Issiqlik shoki gen ekspressioni (ROSE) elementining repressiyasi - Repression of heat shock gene expression (ROSE) element

Issiqlik shoki gen ekspressioni (ROSE) elementining repressiyasi
	Bashorat qilingan ikkilamchi tuzilish va ketma-ketlikni saqlash ROSE ning
Identifikatorlar
Belgilar	ROSE
Rfam	RF00435
Boshqa ma'lumotlar
RNK turi	Cis-reg; termoregulyator
Domen (lar)	Bakteriyalar
SO	SO: 0000204
PDB tuzilmalar	PDBe

MicroROSE RNK ning 3D tuzilishining namoyishi. Bu eritmadan olingan NMR microROSE elementining tuzilishi.^[1]

The issiqlik shoki gen ekspressioni (ROSE) elementining repressiyasi bu RNK elementi topilgan 5 'UTR ba'zi bir issiqlik zarbasi oqsillari mRNAlar. ROSE elementi RNK termometri bu salbiy tartibga soladi issiqlik zarbasi gen ekspressioni. Ikkilamchi strukturani harorat o'zgargan deb hisoblaydi, shuning uchun u RNK termometridir. Ushbu tuzilma ga kirishni bloklaydi ribosomalarni bog'lash joyi normal haroratda. Biroq issiqlik zarbasi paytida tuzilish bo'shashmasdan o'zgaradi ribosoma majburiy sayt va ifoda paydo bo'lishiga imkon beruvchi.^[2]^[3]

Ushbu RNK elementining qisman tuzilishi yordamida aniqlandi NMR.^[1]

ROSE₁ va ROSE_AT2

ROSE₁ va ROSE_AT2 ROSE elementlarining o'ziga xos misollari.^[4] ROSE₁ topilgan Bradyrhizobium japonicum ROSE esa_AT2 dan chambarchas bog'liq bo'lgan element Agrobacterium tumefaciens. Ikkala RNK elementlari o'xshash ikkilamchi tuzilmalar ROSE bilan₁ qo'shimcha narsaga ega bo'lish soch tolasi.^[4] Barcha ROSE elementlari qarama-qarshi tomonga xos "bo'rttirilgan G" ni o'z ichiga oladi Shine-Dalgarno ketma-ketligi majburiy sayt, bu holda nukleotid RNK termometri haroratga sezgirligini yo'qotadi.^[5]

IpbA

IpbA issiqlik zarbasi oqsilining turlari Pseudomonas ROSE tipidagi RNK termometr bilan boshqariladi. Ushbu termometr faqat ikkita haiprindan iborat. Bu inhibe qiladi tarjima IpbA ning past haroratlarda va harorat ko'tarilganda tarjima qilishga imkon beradi.^[6]

rhlA va lsdI ROSE-ga o'xshash elementlar

Pseudomonas aeruginosa kvorumni aniqlash - bog'liq virulentlik omillari termoregulyatsiya qilinishi mumkin. R'OZ termometrining 5'UTR qiymatida mavjud rhlA va 5'UTR da ROSE-ga o'xshash termometr lasI past haroratlarda tarjimani blokirovka qilish.^[7]

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

^ ^a ^b Chowdhury S, Maris C, Allain FH, Narberhaus F (2006). "RNK termometri yordamida haroratni aniqlashning molekulyar asoslari". EMBO J. 25 (11): 2487–2497. doi:10.1038 / sj.emboj.7601128. PMC 1478195. PMID 16710302.
^ Noker, A; Hausherr T; Balsiger S; Krstulovich NP; Hennecke H; Narberhaus F (2001). "MRNA asosidagi termosensor rizobial issiqlik zarbasi genlarining ekspressionini boshqaradi". Nuklein kislotalari rez. 29 (23): 4800–4807. doi:10.1093 / nar / 29.23.4800. PMC 96696. PMID 11726689.
^ Balsiger, S; Ragaz C; Baron C; Narberhaus F (2004). "Agrobacterium tumefaciens kichik issiqlik shoki genlarini replikonga xos tartibga solish". J bakteriol. 186 (20): 6824–6829. doi:10.1128 / JB.186.20.6824-6829.2004. PMC 522190. PMID 15466035.
^ ^a ^b Narberhaus F, Waldminghaus T, Chowdhury S (2006 yil yanvar). "RNK termometrlari". FEMS Mikrobiol. Vah. 30 (1): 3–16. doi:10.1111 / j.1574-6976.2005.004.x. PMID 16438677. Arxivlandi asl nusxasi 2013-01-05 da. Olingan 2010-07-20.
^ Nocker A, Hausherr T, Balsiger S, Krstulovic NP, Hennecke H, Narberhaus F (dekabr 2001). "MRNA asosidagi termosensor rizobial issiqlik zarbasi genlarining ekspressionini boshqaradi". Nuklein kislotalari rez. 29 (23): 4800–4807. doi:10.1093 / nar / 29.23.4800. PMC 96696. PMID 11726689. Olingan 2010-07-20.
^ Krayevskiy, SS; Nagel, M; Narberhaus, F (2013). "Qisqa ROSEga o'xshash RNK termometrlari psevdomonas turlarida IbpA sintezini boshqaradi". PLOS ONE. 8 (5): e65168. doi:10.1371 / journal.pone.0065168. PMC 3669281. PMID 23741480.
^ Grosso-Bekerra, Mariya Viktoriya; Kroda-Garsiya, Jerardo; Merino, Enrike; Servin-Gonsales, Luis; Moxica-Espinosa, Raul; Soberon-Chaves, Gloriya (2014-10-28). "Pseudomonas aeruginosa virulentlik omillarini ikkita yangi RNK termometrlari tomonidan tartibga solish". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 111 (43): 15562–15567. doi:10.1073 / pnas.1402536111. ISSN 1091-6490. PMC 4217398. PMID 25313031.

Qo'shimcha o'qish

De La Fuente, M.; Valera, S .; Martines-Guitarte, J. L. (2012). "NcRNA va termoregulyatsiya: prokaryotlar va eukaryotlarda ko'rinish". FEBS xatlari. 586 (23): 4061–4069. doi:10.1016 / j.febslet.2012.10.018. PMID 23098758.

Tashqi havolalar

Issiqlik shoki gen ekspressioni (ROSE) elementini bostirish uchun sahifa da Rfam

Bu molekulyar yoki hujayra biologiyasi maqola a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[pmid16710302-1] Chowdhury S, Maris C, Allain FH, Narberhaus F (2006). "RNK termometri yordamida haroratni aniqlashning molekulyar asoslari". EMBO J. 25 (11): 2487–2497. doi:10.1038 / sj.emboj.7601128. PMC 1478195. PMID 16710302.

[2] Noker, A; Hausherr T; Balsiger S; Krstulovich NP; Hennecke H; Narberhaus F (2001). "MRNA asosidagi termosensor rizobial issiqlik zarbasi genlarining ekspressionini boshqaradi". Nuklein kislotalari rez. 29 (23): 4800–4807. doi:10.1093 / nar / 29.23.4800. PMC 96696. PMID 11726689.

[3] Balsiger, S; Ragaz C; Baron C; Narberhaus F (2004). "Agrobacterium tumefaciens kichik issiqlik shoki genlarini replikonga xos tartibga solish". J bakteriol. 186 (20): 6824–6829. doi:10.1128 / JB.186.20.6824-6829.2004. PMC 522190. PMID 15466035.

[Narb06-4] Narberhaus F, Waldminghaus T, Chowdhury S (2006 yil yanvar). "RNK termometrlari". FEMS Mikrobiol. Vah. 30 (1): 3–16. doi:10.1111 / j.1574-6976.2005.004.x. PMID 16438677. Arxivlandi asl nusxasi 2013-01-05 da. Olingan 2010-07-20.

[5] Nocker A, Hausherr T, Balsiger S, Krstulovic NP, Hennecke H, Narberhaus F (dekabr 2001). "MRNA asosidagi termosensor rizobial issiqlik zarbasi genlarining ekspressionini boshqaradi". Nuklein kislotalari rez. 29 (23): 4800–4807. doi:10.1093 / nar / 29.23.4800. PMC 96696. PMID 11726689. Olingan 2010-07-20.

[6] Krayevskiy, SS; Nagel, M; Narberhaus, F (2013). "Qisqa ROSEga o'xshash RNK termometrlari psevdomonas turlarida IbpA sintezini boshqaradi". PLOS ONE. 8 (5): e65168. doi:10.1371 / journal.pone.0065168. PMC 3669281. PMID 23741480.

[7] Grosso-Bekerra, Mariya Viktoriya; Kroda-Garsiya, Jerardo; Merino, Enrike; Servin-Gonsales, Luis; Moxica-Espinosa, Raul; Soberon-Chaves, Gloriya (2014-10-28). "Pseudomonas aeruginosa virulentlik omillarini ikkita yangi RNK termometrlari tomonidan tartibga solish". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 111 (43): 15562–15567. doi:10.1073 / pnas.1402536111. ISSN 1091-6490. PMC 4217398. PMID 25313031.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]