Omurgasızların mitokondriyal kodi - Invertebrate mitochondrial code - Wikipedia

The omurgasızların mitokondriyal kodi (tarjima jadvali 5) a genetik kod tomonidan ishlatilgan mitoxondrial ning genomi umurtqasizlar.

Kod

AA = FFLLSSSSYY ** CCWWLLLLPPPHHQQRRRRIIMMTTTNNKKSSSVVVVAAAADDEEGGGG

Boshlaydi = --- M ---------------------------- MMMM --------------- M ------------

Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGG

Base2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGAGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGAGGGG

Base3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG

Asoslari: adenin (A), sitozin (C), guanin (G) va timin (T) yoki urasil (U).

Aminokislotalar: Alanin (Ala, A), Arginin (Arg, R), Qushqo'nmas (Asn, N), Aspartik kislota (Asp, D), Sistein (Cys, C), Glutamik kislota (Yelim, E), Glutamin (Gln, Q), Glitsin (Gly, G), Histidin (Uning, H), Izoletsin (Ile, I), Leytsin (Leu, L), Lizin (Lys, K), Metionin (Met, M), Fenilalanin (Phe, F), Proline (Pro, P), Serin (Ser, S), Treonin (Thr, T), Triptofan (Trp, V), Tirozin (Tyr, Y), Valin (Val, V).

Standart koddan farqlar


DNK kodonlari	RNK kodonlari	Ushbu kod (5)	Standart kod (1)
`AGA`	`AGA`	`Ser` `(S)`	`Arg` `(R)`
`AGG`	`AGG`	`Ser` `(S)`	`Arg` `(R)`
`ATA`	`AUA`	`Uchrashdi` `(M)`	`Ile` `(Men)`
`TGA`	`UGA`	`Trp` `(V)`	`STOP = Ter` `(*)`

Eslatma: AGG kodoni yo'q Drosophila.^[1]

Muqobil boshlang'ich kodonlari

AUA, AUU
AUC: Apis ^[2]
GUG: Polyplacophora^[3]
UUG: Ascaris, Caenorhabditis.

Tizimli diapazon

Nematoda: Ascaris, Caenorhabditis ;
Molluska: Bivalviya );^[4] Polyplacophora;^[3]
Artropoda /Qisqichbaqasimon: Artemiya;^[5]
Artropoda /Hasharot: Drosophila [Locusta migratoria (ko'chib yuruvchi chigirtka), Apis mellifera (Asalari)].

Boshqa o'zgarishlar

Bir nechta artropodlar AGG kodonini serin o'rniga lizin deb tarjima qiladilar (xuddi shunday Pterobranxiya Mitoxondrial kodeksi ) yoki arginin (kabi) standart genetik kod ).^[6]
GUG ehtimol tashabbuskor sifatida ishlashi mumkin Drosophila.^[7]^[8] AUU initiator sifatida ishlatilmaydi Mytilus^[4]
"Ikkala sitoxrom oksidaza I mRNK subunitining tarjimasini boshlash uchun alohida mexanizm ishlashi kerak. D. melanogaster^[9] va D. yakuba,^[10] chunki uning yagona mantiqiy boshlanish kodoni AUA genning qolgan qismi bilan chegaradan tashqarida. Tashabbus AUAA to'rtligini o'qishni talab qiladi, bu AUA da boshlanishiga teng bo'ladi va darhol o'ziga xos ribosomal ramkaga o'tkaziladi. Mumkin bo'lgan yana bir mexanizm ... bu mRNA AUA initsiyasini ramkaga kiritish uchun "tahrirlanganligi". ^[11]

Shuningdek qarang

Genetik kodlar ro'yxati

Adabiyotlar

Ushbu maqolada Amerika Qo'shma Shtatlarining Milliy tibbiyot kutubxonasi ichida joylashgan jamoat mulki.^[12]

^ Sengupta S, Yang X, Xiggs PG (iyun 2007). "Mitokondriyal genetik kodlarda kodonlarni qayta tayinlash mexanizmlari". Molekulyar evolyutsiya jurnali. 64 (6): 662–88. doi:10.1007 / s00239-006-0284-7. PMC 1894752. PMID 17541678.
^ Crozier RH, Crozier YC (yanvar 1993). "Apis mellifera asal asalining mitoxondriyal genomi: to'liq ketma-ketlik va genomning tashkil etilishi". Genetika. 133 (1): 97–117. PMC 1205303. PMID 8417993.
^ ^a ^b Boore JL, Brown WM (1994 yil oktyabr). "Qora xiton mitoxondriyal genomining to'liq DNK ketma-ketligi, Katharina tunicata". Genetika. 138 (2): 423–43. PMC 1206160. PMID 7828825.
^ ^a ^b Hoffmann RJ, Boore JL, Brown WM (iyun 1992). "Moviy midiya uchun yangi mitoxondriyal genom tashkiloti, Mytilus edulis". Genetika. 131 (2): 397–412. PMC 1205014. PMID 1386586.
^ Batuecas B, Garesse R, Calleja M, Valverde JR, Marko R (iyul 1988). "Artemiya mitoxondrial DNKning genom tashkiloti". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 16 (14A): 6515-29. doi:10.1093 / nar / 16.14.6515. PMC 338311. PMID 3135541.
^ Abascal F, Posada D, Knight RD, Zardoya R (may 2006). "Artropod mitoxondrial genomlarda genetik kodning parallel evolyutsiyasi". PLOS biologiyasi. 4 (5): e127. doi:10.1371 / journal.pbio.0040127. PMC 1440934. PMID 16620150.
^ Clary DO, Volstenholme DR (1985). "Drosophila yakubaning mitoxondriyal DNK molekulasi: nukleotidlar ketma-ketligi, genlar tashkiloti va genetik kod". Molekulyar evolyutsiya jurnali. 22 (3): 252–71. doi:10.1007 / BF02099755. PMID 3001325.
^ Gadaleta G, Pepe G, De Candia G, Quagliariello C, Sbisà E, Saccone C (iyul 1988). "Sichqoncha mitoxondriyal NADH dehidrogenaza subbirligi nukleotidlar ketma-ketligi. GTG, umurtqali hayvonlar mitoxondrial genomidagi yangi tashabbuskor kodon". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 16 (13): 6233. doi:10.1093 / nar / 16.13.6233. PMC 336868. PMID 3399396.
^ de Bruijn MH (1983). "Drosophila melanogaster mitoxondrial DNA, yangi tashkilot va genetik kod". Tabiat. 304 (5923): 234–41. doi:10.1038 / 304234a0. PMID 6408489.
^ Clary DO, Wolstenholme DR (iyun 1983). "Drosophila mitoxondriyal DNK segmentining nukleotidlar ketma-ketligi, tarkibida sitoxrom c oksidaza II va III kichik birliklari va ATPaza subbirligi 6 uchun genlar mavjud". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 11 (12): 4211–27. doi:10.1093 / nar / 11.12.4211. PMC 326036. PMID 6306579.
^ Fox TD (1987). "Genetik kodning tabiiy o'zgarishi". Genetika fanining yillik sharhi. 21: 67–91. doi:10.1146 / annurev.ge.21.120187.000435. PMID 3327473.
^ Elzanovski A, Ostell J, Leyp D, Soussov V. "Genetik kodlar". Taksonomiya brauzeri. Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi (NCBI), AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi. Olingan 26 avgust 2015.

Bu mikrobiologiya bilan bog'liq maqola a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[1] Sengupta S, Yang X, Xiggs PG (iyun 2007). "Mitokondriyal genetik kodlarda kodonlarni qayta tayinlash mexanizmlari". Molekulyar evolyutsiya jurnali. 64 (6): 662–88. doi:10.1007 / s00239-006-0284-7. PMC 1894752. PMID 17541678.

[2] Crozier RH, Crozier YC (yanvar 1993). "Apis mellifera asal asalining mitoxondriyal genomi: to'liq ketma-ketlik va genomning tashkil etilishi". Genetika. 133 (1): 97–117. PMC 1205303. PMID 8417993.

[Boore_1994-3] Boore JL, Brown WM (1994 yil oktyabr). "Qora xiton mitoxondriyal genomining to'liq DNK ketma-ketligi, Katharina tunicata". Genetika. 138 (2): 423–43. PMC 1206160. PMID 7828825.

[Hoffmann_1992-4] Hoffmann RJ, Boore JL, Brown WM (iyun 1992). "Moviy midiya uchun yangi mitoxondriyal genom tashkiloti, Mytilus edulis". Genetika. 131 (2): 397–412. PMC 1205014. PMID 1386586.

[Batuecas_1988-5] Batuecas B, Garesse R, Calleja M, Valverde JR, Marko R (iyul 1988). "Artemiya mitoxondrial DNKning genom tashkiloti". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 16 (14A): 6515-29. doi:10.1093 / nar / 16.14.6515. PMC 338311. PMID 3135541.

[Abascal_2006-6] Abascal F, Posada D, Knight RD, Zardoya R (may 2006). "Artropod mitoxondrial genomlarda genetik kodning parallel evolyutsiyasi". PLOS biologiyasi. 4 (5): e127. doi:10.1371 / journal.pbio.0040127. PMC 1440934. PMID 16620150.

[Clary_1985-7] Clary DO, Volstenholme DR (1985). "Drosophila yakubaning mitoxondriyal DNK molekulasi: nukleotidlar ketma-ketligi, genlar tashkiloti va genetik kod". Molekulyar evolyutsiya jurnali. 22 (3): 252–71. doi:10.1007 / BF02099755. PMID 3001325.

[Gadaleta_1988-8] Gadaleta G, Pepe G, De Candia G, Quagliariello C, Sbisà E, Saccone C (iyul 1988). "Sichqoncha mitoxondriyal NADH dehidrogenaza subbirligi nukleotidlar ketma-ketligi. GTG, umurtqali hayvonlar mitoxondrial genomidagi yangi tashabbuskor kodon". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 16 (13): 6233. doi:10.1093 / nar / 16.13.6233. PMC 336868. PMID 3399396.

[de_Bruijn_1983-9] Bruijn MH (1983). "Drosophila melanogaster mitoxondrial DNA, yangi tashkilot va genetik kod". Tabiat. 304 (5923): 234–41. doi:10.1038 / 304234a0. PMID 6408489.

[Clary_1983-10] Clary DO, Wolstenholme DR (iyun 1983). "Drosophila mitoxondriyal DNK segmentining nukleotidlar ketma-ketligi, tarkibida sitoxrom c oksidaza II va III kichik birliklari va ATPaza subbirligi 6 uchun genlar mavjud". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 11 (12): 4211–27. doi:10.1093 / nar / 11.12.4211. PMC 326036. PMID 6306579.

[pmid3327473-11] Fox TD (1987). "Genetik kodning tabiiy o'zgarishi". Genetika fanining yillik sharhi. 21: 67–91. doi:10.1146 / annurev.ge.21.120187.000435. PMID 3327473.

[NCBI-12] Elzanovski A, Ostell J, Leyp D, Soussov V. "Genetik kodlar". Taksonomiya brauzeri. Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi (NCBI), AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi. Olingan 26 avgust 2015.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]