POLR2C - POLR2C

POLR2C
Mavjud tuzilmalar
PDB	Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	5IYC, 5IY6, 5IYD, 5IY8, 5IY7, 5IY9, 5IYA, 5IYB, %% s5IYD, 5IY8, 5IYC, 5IY6, 5IY7, 5IYA, 5IY9, 5IYB
Identifikatorlar
Taxalluslar	POLR2C, RPB3, RPB31, hRPB33, hsRPB3, polimeraza (RNK) II subbirligi C, RNK polimeraza II subbirligi C
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 180663 MGI: 109299 HomoloGene: 2017 Generkartalar: POLR2C
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 16 (odam)
Oxiri	57,472,009 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 8 (sichqoncha)
Oxiri	94,873,535 bp
RNK ekspressioni naqsh
	; ; ; ;
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• DNK bilan bog'lanish; • oqsillarni dimerizatsiya qilish faoliyati; • RNK polimeraza II faolligi; • DNKga yo'naltirilgan 5'-3 'RNK polimeraza faolligi; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish;
Uyali komponent	• mikrotubulali sitoskelet; • DNK yo'naltirilgan RNK polimeraza II, yadro kompleksi; • hujayra yadrosi; • nukleoplazma; • sitozol; • sitoplazma;
Biologik jarayon	• mRNK qo'shilishi, splitseozoma orqali; • RNK polimeraza II promotoridan transkripsiyaning uzayishi; • 7-metilguanozin mRNKning yopilishi; • transkripsiya bilan bog'langan nukleotid-eksizyonni tiklash; • RNK polimeraza II promotoridan transkripsiyani boshlash; • RNK polimeraza II promotoridan snRNA transkripsiyasi; • fibroblast o'sish omil retseptorlari signalizatsiya yo'li; • RNK polimeraza II promotoridan transkripsiya; • RNK metabolik jarayoni; • genlarni susaytirishni miRNA bilan tartibga solish; • transkripsiya, DNK-andozali; • somatik ildiz hujayralari populyatsiyasini saqlash; • virusli transkripsiyaning ijobiy regulyatsiyasi;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	5432
	20021
	ENSG00000102978
	ENSMUSG00000031783
	P19387; Q6FGR6
	P97760
	NM_002694; NM_032940
	NM_009090
	NP_116558; NP_116558.1
	NP_033116
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

DNKga yo'naltirilgan RNK polimeraza II subbirligi RPB3 bu ferment odamlarda kodlanganligi POLR2C gen.^[5]

Funktsiya

Ushbu gen uchinchi yirik subbirlikni kodlaydi RNK polimeraza II, messenjerni sintez qilish uchun mas'ul bo'lgan polimeraza RNK eukaryotlarda. Ushbu genning mahsuloti sisteinga boy mintaqani o'z ichiga oladi va boshqa polimeraza subbirligi bilan heterodimer sifatida mavjud, POLR2J. Ushbu ikkita kichik bo'linma polimeraza yadrosi pastki yig'ish birligini tashkil qiladi. A psevdogen 21-xromosomada aniqlangan.^[6]

O'zaro aloqalar

POLR2C ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan:

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000102978 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000031783 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Acker J, Mattei MG, Wintzerith M, Roeckel N, Depetris D, Vigneron M, Kedinger C (Avgust 1994). "Inson RNK polimeraza II subunit genlarining xromosomal lokalizatsiyasi". Genomika. 20 (3): 496–9. doi:10.1006 / geno.1994.1208. PMID 8034326.
^ "Entrez Gen: POLR2C polimeraza (RNK) II (DNK yo'naltirilgan) polipeptid C, 33kDa".
^ De Angelis R, Iezzi S, Bruno T, Corbi N, Di Padova M, Floridi A, Fanciulli M, Passananti C (Jul 2003). "RNK polimeraza II (RPB3) ning 3-bo'linmasining transkripsiya faktor-4 (ATF4) bilan funktsional o'zaro ta'siri". FEBS Lett. 547 (1–3): 15–9. doi:10.1016 / s0014-5793 (03) 00659-8. PMID 12860379. S2CID 33230891.
^ Corbi N, Bruno T, De Angelis R, Di Padova M, Libri V, Di Certo MG, Spinardi L, Floridi A, Fanciulli M, Passananti C (sentyabr 2005). "RNK polimeraza II subbirligi 3, psoriaz vulgaris nomzod gen mahsuloti bo'lgan HCR bilan o'zaro ta'siri orqali sitoplazmada saqlanib qoladi". J. Cell Sci. 118 (Pt 18): 4253-60. doi:10.1242 / jcs.02545. PMID 16141233.
^ ^a ^b Corbi N, Di Padova M, De Angelis R, Bruno T, Libri V, Iezzi S, Floridi A, Fanciulli M, Passananti C (oktyabr 2002). "Alfa o'xshash RNK-polimeraza II yadro kichik birligi 3 (RPB3) miogen omil miogenin bilan o'zaro ta'sir orqali to'qimalarga xos transkripsiya va mushaklarning differentsiatsiyasida ishtirok etadi". FASEB J. 16 (12): 1639–41. doi:10.1096 / fj.02-0123fje. PMID 12207009. S2CID 30243193.
^ ^a ^b ^v ^d ^e ^f ^g ^h ^men Acker J, de Graaff M, Cheynel I, Khazak V, Kedinger C, Vigneron M (Iyul 1997). "Inson RNK polimeraza II subbirliklari o'rtasidagi o'zaro ta'sir". J. Biol. Kimyoviy. 272 (27): 16815–21. doi:10.1074 / jbc.272.27.16815. PMID 9201987.
^ Bertolotti A, Melot T, Aker J, Vigneron M, Delattre O, Tora L (1998 yil mart). "EWS-FLI-1 emas, balki EWS ham TFIID, ham RNK polimeraza II bilan bog'liq: TET oilasining ikki a'zosi o'zaro ta'siri, EWS va hTAFII68 va TFIID va RNK polimeraza II komplekslarining subbirliklari". Mol. Hujayra. Biol. 18 (3): 1489–97. doi:10.1128 / mcb.18.3.1489. PMC 108863. PMID 9488465.

Qo'shimcha o'qish

Jeang KT (1998). "Tat, Tat bilan bog'liq kinaz va transkripsiya". J. Biomed. Ilmiy ish. 5 (1): 24–7. doi:10.1007 / BF02253352. PMID 9570510.
Yanqulov K, Bentley D (1998). "Transkripsiya nazorati: Tat kofaktorlari va transkripsiya uzayishi". Curr. Biol. 8 (13): R447-9. doi:10.1016 / S0960-9822 (98) 70289-1. PMID 9651670. S2CID 15480646.
Romano G, Kasten M, De Falco G, Micheli P, Khalili K, Giordano A (2000). "Cdk9 va T1 siklinining OIV-tat transaktivatsiya yo'li genlarini ekspressionida regulyativ funktsiyalari". J. hujayra. Biokimyo. 75 (3): 357–68. doi:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19991201) 75: 3 <357 :: AID-JCB1> 3.0.CO; 2-K. PMID 10536359.
Marcello A, Zoppé M, Giacca M (2002). "OIV-1 Tat transaktivatori orqali transkripsiyani boshqarishning ko'p usullari". IUBMB hayoti. 51 (3): 175–81. doi:10.1080/152165401753544241. PMID 11547919. S2CID 10931640.
Stivens M, De Clercq E, Balzarini J (2007). "OIV-1 transkripsiyasini tartibga solish: kimyoviy terapevtik aralashuv uchun molekulyar maqsadlar". Med Res Rev. 26 (5): 595–625. doi:10.1002 / med.20081. PMC 7168390. PMID 16838299.
Xarrix D, McMillan N, Munoz L, Apolloni A, Meredith L (2007). "Tatning turli xil o'zaro ta'siri yangi antitrovirus preparatlariga olib keladimi?". Giyohvandlikning dolzarb maqsadlari. 7 (12): 1595–606. doi:10.2174/138945006779025338. PMID 17168834.
Kato H, Sumimoto H, Pognonec P, Chen CH, Rozen CA, Roeder RG (1992). "OIV-1 Tat uyali uzayish omillari bilan birgalikda in vitro protsessivlik omili sifatida ishlaydi". Genlar Dev. 6 (4): 655–66. doi:10.1101 / gad.6.4.655. PMID 1559613.
Pati UK, Weissman SM (1990). "Odamning RNK polimerazasi II 33-kDa hRPB 33 ning aminokislotalar ketma-ketligi eukaryotlar orasida juda yaxshi saqlanib qolgan". J. Biol. Kimyoviy. 265 (15): 8400–3. PMID 2187864.
Southgate C, Zapp ML, Green MR (1990). "OIV-1 Tat oqsili bilan transkripsiyani boshqa oqsil orqali yangi paydo bo'lgan RNK bilan bog'langan holda faollashtirish". Tabiat. 345 (6276): 640–2. Bibcode:1990 yil Natur.345..640S. doi:10.1038 / 345640a0. PMID 2190099. S2CID 4233742.
Vu-Baer F, Sigman D, Gaynor RB (1995). "RNK polimeraza II ning inson immunitet tanqisligi virusi trans-faollashtiruvchi mintaqasi RNK bilan o'ziga xos bog'lanishi hujayra kofaktorlari va Tat tomonidan tartibga solinadi". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 92 (16): 7153–7. Bibcode:1995 yil PNAS ... 92.7153 Vt. doi:10.1073 / pnas.92.16.7153. PMC 41297. PMID 7638159.
Herrmann CH, Rays AP (1995). "Lentivirus Tat oqsillari, ayniqsa, RNK polimeraza II ning katta subbirligidagi karboksil-terminal domenini giperfosforillaydigan hujayra oqsili kinaza TAK bilan bog'lanadi: Tat kofaktoriga nomzod". J. Virol. 69 (3): 1612–20. doi:10.1128 / JVI.69.3.1612-1620.1995. PMC 188757. PMID 7853496.
Keen NJ, Gait MJ, Karn J (1996). "1-turdagi inson immunitet tanqisligi virusi Tat faollashtirilgan transkripsiya-uzaytirish kompleksining ajralmas qismidir". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 93 (6): 2505–10. Bibcode:1996 yil PNAS ... 93.2505K. doi:10.1073 / pnas.93.6.2505. PMC 39827. PMID 8637904.
Yang X, Herrmann CH, Rays AP (1996). "Inson immunitet tanqisligi virusi bo'lgan Tat oqsillari in vivo jonli ravishda TAK bilan birikadi va ishlash uchun RNK polimeraza II ning karboksil-terminal domenini talab qiladi". J. Virol. 70 (7): 4576–84. doi:10.1128 / JVI.70.7.4576-4584.1996. PMC 190394. PMID 8676484.
Agostini I, Navarro JM, Rey F, Bouhamdan M, Spire B, Vigne R, Sire J (1996). "Inson immunitet tanqisligi virusining 1-turi Vpr transaktivatori: promotor bilan bog'langan aktivator domenlari bilan hamkorlik va TFIIB bilan bog'lanish". J. Mol. Biol. 261 (5): 599–606. doi:10.1006 / jmbi.1996.0485. PMID 8800208.
Chjou Q, Sharp PA (1996). "Tat-SF1: OIV-1 Tat bilan transkripsiya cho'zilishini stimulyatsiya qiluvchi kofaktor". Ilm-fan. 274 (5287): 605–10. Bibcode:1996Sci ... 274..605Z. doi:10.1126 / science.274.5287.605. PMID 8849451. S2CID 13266489.
Okamoto H, Sheline CT, Corden JL, Jones KA, Peterlin BM (1996). "Inson immunitet tanqisligi virusi Tat oqsilining trans-faollashishi uchun RNK polimeraza II ning S-terminal domeni kerak". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 93 (21): 11575–9. Bibcode:1996 yil PNAS ... 9311575O. doi:10.1073 / pnas.93.21.11575. PMC 38099. PMID 8876177.
Chun RF, Jeang KT (1996). "RNK polimeraza II karboksil-terminal domeniga inson retroviruslari inson T-hujayrasi lenfotrop virusi I va OIV-1 faollashtirilgan transkripsiyasi uchun talablar". J. Biol. Kimyoviy. 271 (44): 27888–94. doi:10.1074 / jbc.271.44.27888. PMID 8910388.
Parada, CA, Roeder RG (1996). "RNK polimeraza II ning kengaytirilgan protsessivligi, uning karboksi-terminal domenining Tat tomonidan indikatsiyalangan fosforillanishidan kelib chiqadi". Tabiat. 384 (6607): 375–8. Bibcode:1996 yil Natur.384..375P. doi:10.1038 / 384375a0. PMID 8934526. S2CID 4278432.
García-Martines LF, Ivanov D, Gaynor RB (1997). "Tatning tozalangan OIV-1 va OIV-2 transkripsiyasini oldindan tayyorlash komplekslari bilan assotsiatsiyasi". J. Biol. Kimyoviy. 272 (11): 6951–8. doi:10.1074 / jbc.272.11.6951. PMID 9054383.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 16 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000102978 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000031783 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid8034326-5] Acker J, Mattei MG, Wintzerith M, Roeckel N, Depetris D, Vigneron M, Kedinger C (Avgust 1994). "Inson RNK polimeraza II subunit genlarining xromosomal lokalizatsiyasi". Genomika. 20 (3): 496–9. doi:10.1006 / geno.1994.1208. PMID 8034326.

[6] "Entrez Gen: POLR2C polimeraza (RNK) II (DNK yo'naltirilgan) polipeptid C, 33kDa".

[pmid12860379-7] De Angelis R, Iezzi S, Bruno T, Corbi N, Di Padova M, Floridi A, Fanciulli M, Passananti C (Jul 2003). "RNK polimeraza II (RPB3) ning 3-bo'linmasining transkripsiya faktor-4 (ATF4) bilan funktsional o'zaro ta'siri". FEBS Lett. 547 (1–3): 15–9. doi:10.1016 / s0014-5793 (03) 00659-8. PMID 12860379. S2CID 33230891.

[pmid16141233-8] Corbi N, Bruno T, De Angelis R, Di Padova M, Libri V, Di Certo MG, Spinardi L, Floridi A, Fanciulli M, Passananti C (sentyabr 2005). "RNK polimeraza II subbirligi 3, psoriaz vulgaris nomzod gen mahsuloti bo'lgan HCR bilan o'zaro ta'siri orqali sitoplazmada saqlanib qoladi". J. Cell Sci. 118 (Pt 18): 4253-60. doi:10.1242 / jcs.02545. PMID 16141233.

[pmid12207009-9] Corbi N, Di Padova M, De Angelis R, Bruno T, Libri V, Iezzi S, Floridi A, Fanciulli M, Passananti C (oktyabr 2002). "Alfa o'xshash RNK-polimeraza II yadro kichik birligi 3 (RPB3) miogen omil miogenin bilan o'zaro ta'sir orqali to'qimalarga xos transkripsiya va mushaklarning differentsiatsiyasida ishtirok etadi". FASEB J. 16 (12): 1639–41. doi:10.1096 / fj.02-0123fje. PMID 12207009. S2CID 30243193.

[pmid9201987-10] v ^d ^e ^f ^g ^h ^men Acker J, de Graaff M, Cheynel I, Khazak V, Kedinger C, Vigneron M (Iyul 1997). "Inson RNK polimeraza II subbirliklari o'rtasidagi o'zaro ta'sir". J. Biol. Kimyoviy. 272 (27): 16815–21. doi:10.1074 / jbc.272.27.16815. PMID 9201987.

[pmid9488465-11] Bertolotti A, Melot T, Aker J, Vigneron M, Delattre O, Tora L (1998 yil mart). "EWS-FLI-1 emas, balki EWS ham TFIID, ham RNK polimeraza II bilan bog'liq: TET oilasining ikki a'zosi o'zaro ta'siri, EWS va hTAFII68 va TFIID va RNK polimeraza II komplekslarining subbirliklari". Mol. Hujayra. Biol. 18 (3): 1489–97. doi:10.1128 / mcb.18.3.1489. PMC 108863. PMID 9488465.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]