HOTAIR - HOTAIR

HOTAIR
Identifikatorlar
Taxalluslar	HOTAIR, HOXAS, HOXC-AS4, HOXC11-AS1, NCRNA00072, HOX transkript antisens RNK
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 611400 Generkartalar: HOTAIR
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 12 (odam)
Oxiri	53,974,956 bp
Ortologlar
	100124700
	n / a
	ENSG00000228630
	n / a
	n / a
	n / a
	n / a
	n / a
	n / a
	n / a
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash

HOTAIR (uchun HOX stenogramma antisens RNK )^[3] inson gen joylashgan xromosoma 12. Bu ta'sir ko'rsatadigan bitta xromosomada ifodalangan RNKning birinchi namunasidir transkripsiya boshqa xromosomada.

Gen va transkripsiyalangan RNK mahsuloti

HOTAIR genida 6232 ta mavjud bp va 2,2 kb kodlaydi uzun bo'lmagan kodlash RNK gen ekspressionini boshqaruvchi molekula. Uning manbai DNK ichida joylashgan HOXC gen klasteri. U 12-xromosomadan 2-xromosomaga Suz-o'n ikki oqsil.^[4]

Funktsiya

The 5′ HOTAIRning oxiri a bilan o'zaro ta'sir qiladi Polikom guruhi oqsili Polycomb Repressiv Kompleksi 2 (PRC2 ) va natijada tartibga soladi kromatin davlat. Bu genlarni susaytirish uchun talab qilinadi HOXD PRC2 tomonidan joylashtirilgan joy.^[5]^[6] The 3′ HOTAIR tugashi bilan o'zaro ta'sir qiladi histon demetilaza LSD1.^[6]

Bu muhim omil epigenetik tananing yuzasida terining farqlanishi. Turli xil anatomik pozitsiyalarning terisi ajralib turadi, masalan. asrning terisi oyoq tagidan sezilarli darajada farq qiladi.^[5]^[7]

Klinik ahamiyati

HOTAIR yuqori darajada ifoda etilgan metastatik ko'krak bezi saratoni. Birlamchi ko'krak o'smalaridagi yuqori darajadagi ekspresiya keyingi metastaz va o'limning muhim bashoratidir. Bu qisman HOTAIR vositachiligiga bog'liq haddan tashqari ifoda ning HER2 onkogen miR-331-3p sekvestratsiyasi orqali, bu a salbiy regulyator HER2 ifodasi.^[8] Hujayralarda, ayniqsa ekspression bo'lgan hujayralarda PRC2, HOTAIR ekspressionining oldini olish bu hujayraning invaziv potentsialini pasayishiga olib keladi. ^[9] Shuningdek, u ham ishtirok etadi qizilo'ngach skuamöz hujayrali karsinomasi.^[10]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000228630 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "HOTAIR-da Genecards-ga kirish". Olingan 20 iyul 2010.
^ Petherick A (2008 yil avgust). "Genetika: ishlab chiqarish liniyasi". Tabiat. 454 (7208): 1042–1045. doi:10.1038 / 4541042a. PMID 18756228.
^ ^a ^b Rinn JL, Kertesz M, Vang JK, Squazzo SL, Xu X, Brugmann SA, Goodnough LH, Helms JA, Farnham PJ, Segal E, Chang HY (iyun 2007). "Odamning HOX lokuslaridagi faol va jim xromatin domenlarini kodlashsiz RNKlar yordamida funktsional ravishda demarkatsiya qilish". Hujayra. 129 (7): 1311–1323. doi:10.1016 / j.cell.2007.05.022. PMC 2084369. PMID 17604720.
^ ^a ^b Tsay MC, Manor O, Van Y, Mosammaparast N, Vang JK, Lan F, Shi Y, Segal E, Chang HY (Avgust 2010). "Uzoq kodlashsiz RNK, giston modifikatsiyalash majmualarining modulli iskali". Ilm-fan. 329 (5992): 689–693. doi:10.1126 / science.1192002. PMC 2967777. PMID 20616235.
^ Chuong CM (2003 yil yanvar). "Homeobox genlari, homila yarasini davolash va terining mintaqaviy o'ziga xosligi". Tergov dermatologiyasi jurnali. 120 (1): 9–11. doi:10.1046 / j.1523-1747.2003.00002.x. PMC 4383243. PMID 12535191.
^ Liu, Syang-xua; Quyosh, Ming; Nie, Feng-qi; Ge, Ying-bin; Chjan, Er-bao; Yin, Dan-dan; Kong, Rong; Xia, Rui; Lu, Kay-xua (2014-04-28). "Lnc RNA HOTAIR me'da-ichak saratonida miR-331-3p sponging yordamida HER2 ekspresiyasini tartibga solish uchun raqobatdosh endogen RNK sifatida ishlaydi". Molekulyar saraton. 13: 92. doi:10.1186/1476-4598-13-92. ISSN 1476-4598. PMC 4021402. PMID 24775712.
^ Gupta RA, Shah N, Vang KC, Kim J, Horlings XM, Vong DJ, Tsay MC, Xang T, Argani P, Rinn JL, Vang Y, Brzoska P, Kong B, Li R, G'arbiy RB, van de Vijver MJ, Sukumar S, Chang HY (2010 yil aprel). "Uzoq vaqt davomida kodlanmaydigan RNK HOTAIR saraton metastazini rivojlantirish uchun xromatin holatini qayta dasturlaydi". Tabiat. 464 (7291): 1071–1076. doi:10.1038 / nature08975. PMC 3049919. PMID 20393566.
^ Chen FJ, Sun M, Li SQ, Wu QQ, Ji L, Liu ZL, Chjou GZ, Cao G, Jin L, Xie HW, Vang CM, Lv J, De V, Vu M, Cao XF (2013 yil noyabr). "Uzoq vaqt davomida kodlanmaydigan RNK HOTAIRni regulyatsiya qilish qizilo'ngachning skuamöz hujayrali karsinomasi metastazini va yomon prognozni rivojlantiradi". Molekulyar kanserogenez. 52 (11): 908–915. doi:10.1002 / mc.21944. PMID 24151120. S2CID 12457373.

Qo'shimcha o'qish

Woo CJ, Kingston RE (iyun 2007). "HOTAIR kodlanmaydigan RNKlarni yangi darajalarga ko'taradi". Hujayra. 129 (7): 1257–1259. doi:10.1016 / j.cell.2007.06.014. PMID 17604716. S2CID 18124576.
Xalil AM, Guttman M, Huarte M, Garber M, Raj A, Rivea Morales D, Tomas K, Presser A, Bernshteyn BE, van Oudenaarden A, Regev A, Lander ES, Rinn JL (Iyul 2009). "Odamlarning ko'p sonli intergenik kodlamaydigan RNKlari xromatinni o'zgartiruvchi komplekslar bilan birikib, gen ekspressioniga ta'sir qiladi".. Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 106 (28): 11667–11672. doi:10.1073 / pnas.0904715106. PMC 2704857. PMID 19571010.
Van Y, Chang HY (sentyabr 2010). "HOTAIR: saraton metastazida kodlamaydigan RNKlarning parvozi". Hujayra aylanishi. 9 (17): 3391–3392. doi:10.4161 / cc.9.17.13122. PMC 3066151. PMID 20864820.
Hung T, Chang HY (sentyabr 2010). "Genomni boshqarishda uzoq vaqt kodlanmaydigan RNK: istiqbollari va mexanizmlari". RNK biologiyasi. 7 (5): 582–585. doi:10.4161 / rna.7.5.13216. PMC 3073254. PMID 20930520.
Kaneko S, Li G, Son J, Xu CF, Margueron R, Neubert TA, Reinberg D (Dekabr 2010). "Ezh2 PRC2 komponentining fosforillanishi hujayra siklini boshqaradi va uning ncRNA bilan bog'lanishini tartibga soladi". Genlar va rivojlanish. 24 (23): 2615–2620. doi:10.1101 / gad.1983810. PMC 2994035. PMID 21123648.
Sun L, Fang J (yanvar 2011). "Yozuvchi HOTAIR-da o'chirgich bilan uchrashdi". Acta Biochimica et Biofhysica Sinica. 43 (1): 1–3. doi:10.1093 / abbs / gmq110. PMID 21138898.
Yang Z, Chjou L, Vu LM, Lay MC, Xie XY, Zhang F, Zheng SS (may 2011). "Uzoq vaqt davomida kodlanmaydigan RNK HOTAIRning haddan tashqari ekspressioni jigar transplantatsiyasidan keyin gepatotsellulyar karsinoma kasalligida o'smaning qaytalanishini bashorat qilmoqda". Jarrohlik onkologiyasi yilnomalari. 18 (5): 1243–1250. doi:10.1245 / s10434-011-1581-y. PMID 21327457. S2CID 21457941.
Nie Y, Liu X, Qu S, Song E, Zou H, Gong C (2013 yil aprel). "Uzoq kodlamaydigan RNK HOTAIR nazofarengeal karsinoma rivojlanishi va omon qolish uchun mustaqil prognostik belgidir". Saraton kasalligi. 104 (4): 458–464. doi:10.1111 / cas.12092. PMID 23281836. S2CID 207103684.

Tashqi havolalar

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 12 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000228630 - Ansambl, 2017 yil may

[2] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[3] "HOTAIR-da Genecards-ga kirish". Olingan 20 iyul 2010.

[pmid18756228-4] Petherick A (2008 yil avgust). "Genetika: ishlab chiqarish liniyasi". Tabiat. 454 (7208): 1042–1045. doi:10.1038 / 4541042a. PMID 18756228.

[Rinn-5] Rinn JL, Kertesz M, Vang JK, Squazzo SL, Xu X, Brugmann SA, Goodnough LH, Helms JA, Farnham PJ, Segal E, Chang HY (iyun 2007). "Odamning HOX lokuslaridagi faol va jim xromatin domenlarini kodlashsiz RNKlar yordamida funktsional ravishda demarkatsiya qilish". Hujayra. 129 (7): 1311–1323. doi:10.1016 / j.cell.2007.05.022. PMC 2084369. PMID 17604720.

[pmid20616235-6] Tsay MC, Manor O, Van Y, Mosammaparast N, Vang JK, Lan F, Shi Y, Segal E, Chang HY (Avgust 2010). "Uzoq kodlashsiz RNK, giston modifikatsiyalash majmualarining modulli iskali". Ilm-fan. 329 (5992): 689–693. doi:10.1126 / science.1192002. PMC 2967777. PMID 20616235.

[pmid12535191-7] Chuong CM (2003 yil yanvar). "Homeobox genlari, homila yarasini davolash va terining mintaqaviy o'ziga xosligi". Tergov dermatologiyasi jurnali. 120 (1): 9–11. doi:10.1046 / j.1523-1747.2003.00002.x. PMC 4383243. PMID 12535191.

[8] Liu, Syang-xua; Quyosh, Ming; Nie, Feng-qi; Ge, Ying-bin; Chjan, Er-bao; Yin, Dan-dan; Kong, Rong; Xia, Rui; Lu, Kay-xua (2014-04-28). "Lnc RNA HOTAIR me'da-ichak saratonida miR-331-3p sponging yordamida HER2 ekspresiyasini tartibga solish uchun raqobatdosh endogen RNK sifatida ishlaydi". Molekulyar saraton. 13: 92. doi:10.1186/1476-4598-13-92. ISSN 1476-4598. PMC 4021402. PMID 24775712.

[pmid20393566-9] Gupta RA, Shah N, Vang KC, Kim J, Horlings XM, Vong DJ, Tsay MC, Xang T, Argani P, Rinn JL, Vang Y, Brzoska P, Kong B, Li R, G'arbiy RB, van de Vijver MJ, Sukumar S, Chang HY (2010 yil aprel). "Uzoq vaqt davomida kodlanmaydigan RNK HOTAIR saraton metastazini rivojlantirish uchun xromatin holatini qayta dasturlaydi". Tabiat. 464 (7291): 1071–1076. doi:10.1038 / nature08975. PMC 3049919. PMID 20393566.

[10] Chen FJ, Sun M, Li SQ, Wu QQ, Ji L, Liu ZL, Chjou GZ, Cao G, Jin L, Xie HW, Vang CM, Lv J, De V, Vu M, Cao XF (2013 yil noyabr). "Uzoq vaqt davomida kodlanmaydigan RNK HOTAIRni regulyatsiya qilish qizilo'ngachning skuamöz hujayrali karsinomasi metastazini va yomon prognozni rivojlantiradi". Molekulyar kanserogenez. 52 (11): 908–915. doi:10.1002 / mc.21944. PMID 24151120. S2CID 12457373.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]