Mothur - Mothur

kuya
Asl muallif (lar)Doktor Patrik Shloss va boshq[1]
Dastlabki chiqarilish2009 yil 13 fevral; 11 yil oldin (2009-02-13)[2]
Barqaror chiqish1.43.0 [3] (2019 yil 21 oktyabr); 13 oy oldin (2019-10-21)[3]) [±]
Omborgithub.com/ mothur/ mothur/
YozilganC ++[1][4]
Operatsion tizimWindows, manba mavjud Unixga o'xshash[1][5]
Hajmi13.50 MB (Windows) dan 22.80 MB (MacOS) gacha[6]
Mavjud:Ingliz tili
TuriBioinformatika dasturi
LitsenziyaGNU GPL v3[1][7]
Veb-saytwww.mothur.org Buni Vikidatada tahrirlash

kuya bu ochiq manba uchun dasturiy ta'minot to'plami bioinformatika ma'lumotlarni qayta ishlash.[8] To'plam tez-tez tahlil qilishda ishlatiladi DNK madaniyatsiz mikroblardan. Mothur bir nechta ma'lumotlardan ishlov berishga qodir DNKning ketma-ketligi 454 ta pirosekvensiya, Illumina HiSeq va MiSeq, Sanger, PacBio va IonTorrent kabi usullar.[9] Kuyovning birinchi chiqarilishi 2009 yilda sodir bo'lgan.[10] Kuyovning chiqarilishi jurnaldagi nashrda e'lon qilindi Amaliy va atrof-muhit mikrobiologiyasi.[1] 2015 yil 12-sentabr holatiga ko'ra, kuya go'shtini chiqaradigan maqola 3.992 ta boshqa tadqiqot ishlari tomonidan keltirilgan.

Tashqi havolalar

Adabiyotlar

  1. ^ a b v d e Schloss, P. D .; Vestkott, S. L .; Ryabin, T .; Xoll, J. R .; Xartmann, M.; Hollister, E. B.; Lesnievskiy, R. A .; Oakli, B. B.; Parklar, D. H .; Robinson, C. J .; Sahl, J. V .; Stres, B .; Tallinger, G. G.; Van Xorn, D. J .; Weber, C. F. (2009). "Mothur bilan tanishish: Mikrobial jamoalarni tavsiflash va taqqoslash uchun ochiq manbali, platformadan mustaqil, jamoat tomonidan qo'llab-quvvatlanadigan dastur". Amaliy va atrof-muhit mikrobiologiyasi. Amerika Mikrobiologiya Jamiyati. 75 (23): 7537–7541. doi:10.1128 / aem.01541-09. ISSN  0099-2240. PMC  2786419. PMID  19801464.
  2. ^ "Mothur v.1.0.0". mothur wiki. Olingan 2019-11-27.
  3. ^ a b "Relizlar". GitHub. Olingan 2019-11-27.
  4. ^ "mothur / mothur". GitHub. Olingan 2019-11-27.
  5. ^ "O'rnatish". mothur wiki. Olingan 2019-11-27.
  6. ^ "1.43.0 versiyasini chiqarish". GitHub. Olingan 2019-11-27.
  7. ^ "License.md". GitHub. Olingan 2019-11-27.
  8. ^ Rikki, SS; Atungulu, G.G .; Yomg'ir suvi, C.; Park, S.H. (2017). Oziq-ovqat va ozuqa xavfsizligi tizimlari va tahlili. Elsevier Science. p. 359. ISBN  978-0-12-849888-0. Olingan 13 iyun, 2018.
  9. ^ Orkett, B.N .; Silvan, JB .; Santelli, CM (2017). Okean po'stining geomikrobiologiyasining so'nggi yutuqlari. Chegaralarni tadqiq qilish mavzulari. p. 264. ISBN  978-2-88945-283-5. Olingan 13 iyun, 2018.
  10. ^ Karter, D.O .; Tomberlin, J.K .; Benbou, M.E .; Metkalf, JL (2017). Sud mikrobiologiyasi. Fokusdagi sud ekspertizasi. Vili. p. 180. ISBN  978-1-119-06257-8. Olingan 13 iyun, 2018.