NIAID ChemDB - NIAID ChemDB - Wikipedia

ChemDB OIV, fursatchi infektsiya va silni davolash bo'yicha ma'lumotlar bazasi
Tarkib
TavsifOIV va / yoki unga aloqador opportunistik infektsiyalarga qarshi sinovdan o'tgan kichik molekulalar
Aloqa
Ilmiy-tadqiqot markaziMilliy allergiya va yuqumli kasalliklar instituti (NIAID)
Ishlab chiqarilish sanasi1989
Kirish
Veb-saythttp://chemdb.niaid.nih.gov/

The ChemDB OIV, fursatchi infektsiya va silni davolash bo'yicha ma'lumotlar bazasi tomonidan ishlab chiqilgan ommaviy vositadir Milliy allergiya va yuqumli kasalliklar instituti potentsial terapevtik ta'sirga ega bo'lgan kichik molekulalar bo'yicha klinikadan oldingi ma'lumotlarni yig'ish OIV / OITS va shunga bog'liq opportunistik infektsiyalar.[1]

Xususiyatlari va mazmuni

1989 yildan beri ChemDB nashrida nashr etilgan adabiyotlar, konferentsiyalar materiallari va patentlardan olingan ma'lumotlar bilan yangilandi.[2] Ma'lumotlar birikma tuzilishi, kimyoviy xossalari, biologik faolligi (masalan, maqsadli protein, IC50, EC50, Sitotoksiklik, TI, Ki va yoki MIK ) va ma'lumotlarning tafsilotlari (masalan, muallif, jurnal).[3]

ChemDB veb-interfeysi biologik, matnli va kimyoviy ma'lumotlarni qidirishni qo'llab-quvvatlaydi Oracle matni, Accelrys Direct kimyoviy qidiruvi va ChemAxon's Marvin vositalari.[1] Ushbu vositalar veb-foydalanuvchilarga yuklangan yoki chizilgan kimyoviy tuzilmalar bilan o'xshashlik yoki moslashuvchanlik darajasini taqqoslash orqali ma'lumotlar bazasini qidirishga imkon beradi. Mantiqiy qo'shimcha izlanishlar tarkibni qidirish bilan birlashtirilib, qiziqish bo'yicha boshqa sohalarni, shu jumladan maqsadli organizmni yoki Lipinski hisobi. Ommaviy veb-interfeysdan tashqari, ilmiy tadqiqot hamjamiyati tomonidan ma'lumotlar bazasini to'liq yuklab olish mumkin.[2] Ma'lumotlar bazasi ekspertlar tomonidan ko'rib chiqilgan ilmiy tadqiqotlarda tez-tez ishlatiladi.[4][5][6][7][8][9][10][11][12][13]

Opportunistik patogenlar

Ushbu ma'lumotlar bazasiga kiritilgan imkoniyatli patogenlar:[1]

SIV
Besh
Inson sitomegalovirusi (HCMV)
Epstein-Barr virusi
Herpes simplex virusi 1
Herpes simplex virusi 2
Kaposi sarkomasi virus
Gepatit A virusi
Gepatit B virusi
Gepatit C virusi
Mycobacterium spp.
Pnevmotsistis karinni
Cryptococcus spp.
Candida spp.
Aspergillus spp.
Mikrosporidiya
Toxoplasma gondii
Cryptosporidium parvum
Leishmania spp.
Plazmodium spp.

Adabiyotlar

  1. ^ a b v "OITSga qarshi OIV / OI / Silga qarshi terapiya ma'lumotlar bazasi". Milliy sog'liqni saqlash institutlari, AQSh Sog'liqni saqlash va aholiga xizmat ko'rsatish vazirligi. Arxivlandi asl nusxasi 2012-01-17. Olingan 2012-01-24.
  2. ^ a b Rush M, Xuffman D, Noble G, Whiting M, Nasr M (2011 yil 25-26 avgust). "2011 yil AQSh gubernatori kimyosi bo'yicha ma'lumotlar bazasi va ochiq kimyo bo'yicha uchrashuv". NIAID ChemDB OIV / OITS ma'lumotlar bazasi.
  3. ^ "OITSga qarshi OIV / OI / Silga qarshi terapiya ma'lumotlar bazasi". Foydalanuvchi uchun qo'llanma. Milliy sog'liqni saqlash institutlari, AQSh Sog'liqni saqlash va aholiga xizmat ko'rsatish vazirligi. Olingan 2012-01-24.
  4. ^ Hochstayn C, Goshorn J, Chang F (2009). "Amerika Qo'shma Shtatlari Tibbiyot Milliy kutubxonasi Giyohvand moddalar haqida ma'lumot portali". Med Ref Serv Q. 28 (2): 154–163. doi:10.1080/02763860902816784. PMC  2760770. PMID  19384716.
  5. ^ Cheah EL, Heng PW, Chan LW (2010). Taguchi dizayni yordamida Magnolis officinalis-dan superkritik suyuqlik ekstraktsiyasini optimallashtirish va bosimli suyuqlik ekstraktsiyasini olish. Sep Purif Technol. 71 (3): 293–301. doi:10.1016 / j.seppur.2009.12.009.
  6. ^ Portugaliya J (2009). "O'simta qarshi dorilar uchun molekulyar tavsiflovchilarni DNK bilan kovalent bo'lmagan bog'lanish va antiproliferativ faollikka nisbatan baholash". BMC Farmakol. 9: 11. doi:10.1186/1471-2210-9-11. PMC  2758867. PMID  19758437.
  7. ^ Xiong S, Fan J, Kitazato K (2010). "Virusga qarshi siyanovirin-N oqsillari: uni ishlab chiqarishning hozirgi holati va qo'llanilishi" (PDF). Appl Microbiol Biotechnol. 86 (3): 805–12. doi:10.1007 / s00253-010-2470-1. hdl:10069/25148. PMID  20162270.
  8. ^ Kremb S, Helfer M, Heller V, Hoffmann D, Volf H, Kleinshmidt A, Cepok S, Hemmer B, Durner J, Brak-Verner R (2010). "EASY-HIT: OIV inhibitörlerinin ko'p sinflarini keng kashf qilish uchun OIVni to'liq takrorlash texnologiyasi". Mikrobga qarshi vositalar onasi. 54 (12): 5257–68. doi:10.1128 / AAC.00515-10. PMC  2981278. PMID  20876377.
  9. ^ Serafin K, Mazur P, Bak A, Leyn E, Tchertanov L, Muskadet JF, Polanski J (2011). "Etil malonat amidlar: OIV-integraza inhibatsiyasi uchun diketo kislota avlodlari bo'lagi". Bioorg Med Chem. 19 (16): 5000–5. doi:10.1016 / j.bmc.2011.06.054. PMID  21767953.
  10. ^ Durdagi S, Mavromoustakos T, Papdopoulos MG (2008). "3D QSAR CoMFA / CoMSIA, molekulyar biriktirish va fullerenga asoslangan OIV-1 PR inhibitörlerinin molekulyar dinamikasini o'rganish". Bioorg Med Chem Lett. 18 (23): 6283–9. doi:10.1016 / j.bmcl.2008.09.107. PMID  18951793.
  11. ^ Prasanna MD, Vondrasek J, Wlodawer A, Bha TN (2005). "InChI-ni 3-o'lchovli tuzilma, indeks va so'rovlar uchun qo'llash". Oqsillar. 60 (1): 001–004. doi:10.1002 / prot.20469. PMID  15861385.
  12. ^ Sanches R, Morgado E, Grau R (2005). "Genetik kod mantiqiy tuzilish. I. mantiqiy deduksiyaning ma'nosi". Matematik biologiya byulleteni. 67 (1): 001–014. doi:10.1016 / j.bulm.2004.05.005. PMID  15691536.
  13. ^ Chjan XW (2005). "SARS-koronavirus asosiy proteinazasi uchun prognozli farmakofor modelini yaratish". Eur J Med Chem. 40 (1): 57–62. doi:10.1016 / j.ejmech.2004.09.013. PMID  15642409.

Tashqi havolalar

  • NIAID ChemDB [1]