Laktis-leu-phe lideri RNK motifi - Lactis-leu-phe leader RNA motif

Ikkinchi tuzilmaning konsensusi laktis-leu / phe lideri RNKlari. Ushbu ko'rsatkich avvalgi nashrdan moslashtirilgan.[1]
Lactococcus lactis dan leu / phe lideri RNK
Identifikatorlar
Belgilarleu-phe_leader
RfamRF01743
Boshqa ma'lumotlar
RNK turiCis-reg; rahbar;
Domen (lar)Bakteriyalar;
SOSO: 0005836
PDB tuzilmalarPDBe

The leu / phe-lideri RNK motifi (shuningdek laktis-leu / phe-lideri motifi) saqlanib qolgan RNK tomonidan aniqlangan tuzilish bioinformatika.[1] Ushbu RNKlar quyidagi kabi ishlaydi peptid rahbarlari. Ularda qisqa mavjud ochiq o'qish doirasi Ko'pni o'z ichiga olgan (ORF) kodonlar uchun leytsin yoki fenilalanin. Odatda, quyi oqimning ifodasi genlar bostirilgan. Biroq, tegishli bo'lgan uyali konsentratsiyalar aminokislota past, ribosoma to'xtab qolish, quyi oqimdagi gen ekspressionini ta'minlaydigan muqobil tuzilishga olib keladi.

Ushbu tuzilmaning leu / phe rahbarlari faqat turlarda ma'lum Lactococcus lactis, va aslida ilgari tavsiflangan bilan bir xil leytsin bir xil turdagi etakchi.[2] Qo'shimcha gomologlar Leysin kodonlari o'rniga fenilalanin kodonlarini o'z ichiga olgan va lösin o'rniga fenilalanin sintezida ishtirok etadigan genlarning yuqori qismida joylashgan.

Adabiyotlar

  1. ^ a b Vaynberg Z, Vang JX, Bogue J va boshq. (2010 yil mart). "Qiyosiy genomika bakteriyalar, arxeylar va ularning metagenomlaridan 104 nomzodning tuzilgan RNKlarini aniqlaydi". Genom Biol. 11 (3): R31. doi:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. PMC  2864571. PMID  20230605.
  2. ^ Kok J (1996 yil oktyabr). "Sut kislotasi bakteriyalarida induktiv gen ekspressioni va ekologik jihatdan tartibga solinadigan genlar" (PDF). Antoni van Leyvenxuk. 70 (2–4): 129–145. doi:10.1007 / BF00395930. PMID  8879404.

Tashqi havolalar