Rne-II RNK motifi - Rne-II RNA motif

rne-II RNK
Rne-II-RNA.svg
Ikkinchi tuzilmaning konsensusi rne-II RNK
Identifikatorlar
Belgilarrne-II RNK
RfamRF01756
Boshqa ma'lumotlar
RNK turiCis- tartibga soluvchi element
Domen (lar)Pseudomonadaceae
PDB tuzilmalarPDBe

The rne-II RNK motifi saqlanib qolgan RNK yordamida aniqlangan tuzilish bioinformatika.[1] Bu faqat aniqlangan turlari ichida tasniflangan oila Pseudomonadaceae, bir guruh gammaproteobakteriyalar. rne-II RNK doimiy ravishda taxmin qilingan joyda joylashgan 5 'tarjima qilinmagan mintaqalar (5 'UTR) ning genlar bu kodlash Ribonukleaz E (RNase E). The RNase E 5 'UTR elementi ilgari aniqlangan RNK tuzilishi bo'lib, u RNase E genlarining 5 'UTRlarida ham uchraydi. Biroq, oxirgi motif faqatgina topilgan enterobakteriyalar va ikkala motif ko'rinishda bir-biriga bog'liq bo'lmagan tuzilishga ega. Ularning farqlarini hisobga olgan holda, shunday deb taxmin qilingan edi rne-II RNKlar RNase E 5 'UTR elementlari bilan bir xil funktsional rolni bajaradi, ya'ni RNase E darajasini tartibga solish oqsillar RNase E uchun substrat vazifasini bajarib, shuning uchun RNase E kontsentratsiyasi yuqori bo'lsa, ular o'zlarini buzadilar xabarchi RNK.

Adabiyotlar

  1. ^ Vaynberg Z, Vang JX, Bogue J va boshq. (2010 yil mart). "Qiyosiy genomika bakteriyalar, arxeylar va ularning metagenomlaridan 104 nomzodning tuzilgan RNKlarini aniqlaydi". Genom Biol. 11 (3): R31. doi:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. PMC  2864571. PMID  20230605.

Tashqi havolalar