Plakofilin-4 - Plakophilin-4

PKP4
Identifikatorlar
Taxalluslar	PKP4, p0071, plakofilin 4
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 604276 MGI: 109281 HomoloGene: 2689 Generkartalar: PKP4
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 2 (odam)
Oxiri	158,682,879 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 2 (sichqoncha)
Oxiri	59,355,208 bp
RNK ekspressioni naqsh
	; ; ; ;
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • kaderin bilan bog'lash;
Uyali komponent	• sitoplazma; • mil ustuni; • membrana; • GO: 0097483, GO: 0097481 postsinaptik zichlik; • hujayra hujayralarining aloqa zonasi; • hujayralararo birikma; • mil; • desmosoma; • hujayra birikmasi; • o'rtamiyona; • shpindel midzone; • sitoplazmaning perinuklear mintaqasi; • plazma membranasining sitoplazmatik tomoni; • mitotik mil; • sitoskelet; • kornişli konvert; • hujayra membranasi; • hujayra yadrosi;
Biologik jarayon	• hujayra-uyali signalizatsiya; • sitokinezning ijobiy regulyatsiyasi; • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 GTPase faolligini ijobiy tartibga solish; • hujayra yopishishini tartibga solish; • hujayraning yopishishi; • hujayra xujayralari birikmasi; • keratizatsiya; • kornifikatsiya; • hujayra hujayralarining yopishishi;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	8502
	227937
	ENSG00000144283
	ENSMUSG00000026991
	Q99569
	Q68FH0
NM_001005476; NM_001304969; NM_001304970; NM_001304971; NM_003628;
	NM_001377218; NM_001377219; NM_001377220; NM_001377221; NM_001377222; NM_001377223; NM_001377224; NM_001377225; NM_001377226
NM_026361; NM_175464; NM_001362990; NM_001362991; NM_001362992;
	NM_001362993; NM_001362994; NM_001362995; NM_001362996; NM_001362997; NM_001362998; NM_001362999
NP_001005476; NP_001291898; NP_001291899; NP_001291900; NP_003619;
	NP_001364147; NP_001364148; NP_001364149; NP_001364150; NP_001364151; NP_001364152; NP_001364153; NP_001364154; NP_001364155
NP_080637; NP_780673; NP_001349919; NP_001349920; NP_001349921;
	NP_001349922; NP_001349923; NP_001349924; NP_001349925; NP_001349926; NP_001349927; NP_001349928
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Plakofilin-4 a oqsil odamlarda kodlanganligi PKP4 gen.^[5]^[6]^[7]

Funktsiya

Armadilloga o'xshash oqsillar birinchi bo'lib Drosophila 'armadillo' geni mahsulotida aniqlangan bir qator armadillo takrorlanishlari bilan tavsiflanadi, ular odatda uzunligi 42 dan 45 gacha aminokislotalardir. Ushbu oqsillarni takrorlanish soni, umumiy ketma-ketlik o'xshashligi va takrorlanishning butun ketma-ketligi bo'yicha tarqalishiga qarab subfamilalarga bo'lish mumkin. Armadilloga o'xshash oqsillarning p120 (ctn) / plakofilin subfamiliyasi a'zolari, shu jumladan CTNND1, CTNND2, PKP1, PKP2, PKP4 va ARVCF. PKP4 desmosomal blyashka va boshqa yopishqoqlik plakatlarining tarkibiy qismi bo'lishi mumkin va birikma blyashka tashkiloti va kaderin funktsiyasini boshqarishda ishtirok etadi deb o'ylashadi. Ushbu gen uchun bir nechta transkript variantlari topilgan, ammo hozirgacha ulardan faqat ikkitasining to'liq metrajli tabiati tasvirlangan. Ushbu ikkita variant alohida izoformlarni kodlaydi.^[7]

O'zaro aloqalar

PKP4 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan:

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000144283 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000026991 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Paffenholz R, Franke VW (dekabr 1997). "Plakoglobin / armadillo multigene oilasining asabiy ta'sirlangan a'zosini aniqlash va lokalizatsiya qilish". Differentsiya. 61 (5): 293–304. doi:10.1046 / j.1432-0436.1997.6150293.x. PMID 9342840.
^ Xatsfeld M, Nachtsheim C (may 1997). "Armadillo oilasining yangi a'zosini klonlash va tavsifi, p0071, birikma plakasi bilan bog'liq: bir-biriga yaqin bo'lgan oqsillarning subfamiliyasi uchun dalillar". J Uyali ilmiy ish. 109 (11): 2767–78. PMID 8937994.
^ ^a ^b "Entrez Gen: PKP4 plakofilin 4".
^ Izawa I, Nishizawa M, Tomono Y, Ohtakara K, Takahashi T, Inagaki M (may 2002). "ERBIN epiteliya hujayralarining hujayra tutashgan joylarida armadillo oqsili p0071 bilan bog'lanadi". Gen hujayralari. 7 (5): 475–85. doi:10.1046 / j.1365-2443.2002.00533.x. PMID 12047349. S2CID 12598418.
^ Jaulin-Bastard F, Arsanto JP, Le Bivic A, Navarro C, Vély F, Saito H, Marchetto S, Xatsfeld M, Santoni MJ, Birnbaum D, Borg JP (yanvar 2002). "Epiteliya hujayralarida Erbin va Katenin bilan bog'liq oqsil o'rtasidagi o'zaro bog'liqlik". J. Biol. Kimyoviy. 277 (4): 2869–75. doi:10.1074 / jbc.M109652200. PMID 11711544.
^ Laura RP, Witt AS, Held HA, Gerstner R, Deshayes K, Koehler MF, Kosik KS, Sidhu SS, Lasky LA (aprel 2002). "Erbin PDZ domeni delta-katenin va ARVCF karboksil terminalariga yuqori yaqinlik va o'ziga xoslik bilan bog'lanadi". J. Biol. Kimyoviy. 277 (15): 12906–14. doi:10.1074 / jbc.M200818200. PMID 11821434.
^ Deguchi M, Iizuka T, Xata Y, Nishimura V, Xirao K, Yao I, Kavabe H, Takai Y (sentyabr 2000). "PAPIN. Neyrok plakofilinga bog'liq armadillo takroriy oqsil / delta-katenin va p0071 bilan o'zaro ta'sir qiluvchi yangi PSD-95 / Dlg-A / ZO-1 oqsillari". J. Biol. Kimyoviy. 275 (38): 29875–80. doi:10.1074 / jbc.M005384200. PMID 10896674.
^ Ohno H, Xirabayashi S, Iizuka T, Ohnishi H, Fujita T, Xata Y (oktyabr 2002). "P0071 bilan o'zaro ta'sir qiluvchi oqsillarni, plakofilin bilan bog'liq bo'lgan armadillo-takroriy protein bilan o'zaro ta'sir qiluvchi oqsilni (PAPIN) va ERBINni epiteliya hujayralarida lokalizatsiya qilish". Onkogen. 21 (46): 7042–9. doi:10.1038 / sj.onc.1205852. PMID 12370826.
^ Stahl B, Diehlmann A, Südhof TC (aprel 1999). "Altsgeymer kasalligi bilan bog'liq presenilin 1 ning armadillo oqsili p0071 bilan bevosita o'zaro ta'siri". J. Biol. Kimyoviy. 274 (14): 9141–8. doi:10.1074 / jbc.274.14.9141. PMID 10092585.

Qo'shimcha o'qish

Keil R, Wolf A, Hüttelmaier S, Xatsfeld M (2007). "Hujayra yopishqoqligini tartibga solishdan tashqari: p0071 katenin tomonidan parchalanadigan jo'yakda RhoA ning mahalliy nazorati". Hujayra aylanishi. 6 (2): 122–7. doi:10.4161 / cc.6.2.3741. PMID 17264675.
Bonne S, van Xengel J, van Roy F (1998). "P120 (ctn) / plakofilin oilasiga mansub inson armadillo genlarini xromosomal xaritasi". Genomika. 51 (3): 452–4. doi:10.1006 / geno.1998.5398. PMID 9721216.
Levesque G, Yu G, Nishimura M, Zhang DM, Levesque L, Yu H, Xu D, Liang Y, Rogaeva E, Ikeda M, Duthie M, Murgolo N, Vang L, VanderVere P, Bayne ML, Strader CD, Rommens JM. , Fraser PE, Sent-Jorj-Xislop P (1999). "Presenilinlar armadillo oqsillari bilan o'zaro ta'sir qiladi, shu jumladan neyronga xos plakofilinga bog'liq oqsil va beta-katenin". J. neyrokim. 72 (3): 999–1008. doi:10.1046 / j.1471-4159.1999.0720999.x. PMID 10037471. S2CID 36124450.
Stahl B, Diehlmann A, Südhof TC (1999). "Altsgeymer kasalligi bilan bog'liq presenilin 1 ning armadillo oqsili p0071 bilan bevosita o'zaro ta'siri". J. Biol. Kimyoviy. 274 (14): 9141–8. doi:10.1074 / jbc.274.14.9141. PMID 10092585.
Deguchi M, Iizuka T, Xata Y, Nishimura V, Xirao K, Yao I, Kavabe H, Takai Y (2000). "PAPIN. Neyrok plakofilinga bog'liq armadillo takroriy oqsil / delta-katenin va p0071 bilan o'zaro ta'sir qiluvchi yangi PSD-95 / Dlg-A / ZO-1 oqsillari". J. Biol. Kimyoviy. 275 (38): 29875–80. doi:10.1074 / jbc.M005384200. PMID 10896674.
Schröder R, van der Ven PF, Warlo I, Shumann H, Fürst DO, Blümcke I, Shmidt MC, Xatsfeld M (2001). "p0071, armadillo multigene oilasining a'zosi, inson skelet mushaklaridagi sarkomerik I-tasmalarning tarkibiy qismidir". J. Muskul Res. Hujayra. Motil. 21 (6): 577–86. doi:10.1023 / A: 1026587530656. PMID 11206135. S2CID 1342967.
Jaulin-Bastard F, Arsanto JP, Le Bivic A, Navarro C, Vély F, Saito H, Marchetto S, Xatsfeld M, Santoni MJ, Birnbaum D, Borg JP (2002). "Epiteliya hujayralarida Erbin va Katenin bilan bog'liq oqsil o'rtasidagi o'zaro bog'liqlik". J. Biol. Kimyoviy. 277 (4): 2869–75. doi:10.1074 / jbc.M109652200. PMID 11711544.
Izawa I, Nishizawa M, Tomono Y, Ohtakara K, Takahashi T, Inagaki M (2002). "ERBIN epiteliya hujayralarining hujayra tutashgan joylarida armadillo oqsili p0071 bilan bog'lanadi". Gen hujayralari. 7 (5): 475–85. doi:10.1046 / j.1365-2443.2002.00533.x. PMID 12047349. S2CID 12598418.
Ohno H, Xirabayashi S, Iizuka T, Ohnishi H, Fujita T, Xata Y (2002). "P0071 bilan o'zaro ta'sir qiluvchi oqsillarni, plakofilin bilan bog'liq bo'lgan armadillo-takroriy protein bilan o'zaro ta'sir qiluvchi oqsilni (PAPIN) va ERBINni epiteliya hujayralarida lokalizatsiya qilish". Onkogen. 21 (46): 7042–9. doi:10.1038 / sj.onc.1205852. PMID 12370826.
Calkins CC, Hoepner BL, Law CM, Novak MR, Setzer SV, Hatzfeld M, Kowalczyk AP (2003). "Armadillo oilasi oqsili p0071 VE-kaderin va desmoplakin bilan bog'lovchi oqsil". J. Biol. Kimyoviy. 278 (3): 1774–83. doi:10.1074 / jbc.M205693200. PMID 12426320.
Salomon AR, Ficarro SB, Brill LM, Brinker A, Phung QT, Erikson C, Sauer K, Brok A, Horn DM, Shults PG, Peters EC (2003). "Mass spektrometriya yordamida odam hujayralarida tirozin fosforillanish yo'llarini profillash". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 100 (2): 443–8. doi:10.1073 / pnas.2436191100. PMC 141014. PMID 12522270.
Xatsfeld M, Green KJ, Sauter H (2003). "P0071-ni desmozomalar va yopishgan birikmalarga yo'naltirish turli xil oqsil domenlari vositasida amalga oshiriladi". J. Cell Sci. 116 (Pt 7): 1219-33. doi:10.1242 / jcs.00275. PMID 12615965.
Setzer SV, Calkins CC, Garner J, Summers S, Green KJ, Kowalczyk AP (2004). "A431 epiteliya hujayralari birikmasini, yopishishini va migratsiyasini boshqarishda Armadillo oilasi oqsillarini qiyosiy tahlili". J. Invest. Dermatol. 123 (3): 426–33. doi:10.1111 / j.0022-202X.2004.23319.x. PMID 15304078.
Zhang Y, Wolf-Yadlin A, Ross PL, Pappin DJ, Rush J, Lauffenburger DA, White FM (2005). "Epidermal o'sish omili retseptorlari signalizatsiya tarmog'idagi tirozin fosforillanish joylarining vaqt bo'yicha aniqlangan mass-spektrometri dinamik modullarni ochib beradi". Mol. Hujayra. Proteomika. 4 (9): 1240–50. doi:10.1074 / mcp.M500089-MCP200. PMID 15951569.
Tao VA, Vullsheid B, O'Brayen R, Eng JK, Li XJ, Bodenmiller B, Uotts JD, Hood L, Aebersold R (2005). "Dendrimer konjugatsiya kimyosi va tandem mass-spektrometriyasi yordamida miqdoriy fosfoproteom tahlillari". Nat. Usullari. 2 (8): 591–8. doi:10.1038 / nmeth776. PMID 16094384. S2CID 20475874.
Olsen QK, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). "Signalizatsiya tarmoqlarida global, in vivo jonli va saytga xos fosforillanish dinamikasi". Hujayra. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 2 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000144283 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000026991 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid9342840-5] Paffenholz R, Franke VW (dekabr 1997). "Plakoglobin / armadillo multigene oilasining asabiy ta'sirlangan a'zosini aniqlash va lokalizatsiya qilish". Differentsiya. 61 (5): 293–304. doi:10.1046 / j.1432-0436.1997.6150293.x. PMID 9342840.

[pmid8937994-6] Xatsfeld M, Nachtsheim C (may 1997). "Armadillo oilasining yangi a'zosini klonlash va tavsifi, p0071, birikma plakasi bilan bog'liq: bir-biriga yaqin bo'lgan oqsillarning subfamiliyasi uchun dalillar". J Uyali ilmiy ish. 109 (11): 2767–78. PMID 8937994.

[entrez-7] "Entrez Gen: PKP4 plakofilin 4".

[pmid12047349-8] Izawa I, Nishizawa M, Tomono Y, Ohtakara K, Takahashi T, Inagaki M (may 2002). "ERBIN epiteliya hujayralarining hujayra tutashgan joylarida armadillo oqsili p0071 bilan bog'lanadi". Gen hujayralari. 7 (5): 475–85. doi:10.1046 / j.1365-2443.2002.00533.x. PMID 12047349. S2CID 12598418.

[pmid11711544-9] Jaulin-Bastard F, Arsanto JP, Le Bivic A, Navarro C, Vély F, Saito H, Marchetto S, Xatsfeld M, Santoni MJ, Birnbaum D, Borg JP (yanvar 2002). "Epiteliya hujayralarida Erbin va Katenin bilan bog'liq oqsil o'rtasidagi o'zaro bog'liqlik". J. Biol. Kimyoviy. 277 (4): 2869–75. doi:10.1074 / jbc.M109652200. PMID 11711544.

[pmid11821434-10] Laura RP, Witt AS, Held HA, Gerstner R, Deshayes K, Koehler MF, Kosik KS, Sidhu SS, Lasky LA (aprel 2002). "Erbin PDZ domeni delta-katenin va ARVCF karboksil terminalariga yuqori yaqinlik va o'ziga xoslik bilan bog'lanadi". J. Biol. Kimyoviy. 277 (15): 12906–14. doi:10.1074 / jbc.M200818200. PMID 11821434.

[pmid10896674-11] Deguchi M, Iizuka T, Xata Y, Nishimura V, Xirao K, Yao I, Kavabe H, Takai Y (sentyabr 2000). "PAPIN. Neyrok plakofilinga bog'liq armadillo takroriy oqsil / delta-katenin va p0071 bilan o'zaro ta'sir qiluvchi yangi PSD-95 / Dlg-A / ZO-1 oqsillari". J. Biol. Kimyoviy. 275 (38): 29875–80. doi:10.1074 / jbc.M005384200. PMID 10896674.

[pmid12370826-12] Ohno H, Xirabayashi S, Iizuka T, Ohnishi H, Fujita T, Xata Y (oktyabr 2002). "P0071 bilan o'zaro ta'sir qiluvchi oqsillarni, plakofilin bilan bog'liq bo'lgan armadillo-takroriy protein bilan o'zaro ta'sir qiluvchi oqsilni (PAPIN) va ERBINni epiteliya hujayralarida lokalizatsiya qilish". Onkogen. 21 (46): 7042–9. doi:10.1038 / sj.onc.1205852. PMID 12370826.

[pmid10092585-13] Stahl B, Diehlmann A, Südhof TC (aprel 1999). "Altsgeymer kasalligi bilan bog'liq presenilin 1 ning armadillo oqsili p0071 bilan bevosita o'zaro ta'siri". J. Biol. Kimyoviy. 274 (14): 9141–8. doi:10.1074 / jbc.274.14.9141. PMID 10092585.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]