RBM4 - RBM4

RBM4

Protein RBM4 PDB 2dgt.png

Mavjud tuzilmalar

Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB

PDB id kodlari ro'yxati
2DNQ

Identifikatorlar

RBM4, LARK, RBM4A, ZCCHC21, ZCRB3A, RNK bilan bog'lovchi motifli oqsil 4

Tashqi identifikatorlar

OMIM: 602571 MGI: 1100865 HomoloGene: 82510 Generkartalar: RBM4

Gen joylashuvi (odam)

Chr.	Xromosoma 11 (odam)^[1]

Band	11q13.2	Boshlang	66,638,617 bp^[1]
Band	11q13.2	Oxiri	66,668,374 bp^[1]

Gen joylashuvi (Sichqoncha)

Chr.	Xromosoma 19 (sichqoncha)^[2]

Band	19 \| 19 A	Boshlang	4,784,293 bp^[2]
Band	19 \| 19 A	Oxiri	4,793,901 bp^[2]

Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• mRNKgacha intronik pirimidinga boy ulanish • mRNKgacha intronik bog'lanish • miRNA bilan bog'lanish • rux ioni bilan bog'lash • metall ionlari bilan bog'lanish • mRNA 3'-UTR majburiy • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish • RNK bilan bog'lanish • nuklein kislota bilan bog'lanish • mRNA bilan bog'lanish • siklin bilan bog'lanish
Uyali komponent	• sitoplazma • yadro zarrasi • nukleoplazma • nukleus • Stress granulasi • hujayra yadrosi • sitozol
Biologik jarayon	• hujayralarni differentsiatsiyasi • nukleotsitoplazmatik transportni tartibga solish • RNKni qayta ishlash • tarjimani salbiy tartibga solish • tarjimani stressga javoban salbiy tartibga solish • tarjima boshlanishining salbiy regulyatsiyasi • mushak hujayralarining farqlanishini ijobiy tartibga solish • mRNKni qayta ishlash • mishyak o'z ichiga olgan moddaga javob • splitseozoma orqali muqobil mRNK qo'shilishini tartibga solish • mustaqil ravishda tarjima qilishni boshlash • tarjimani sirkadiyalik tartibga solish • miRNA vositachiligida tarjimani inhibe qilish • Chiziqli mRNKning IRESga bog'liq tarjima boshlanishi • RNK qo'shilishi • genning RNK tomonidan susayishi • sirkadiyalik soatni fotoperiod orqali o'rganish • mRNA cis birikmasi, splitseozoma orqali
Manbalar:Amigo / QuickGO

Turlar

Inson

Sichqoncha


5936


19653


ENSG00000173933


ENSMUSG00000094936


Q9BWF3


Q8C7Q4

RefSeq (mRNA)


NM_002896 NM_001198843 NM_001198844


NM_001290122 NM_001290123 NM_001290124 NM_001290125 NM_009032

RefSeq (oqsil)


NP_001185772 NP_001185773 NP_002887


NP_001277051 NP_001277052 NP_001277053 NP_001277054 NP_033058

Joylashuv (UCSC)

Chr 11: 66.64 - 66.67 Mb

Chr 19: 4.78 - 4.79 Mb

PubMed qidirmoq

^[3]

^[4]

Insonni ko'rish / tahrirlash

Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

RNK bilan bog'langan oqsil 4 a oqsil odamlarda kodlanganligi RBM4 gen.^[5]^[6]^[7]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000173933 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000094936 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Jekson FR, Banfi S, Guffanti A, Rossi E (Iyul 1997). "Insonlarga mevali chivinlardan saqlanib qolgan, tarkibida RNK bilan bog'lovchi yangi sink barmoqlari bo'lgan protein". Genomika. 41 (3): 444–52. doi:10.1006 / geno.1997.4704. PMID 9169144.
^ Lin JC, Tarn WY (noyabr 2005). "Alfa-tropomiyosin mRNKdagi ekzon tanlovi RBM4 va PTB antagonistik ta'sirida tartibga solinadi". Mol hujayrasi biol. 25 (22): 10111–21. doi:10.1128 / MCB.25.22.10111-10121.2005. PMC 1280272. PMID 16260624.
^ "Entrez Gen: RBM4 RNK bilan bog'lovchi motifli oqsil 4".

Qo'shimcha o'qish

Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-kepka: eukaryotik mRNAlarning kepka tuzilishini oligoribonukleotidlar bilan almashtirishning oddiy usuli". Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagava K, Maruyama K va boshq. (1997). "To'liq boyitilgan va 5'darajali boyitilgan cDNA kutubxonasini qurish va tavsifi". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Andersen JS, Lion CE, Fox AH va boshqalar. (2002). "Inson yadrosi yo'naltirilgan proteomik tahlil". Curr. Biol. 12 (1): 1–11. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID 11790298. S2CID 14132033.
Bernert G, Fountoulakis M, Lubec G (2003). "Manifold matrinin 3 oqsil miqdorini pasaytirdi, homila Down sindromi miyasida vosita oqsillari HMP va hlarkni kamaytirdi". Proteomika. 2 (12): 1752–7. doi:10.1002 / 1615-9861 (200212) 2:12 <1752 :: AID-PROT1752> 3.0.CO; 2-Y. PMID 12469345.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH va boshq. (2003). "15000 dan ortiq to'liq uzunlikdagi odam va sichqonchani cDNA sekanslarini yaratish va dastlabki tahlil qilish". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Petersen XH, Xilpert J, Milits D va boshq. (2003). "Megalinni megalin bog'lovchi oqsil (MegBP) bilan funktsional o'zaro ta'siri, yangi tetratrico peptid takroriy o'z ichiga olgan adapter molekulasi". J. Cell Sci. 116 (Pt 3): 453-61. doi:10.1242 / jcs.00243. PMID 12508107.
Lay MC, Kuo HW, Chang WC, Tarn WY (2003). "Yangi qo'shilish regulyatori SR oqsillari bilan yadroviy import yo'lini taqsimlaydi". EMBO J. 22 (6): 1359–69. doi:10.1093 / emboj / cdg126. PMC 151058. PMID 12628928.
Ota T, Suzuki Y, Nishikava T va boshq. (2004). "21,243 to'liq uzunlikdagi odam cDNA-larining to'liq ketma-ketligi va tavsifi". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Diederichs S, Bäumer N, Ji P va boshq. (2004). "A1-CDK2 tsiklin kompleksining o'zaro ta'sir sheriklari va substratlarini aniqlash". J. Biol. Kimyoviy. 279 (32): 33727–41. doi:10.1074 / jbc.M401708200. PMID 15159402.
Gerxard DS, Vagner L, Feingold EA va boshq. (2004). "NIH to'liq metrajli cDNA loyihasining holati, sifati va kengayishi: sutemizuvchilar genlari to'plami (MGC)". Genom Res. 14 (10B): 2121-7. doi:10.1101 / gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rush J, Moritz A, Li KA va boshq. (2005). "Saraton hujayralarida tirozin fosforillanishining immunoafinity profilaktikasi". Nat. Biotexnol. 23 (1): 94–101. doi:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T va boshq. (2005). "Odamning oqsil va oqsil bilan o'zaro aloqasi tarmog'ining proteom miqyosli xaritasi tomon". Tabiat. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Kimura K, Vakamatsu A, Suzuki Y va boshq. (2006). "Transkripsiya modulyatsiyasining diversifikatsiyasi: keng ko'lamli identifikatsiyalash va inson genlarining muqobil alternativ targ'ibotchilarini tavsiflash". Genom Res. 16 (1): 55–65. doi:10.1101 / gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Kar A, Havlioglu N, Tarn WY, Wu JY (2006). "RBM4 intronik element bilan o'zaro ta'sir qiladi va tau exon 10 qo'shilishini rag'batlantiradi". J. Biol. Kimyoviy. 281 (34): 24479–88. doi:10.1074 / jbc.M603971200. PMC 2072872. PMID 16777844.
Markus MA, Geynrix B, Raitskin O va boshq. (2006). "WT1 biriktiruvchi RBM4 oqsili bilan o'zaro ta'sir qiladi va uning in vivo jonli muqobil birikmasini modulyatsiya qilish qobiliyatini tartibga soladi". Muddati Hujayra rez. 312 (17): 3379–88. doi:10.1016 / j.yexcr.2006.07.008. PMID 16934801.
Lin JC, Hsu M, Tarn WY (2007). "Hujayra stressi tarjimani boshqarishda regulyatsion RBM4 oqsilini qo'shish funktsiyasini modulyatsiya qiladi". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 104 (7): 2235–40. doi:10.1073 / pnas.0611015104. PMC 1893002. PMID 17284590.

PDB galereyasi
2dgt: RNK bilan bog'laydigan oqsil 30 da ikkinchi RNK bilan bog'lanish sohasining eritma tuzilishi 2dnq: RNK bilan bog'laydigan oqsil 30 da RNKni bog'lash sohasi 1 ning eritma tuzilishi

Bu oqsil bilan bog'liq maqola a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.