SPSB1 - SPSB1

SPSB1

SPSB1 PDB 2JK9.png oqsillari

Mavjud tuzilmalar

Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB

PDB id kodlari ro'yxati
2JK9, 3F2O

Identifikatorlar

SPSB1, SSB-1, SSB1, splA / ryanodin retseptorlari domeni va 1 ni o'z ichiga olgan SOCS qutisi

Tashqi identifikatorlar

OMIM: 611657 MGI: 1921896 HomoloGene: 11832 Generkartalar: SPSB1

Gen joylashuvi (odam)

Chr.	Xromosoma 1 (odam)^[1]

Band	1p36.22	Boshlang	9,292,894 bp^[1]
Band	1p36.22	Oxiri	9,369,532 bp^[1]

Gen joylashuvi (Sichqoncha)

Chr.	Xromosoma 4 (sichqoncha)^[2]

Band	4 \| 4 E2	Boshlang	149,896,283 bp^[2]
Band	4 \| 4 E2	Oxiri	149,955,043 bp^[2]

RNK ekspressioni naqsh

Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari

Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish • ubikuitin-protein transferaza faolligi • hamma joyda mavjud bo'lish uchun substratni aniqlashda ishtirok etadigan oqsillarni biriktirish, ko'prik
Uyali komponent	• sitoplazma • sitozol • SCF ubikuitin ligaza kompleksi
Biologik jarayon	• oqsilning hamma joyda tarqalishi • oqsil poliubikvitinatsiyasi • tarjimadan keyingi modifikatsiya • ubikuitinga bog'liq oqsil katabolik jarayoni • proteazom vositachiligidagi ubiqitinga bog'liq oqsil katabolik jarayoni
Manbalar:Amigo / QuickGO

Turlar

Inson

Sichqoncha


80176


74646


ENSG00000171621


ENSMUSG00000039911


Q96BD6


Q9D5L7

RefSeq (mRNA)


NM_025106


NM_029035

RefSeq (oqsil)


NP_079382


NP_083311

Joylashuv (UCSC)

Chr 1: 9.29 - 9.37 Mb

Chr 4: 149.9 - 149.96 Mb

PubMed qidirmoq

^[3]

^[4]

Insonni ko'rish / tahrirlash

Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

SPRY domen tarkibidagi SOCS qutisi oqsil 1 a oqsil odamlarda kodlanganligi SPSB1 gen.^[5]^[6]^[7]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000171621 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000039911 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Vang D, Li Z, Messing EM, Vu G (2005 yil aprel). "SPRY domenini o'z ichiga olgan SOCS box 1 oqsil (SSB-1) MET bilan o'zaro ta'sir qiladi va gepatotsitlar o'sish faktoridan kelib chiqqan Erk-Elk-1-sarum javob elementi yo'lini kuchaytiradi". J Biol Chem. 280 (16): 16393–401. doi:10.1074 / jbc.M413897200. PMID 15713673.
^ Kile BT, Schulman BA, Aleksandr VS, Nikola NA, Martin XM, Xilton DJ (iyun 2002). "SOCS qutisi: vayronagarchilik va degradatsiya haqidagi ertak". Trends Biochem Sci. 27 (5): 235–41. doi:10.1016 / S0968-0004 (02) 02085-6. PMID 12076535.
^ "Entrez Gen: SPSB1 splA / ryanodin retseptorlari domeni va 1 ta o'z ichiga olgan SOCS qutisi".

Qo'shimcha o'qish

Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-kepka: eukaryotik mRNAlarning kepka tuzilishini oligoribonukleotidlar bilan almashtirishning oddiy usuli". Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Andersson B, Ventlend MA, Rikafrente JY va boshq. (1996). "Yaxshi o'qotar qurol kutubxonasini qurish uchun" ikkita adapter "usuli". Anal. Biokimyo. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Yu V, Andersson B, Uorli KC va boshq. (1997). "Katta ko'lamli birlashma cDNA ketma-ketligi". Genom Res. 7 (4): 353–8. doi:10.1101 / gr.7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagava K, Maruyama K va boshq. (1997). "To'liq boyitilgan va 5'darajali boyitilgan cDNA kutubxonasini qurish va tavsifi". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH va boshq. (2003). "15000 dan ortiq to'liq uzunlikdagi odam va sichqonchani cDNA sekanslarini yaratish va dastlabki tahlil qilish". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikava T va boshq. (2004). "21,243 to'liq uzunlikdagi odam cDNA-larining to'liq ketma-ketligi va tavsifi". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerxard DS, Vagner L, Feingold EA va boshq. (2004). "NIH to'liq uzunlikdagi cDNA loyihasining holati, sifati va kengayishi: sutemizuvchilar genlari to'plami (MGC)". Genom Res. 14 (10B): 2121-7. doi:10.1101 / gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Vu JS, Imm JH, Min CK va boshq. (2006). "B30.2 / SPRY domeni bo'yicha tarkibiy va funktsional tushunchalar". EMBO J. 25 (6): 1353–63. doi:10.1038 / sj.emboj.7600994. PMC 1422157. PMID 16498413.
Gregori SG, Barlow KF, McLay KE va boshq. (2006). "DNKning ketma-ketligi va odam xromosomasining biologik izohlanishi 1". Tabiat. 441 (7091): 315–21. doi:10.1038 / nature04727. PMID 16710414.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 1 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.