PAN domeni - PAN domain

PAN_1
PDB 1hky EBI.jpg
eimeria tenella-dan pan modulining eritma tuzilishi
Identifikatorlar
BelgilarPAN_1
PfamPF00024
Pfam klanCL0168
InterProIPR003014
PROSITEPDOC00376
SCOP21 baravar / QOIDA / SUPFAM

PAN domenlar turli xil bajaradigan muhim funktsional ko'p qirrali xususiyatlarga ega biologik vositachilik qilish orqali rollar oqsil-oqsil va oqsil va uglevodlarning o'zaro ta'siri.[1] Ushbu domenlarda a mavjud sochlar uchun ilmoq o'xshash tuzilishga o'xshash, topilganiga o'xshash knottinlar ammo boshqa naqsh bilan disulfid birikmalari.

A'zolarining N-terminal domenlari ekanligi ko'rsatilgan plazminogen /gepatotsitlarning o'sish omili oila, olma domenlari plazma prekallikrein /koagulyatsion omil XI oila va turli xil domenlar nematod oqsillar bir xil superfamilaga, ya'ni PAN moduliga tegishli.[1] PAN domenida a mavjud saqlanib qolgan uchta disulfidli ko'prikning yadrosi. Oilaning ayrim a'zolarida qo'shimcha to'rtinchi disulfid ko'prigi mavjud N- va C-termini domen.

Olma domeni, shuningdek PAN domenining boshqa misollari 7 dan iborat b-iplar egri antiparallelga o'ralgan varaq beshik a-spiral. Ikki disulfidli bog'lanish spiralni markaziy β4 va -5 iplariga qulflaydi, uchinchisi esa domenning N- va C-terminalarini birlashtiradi. Olma domenida β4-β5 halqasi va β5-β6 o'zaro faoliyat tsikli a-spiraldan varaqning qarama-qarshi tomonida kichik cho'ntak hosil qiladi.[2]

Mahalliy plazminogenda PAN domeni beshta bilan bog'langan kringle domenlar.[3] PAN domeni va kringllarning o'zaro ta'siri mahalliy plazminogenning to'rtinchi majmuasini barqarorlashtirishda hal qiluvchi rol o'ynaydi;

Adabiyotlar

  1. ^ a b Tordai H, Banyai L, Patti L (1999 yil noyabr). "PAN moduli: plazminogen va gepatotsitlarning o'sish omilining N-terminal domenlari prekallikreinlar oilasining olma domenlari bilan va ko'plab nematod oqsillarida mavjud bo'lgan yangi domen bilan homologdir". FEBS Lett. 461 (1–2): 63–7. doi:10.1016 / s0014-5793 (99) 01416-7. PMID  10561497. S2CID  29929643.
  2. ^ Emsli J, McEwan PA, Gailani D (2010 yil aprel). "XI omilning tuzilishi va funktsiyasi". Qon. 115 (13): 2569–77. doi:10.1182 / qon-2009-09-199182. PMC  4828079. PMID  20110423.
  3. ^ Xue Y, Bodin C, Olsson K (2012). "Mahalliy plazminogenning kristalli tuzilishi aktivatsiyaga chidamli ixcham konformatsiyani ochib beradi". J Tromb Haemost. 10 (7): 1385–96. doi:10.1111 / j.1538-7836.2012.04765.x. PMID  22540246.
Ushbu maqola jamoat domenidagi matnlarni o'z ichiga oladi Pfam va InterPro: IPR003014