S2CID 22921110.

[entrez-6] "Entrez Gen: HMG20B yuqori harakatchanlik guruhi 20B".

[pmid12032298-7] v ^d ^e Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J, Lane WS, Mandel G, Shiekhattar R (may 2002). "Giston deatsetilaza o'z ichiga olgan yadro-BRAF35 kompleksi neyronlarga xos genlarning repressiyasida vositachilik qiladi". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 99 (11): 7420–5. doi:10.1073 / pnas.112008599. PMC 124246. PMID 12032298.

[pmid11207365-8] Marmorshteyn LY, Kinev AV, Chan GK, Bochar DA, Beniya H, Epstein JA, Yen TJ, Shiekattar R (yanvar 2001). "DNKni biriktiruvchi tarkibiy qismini o'z ichiga olgan insonning BRCA2 kompleksi hujayra tsiklining rivojlanishiga ta'sir qiladi". Hujayra. 104 (2): 247–57. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00209-4. PMID 11207365. S2CID 5822368.

[pmid12493763-9] Hakimi MA, Dong Y, Leyn WS, Speicher DW, Shiekhattar R (fevral 2003). "X-ga bog'liq bo'lgan aqliy zaiflik geni - bu histon deatsetilaza o'z ichiga olgan komplekslarning yangi oilasining tarkibiy qismi". Biologik kimyo jurnali. 278 (9): 7234–9. doi:10.1074 / jbc.M208992200. PMID 12493763.

[pmid12809554-10] Li YM, Kim V (sentyabr 2003). "BRCA2 bilan bog'liq omil 35 bilan inson kinesin superfamily oqsil a'zosi 4 assotsiatsiyasi". Biokimyoviy jurnal. 374 (Pt 2): 497-503. doi:10.1042 / BJ20030452. PMC 1223617. PMID 12809554.

[pmid15325272-11] Iwase S, Januma A, Miyamoto K, Shono N, Honda A, Yanagisawa J, Baba T (sentyabr 2004). "BRAF-HDAC kompleksidagi BHC80 ning xarakteristikasi, neyronlarga xos gen repressiyasida ishtirok etadi". Biokimyoviy va biofizik tadqiqotlari. 322 (2): 601–8. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.07.163. PMID 15325272.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]