Pnevmoviridae - Pneumoviridae

Pnevmoviridae
Ijms-20-04657-g008.webp
Pnevmovirus tuzilishi va genomi
Elektron mikograf ning Inson ortopnevmovirusi
Viruslarning tasnifi e
(ochilmagan):Virus
Shohlik:Riboviriya
Qirollik:Orthornavirae
Filum:Negarnavirikota
Sinf:Monjiviritset
Buyurtma:Mononegavirales
Oila:Pnevmoviridae
Turlar va turlar[1]

Pnevmoviridae (yunoncha pneumo-, o'pka, -viridae, lotincha virus, zahar, shilimshiq suyuqlikdan)[2][3] tartibda viruslar oilasi Mononegavirales.[4] U 2015 yilda erigan eritmani ko'tarish orqali yaratilgan paramiksoviral subfamily Pnevmovirina.[5] Tabiiy xostlarga odamlar, qoramollar va kemiruvchilar kiradi.[6] Hozirda ularning 5 turi mavjud Pnevmoviridae 2 avlodga bo'lingan oila (Metapnevmovirus va Ortopnevmovirus ).[4] Pnevmoviruslar diametri 150 dan 200 nm gacha o'zgarib turadigan sferik va filamentli o'ralgan virionlar (virus zarralari) ishlab chiqarishga qodir pleomorfdir. The nukleokapsid oqsil qobig'i va virusli nuklein kislotalardan tashkil topgan spiral simmetriyaga ega. Nukleokapsidlarning diametri 13,5 nm, spiral balandligi 6,5 nm.[7] Genom negativ bo'lmagan bir simli RNKdan iborat bo'lib, u segmentlarga bo'linmaydi. Uning hajmi taxminan 15kb va 11 ta oqsilni kodlaydi.[6] Genomning o'ziga xos xususiyati M2 genidir, u M2-1 va M2-2 oqsillarini kodlaydi. The Pnevmoviridae M2-1 oqsili o'ziga xosdir va boshqa biron bir virus oilasida gomolog topilmadi. U virus RNKga bog'liq bo'lgan RNK polimeraza uchun protsessivlik omili sifatida ishlaydi va virusli RNK sinteziga yordam beradi.[8] Ushbu oiladagi viruslar ko'pincha nafas yo'llarining infektsiyalari bilan bog'liq bo'lib, nafas olish yo'llari orqali yuqadi.[6]

Taksonomiya

Oila Pnevmoviridae: nasl, turlar va ularning viruslari[4][9]
JinsTurlarVirus (qisqartirish)
MetapnevmovirusQushlarning metapnevoviruslari *qush metapnevovirus (AMPV)
Inson metapnevmovirusiinson metapnevovirus (HMPV)
OrtopnevmovirusQoramol ortopnevmovirusisigirning nafas olish yo'llari bilan yuqadigan virusi (BRSV)
Inson ortopnevmovirusi *odamning nafas olish sinditsial virusi A2 (HRSV-A2)
inson nafas yo'llari bilan ishlaydigan sititsial virus B1 (HRSV-B1)
Murine orthopneumovirusmurin pnevmoniya virusi (MPV)

Jadval afsonasi: "*" turlarning turlarini bildiradi.

Inson metapnevmovirusi

Odam metapnömovirusi birinchi marta 2001 yilda pnevmovirus deb tasniflangan. Inson metapnömovirusi (HMPV) - bu salbiy, bir zanjirli RNK virusi bo'lib, u yosh bolalarda pastki nafas yo'llari infektsiyasining ikkinchi eng keng tarqalgan sababi hisoblanadi. Pnevmovirus boshqa Paramyxoviridae va Orthomyxoviridae o'rtasida kattaligi bo'yicha oraliqdir. Sitoplazmatik qo'shimchalar oiladagi boshqa viruslarga qaraganda ancha zichroq. Inson metapnevovirusi sizning oddiy shamollashingizga juda o'xshaydi; bu yuqori nafas yo'llarining infektsiyasi. Bu odatda qishda va erta bahorda sodir bo'ladi. Ushbu o'ziga xos infektsiya ko'pincha bolalarda, ayniqsa besh yoshgacha bo'lganlarda uchraydi. Umumiy simptomlar orasida burun oqishi, tiqilishi, tomoq og'rig'i, yo'tal, bosh og'rig'i va isitma bor, bu esa sovuq kabi ko'rinishi mumkin. Odatda bir necha kundan keyin yo'qoladi. Agar bu 75 yoshdan oshgan odamlarda kuzatilsa, u holda tashvishga sabab bor, chunki u pnevmoniyaga aylanishi mumkin.[10][11][12][13][14]

Hayot davrasi

Pnevmoviruslar mezbon hujayraning sitoplazmasida ko'payadi.[4][6] Birinchidan, virus hujayra yuzasida ifodalangan HN glikoprotein retseptorlari bilan bog'lanadi.[6] Keyin, termoyadroviy oqsil ta'sirida virus mezbon plazma membranasiga birikadi va nukleokapsid ajralib chiqadi.[6] Replikatsiya qilinishidan oldin mRNK transkripsiyalanadi va virusli oqsillar tarjima qilinadi. Transkripsiya virusni kodlangan RNKga bog'liq bo'lgan RNK-polimerazaga bog'liq bo'lib, u genomni 3 'etakchi mintaqada bog'laydi va keyinchalik har bir genni ketma-ket transkripsiyalaydi. Virusli oqsillarni tarjimasi xujayra ribosomalari tomonidan amalga oshiriladi.[15][16] Yangi takrorlangan genom atrofida kapsid hosil qilish uchun etarli miqdorda P, N, L va M2 oqsillari mavjud bo'lganda, virus replikatsiyaga uchraydi.[16] Replikatsiyadan so'ng P, L va M oqsillari ribonukleokapsidni hosil qilishda ishtirok etadi. Virion yig'ilishi tugagandan so'ng, virion hujayradan chiqib, tashqariga chiqadi.[16]

Oqsillar

N- Nukleokapsid oqsili. Virusli replikatsiya va transkripsiya uchun zarur. Virusli genom atrofida kapsid hosil bo'lishida katta rol o'ynaydi.[17]

P- Replikatsiya uchun zarur bo'lgan fosfoprotein.[17] RNKga bog'liq bo'lgan RNK polimeraza biriktirilishini osonlashtiradi va M2 oqsilini jalb qiladi.[18]

M1- Matritsa oqsili. Nukleokapsid va konvertlarning o'zaro ta'sirini osonlashtiradi.[19]

M2-1- Matritsa oqsili. MRNA transkripsiyasining cho'zilishi uchun zarur bo'lgan intragenik va intergenik transkripsiya omili.[17] Yangi tugashni bog'laydi va muddatidan oldin tugatilishining oldini olish uchun barqarorlikni ta'minlaydi.[20]

M2-2- Matritsa oqsili. Transkripsiya va replikatsiyani tartibga solishda ishtirok etadi. Haddan tashqari ta'sirlanganda, virusning ko'payishiga to'sqinlik qiladi.[21]

F- birlashma oqsili. Virus va mezbon hujayra membranasi o'rtasida birlashishni osonlashtiradigan I turdagi glikoprotein.[22]

SH- Kichik hidrofob oqsil. Muhim emas. To'liq funktsiyasi noma'lum. Membrana o'tkazuvchanligini o'zgartirish va apoptozni blokirovka qilish uchun tavsiya etilgan.[22][23]

G- II turdagi glikoprotein.[22] Glikozaminoglikanlar bilan o'zaro ta'sirlashish orqali virus biriktirilishini osonlashtiradi.[24]

L- RNKga bog'liq bo'lgan RNK polimeraza.[25] Replikatsiya uchun talab qilinadi.[17] Metillangan guanozin qopqog'i va poli (A) dumini yangi paydo bo'lgan mRNKga qo'shadi.[25]

Adabiyotlar

  1. ^ "Virus taksonomiyasi: 2018 yilgi chiqish" (HTML). Viruslar taksonomiyasi bo'yicha xalqaro qo'mita (ICTV). 2018 yil oktyabr. Olingan 6 fevral 2019.
  2. ^ "Onlayn etimologiya lug'ati". www.etymonline.com. Olingan 2016-12-14.
  3. ^ "Onlayn etimologiya lug'ati". www.etymonline.com. Olingan 2016-12-14.
  4. ^ a b v d "ICTV Online (10-chi) hisobot".
  5. ^ Afonso, Klaudio L.; Amarasinghe, Gaya K.; Banyay, Kristsyan; Bao, Yimin; Basler, Kristofer F.; Bavari, Sina; Beyjerman, Nikolas; Blasdell, Kim R .; Briand, Fransua-Xaver (2016-08-01). "Mononegavirales buyurtmasi taksonomiyasi: yangilanish 2016". Virusologiya arxivi. 161 (8): 2351–2360. doi:10.1007 / s00705-016-2880-1. ISSN  1432-8798. PMC  4947412. PMID  27216929.
  6. ^ a b v d e f "ViralZone: Pnevmovirus". viralzone.expasy.org. Olingan 2016-12-14.
  7. ^ Gutshe, Irina; Desfosses, Ambroise; Effantin, Gregori; Ling, Vay Li; Xaupt, Melina; Ruigrok, Rob V. X.; Sakse, Karsten; Shohn, Guy (2015-04-16). "Nukleokapsid spiral qizamiq virusining atomga yaqin kriyo-EM tuzilishi". Ilm-fan. 348 (6235): 704–7. Bibcode:2015Sci ... 348..704G. doi:10.1126 / science.aaa5137. ISSN  0036-8075. PMID  25883315.
  8. ^ Kuh, Jens H. (2015 yil noyabr). "Paramyxoviral subfamily Pneumovirinae-ni Mononegavirales tartibida Pneumoviridae oilaviy oilaviy maqomiga ko'tarish va bitta pnevmoviral turini qayta nomlash" (PDF). ICTV. ICTV. Arxivlandi asl nusxasi (PDF) 2016-09-10. Olingan 2016-12-14.
  9. ^ Amarasinghe, Gaya K.; Bao, Yimin; Basler, Kristofer F.; Bavari, Sina; Pivo, Martin; Beyjerman, Nikolas; Blasdell, Kim R .; Bochnovski, Alisa; Briz, Tomas (2017-04-07). "Mononegavirales buyurtmasi taksonomiyasi: yangilanish 2017". Virusologiya arxivi. 162 (8): 2493–2504. doi:10.1007 / s00705-017-3311-7. ISSN  1432-8798. PMC  5831667. PMID  28389807.
  10. ^ "Pnevmovirus". Bepul lug'at.
  11. ^ "Inson metapnevmovirusi (hMPV) to'g'risida ma'lumot oling". Amerika o'pka assotsiatsiyasi. Olingan 2016-05-13.
  12. ^ "Wolters Kluwer Health - maqola ochilish sahifasi". pt.wkhealth.com. Olingan 2016-05-13.
  13. ^ Bao, Xiaoyong; Liu, Tyanshuang; Shan, Yichu; Li, Kui; Garofalo, Roberto P.; Casola, Antonella (2008-05-30). "Inson metapnömovirusi Glikoprotein G tug'ma immunitetni inhibe qiladi". PLOS Pathog. 4 (5): e1000077. doi:10.1371 / journal.ppat.1000077. ISSN  1553-7374. PMC  2386556. PMID  18516301.
  14. ^ Peiris, J.S. Malik; Tang, Wing-Hong; Chan, Kvok-Xang; Khong, Pek-Lan; Guan, Yi; Lau, Yu-Lung; Chiu, Syuzan S. (2003-06-01). "Gonkongda metapnevovirus bilan kasallangan nafas olish kasalligi bo'lgan bolalar". Rivojlanayotgan yuqumli kasalliklar. 9 (6): 628–633. doi:10.3201 / eid0906.030009. ISSN  1080-6040. PMC  3000155. PMID  12781000.
  15. ^ Iston, Endryu J.; Domaxovsk, Jozef B.; Rozenberg, Helene F. (2017-05-01). "Hayvonlarning pnevmoviruslari: molekulyar genetika va patogenezi". Klinik mikrobiologiya sharhlari. 17 (2): 390–412. doi:10.1128 / CMR.17.2.390-412.2004. ISSN  0893-8512. PMC  387412. PMID  15084507.
  16. ^ a b v Panda, Swagatika; Mohakud, Nirmal Kumar; Pena, Lindomar; Kumar, Subrat (2014). "Inson metapnömovirusi: muhim nafas olish yo'llari patogenini ko'rib chiqish". Xalqaro yuqumli kasalliklar jurnali. 25: 45–52. doi:10.1016 / j.ijid.2014.03.1394. PMID  24841931.
  17. ^ a b v d Stoks, H. L .; Iston, A. J .; Marriott, A. C. (2003-01-01). "Kimyoviy pnevovirus nukleokapsid (N) oqsillari nafas olish sinitsial virusi N oqsilining ishlashi uchun zarur bo'lgan aminokislotalarni aniqlashga imkon beradi". Umumiy virusologiya jurnali. 84 (10): 2679–2683. doi:10.1099 / vir.0.19370-0. PMID  13679601.
  18. ^ Renner, Maks; Bertinelli, Mattiya; Leyrat, Sedrik; Paesen, Gvido S.; Oliveira, Laura Freitas Saraiva de; Xyusskonen, Yuxa T.; Grimes, Jonathan M. (2016-02-15). "Pnevmoviruslarda nukleokapsid yig'ilishi N oqsilining konformatsion kommutatsiyasi bilan tartibga solinadi". eLife. 5: e12627. doi:10.7554 / eLife.12627. ISSN  2050-084X. PMC  4798948. PMID  26880565.
  19. ^ Tomas., Leytner (2002-01-01). Odam viruslarining molekulyar epidemiologiyasi. Springer AQSh. p. 330. OCLC  852790083.
  20. ^ Leyrat, Sedrik; Renner, Maks; Xarlos, Karl; Xyusskonen, Yuxa T.; Grimes, Jonathan M. (2014-05-19). "M2-1 antiterminatorining konformatsion dinamikasidagi keskin o'zgarishlar pnevmovirinadagi transkripsiya samaradorligini tartibga soladi". eLife. 3: e02674. doi:10.7554 / eLife.02674. ISSN  2050-084X. PMC  4051120. PMID  24842877.
  21. ^ Cheng, Xing; Park, HyunJung; Chjou, Xelen; Jin, Xong (2005-11-15). "Nafas olish sinditsial virusi M2-2 oqsilining haddan tashqari namoyon bo'lishi virus ko'payishini inhibe qiladi". Virusologiya jurnali. 79 (22): 13943–13952. doi:10.1128 / JVI.79.22.13943-13952.2005. ISSN  0022-538X. PMC  1280200. PMID  16254330.
  22. ^ a b v Melero, Xose A.; Mas, Visente (2015-11-02). "Pneumovirinae termoyadroviy (F) oqsili: vaktsinalar va antivirallar uchun umumiy maqsad". Viruslarni o'rganish. Maxsus masala: Virusli infektsiyaga hujayralardagi javob. 209: 128–135. doi:10.1016 / j.virusres.2015.02.024. PMID  25738581.
  23. ^ Graf, Miranda de; Herfst, Sander; Aarbiou, Jamil; Burgerlar, Piter S.; Fotiha shahridagi Zaraoui-Butahar; Bijl, Marten; Icken, Vilfred van; Schrauwen, Eefje J. A.; Osterhaus, Albert D. M. E. (2013-03-06). "Inson metapnevovirusining kichik gidrofob oqsili viruslarning ko'payishiga va xost genlarining ekspluatatsiyasiga ta'sir qilmaydi". PLOS One. 8 (3): e58572. Bibcode:2013PLoSO ... 858572D. doi:10.1371 / journal.pone.0058572. ISSN  1932-6203. PMC  3590193. PMID  23484037.
  24. ^ Tammavat, Suttivan; Sadlon, Taniya A.; Xolsvort, Piter G.; Gordon, Devid L. (2008-12-01). "Uyali glikozaminoglikanlarning roli va Virusli G oqsilining zaryadlangan mintaqalari inson metapnevovirus infektsiyasida". Virusologiya jurnali. 82 (23): 11767–11774. doi:10.1128 / JVI.01208-08. ISSN  0022-538X. PMC  2583676. PMID  18786997.
  25. ^ a b Paesen, Gvido S.; Kollet, Aksel; Salamand, Korin; Debart, Fransua; Vasseur, Jan-Jak; Kanad, Bruno; Dekroli, Etien; Grimes, Jonathan M. (2015-11-09). "Mononegavirales L-oqsil domenining rentgen tuzilishi va faoliyati". Tabiat aloqalari. 6: 8749. Bibcode:2015 NatCo ... 6.8749P. doi:10.1038 / ncomms9749. ISSN  2041-1723. PMC  4659945. PMID  26549102.