SETD7 - SETD7

SETD7

SETD7 PDB 1h3i.png oqsillari

Mavjud tuzilmalar

Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB

PDB id kodlari ro'yxati
1H3I, 1MT6, 1MUF, 1N6A, 1N6C, 1O9S, 1XQH, 2F69, 3CBM, 3CBO, 3CBP, 3M53, 3M54, 3M55, 3M56, 3M57, 3M58, 3M59, 3M5A, 3OS5, 3VUZ, 3VV0, 4E47, 4J7F, 4J8O, 4JDS, 4JLG, 5EG2, 5AYF

Identifikatorlar

SETD7, Lizin metiltransferaza 7, KMT7, SET7, SET7 / 9, SET9, SET domeni, 7 o'z ichiga olgan SET domeni, histon lizin metiltransferaza

Tashqi identifikatorlar

OMIM: 606594 MGI: 1920501 HomoloGene: 12741 Generkartalar: SETD7

Gen joylashuvi (odam)

Chr.	Xromosoma 4 (odam)^[1]

Band	4q31.1	Boshlang	139,495,941 bp^[1]
Band	4q31.1	Oxiri	139,606,699 bp^[1]

Gen joylashuvi (Sichqoncha)

Chr.	Xromosoma 3 (sichqoncha)^[2]

Band	3 \| 3 C	Boshlang	51,515,319 bp^[2]
Band	3 \| 3 C	Oxiri	51,560,879 bp^[2]

RNK ekspressioni naqsh

Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari

Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• metiltransferaza faolligi • transferaza faoliyati • p53 majburiy • xromatin bilan bog'lanish • oqsil-lizin N-metiltransferaza faolligi • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish • giston-lizin N-metiltransferaza faolligi
Uyali komponent	• nukleoplazma • xromosoma • nukleus • hujayra yadrosi
Biologik jarayon	• transkripsiyani tartibga solish, DNK-andozalari • peptidil-lizin monometilatsiyasi • transkripsiya, DNK-andozali • DNKning zararlanishini rag'batlantirishga uyali javob • transkripsiyaning ijobiy regulyatsiyasi, DNK-andozalari • peptidil-lizin metilatsiyasi • metilatsiya • heteroxromatin moddasi • peptidil-lizin dimetilatsiyasi • giston lizin metilatsiyasi • etanolga javob • histon H3-K9 metilatsiyasini tartibga solish • xromatin moddasi
Manbalar:Amigo / QuickGO

Turlar

Inson

Sichqoncha


80854


73251


ENSG00000145391


ENSMUSG00000037111


8-savol


Q8VHL1

RefSeq (mRNA)


NM_001306199 NM_001306200 NM_030648


NM_080793

RefSeq (oqsil)


NP_001293128 NP_001293129 NP_085151


NP_542983

Joylashuv (UCSC)

Chr 4: 139.5 - 139.61 Mb

Chr 3: 51.52 - 51.56 Mb

PubMed qidirmoq

^[3]

^[4]

Insonni ko'rish / tahrirlash

Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Giston-lizin N-metiltransferaza SETD7 bu ferment odamlarda kodlanganligi SETD7 gen.^[5]^[6]^[7]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000145391 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000037111 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Nishioka K, Chuikov S, Sarma K, Erdjument-Bromage H, Allis CD, Tempst P, Reinberg D (Fevral 2002). "Set9, heteroxromatin hosil bo'lishi uchun zarur bo'lgan histon quyruq modifikatsiyasini istisno qilib, transkripsiyani osonlashtiradigan yangi histon H3 metiltransferaza". Genlar Dev. 16 (4): 479–89. doi:10.1101 / gad.967202. PMC 155346. PMID 11850410.
^ Vang H, Cao R, Xia L, Erdjument-Bromage H, Borchers C, Tempst P, Zhang Y (Yanvar 2002). "Giston H3-lizin 4-o'ziga xos metiltransferazni tozalash va funktsional tavsifi". Mol hujayrasi. 8 (6): 1207–17. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00405-1. PMID 11779497.
^ "Entrez Gen: SETD7 SET domeni (lizin metiltransferaza) 7".

Qo'shimcha o'qish

Nagase T, Kikuno R, Hattori A va boshq. (2001). "Insonning noma'lum genlarini kodlash ketma-ketligini bashorat qilish. XIX. In vitro katta oqsillarni kodlovchi miyadan 100 ta yangi cDNA klonlarining to'liq ketma-ketliklari". DNK rez. 7 (6): 347–55. doi:10.1093 / dnares / 7.6.347. PMID 11214970.
Wilson JR, Jing C, Walker PA, va boshq. (2002). "SET7 / 9 giston metiltransferaza kristalli tuzilishi va funktsional tahlili". Hujayra. 111 (1): 105–15. doi:10.1016 / S0092-8674 (02) 00964-9. PMID 12372304. S2CID 14727763.
Jacobs SA, Harp JM, Devarakonda S va boshq. (2002). "SET domenining faol sayti tugunda qurilgan". Nat. Tuzilishi. Biol. 9 (11): 833–8. doi:10.1038 / nsb861. PMID 12389038. S2CID 28718612.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH va boshq. (2003). "15000 dan ortiq to'liq uzunlikdagi odam va sichqonchani cDNA sekanslarini yaratish va dastlabki tahlil qilish". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002 yil PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Kvon T, Chang JH, Kvak E va boshq. (2003). "SET7 / 9-AdoMet tuzilishi bilan aniqlangan giston lizin metilni uzatish mexanizmi". EMBO J. 22 (2): 292–303. doi:10.1093 / emboj / cdg025. PMC 140100. PMID 12514135.
Xiao B, Jing C, Uilson JR va boshq. (2003). "SET7 / 9 inson histoni metiltransferaza tuzilishi va katalitik mexanizmi" (PDF). Tabiat. 421 (6923): 652–6. Bibcode:2003 yil natur.421..652X. doi:10.1038 / tabiat01378. PMID 12540855. S2CID 4423407.
Wysocka J, Myers MP, Laherty CD va boshqalar. (2003). "Inson Sin3 deatsetilaza va tritoksakka bog'liq Set1 / Ash2 histoni H3-K4 metiltransferaza hujayralar ko'payishi faktori HCF-1 tomonidan tanlab bog'lanadi". Genlar Dev. 17 (7): 896–911. doi:10.1101 / gad.252103. PMC 196026. PMID 12670868.
Kouskouti A, Scheer E, Staub A va boshq. (2004). "SET9 vositachiligidagi metilasyon bilan TAF10 funktsiyasining genlarga xos modulyatsiyasi". Mol. Hujayra. 14 (2): 175–82. CiteSeerX 10.1.1.320.8454. doi:10.1016 / S1097-2765 (04) 00182-0. PMID 15099517.
Gerxard DS, Vagner L, Feingold EA va boshq. (2004). "NIH to'liq uzunlikdagi cDNA loyihasining holati, sifati va kengayishi: sutemizuvchilar genlari to'plami (MGC)". Genom Res. 14 (10B): 2121-7. doi:10.1101 / gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Chuikov S, Kurash JK, Wilson JR va boshq. (2004). "L5-metilasyon orqali p53 faolligini tartibga solish". Tabiat. 432 (7015): 353–60. Bibcode:2004 yil natur.432..353C. doi:10.1038 / nature03117. PMID 15525938. S2CID 4398310.
Couture JF, Collazo E, Hauk G, Trievel RC (2006). "SET7 / 9 metilatlanish joyining o'ziga xosligi uchun strukturaviy asos". Nat. Tuzilishi. Mol. Biol. 13 (2): 140–6. doi:10.1038 / nsmb1045. PMID 16415881. S2CID 38483056.
Xayakava T, Ohtani Y, Xayakava N va boshq. (2007). "RBP2 MRG15 kompleks komponentidir va intragenik histon H3 lizin 4 metilatsiyasini pastga regulyatsiya qiladi". Gen hujayralari. 12 (6): 811–26. doi:10.1111 / j.1365-2443.2007.01089.x. PMID 17573780. S2CID 10003129.

PDB galereyasi

1h3i: HISTONE METHYLTRANSFERASE SET7 / 9 ning kristalli tuzilishi
1mt6: AdoHcy bilan histon H3 K4 o'ziga xos metiltransferaza SET7 / 9 ning tuzilishi
1muf: SET7 / 9 histonining H3 K4 o'ziga xos metiltransferaza tuzilishi
1n6a: SET7 / 9 tuzilishi
1n6c: SET7 / 9 tuzilishi
1o9s: INSON HISTONE METHYLTRANSFERASE SET7 / 9 TERNARY KOMPLEKSINING KRISTAL TUZILISHI
1xq: P53 peptidi va SAH bilan metetransferaza SET9 (shuningdek SET7 / 9 deb ham nomlanadi) uchlik kompleksining kristalli tuzilishi.
2f69: AdoHcy va TAF10 peptidi bilan bog'langan SET7 / 9 ning uchlik kompleksi

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 4 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.