Haplogroup H5 (mtDNA) - Haplogroup H5 (mtDNA)

Haplogroup H5
Mumkin bo'lgan kelib chiqish vaqti11,500 yil oldin (miloddan avvalgi 9500 yil)[1]
Mumkin bo'lgan kelib chiqishiYaqin Sharq / G'arbiy Kavkaz
AjdodH5'36
AvlodlarH5a
Mutatsiyalarni aniqlashC456T, T16304C[2]

Yilda inson mitoxondriyal genetikasi, Haplogroup H5 a inson mitoxondrial DNK (mtDNA) haplogroup kelib chiqqan Haplogroup H (mtDNA). H5 HVR1 mintaqasida T16304C va HVR2 mintaqasida 456 tomonidan belgilanadi.[3]

Kelib chiqishi

H5 11,500 miloddan avvalgi (miloddan avvalgi 9500) bilan sanaladi.[4] U G'arbiy Kavkazda eng tez-tez va xilma-xil bo'lib ko'rinadi, shuning uchun kelib chiqishi taxmin qilingan, H5a subkladasi esa Evropaga o'xshaydi.[5] Ammo HVR1 mintaqasida T16304C bo'lgan mtDNA namunalari miloddan avvalgi 6800 yillarga oid to'rt kishidan topilgan. Kuloldan oldingi neolit ​​davri B sayt Halulaga ayting, Suriya,[6] H5 Kavkazga Yaqin Sharqdagi dehqonlar bilan kelgan bo'lishi mumkinligini taxmin qilmoqda.

Tarqatish

H5 * Yaqin Sharq bo'ylab past darajada (1% -3%) mavjud.[7] H5 * Kavkazda eng tez-tez uchraydi, u Karatcha-Balkar va gruzinlar - Gaplogroup H genofondining 20% ​​dan ortig'ini tashkil etadi - bu yuqori Kavkazning ikki tomoniga yaqin joyda yashaydi. U Markaziy Osiyoda mavjud emas ko'rinadi. Evropada taxminiy darajalar Volga-Ural Fin-Ugriyasida umuman yo'qligidan slovaklar va frantsuzlarda 8% gacha o'zgarib turadi.[8] Ammo bu daraja odatda o'rtacha 5% atrofida.[9] Garchi ba'zi tadqiqotlar Uelsdagi kabi Evropada H5 kontsentratsiyasining eng yuqori darajasini beradi. (8,5%)[iqtibos kerak ]

Altsgeymer kasalligi

Mitoxondriya - hujayralar hayoti va o'limining asosiy regulyatorlari.[10]O'rtasida mumkin bo'lgan bog'liqlik haqida eng so'nggi hisobot Altsgeymer kasalligi (AD) va mtDNA genotiplari subhaplogroup H5 ning kech boshlangan AD uchun xavf omili sifatida dalillarni ko'rsatishi mumkin.[11]

Subclade H5a

H5 ning ma'lum bo'lgan subkladasi - H5a1 va H5a2 ning o'z subkladlariga ega bo'lgan, nazorat mintaqasida T4336C tomonidan belgilangan H5a.[3] H5a taxminan 7000–8000 yoshda deb o'ylashadi, boshqacha aytganda T4336C mutatsiyasi v. Miloddan avvalgi 5500 yil. U Evropa bo'ylab past darajada teng ravishda taqsimlanadi. Avstriya, Germaniya, Vengriya, Makedoniya va Ruminiyadan olingan namunalar o'rtacha 2,4% ni tashkil etdi.[9] Shunga qaramay, u Kavkaz va Yaqin Sharqda deyarli yo'q, bu Evropa kelib chiqishini anglatadi. Dastlab u markaziy Evropa tekisligida eng yuqori darajaga ega deb o'ylagan bo'lsa ham,[7] yaqinda o'tkazilgan tadqiqotlar Iberiya, Bolqon va Finno-Skandiyada eng yuqori darajani ko'rsatdi.[12] Keyingi tadqiqotdan Britaniya orollari chetlashtirildi, ammo birinchisi, H5a u erda sodir bo'lishini ko'rsatdi.

Alvarez-Iglesias va boshq. Frantsuz-Kantabriya mintaqasida H5a chastotasining Sharqiy Evropaga qarab pasayishini kuzatdi va "Bu LGM davridan keyin Evropaning demografik populyatsiyasi jarayoni bilan mos keladi", deb izoh berdi.[12] Ammo bunday ssenariy v-sana uchun juda erta bo'ladi. Miloddan avvalgi 5500 yil. Luiza Pereyra, Martin Richards, Ana Gios va boshqalar tomonidan hisoblab chiqilgan.[7] Uchrashuv to'g'ri bo'lsa, Evropada keyinchalik tarqatish ehtimoli ko'proq bo'ladi.

Qadimgi DNK

Qadimgi DNKni o'rganish miloddan avvalgi 6800 yillarda to'rtta odamda H5 ni kulolchilikdan oldingi neolit ​​davri B joyidan topdi. Halulaga ayting, Suriya.[6] H5a rus dashtida Y-DNKsi R1a1a bo'lgan Tagar (miloddan avvalgi 800 yildan - milodiy 100 yilgacha) odamda topilgan. [13] va Margrethe, Milodiy 11-asr Daniya malikasi.[14]

Subclade H5a1

Subclade H5a1 C15833T qo'shimcha o'tish yo'li bilan aniqlanadi.[15] Bu Evropada ota-onasidan bir oz pastroq darajada teng ravishda sodir bo'ladi. Avstriya, Germaniya, Vengriya, Makedoniya va Ruminiyadan olingan namunalar bo'yicha o'rtacha aholi 1,8% ni tashkil etdi.[9] Aholining juda katta namunalarida Avstriyalik Tirol, H5a1 2% da, H5a esa 2,9% da topilgan.[16]

Daraxt

Ushbu Haplogroup H5 subkladlarining filogenetik daraxti Manis van Oven, PhyloTree-dan olingan.[17]

  • H5'36
    • H5
      • H5a
        • H5a1
        • H5a2
      • H5b
      • H5c
        • H5c1
          • H5c1a
          • H5c1b
        • H5c2
      • H5d
      • H5e
      • H5f
      • H5g
      • H5h
      • H5i
      • H5k
      • H5l
      • H5m
      • H5n
      • H5o
      • H5p
      • H5u

Adabiyotlar

  1. ^ Soares, P; Ermini, L; Tomson, N; Mormina, M; Rito, T; Rul, A; Salas, A; Oppengeymer, S; Makolay, V (2009). "Tanlovni tozalash uchun tuzatish: takomillashtirilgan inson mitoxondriyal molekulyar soati". Amerika inson genetikasi jurnali. 84 (6): 740–59. doi:10.1016 / j.ajhg.2009.05.001. PMC  2694979. PMID  19500773.
  2. ^ van Oven, Mannis; Manfred Kayser (2008 yil 13 oktyabr). "Insonning global mitoxondriyal DNK o'zgarishi bo'yicha yangilangan keng qamrovli filogenetik daraxt". Inson mutatsiyasi. 30 (2): E386-E394. doi:10.1002 / humu.20921. PMID  18853457. S2CID  27566749. Arxivlandi asl nusxasi 2012 yil 4 dekabrda. Olingan 2009-05-20.
  3. ^ a b Genebaseteam. "MtDNA va uning ajdodlardagi roli: XI qism (mtDNA Haplogroup H)". Genebase tizimlari. Arxivlandi asl nusxasi 2009 yil 8 fevralda. Olingan 24 dekabr, 2008.
  4. ^ Soares, P; Ermini, L; Tomson, N; va boshq. (Iyun 2009). "Tanlovni tozalash uchun tuzatish: takomillashtirilgan inson mitoxondriyal molekulyar soati". Am. J. Xum. Genet. 84 (6): 740–59. doi:10.1016 / j.ajhg.2009.05.001. PMC  2694979. PMID  19500773.
  5. ^ U. Roostalu va boshq. Gap Evroosiyoda odamlarning dominant mitoxondriyal DNK nasli: haplogroup H ning kelib chiqishi va kengayishi: Yaqin Sharq va Kavkaz istiqboli, Molekulyar biologiya va evolyutsiya, vol. 24, yo'q. 2 (2007), 436-448-betlar
  6. ^ a b Fernández, E. va boshq., Tell Halula qadimiy neolit ​​davridagi Mitoxondriyal DNKning genetik aloqalari, Xalqaro sud ekspertizasi: Genetika qo'shimchalari seriyasi, vol.1, yo'q. 1 (2008), 271-273 betlar.
  7. ^ a b v Pereyra, L; Richards, M; Goios, A; va boshq. (2005 yil yanvar). "Evropaning Iberiya refugiumidan kech muzliklarga ko'chirilishining yuqori aniqlikdagi mtDNA dalillari". Genom tadqiqotlari. 15 (1): 19–24. doi:10.1101 / gr.3182305. PMC  540273. PMID  15632086.
  8. ^ Eva-Liis Loogvali va boshq., Birlashtiruvchi bir xillik: Evrosiyoda mtDNA Haplogroup H ning Pied Cladistic Tuvali, Molekulyar biologiya va evolyutsiya, vol. 21 yo'q. 11 (2004), 2012–2021-betlar; U. Roostalu va boshq. Gap Evroosiyoda odamlarning dominant mitoxondriyal DNK nasli: haplogroup H ning kelib chiqishi va kengayishi: Yaqin Sharq va Kavkaz istiqboli, Molekulyar biologiya va evolyutsiya, vol. 24, yo'q. 2 (2007), 436-448-betlar.
  9. ^ a b v Brandstätter, A; Zimmermann, B; Vagner, J; Göbel, T; Rok, AW; Salas, A; Karrasedo, A; Parson, V (2008). "Markaziy Evropa va O'rta Sharqdagi mitoxondriyal DNK makro-haplogroupining o'zgaruvchanligi vaqtini aniqlash va dehifrlash". BMC evolyutsion biologiyasi. 8: 191. doi:10.1186/1471-2148-8-191. PMC  2491632. PMID  18601722.
  10. ^ Ienco, EC; Simoncini, C; Orsucci, D; Petrucci, L; Filosto, M; Mankuso, M; Sitsiliano, G (2011). "" Mitokondriyal arafa "va mitoxondriyal haplogruplar neyrodejeneratsiya va Altsgeymer kasalligida rol o'ynashi mumkinmi?". Int J Altsgeymer kasalligi. 2011: 1–11. doi:10.4061/2011/709061. PMC  3056451. PMID  21423558.
  11. ^ Santoro, A; Balbi, V; Balducci, E; Pirazzini, C; Rozini, F; va boshq. (2010). "Mitoxondriyal DNKning Haplogroup H5 ning kech boshlangan Altsgeymer kasalligi uchun xavfli omil sifatida dalillar". PLOS ONE. 5 (8): e12037. Bibcode:2010PLoSO ... 512037S. doi:10.1371 / journal.pone.0012037. PMC  2917370. PMID  20700462.
  12. ^ a b Alvares-Iglesias, V; Mosquera-Migel, A; Cerezo, M; va boshq. (2009). "Mitokondriyal DNK makro-gaplogroup R0 ichidagi o'zgaruvchanlikning yangi populyatsiyasi va filogenetik xususiyatlari". PLOS ONE. 4 (4): e5112. Bibcode:2009PLoSO ... 4.5112A. doi:10.1371 / journal.pone.0005112. PMC  2660437. PMID  19340307.
  13. ^ C. Keyser va boshq. Qadimgi DNK janubiy Sibir kurgan aholisi tarixi haqida yangi ma'lumot beradi, Inson genetikasi (2009 yil 16-mayda onlayn nashr qilingan)
  14. ^ J. Dissing, oxirgi Viking qiroli: qadimiy DNK-tahlil bilan hal qilingan qirollik onalik ishi, Xalqaro sud ekspertizasi, vol. 166, yo'q. 1 (2007 yil fevral), 21-7 bet.
  15. ^ E.-L. Loogväli, U. Roostalu va boshq., Molekulyar biologiya va evolyutsiya jild. 21, (2004), 2012–2021-betlar.
  16. ^ Brandstätter A, Salas A, Niederstätter H, Gassner C, Carracedo A, Parson V (2006). "Kodlash mintaqasi SNPlaridan foydalangan holda mitoxondriyal superhaplogup H ning dissektsiyasi". Elektroforez. 27 (13): 2541–2550. doi:10.1002 / elps.200500772. PMID  16721903. S2CID  22257992.
  17. ^ Mannis van Oven, PhyloTree

Shuningdek qarang

Filogenetik daraxt inson mitoxondrial DNK (mtDNA) haplogrouplari

 Mitoxondrial Momo Havo (L )  
L0L1-6 
L1L2 L3  L4L5L6
MN 
CZD.EGQ OASR MenVXY
CZBFR0 JTgacha P U
VVJTK
HVJT