LigandScout - LigandScout
| Tuzuvchi (lar) | Inte: Ligand GmbH |
|---|---|
| Dastlabki chiqarilish | 2005 |
| Barqaror chiqish | 4.0 / 2016 |
| Operatsion tizim | Windows, Mac OS X, Linux |
| Platforma | x86, x86-64 |
| Mavjud: | Ingliz tili |
| Turi | Molekulyar modellashtirish va dizayn |
| Litsenziya | Mulkiy tijorat dasturlari |
| Veb-sayt | www |
LigandScout bu kompyuter dasturiy ta'minot bu uch o'lchovli (3D) yaratishga imkon beradi farmakofor ning strukturaviy ma'lumotlaridan modellar makromolekula –ligand komplekslar yoki organik molekulalarning o'qitish va sinov to'plamlaridan. U bog'langan kichik organik moddalarning o'zaro ta'sirini tavsiflovchi 3D kimyoviy xususiyatlarining to'liq ta'rifini o'z ichiga oladi (masalan, vodorod bog'langan donorlar, aktseptorlar, lipofil zonalar, ijobiy va salbiy ionlanadigan kimyoviy guruhlar). molekula (ligand ) va atrof majburiy sayt ning makromolekula.[1] Ushbu farmakoforlarni naqshga mos keladigan hizalama algoritmi yordamida qoplash va ustiga qo'yish mumkin[2] bu faqat kimyoviy tuzilish o'rniga farmakoforik xususiyatlarga asoslangan. Bunday qo'shimchadan, birgalikda funktsiyalar interpolatsiya qilinishi mumkin umumiy xususiyatli farmakofora bir nechta majburiy saytlar / ligandlarning barcha umumiy o'zaro ta'sirlarini baham ko'radigan yoki ularni yaratish uchun kengaytirilgan birlashtirilgan xususiyat farmakofor. Dastur yangi qo'rg'oshin tuzilmalarini bashorat qilish uchun muvaffaqiyatli ishlatilgan dori dizayni, masalan, bashorat qilish biologik faollik yangi inson immunitet tanqisligi virusi (OIV ) teskari transkriptaz inhibitörleri.[3]
Shunga o'xshash vositalar
Farmakoforlarni modellashtirishga yordam beradigan boshqa dasturiy vositalarga quyidagilar kiradi:
- Molekulyar operatsion muhit] (MOE) - tomonidan Kimyoviy hisoblash guruhi[4]
- Bosqich Shredinger[5]
- Discovery Studio - muallifi Accelrys[6]
- SYBYL-X - Tripos tomonidan[7]
- Fir'avn tomonidan Silicos-It[1]
Shuningdek qarang
Adabiyotlar
- ^ Wolber G, Langer T (2005). "LigandScout: oqsil bilan bog'langan ligandlardan olingan 3-o'lchovli farmakoforalar va ularni virtual skrining filtrlari sifatida ishlatish". J Chem Inf modeli. 45 (1): 160–169. doi:10.1021 / ci049885e. PMID 15667141.
- ^ Wolber G, Dornhofer AA, Langer T (2007). "3D farmakoforalar yordamida kichik organik molekulalarning samarali qatlami". J hisoblash texnikasi bilan ta'minlangan mol. 20 (12): 773–788. doi:10.1007 / s10822-006-9078-7. PMID 17051340.
- ^ Barreca ML, De Luca L, Iraci N, Rao A, Ferro S, Maga G, Chimirri A (2007). "Strukturaga asoslangan yangi kimyoviy iskala nukleosid bo'lmagan teskari transkriptaz inhibitörleri sifatida farmakoforni aniqlash". J Chem Inf modeli. 47 (2): 557–562. doi:10.1021 / ci600320q. PMID 17274611.
- ^ Molekulyar ish muhiti
- ^ Bosqich Arxivlandi 2013-05-14 da Orqaga qaytish mashinasi
- ^ Discovery Studio
- ^ SYBYL-X Arxivlandi 2010-10-19 da Orqaga qaytish mashinasi
Qo'shimcha o'qish
- Wolber G, Kosara R. "6-bob: LigandScout bilan makromolekulyar komplekslardan farmakoforalar". Farmakoforlar va farmakoforlarni izlash. Vili. ISBN 3-527-31250-1. Arxivlandi asl nusxasi 2008-10-13 kunlari.