Lakto-usp RNK motifi - Lacto-usp RNA motif

Lakto-usp RNK
Lacto-usp-RNA.svg
Lacto- ning ikkinchi darajali tuzilmasiusp RNKlar
Identifikatorlar
BelgilarLakto-usp RNK
RfamRF01710
Boshqa ma'lumotlar
RNK turisRNK
Domen (lar)Sut kislotasi bakteriyalari
PDB tuzilmalarPDBe

The Lakto-usp RNK motifi saqlanib qolgan RNK ichida aniqlangan tuzilma bakteriyalar tomonidan bioinformatika.[1] Lakto-usp RNKlar faqat ichida joylashgan sut kislotasi bakteriyalari va faqat imkoni boricha 5, tarjima qilinmagan mintaqalar ning (5 s UTR) operonlar gipotetikani o'z ichiga oladi gen va a usp gen. The usp gen kodlaydi universal stress oqsili. Lakto-usp ga mos kelishi mumkin 6S RNK tegishli turlarning turlari, chunki ushbu turlarning beshtasidan to'rttasida taxmin qilingan 6S RNK yo'q va 6S RNKlari odatda 5 ′ UTR da uchraydi. usp genlar. Ammo, Lakto-usp RNK motifi standart 6S RNK tuzilishidan, Lakto- funktsiyasidan ancha qisqausp RNKlar noaniqligicha qolmoqda.

Adabiyotlar

  1. ^ Vaynberg Z, Vang JX, Bogue J va boshq. (2010 yil mart). "Qiyosiy genomika bakteriyalar, arxeylar va ularning metagenomlaridan 104 nomzodning tuzilgan RNKlarini aniqlaydi". Genom Biol. 11 (3): R31. doi:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. PMC  2864571. PMID  20230605.

Tashqi havolalar