RAB1B - RAB1B

RAB1B

Protein RAB1B PDB 2fol.png

Mavjud tuzilmalar

Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB

PDB id kodlari ro'yxati
3JZA, 3NKV, 4HLQ, 4I1O

Identifikatorlar

RAB1B, RAS onkogen oilasi a'zosi

Tashqi identifikatorlar

OMIM: 612565 MGI: 1923558 HomoloGene: 128838 Generkartalar: RAB1B

Gen joylashuvi (odam)

Chr.	Xromosoma 11 (odam)^[1]

Band	11q13.2	Boshlang	66,268,590 bp^[1]
Band	11q13.2	Oxiri	66,277,492 bp^[1]

Gen joylashuvi (Sichqoncha)

Chr.	Xromosoma 19 (sichqoncha)^[2]

Band	19 \| 19 A	Boshlang	5,099,205 bp^[2]
Band	19 \| 19 A	Oxiri	5,107,072 bp^[2]

RNK ekspressioni naqsh

Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari

Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• nukleotid bilan bog'lanish • GTP majburiyligi • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish • GTPase faoliyati
Uyali komponent	• sitoplazma • avtofagosomadan oldingi tuzilish membranasi • Golgi apparati • membrana • Golgi membranasi • transport pufagi • mitoxondriya • hujayra tashqari ekzozoma • endoplazmatik to'r-Golgi oraliq bo'linma membranasi • endoplazmik retikulum-Golgi oraliq bo'limi • endoplazmatik to'r pardasi • sitozol • sitoplazmaning perinuklear mintaqasi
Biologik jarayon	• endotelial ichak to'sig'ini o'rnatish • glikoprotein metabolik jarayonini ijobiy tartibga solish • avtofagiya • avtofagosoma yig'ilishini tartibga solish • Golgi pufakchali vositasida transport • COPII pufakchali qoplamasi • oqsillarni tashish • retrograd vesikula vositasida transport, Golgi ER ga • tarjimadan keyingi modifikatsiya • transport • hujayra ichidagi oqsillarni tashish • Rab oqsil signalini o'tkazish
Manbalar:Amigo / QuickGO

Turlar

Inson

Sichqoncha


81876


76308


ENSG00000174903


ENSMUSG00000024870


Q9H0U4


Q9D1G1

RefSeq (mRNA)


NM_030981


NM_029576

RefSeq (oqsil)


NP_112243


NP_083852

Joylashuv (UCSC)

Chr 11: 66.27 - 66.28 Mb

Chr 19: 5.1 - 5.11 Mb

PubMed qidirmoq

^[3]

^[4]

Insonni ko'rish / tahrirlash

Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Ras bilan bog'liq protein Rab-1B a oqsil odamlarda kodlanganligi RAB1B gen.^[5]^[6]

O'zaro aloqalar

RAB1B ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan GOLGA2.^[7]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000174903 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000024870 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Chen D, Guo J, Gahl VA (mart 1997). "Inson melanomasi hujayralarida ifodalangan RAB GTPazalari". Biochim Biofhys Acta. 1355 (1): 1–6. doi:10.1016 / S0167-4889 (96) 00169-3. PMID 9030196.
^ "Entrez Gen: RAB1B RAB1B, RAS a'zosi onkogen oilasi".
^ Weide, T; Bayer M; Köster M; Siebrasse J P; Peters R; Barnekow A (2001 yil aprel). "Golgi matritsasi oqsili GM130: kichik GTPase rab1b ning o'zaro ta'sir qiluvchi sherigi". EMBO vakili. Angliya. 2 (4): 336–41. doi:10.1093 / embo-report / kve065. ISSN 1469-221X. PMC 1083862. PMID 11306556.

Qo'shimcha o'qish

Plutner H, Cox AD, Pind S va boshq. (1991). "Rab1b endoplazmik retikulum va ketma-ket Golgi bo'limlari o'rtasida pufakchali transportni tartibga soladi". J. Hujayra Biol. 115 (1): 31–43. doi:10.1083 / jcb.115.1.31. PMC 2289927. PMID 1918138.
Soldati T, Rancaño C, Geissler H, Pfeffer SR (1995). "Rab7 va Rab9 biokimyoviy jihatdan ajralib turadigan jarayonlar bilan kech endosomalarga olinadi". J. Biol. Kimyoviy. 270 (43): 25541–8. doi:10.1074 / jbc.270.43.25541. PMID 7592724.
Uilson AL, Sheridan KM, Erdman RA, Malta WA (1996). "GTPaza faolligi o'zgargan Rab1B mutantining prenilatsiyasi hujayrasiz tizimlarda buziladi, ammo buzilmagan sutemizuvchilar hujayralarida emas". Biokimyo. J. 318 (Pt 3): 1007-14. doi:10.1042 / bj3181007. PMC 1217717. PMID 8836150.
Overmeyer JH, Uilson AL, Erdman RA, Malta WA (1998). "The Putative" Switch 2 "Ras bilan bog'liq bo'lgan GTPase domeni, Rab1B, Rab Escort oqsillari bilan o'zaro aloqada muhim rol o'ynaydi". Mol. Biol. Hujayra. 9 (1): 223–35. doi:10.1091 / mbc.9.1.223. PMC 25245. PMID 9437002.
Weide T, Koster M, Barnekow A (1999). "Rab1b ning harakatsiz va faol mutantlari maqsadli membranalarga mahkam qo'shilmagan". Int. J. Onkol. 15 (4): 727–36. doi:10.3892 / ijo.15.4.727. PMID 10493955.
Xartli JL, Temple GF, Brasch MA (2001). "In vitro saytga xos rekombinatsiyadan foydalangan holda DNKni klonlash". Genom Res. 10 (11): 1788–95. doi:10.1101 / gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R va boshq. (2001). "Inson genlari va oqsillari katalogiga qarab: 500 cDNA ning to'liq kodlangan oqsillarini izchillik bilan tahlil qilish". Genom Res. 11 (3): 422–35. doi:10.1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A va boshq. (2001). "Keng ko'lamli cDNA sekvensiyasi bilan aniqlangan yangi oqsillarni tizimli hujayralararo lokalizatsiyasi". EMBO vakili. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-report / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Vayd T, Bayer M, Köster M va boshqalar. (2001). "Golgi matritsasi oqsili GM130: kichik GTPase rab1b ning o'zaro ta'sir qiluvchi sherigi". EMBO vakili. 2 (4): 336–41. doi:10.1093 / embo-report / kve065. PMC 1083862. PMID 11306556.
Zhao H, Ettala O, Väänänen HK (2002). "Kichkina GTP bilan bog'langan rab oqsillarini klonlash va subcellular lokalizatsiya tadqiqotlari natijasida aniqlangan suyak rezorbtsiyalovchi osteoklastlarda hujayra ichidagi membranalar savdosi yo'llari". Biokimyo. Biofiz. Res. Kommunal. 293 (3): 1060–5. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 00326-1. PMID 12051767.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH va boshq. (2003). "15000 dan ortiq to'liq uzunlikdagi odam va sichqonchani cDNA sekanslarini yaratish va dastlabki tahlil qilish". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002 yil PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Gerxard DS, Vagner L, Feingold EA va boshq. (2004). "NIH to'liq uzunlikdagi cDNA loyihasining holati, sifati va kengayishi: sutemizuvchilar genlari to'plami (MGC)". Genom Res. 14 (10B): 2121-7. doi:10.1101 / gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wiemann S, Arlt D, Huber V va boshqalar. (2004). "ORFeome'dan Biologiyaga: funktsional genomika quvuri". Genom Res. 14 (10B): 2136-44. doi:10.1101 / gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Fischer J, Vayd T, Barnekow A (2005). "MICAL oqsillari va rab1: sitoskelet bilan bog'lanish mumkinmi?". Biokimyo. Biofiz. Res. Kommunal. 328 (2): 415–23. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.12.182. PMID 15694364.
Bayer M, Fischer J, Kremerskothen J va boshq. (2006). "Iporinni rab1 uchun yangi o'zaro hamkorlik sherigi sifatida aniqlash va tavsifi". BMC Cell Biol. 6 (1): 15. doi:10.1186/1471-2121-6-15. PMC 1079803. PMID 15796781.
Mehrle A, Rozenfelder H, Shupp I va boshq. (2006). "2006 yilda LIFEdb ma'lumotlar bazasi". Nuklein kislotalari rez. 34 (Ma'lumotlar bazasi muammosi): D415-8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Ewing RM, Chu P, Elisma F va boshq. (2007). "Mass-spektrometriya bo'yicha odam oqsillari va oqsillarning o'zaro ta'sirini keng miqyosda xaritalash. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
Monetta P, Slavin I, Romero N, Alvarez C (2007). "Rab1b GBF1 bilan o'zaro aloqada bo'lib, ARF1 Dynamics va COPI Assotsiatsiyasini modulyatsiya qiladi". Mol. Biol. Hujayra. 18 (7): 2400–10. doi:10.1091 / mbc.E06-11-1005. PMC 1924811. PMID 17429068.
Machner MP, Isberg RR (2007). "Ikki funktsional bakterial oqsil GDI siljishini Rab1 aktivatsiyasiga bog'laydi". Ilm-fan. 318 (5852): 974–7. Bibcode:2007 yil ... 318..974M. doi:10.1126 / science.1149121. PMID 17947549. S2CID 21889766.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 11 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.