Monorafidiym beparvoligi - Monoraphidium neglectum

Monorafidiym beparvoligi
Ilmiy tasnif tahrirlash
Filum:Xlorofit
Sinf:Xlorofitlar
Buyurtma:Sphaeropleales
Oila:Selenastrasiyalar
Tur:Monorafidiyum
Turlar:
M. beparvo
Binomial ism
Monorafidiym beparvoligi
Xeynig va Krienits

Monorafidiym beparvoligi a bitta hujayrali yashil suv o'tlari oilaning Selenastrasiyalar.[1][2] Foydalanishga qiziqish mavjud M. beparvo ishlab chiqarish uchun bioyoqilg'i chunki u ko'p miqdorda (hujayra quruq vaznining 33% gacha) to'planishi mumkin triatsilgliseridlar (Teglar).[3]

2013 yilda yadro, mitoxondriyal va xloroplast genomining loyihasi taxminan 68 Mb yadro hajmi va taxminan 16 761 gen bilan nashr etildi.[4] Yadro genomi ehtimol diploid.[4] Ning mitoxondriyal genomi M. beparvo 96 kb ni tashkil etadi, bu ikki baravar katta Nanoxloropsis gaditana va yashil yosunlardan qariyb olti baravar katta Chlamydomonas reinhardtii, ammo kamroq genlarni o'z ichiga oladi.[4][5]

Yadro transformatsiyasi texnikasi yaratildi M. beparvo foydalanish elektr transformatsiyasi DNKni yuborish usuli sifatida.[6] Ushbu tadqiqotda tasvirlangan strategiya, shu jumladan hujayra devorini zaiflashtirish uchun oldindan davolash bosqichi[6], kelajakda elektrotransformatsiyadan foydalangan holda barqaror yadro genetik transformatsiyasiga yo'naltirilgan boshqa mikroalglar bilan olib boriladigan tadqiqotlarni ilhomlantirishi mumkin.

Transkriptom M. beparvo yordamida ketma-ketlik qilingan Illumina HiSeq texnologiyasi. Poli-A baliq ovlash va genomni boshqarish usulidan foydalangan holda transkriptom 20751 genga (i. E., Loci) to'plangan.[7] Ma'lumotlar bazasi har ikkala sharoitda ham yuqori darajadagi TAG to'planishi va undan keyingi TAG degradatsiyasi sharoitida vaqt sinovini o'z ichiga oladi.[7] TAG to'planishi va parchalanishi azotni yo'q qilish (-N sharoitlari) va azotni qayta to'ldirish (NR sharoitlari) natijasida yuzaga keldi.[7] Umuman olganda, transkriptom 12 vaqt punktlarida (t0, 7x -N, 4x NR) ketma-ketlikda to'planib, keng qamrovli va sifatli ma'lumotlar to'plamini berdi.[7] Xom ma'lumotlar (100 nt juftlik oxiri) saqlangan SRA SRA Study-ga qo'shilish raqami ostida SRP112537.[7] Qayta ishlangan ma'lumotlar mavjud http://tdbmn.cebitec.uni-bielefeld.de, unda to'g'ridan-to'g'ri gen va Portlash ma'lumotlarni qidirish va avtotrofik -N va NR sharoitida maqsadli genlarning ekspression shakllarini o'rganish uchun qidiruvni faollashtirish.[7] Bundan tashqari, maqsadli genlarning ekspression shakllarini taqqoslash mumkin M. beparvo TAG birikmasini keltirib chiqarish uchun -N sharoitlariga duch kelgan boshqa mikroalglar bilan.[7]

Adabiyotlar

  1. ^ Xeynig X, Krienits L (1982). "Monorafidiym beparvoligi n. sp. sowie einige Bemerkungen zu den Gattungen Monoraphidium, Chlorolobium und Keratococcus (Chlorococcales) ". Archiv für Protistenkunde (nemis tilida). 125 (1–4): 335–344. doi:10.1016 / S0003-9365 (82) 80032-8.
  2. ^ Ga qarang NCBI Monoraphidium-dagi veb-sahifa. Dan olingan ma'lumotlar "NCBI taksonomiyasi resurslari". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi. Olingan 2017-03-17.
  3. ^ Jaeger D, Pilger C, Hachmeister H, Oberländer E, Wördenweber R, Wichmann J, Mussgnug JH, Huser T, Kruse O (oktyabr 2016). "Oleaginous microalga Monoraphidium neglectum tarkibidagi hujayra ichidagi lipid tomchilarining in vivo jonli tahlillari izchil Raman sochuvchi mikroskopi orqali". Ilmiy ma'ruzalar. 6: 35340. doi:10.1038 / srep35340. PMC  5073319. PMID  27767024.
  4. ^ a b v Bogen C, Al-Dilayimi A, Albersmeier A, Vichmann J, Grundmann M, Rupp O, Lauersen KJ, Blifernez-Klassen O, Kalinovski J, Goesmann A, Mussgnug JH, Kruse O (dekabr 2013). "Monoraphidium neglectum mikroalga uchun lipid metabolizmini genom ketma-ketligidan tiklash bioyoqilg'i ishlab chiqarish uchun mos xususiyatlarni ochib beradi". BMC Genomics. 14: 926. doi:10.1186/1471-2164-14-926. PMC  3890519. PMID  24373495.
  5. ^ Radakovits R, Jinkerson RE, Fuerstenberg SI, Tae H, Settlage RE, Boore JL, Posewitz MC (fevral 2012). "Oleaginous alg Nannochloropis gaditana genomining ketma-ketligi va genetik o'zgarishi". Tabiat aloqalari. 3: 686. doi:10.1038 / ncomms1688. PMC  3293424. PMID  22353717.
  6. ^ a b Jaeger D, Xyubner V, Xuser T, Mussgnug JH, Kruse O (may 2017). "Oleaginous microalga Monoraphidium neglectum-da yadroviy transformatsiya va funktsional gen ekspressioni". Biotexnologiya jurnali. 249: 10–15. doi:10.1016 / j.jbiotec.2017.03.011. PMID  28302588.
  7. ^ a b v d e f g Jaeger D, Vinkler A, Mussgnug JH, Kalinovskiy J, Goesmann A, Kruse O (2017-08-14). "Monoraphidium neglectum triatsilgliserol va lipidlarning giperakkumulyatsiyasi modelini ochib berdi". Bioyoqilg'i uchun biotexnologiya. 10: 197. doi:10.1186 / s13068-017-0882-1. PMC  5556983. PMID  28814974.

Tashqi havolalar