S100A13 - S100A13

S100A13
Mavjud tuzilmalar
PDB	Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	1YUR, 1YUS, 1YUT, 1YUU, 2EGD, 2H2K, 2K8M, 2KI4, 2KI6, 2KOT, 2L5X, 2LE9
Identifikatorlar
Taxalluslar	S100A13, S100 kaltsiyni bog'lovchi oqsil A13
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 601989 MGI: 109581 HomoloGene: 7523 Generkartalar: S100A13
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 1 (odam)
Oxiri	153,631,360 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 3 (sichqoncha)
Oxiri	90,524,581 bp
RNK ekspressioni naqsh
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• kaltsiy ioni bilan bog'lanish; • oqsilni homodimerizatsiya qilish faoliyati; • rux ioni bilan bog'lash; • metall ionlari bilan bog'lanish; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • RAGE retseptorlari bilan bog'lanish; • fibroblast o'sish faktorini bog'lash; • mis ionlari bilan bog'lanish; • lipid bilan bog'lanish;
Uyali komponent	• sitoplazma; • sitozol; • sitoplazmaning perinuklear mintaqasi; • hujayra yadrosi; • mast hujayra granulasi; • hujayradan tashqari; • nukleus; • hujayra membranasi; • hujayradan tashqari mintaqa;
Biologik jarayon	• mis ioniga javob; • sitokin sekretsiyasi; • elektr stimulga javob; • hujayralar ko'payishini ijobiy tartibga solish; • hujayra shaklini tartibga solish; • oqsillarni tashish; • I-kappaB kinaz / NF-kappaB signalizatsiyasining ijobiy regulyatsiyasi; • mast hujayralarining degranulyatsiyasi;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	6284
	20196
	ENSG00000189171
	ENSMUSG00000042312
	Q99584
	P97352
	NM_001024210; NM_001024211; NM_001024212; NM_001024213; NM_005979
	NM_009113
	NP_001019381; NP_001019382; NP_001019383; NP_001019384; NP_005970
	NP_033139
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

S100 kaltsiyni bog'lovchi oqsil A13 (S100A13) a oqsil odamlarda kodlanganligi S100A13 gen.^[5]^[6]

Funktsiya

Ushbu gen tomonidan kodlangan oqsil S100 oqsillar oilasi kaltsiyni bog'laydigan 2 ta EF qo'l motifini o'z ichiga oladi. S100 oqsillari ko'plab hujayralar sitoplazmasida va / yoki yadrosida lokalize qilingan va hujayra tsiklining rivojlanishi va differentsiatsiyasi kabi bir qator uyali jarayonlarni boshqarishda ishtirok etadi. S100 genlari kamida 13 a'zoni o'z ichiga oladi, ular 1q21 xromosomasida klaster sifatida joylashgan. Ushbu protein qalqonsimon bezda yuqori ekspression darajasiga ega bo'lgan turli xil to'qimalarda keng tarqalgan. Yassi mushak hujayralarida bu protein yadrodagi va stress tolalaridagi boshqa oila a'zolari bilan birgalikda ekspluatatsiya qilinadi va bu signal o'tkazishda turli funktsiyalarni taklif qiladi. Ushbu gen uchun bir xil oqsilni kodlovchi bir nechta muqobil ravishda biriktirilgan transkript variantlari topildi.^[6]

O'zaro aloqalar

S100A13 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan SYT1^[7]^[8] va FGF1.^[7]^[8]

Patologiya

Kist papiller tiroid karsinomasida S100A13 regulyatsiyasi aniqlandi^[9] S100A13 ekspressioni va kemoterapiya qarshiligi assotsiatsiyasi melanomani proteomik o'rganishda ko'rsatildi.^[10]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000189171 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000042312 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Wicki R, Marenholz I, Mischke D, Schäfer BW, Heizmann CW (dekabr 1996). "1q21 xromosomasida S100 gen klasterining yangi a'zosi bo'lgan inson S100A12 (kalgranulin C, p6, CAAF1, CGRP) genining xarakteristikasi". Hujayra kaltsiy. 20 (6): 459–64. doi:10.1016 / S0143-4160 (96) 90087-1. PMID 8985590.
^ ^a ^b "Entrez Gen: S100A13 S100 kaltsiyni bog'lovchi oqsil A13".
^ ^a ^b Mouta Carreira C, LaVallee TM, Tarantini F, Jackson A, Lathrop JT, Hampton B, Burgess WH, Maciag T (Avgust 1998). "S100A13 fibroblast o'sish omil-1 va p40 sinaptotagmin-1 in vitro chiqarilishini boshqarishda ishtirok etadi". Biologik kimyo jurnali. 273 (35): 22224–31. doi:10.1074 / jbc.273.35.22224. PMID 9712836.
^ ^a ^b Landriscina M, Bagala C, Mandinova A, Soldi R, Micucci I, Bellum S, Prudovskiy I, Maciag T (Iyul 2001). "Mis, stressga javoban fibroblast o'sish omilining 1 chiqarilishida ishtirok etadigan ko'p proteinli agregatning yig'ilishini keltirib chiqaradi". Biologik kimyo jurnali. 276 (27): 25549–57. doi:10.1074 / jbc.M102925200. PMID 11432880.
^ Dinets A, Pernemalm M, Kjellin H, Sviatoha V, Sofiadis A, Juhlin CC, Zedenius J, Larsson C, Lehtiö J, Hög A (may 2015). "Papiller tiroid karsinomasi va qalqonsimon bezning lezyonlaridan kist suyuqligining differentsial oqsil ekspression profillari". PLOS ONE. 10 (5): e0126472. doi:10.1371 / journal.pone.0126472. PMC 4433121. PMID 25978681.
^ Azimi A, Pernemalm M, Frostvik Stolt M, Xansson J, Lextiyo J, Egyházi Brage S, Xertzman Yoxansson S. "Melanoma metastazlarini proteomik tahlil qilish: S100A13 ekspressioni va kimyoviy terapiya qarshiligi o'rtasidagi bog'liqlik". Britaniya saraton jurnali. 110: 2489–2495. doi:10.1038 / bjc.2014.169. PMC 4021518. PMID 24722184.

Qo'shimcha o'qish

Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD, Fuldner RA, Bult CJ, Li NH, Kirkness EF, Weinstock KG, Gocayne JD, White O (sentyabr 1995). "CDNA ketma-ketligining 83 million nukleotidiga asoslangan inson genlarining xilma-xilligi va ekspression shakllarini dastlabki baholash" (PDF). Tabiat. 377 (6547 ta qo'shimcha): 3-174. PMID 7566098.
Schäfer BW, Wicki R, Engelkamp D, Mattei MG, Heizmann CW (Fevral 1995). "Inson xromosomasi 1q21 bo'yicha to'qqizta S100 gen klasterini o'z ichiga olgan YAC klonini ajratish: S100 kaltsiy bilan bog'lovchi oqsillar oilasining yangi nomenklaturasi uchun asos". Genomika. 25 (3): 638–43. doi:10.1016/0888-7543(95)80005-7. PMID 7759097.
Wicki R, Schäfer BW, Erne P, Heizmann CW (1996 yil oktyabr). "S100 oqsillar oilasining yangi a'zosi S100A13 uchun kodlovchi odam va sichqoncha cDNAlarining xarakteristikasi". Biokimyoviy va biofizik tadqiqotlari. 227 (2): 594–9. doi:10.1006 / bbrc.1996.1551. PMID 8878558.
Mouta Carreira C, LaVallee TM, Tarantini F, Jackson A, Lathrop JT, Hampton B, Burgess WH, Maciag T (Avgust 1998). "S100A13 fibroblast o'sish omil-1 va p40 sinaptotagmin-1 in vitro chiqarilishini boshqarishda ishtirok etadi". Biologik kimyo jurnali. 273 (35): 22224–31. doi:10.1074 / jbc.273.35.22224. PMID 9712836.
Ridinger K, Schäfer BW, Durussel I, Cox JA, Heizmann CW (Mar 2000). "S100A13. Turli hujayra chiziqlaridagi biokimyoviy tavsif va subcellular lokalizatsiya". Biologik kimyo jurnali. 275 (12): 8686–94. doi:10.1074 / jbc.275.12.8686. PMID 10722710.
Landriscina M, Bagala C, Mandinova A, Soldi R, Micucci I, Bellum S, Prudovskiy I, Maciag T (Iyul 2001). "Mis, stressga javoban fibroblast o'sish omilining 1 chiqarilishida ishtirok etadigan ko'p proteinli agregatning yig'ilishini keltirib chiqaradi". Biologik kimyo jurnali. 276 (27): 25549–57. doi:10.1074 / jbc.M102925200. PMID 11432880.
Hsieh HL, Schäfer BW, Cox JA, Heizmann CW (Avgust 2002). "S100A13 va S100A6 endotelial hujayralardagi aniq translokatsiya yo'llarini namoyish etadi". Hujayra fanlari jurnali. 115 (Pt 15): 3149-58. PMID 12118070.
Prudovskiy I, Bagala S, Tarantini F, Mandinova A, Soldi R, Bellum S, Maciag T (Iyul 2002). "Fibroblast o'sish faktori 1 ajratish kompleksi tarkibiy qismlarining hujayra ichidagi translokatsiyasi ularni eksport qilishdan oldin yig'ilishidan oldin amalga oshiriladi". Hujayra biologiyasi jurnali. 158 (2): 201–8. doi:10.1083 / jcb.200203084. PMC 2173119. PMID 12135982.
Chan VY, Xia CL, Dong DC, Heizmann CW, Yew DT (2003 yil aprel). "Rivojlanayotgan inson gipokampusi va vaqtinchalik korteksida S100 oqsillarining differentsial ifodasi". Mikroskopiya tadqiqotlari va texnikasi. 60 (6): 600–13. doi:10.1002 / jemt.10302. PMID 12645008.
Mandinova A, Soldi R, Graziani I, Bagala C, Bellum S, Landriscina M, Tarantini F, Prudovskiy I, Maciag T (Iyul 2003). "S100A13 misga bog'liq bo'lgan stressga bog'liq ravishda IL-1alpaning inson U937 va murin NIH 3T3 hujayralaridan ajralib chiqishiga vositachilik qiladi" (PDF). Hujayra fanlari jurnali. 116 (Pt 13): 2687-96. doi:10.1242 / jcs.00471. PMID 12746488.
Hsieh HL, Schäfer BW, Weigle B, Heizmann CW (2004 yil aprel). "Hujayradan tashqaridagi S100 ga javoban S100 oqsilining translokatsiyasi retseptorlari vositasida inson endotelial hujayralarida rivojlangan glyatsion endproductlar vositasida amalga oshiriladi". Biokimyoviy va biofizik tadqiqotlari. 316 (3): 949–59. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.02.135. PMID 15033494.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lion Idoralar, Lamond AI, Mann M (yanvar 2005). "Nukleolyar proteom dinamikasi". Tabiat. 433 (7021): 77–83. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413.
Xayrabedyan S, Kyurkchiev S, Kehayov I (2005 yil mart). "Endoglin (cd105) va S100A13 endometriozda faol angiogenez belgilari sifatida". Reproduktiv biologiya. 5 (1): 51–67. PMID 15821778.
Rual JF, Venkatesan K, Xao T, Xirozane-Kishikava T, Drikot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Gedehoussou N, Klitgord N, Saymon S, Boxem M, Milshteyn S, Rozenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Vong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Ducette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (oktyabr 2005). "Odamning oqsil va oqsil bilan o'zaro aloqasi tarmog'ining proteom miqyosli xaritasi tomon". Tabiat. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Oh JH, Yang JO, Xahn Y, Kim MR, Byun SS, Jeon YJ, Kim JM, Song KS, Noh SM, Kim S, Yoo HS, Kim YS, Kim NS (Dekabr 2005). "Odamning oshqozon saratonini transkriptomik tahlil qilish". Sutemizuvchilar genomi. 16 (12): 942–54. doi:10.1007 / s00335-005-0075-2. PMID 16341674.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 1 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000189171 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000042312 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid8985590-5] Wicki R, Marenholz I, Mischke D, Schäfer BW, Heizmann CW (dekabr 1996). "1q21 xromosomasida S100 gen klasterining yangi a'zosi bo'lgan inson S100A12 (kalgranulin C, p6, CAAF1, CGRP) genining xarakteristikasi". Hujayra kaltsiy. 20 (6): 459–64. doi:10.1016 / S0143-4160 (96) 90087-1. PMID 8985590.

[entrez-6] "Entrez Gen: S100A13 S100 kaltsiyni bog'lovchi oqsil A13".

[pmid9712836-7] Mouta Carreira C, LaVallee TM, Tarantini F, Jackson A, Lathrop JT, Hampton B, Burgess WH, Maciag T (Avgust 1998). "S100A13 fibroblast o'sish omil-1 va p40 sinaptotagmin-1 in vitro chiqarilishini boshqarishda ishtirok etadi". Biologik kimyo jurnali. 273 (35): 22224–31. doi:10.1074 / jbc.273.35.22224. PMID 9712836.

[pmid11432880-8] Landriscina M, Bagala C, Mandinova A, Soldi R, Micucci I, Bellum S, Prudovskiy I, Maciag T (Iyul 2001). "Mis, stressga javoban fibroblast o'sish omilining 1 chiqarilishida ishtirok etadigan ko'p proteinli agregatning yig'ilishini keltirib chiqaradi". Biologik kimyo jurnali. 276 (27): 25549–57. doi:10.1074 / jbc.M102925200. PMID 11432880.

[pmid25978681-9] Dinets A, Pernemalm M, Kjellin H, Sviatoha V, Sofiadis A, Juhlin CC, Zedenius J, Larsson C, Lehtiö J, Hög A (may 2015). "Papiller tiroid karsinomasi va qalqonsimon bezning lezyonlaridan kist suyuqligining differentsial oqsil ekspression profillari". PLOS ONE. 10 (5): e0126472. doi:10.1371 / journal.pone.0126472. PMC 4433121. PMID 25978681.

[Azimi-10] Azimi A, Pernemalm M, Frostvik Stolt M, Xansson J, Lextiyo J, Egyházi Brage S, Xertzman Yoxansson S. "Melanoma metastazlarini proteomik tahlil qilish: S100A13 ekspressioni va kimyoviy terapiya qarshiligi o'rtasidagi bog'liqlik". Britaniya saraton jurnali. 110: 2489–2495. doi:10.1038 / bjc.2014.169. PMC 4021518. PMID 24722184.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]