OnlineHPC - OnlineHPC

OnlineHPC
OnlineHPC ish oqimining dizayneri
OnlineHPC ish oqimining dizayneri
Tuzuvchi (lar)OnlineHPC
Yakuniy nashr
1.0 / 2012 yil 24 sentyabr (2012-09-24)
YozilganJava
Operatsion tizimLinux, Mac OS X, Microsoft Windows
LitsenziyaMulkiy EULA
Veb-saytonlaynhpc.com

The OnlineHPC bilan shug'ullanish uchun vositalarni etkazib beradigan bepul ommaviy veb-xizmat edi yuqori samarali kompyuterlar va onlayn ish oqimi muharriri. OnlineHPC foydalanuvchilarga ish oqimlarini onlayn ravishda ishlab chiquvchi dizayner yordamida loyihalashtirish va bajarishga hamda yuqori samarali kompyuterlar - klasterlar va bulutlar bilan ishlashga ruxsat berdi. Yuqori ishlash manbalariga kirish to'g'ridan-to'g'ri xizmatning foydalanuvchi interfeysida, ish oqimi tarkibiy qismlarida bo'lgani kabi mavjud edi. Taverna an'anaviy ravishda ishlatilgan ilmiy ish jarayoni kabi domenlarda ijro etish bioinformatika,[1][2] kiminformatika,[3] Dori, astronomiya,[4] ijtimoiy fan, musiqa va raqamli saqlash.[5]

Tarix

OnlineHPC boshlandi Axborot uzatish muammolari instituti 2012 yilda instituti tadqiqotchilari uchun loyiha sifatida ishlariga kirish huquqi talab etiladi kompyuter klasterlari va kim professional dasturchilar emas.

Loyihaning motivatsiyasi shundaki, tadqiqotchilarning ko'nikmalari va ishlash uchun zarur bo'lgan vakolatlar darajasi o'rtasida farq bor yuqori samarali hisoblash. HPC yo'lida kamida uchta to'siq mavjud:

  • Tadqiqotchi HPC provayderini topishi va kirish huquqini olish uchun otish tartib-qoidalariga o'tishi kerak;
  • Tadqiqotchiga ko'plab past darajadagi dasturiy ta'minotlarni o'rnatish va sozlash va raqamli sertifikatlar bilan ishlash kerak;
  • Tadqiqotchi kabi texnologiyalar va vositalar bilan tanishishi kerak MPI, ommaviy vazifa menejerlari yoki hatto veb-xizmatlar.

Oxirgi talab dastlabki ikki darajadan o'tgan eng taniqli tadqiqotchilarning aksariyatini to'xtatadi. Xizmat kompyuter klasterlari bilan ishlash uchun zarur bo'lgan to'liq oldindan tuzilgan vositalar to'plamini taqdim etish orqali to'siqlarni kamaytirishga qaratilgan: brauzer ichidagi terminal emulyatori, fayllar tizimi brauzeri, hisobga olish ma'lumotlari menejeri va ulkan vazifalar vositasi.

Bir muncha vaqt o'tgach, muhandislik va ilmiy vazifalar tadqiqotchilarga vazifalar oqimi - ish oqimlarini bajarishga imkon beradigan yanada mukammalroq vositalarni talab qilishi aniq bo'ldi. Agar bir qator ilmiy ish oqimlari mavjud bo'lmasa, ular deyarli barcha ish stoli dasturlari va shuning uchun maqsad soddaligi va foydalanuvchi tajribasini oshirishga qaratilgan onlayn muhitni yaratish edi.

Loyiha bioinformatikada ishlatilgan,[6][7] inson salomatligi,[8] telekommunikatsiya va boshqa domenlar.

2016-05 yil holatiga ko'ra, http://onlinehpc.com/ mavjud emas edi.

Imkoniyatlar

OnlineHPC ish oqimi dizaynerining ekran tasviri

OnlineHPC ish stoli va planshetlarida asosiy brauzerlardan (Firefox, Chrome va Internet Explorer) foydalanib, onlayn rejimida ish oqimini yaratuvchi dizaynerga ega edi.

OnlineHPC-dagi ish oqimlari quyidagilarni o'z ichiga oladi:

  • Kompyuter klasterlarida katta hisoblashlarni amalga oshirish
  • SABUN /WSDL va Dam olish Uchun veb-xizmatlar, maxsus komponent BioMart veb-xizmat.
  • R statistika xizmati
  • Loviya skript (Java o'xshash skript tili)
  • Masofadagi mashinalardagi tashqi vositalar (orqali ssh )
  • XPath xml ma'lumotlarini chiqarish
  • Ma'lumotlarni import qilish Microsoft Excel elektron jadvallar

Xizmatda, shuningdek, klasterlarda katta hisoblash vazifalarini tayyorlash va ishga tushirish uchun asosiy vositalar - brauzer ichidagi terminal emulyatori, fayl tizimi brauzeri va klaster holatini ko'rish vositasi mavjud edi. Foydalanuvchilar mavjud apparat klasterini ishlatishni yoki bulutda yangi klaster nusxasini sozlashni boshlashi mumkin.

Shuningdek qarang

Tashqi havolalar

Adabiyotlar

  1. ^ Stivens, R. D.; Robinson, A. J .; Gobl, C. A. (2003). "MyGrid: Axborot tarmog'idagi shaxsiylashtirilgan bioinformatika". Bioinformatika. 19: i302 – i304. doi:10.1093 / bioinformatika / btg1041. PMID  12855473.
  2. ^ Stivens, R. D.; Tipni, H. J .; Vro, C. J .; Oinn, T. M.; Senger, M.; Lord, P. V.; Gobl, C. A.; Guruch, A.; Tassabehji, M. (2004). "MyGrid yordamida Uilyams-Buren sindromini o'rganish". Bioinformatika. 20: i303 – i310. doi:10.1093 / bioinformatika / bth944. PMID  15262813.
  3. ^ Truskovskiy, A .; Jayaseelan, K .; Neyman, S .; Willighagen, E. L.; Zielesniy, A .; Steinbek, C. (2011). "CDK-Taverna ochiq oqim oqimining kimyoviy muhitidagi yangi o'zgarishlar". Cheminformatics jurnali. 3: 54. doi:10.1186/1758-2946-3-54. PMC  3292505. PMID  22166170.
  4. ^ Hook, R. N .; Romaniello, M .; Ullgren, M .; Jarvelaynen, P .; Maysala, S .; Oittinen, T .; Savolainen, V .; Solin, O .; Tyynelä, J .; Peron, M .; Izzo, C .; Licha, T. (2008). "ESO Reflex: Retseptlarni ishlatish uchun grafik ish mexanizmi". 2007 yil ESO asboblarini kalibrlash bo'yicha seminar. ESO Astrofizika simpoziumi Evropa janubiy rasadxonasi. p. 169. doi:10.1007/978-3-540-76963-7_23. ISBN  978-3-540-76962-0.
  5. ^ Raditsch, M.; Shlarb, S .; Mldrup-Dalum, P.; Medjkoune, L. (2012). "Eksperimental bajarish uchun veb-tarkibni bajariladigan ish oqimlari" (PDF).
  6. ^ Taverna Online - metagenomik misollar bilan, 22-iyul, dushanba kuni Keti Volstenkroft tomonidan ISMB-da texnologik trekning nutqi.
  7. ^ Taverna Online - metagenomik misollar bilan, Alan Uilyams, Manchester universiteti, Buyuk Britaniya
  8. ^ VPH-Share loyihasining yo'l xaritasi, VPH-ulushi Ettinchi ramka dasturi Evropa Ittifoqi loyihasi