RAB9A - RAB9A

RAB9A

Protein RAB9A PDB 1s8f.png

Mavjud tuzilmalar

Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB

PDB id kodlari ro'yxati
1WMS

Identifikatorlar

RAB9A, RAB9, RAS a'zosi onkogen oilasi

Tashqi identifikatorlar

OMIM: 300284 MGI: 1890695 HomoloGene: 20900 Generkartalar: RAB9A

Gen joylashuvi (odam)

Chr.	X xromosoma (odam)^[1]

Band	Xp22.2	Boshlang	13,689,128 bp^[1]
Band	Xp22.2	Oxiri	13,710,504 bp^[1]

Gen joylashuvi (Sichqoncha)

Chr.	X xromosoma (sichqoncha)^[2]

Band	X \| X F5	Boshlang	166,457,253 bp^[2]
Band	X \| X F5	Oxiri	166,479,867 bp^[2]

RNK ekspressioni naqsh

Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari

Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• nukleotid bilan bog'lanish • YaIMning majburiyligi • GTP majburiyligi • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish • GTPase faoliyati • bir xil protein bilan bog'lanish
Uyali komponent	• endosoma • kech endosoma • fagotsitik vazikula membranasi • Golgi apparati • endoplazmatik to'r pardasi • membrana • Golgi membranasi • hujayra membranasi • fagotsitik pufakcha • endoplazmatik to'r • lizosoma • hujayra tashqari ekzozoma • sitoplazmatik vazikula • sitoplazmatik vazikula membranasi • Golgi trans-membranasi • sitozol • transport pufagi • melanosoma
Biologik jarayon	• simbiont molekulyar funktsiyasi tomonidan salbiy regulyatsiya • oqsillarni lokalizatsiyasini tartibga solish • Golgi uchun endosomali retrograd transport • oqsillarni tashish • ekzotsitozning ijobiy regulyatsiyasi • transport • hujayra ichidagi oqsillarni tashish • Rab oqsil signalini o'tkazish
Manbalar:Amigo / QuickGO

Turlar

Inson

Sichqoncha


9367


56382


ENSG00000123595


ENSMUSG00000079316


P51151


Q9R0M6

RefSeq (mRNA)


NM_004251 NM_001195328


NM_019773

RefSeq (oqsil)


NP_001182257 NP_004242


NP_062747

Joylashuv (UCSC)

Chr X: 13.69 - 13.71 Mb

Chr X: 166.46 - 166.48 Mb

PubMed qidirmoq

^[3]

^[4]

Insonni ko'rish / tahrirlash

Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Ras bilan bog'liq protein Rab-9A a oqsil odamlarda kodlanganligi RAB9A gen.^[5]^[6]

O'zaro aloqalar

RAB9A ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan RABEPK,^[7] TIP47^[8] va Lizosoma bilan bog'liq organoidlar biogenezi kompleksi 3.^[9]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000123595 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000079316 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Devies JP, Cotter PD, Ioannou YA (may 1997). "Odamning Rab7 va Rab9 cDNA ketma-ketliklarini klonlash va xaritalash va Rab9 psevdogenini aniqlash". Genomika. 41 (1): 131–4. doi:10.1006 / geno.1997.4644. PMID 9126495.
^ "Entrez Gen: RAB9A RAB9A, RAS a'zosi onkogen oilasi".
^ Díaz E, Schimmöller F, Pfeffer SR (iyul 1997). "Endosomadan TGNgacha tashish uchun zarur bo'lgan yangi Rab9 effektori". J. Hujayra Biol. 138 (2): 283–90. doi:10.1083 / jcb.138.2.283. PMC 2138197. PMID 9230071.
^ Kerol KS, Xanna J, Simon I, Krise J, Barbero P, Pfeffer SR (may 2001). "TIP47 tomonidan retseptorlarni jalb qilishni osonlashtirishda Rab9 GTPase-ning roli". Ilm-fan. 292 (5520): 1373–6. doi:10.1126 / science.1056791. PMID 11359012.
^ Kloer DP, Rojas R, Ivan V, Moriyama K, van Vlimen T, Murti N, Girlando R, van der Sluijs P, Xerli JH, Bonifacino JS (mart 2010). "Lizosomaga bog'liq organellar kompleksi-3 (BLOC-3) biogenezini yig'ish va uning Rab9 bilan o'zaro ta'siri". J. Biol. Kimyoviy. 285 (10): 7794–7804. doi:10.1074 / jbc.M109.069088. PMC 2844223. PMID 20048159.

Qo'shimcha o'qish

Shapiro AD, Pfeffer SR (1995). "Prenil Rab9, YaIM dissotsilanish inhibitori-alfa va guanin nukleotidlari o'rtasidagi o'zaro ta'sirlarning miqdoriy tahlili". J. Biol. Kimyoviy. 270 (19): 11085–90. doi:10.1074 / jbc.270.19.11085. PMID 7744738.
Soldati T, Riederer MA, Pfeffer SR (1993). "Rab GDI: rab9 oqsili uchun eruvchan va qayta ishlash omili". Mol. Biol. Hujayra. 4 (4): 425–34. doi:10.1091 / mbc.4.4.425. PMC 300943. PMID 8389620.
Díaz E, Schimmöller F, Pfeffer SR (1997). "Endosomadan TGNgacha tashish uchun zarur bo'lgan yangi Rab9 effektori". J. Hujayra Biol. 138 (2): 283–90. doi:10.1083 / jcb.138.2.283. PMC 2138197. PMID 9230071.
de Leeuw HP, Koster PM, Calafat J, Janssen H, van Zonneveld AJ, van Mourik JA, Voorberg J (1998). "Inson endotelial hujayralarida GTP bilan bog'langan kichik oqsillar". Br. J. Xematol. 103 (1): 15–9. doi:10.1046 / j.1365-2141.1998.00965.x. PMID 9792283.
Shisheva A, Chinni SR, DeMarco C (1999). "Rab oqsillarini membranada chiqarilishida YaIM dissotsilanish inhibitori 2 ning umumiy roli: uning in vitro va in vivo jonli tarkibiy modifikatsiyalari bilan funktsional o'zaro ta'sirining modulyatsiyasi". Biokimyo. 38 (36): 11711–21. doi:10.1021 / bi990200r. PMID 10512627.
Kerol KS, Xanna J, Simon I, Krise J, Barbero P, Pfeffer SR (2001). "TIP47 tomonidan retseptorlarni jalb qilishni osonlashtirishda Rab9 GTPase-ning roli". Ilm-fan. 292 (5520): 1373–6. doi:10.1126 / science.1056791. PMID 11359012.
Orzaez D, de Jong AJ, Woltering EJ (2001). "PIRIN oqsilining pomidorli gomologi dasturlashtirilgan hujayralar o'limida chaqiriladi". Mol zavodi. Biol. 46 (4): 459–68. doi:10.1023 / A: 1010618515051. PMID 11485202.
Mishel F, Soler-Lopez M, Petosa C, Kramer P, Siebenlist U, Myuller CW (2002). "Bcl-3 ankirin takroriy domenining kristalli tuzilishi: IkappaB oqsillar oilasining noyob a'zosi". EMBO J. 20 (22): 6180–90. doi:10.1093 / emboj / 20.22.6180. PMC 125740. PMID 11707390.
Barbero P, Bittova L, Pfeffer SR (2002). "Tirik hujayralardagi endosomalardan trans-Goljiga Rab9 vositachiligida pufakchani tashish vizualizatsiyasi". J. Hujayra Biol. 156 (3): 511–8. doi:10.1083 / jcb.200109030. PMC 2173336. PMID 11827983.
Xanna J, Kerol K, Pfeffer SR (2002). "Rab9 ulanishi uchun zarur bo'lgan TIP47 qoldiqlarini aniqlash". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 99 (11): 7450–4. doi:10.1073 / pnas.112198799. PMC 124251. PMID 12032303.
Walter M, Devies JP, Ioannou YA (2004). "Telomeraza immortalizatsiyasi Rab9 ekspresiyasini tartibga soladi va Nemann-Pick C1 endosomalaridan LDL xolesterin chiqishini tiklaydi". J. Lipid Res. 44 (2): 243–53. doi:10.1194 / jlr.M200230-JLR200. PMID 12576506.
Seaman MN (2004). "Golgi-ga olib chiqish uchun endosomal yuklarni selektiv saralash retromerni talab qiladi". J. Hujayra Biol. 165 (1): 111–22. doi:10.1083 / jcb.200312034. PMC 2172078. PMID 15078902.
Chen L, DiGiammarino E, Chjou XE, Vang Y, Toh D, Hodge TW, Meehan EJ (2004). "Insonning Rab9 GTPazasining yuqori aniqlikdagi kristalli tuzilishi: yangi antiviral dori maqsadi". J. Biol. Kimyoviy. 279 (38): 40204–8. doi:10.1074 / jbc.M407114200. PMID 15263003.
Ganley IG, Kerrol K, Bittova L, Pfeffer S (2005). "Rab9 GTPase endosomaning kech kattaligini tartibga soladi va uning barqarorligi uchun effektor ta'sirini talab qiladi". Mol. Biol. Hujayra. 15 (12): 5420–30. doi:10.1091 / mbc.E04-08-0747. PMC 532021. PMID 15456905.
Ganley IG, Pfeffer SR (2006). "Rab9 xolesterin birikmasini sekvestrlari va NPC1 tanqis hujayralarida kech endosoma funktsiyasini buzadi". J. Biol. Kimyoviy. 281 (26): 17890–9. doi:10.1074 / jbc.M601679200. PMC 3650718. PMID 16644737.
Aivazian D, Serrano RL, Pfeffer S (2006). "TIP47 - bu Rab9 lokalizatsiyasining asosiy effektori". J. Hujayra Biol. 173 (6): 917–26. doi:10.1083 / jcb.200510010. PMC 2063917. PMID 16769818.

PDB galereyasi
1s8f: Yalpi ichki mahsulotga nisbatan murakkab Rab9 kristalli tuzilishi II kaliti faol konformatsiyasi bilan dimerni aniqlaydi 1wms: Odamning Rab9 GTPazasining yuqori aniqlikdagi kristalli tuzilishi: antiviral preparatning yangi maqsadi 1yzl: GppNHp-Bound Rab9 GTPase

Ushbu maqola gen insonga X xromosoma va / yoki unga tegishli oqsil a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.