SRRM1 - SRRM1

SRRM1

Protein SRRM1 PDB 1mp1.png

Mavjud tuzilmalar

Inson UniProt qidiruvi: PDBe RCSB

PDB id kodlari ro'yxati
1MP1

Identifikatorlar

SRRM1, 160-KD, POP101, SRM160, serin va arginin takrorlanadigan matritsa 1

Tashqi identifikatorlar

OMIM: 605975 HomoloGene: 136796 Generkartalar: SRRM1

Gen joylashuvi (odam)

Chr.	Xromosoma 1 (odam)^[1]

Band	1p36.11	Boshlang	24,631,716 bp^[1]
Band	1p36.11	Oxiri	24,673,267 bp^[1]

RNK ekspressioni naqsh

Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari

Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• DNK bilan bog'lanish • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish • RNK bilan bog'lanish
Uyali komponent	• yadro matritsasi • sitozol • katalitik 2-bosqich splitseozoma • splitseozoma kompleksi • hujayra yadrosi • nukleoplazma • yadro zarrasi
Biologik jarayon	• RNK qo'shilishi, transesterifikatsiya reaktsiyalari orqali • mRNK qo'shilishi, splitseozoma orqali • RNK polimeraza II transkripsiyasini tugatish • mRNKni qayta ishlash • mRNA 3'-ni qayta ishlash • mRNA yadrosidan eksport qilish • RNK qo'shilishi • Yadrodan RNK eksporti
Manbalar:Amigo / QuickGO

Turlar

Inson

Sichqoncha


10250


n / a


ENSG00000133226


n / a


Q8IYB3


n / a

RefSeq (mRNA)


NM_001303448 NM_001303449 NM_005839


n / a

RefSeq (oqsil)

NP_001290377 NP_001290378 NP_005830 NP_001353494 NP_001353495
NP_001353496 NP_001353497 NP_001353498 NP_001353499 NP_001353500 NP_001353501 NP_001353502 NP_001353504 NP_001353505 NP_001353506 NP_001353507 NP_001353510 NP_001353511 NP_001353513 NP_001353514 NP_001353515 NP_001353516 NP_001353517 NP_001353518 NP_001353519 NP_001353520 NP_001353521 NP_001353522 NP_001353523 NP_001353524 NP_001353525 NP_001353526 NP_001353527 NP_001353528 NP_001353529


n / a

Joylashuv (UCSC)

Chr 1: 24.63 - 24.67 Mb

n / a

PubMed qidirmoq

^[2]

n / a

Insonni ko'rish / tahrirlash

Serin / arginin takrorlanadigan matritsa oqsili 1 a oqsil odamlarda kodlanganligi SRRM1 gen.^[3]^[4]

O'zaro aloqalar

SRRM1 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan CDC5L.^[5]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000133226 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Blencowe BJ, Issner R, Nickerson JA, Sharp PA (may 1998). "MRNKga qo'shilishning koaktivatori". Genlar Dev. 12 (7): 996–1009. doi:10.1101 / gad.12.7.996. PMC 316672. PMID 9531537.
^ "Entrez Gen: SRRM1 serin / arginin takrorlanadigan matritsa 1".
^ Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JK, Mann M, Lamond AI (dekabr 2000). "Odamning CDC5L kompleksini funktsional tahlil qilish va uning tarkibiy qismlarini mass-spektrometriya yordamida aniqlash". EMBO J. 19 (23): 6569–81. doi:10.1093 / emboj / 19.23.6569. PMC 305846. PMID 11101529.

Qo'shimcha o'qish

Vang HY, Lin V, Dyuk JA, Yeakli JM, Songyang Z, Kantli LC, Fu XD (1998). "SRPK2: sutemizuvchi hujayralardagi mRNK qo'shilish omillarining o'zaro ta'siri va lokalizatsiyasida vositachilikda ishtirok etadigan SR oqsiliga xos kinazning differentsial ifodalanganligi". J. Hujayra Biol. 140 (4): 737–50. doi:10.1083 / jcb.140.4.737. PMC 2141757. PMID 9472028.
Uilson KF, Fortes P, Singh AQSh, Ohno M, Mattaj IW, Cerione RA (1999). "Yadro qopqog'ini bog'laydigan kompleks o'sish omili retseptorlari bilan bog'langan signal uzatishni yangi maqsadidir". J. Biol. Kimyoviy. 274 (7): 4166–73. doi:10.1074 / jbc.274.7.4166. PMID 9933612.
Eldridge AG, Li Y, Sharp PA, Blencowe BJ (1999). "SRm160 / 300 biriktiruvchi koaktivator ekzonni kuchaytiruvchi funktsiyasi uchun talab qilinadi". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 96 (11): 6125–30. doi:10.1073 / pnas.96.11.6125. PMC 26846. PMID 10339552.
Blencowe BJ, Baurén G, Eldridge AG, Issner R, Nickerson JA, Rosonina E, Sharp PA (2000). "SRm160 / 300 biriktiruvchi koaktivator subbirliklari". RNK. 6 (1): 111–20. doi:10.1017 / S1355838200991982. PMC 1369899. PMID 10668804.
Le Xir X, Mur MJ, Maquat LE (2000). "Pre-mRNA splichingi mRNP tarkibini o'zgartiradi: ekzon-ekzon birikmalarida oqsillarning barqaror assotsiatsiyasi uchun dalillar". Genlar Dev. 14 (9): 1098–108. PMC 316578. PMID 10809668.
McGarvey T, Rosonina E, McCracken S, Li Q, Arnaout R, Mientjes E, Nickerson JA, Awrey D, Greenblatt J, Grosveld G, Blencowe BJ (2000). "O'tkir miyeloid leykemiya bilan bog'liq protein, DEK, ekzon-mahsulot komplekslari bilan splazinga bog'liq o'zaro ta'sirni hosil qiladi". J. Hujayra Biol. 150 (2): 309–20. doi:10.1083 / jcb.150.2.309. PMC 2180225. PMID 10908574.
Le Hir H, Izaurralde E, Maquat LE, Mur MJ (2000). "Splitseozoma mRNK ekson-ekzon birikmalarining yuqori qismida bir nechta oqsillarni 20-24 nukleotidni yotqizadi". EMBO J. 19 (24): 6860–9. doi:10.1093 / emboj / 19.24.6860. PMC 305905. PMID 11118221.
Lykke-Andersen J, Shu MD, Steits JA (2001). "Ekson-eksonli birikmalar pozitsiyasini mRNA kuzatuv apparati bilan RNPS1 oqsilining aloqasi". Ilm-fan. 293 (5536): 1836–9. doi:10.1126 / science.1062786. PMID 11546874.
McCracken S, Lambermon M, Blencowe BJ (2002). "SRm160 biriktiruvchi koaktivator transkriptning 3'-uchi bo'linishini ta'minlaydi". Mol. Hujayra. Biol. 22 (1): 148–60. doi:10.1128 / MCB.22.1.148-160.2002. PMC 134228. PMID 11739730.
Szymczyna BR, Pineda-Lucena A, Mills JL, Syperski T, Arrowsmith CH (2002). "1H, 13C va 15N rezonansli topshiriqlari va PWI domenining ikkilamchi tuzilishi SRm160 dan NMR kamaytirilgan o'lchovliligi yordamida". J. Biomol. NMR. 22 (3): 299–300. doi:10.1023 / A: 1014904502424. PMID 11991360.
Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, Grigorieff N, Mur MJ (2002). "Uch o'lchovli strukturaviy tahlil uchun mos bo'lgan mahalliy splitseozomalarni tozalash va tavsiflash". RNK. 8 (4): 426–39. doi:10.1017 / S1355838202021088. PMC 1370266. PMID 11991638.
Lejeune F, Ishigaki Y, Li X, Maquat LE (2002). "Exon-birikma kompleksi sutemizuvchilar hujayralarida CBP80 bilan bog'langan, ammo eIF4E bilan bog'lanmagan mRNKda aniqlanadi: mRNPni qayta qurish dinamikasi". EMBO J. 21 (13): 3536–45. doi:10.1093 / emboj / cdf345. PMC 126094. PMID 12093754.
Meissner M, Lopato S, Gotzmann J, Sauermann G, Barta A (2003). "Proto-onkoprotein TLS / FUS yadro matritsasi bilan bog'langan va PTB, SRm160 va SR oqsillarini biriktiruvchi omillari bilan komplekslangan". Muddati Hujayra rez. 283 (2): 184–95. doi:10.1016 / S0014-4827 (02) 00046-0. PMID 12581738.
Szymczyna BR, Bowman J, McCracken S, Pineda-Lucena A, Lu Y, Kox B, Lambermon M, Graveley BR, Arrowsmith CH, Blencowe BJ (2003). "PWI motifining tuzilishi va funktsiyasi: mRNKgacha qayta ishlashni osonlashtiradigan yangi nuklein kislota bilan bog'lovchi domen". Genlar Dev. 17 (4): 461–75. doi:10.1101 / gad.1060403. PMC 196000. PMID 12600940.
Vagner S, Chiosea S, Nikerson JA (2003). "SRm160 ning fazoviy maqsadli va yadroviy matritsali majburiy domenlari". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 100 (6): 3269–74. doi:10.1073 / pnas.0438055100. PMC 152281. PMID 12624182.
McCracken S, Longman D, Johnstone IL, Cáceres JF, Blencowe BJ (2003). "SRm160 uchun 3-uchli ishlov berishda evolyutsion ravishda saqlanib qolgan rol, ekzon birikmasi kompleks shakllanishidan mustaqil ravishda ishlaydi". J. Biol. Kimyoviy. 278 (45): 44153–60. doi:10.1074 / jbc.M306856200. PMID 12944400.
Vagner S, Chiosea S, Ivshina M, Nikerson JA (2004). "In vitro FRAP ekzon birikmasi SRm160 oqsilining ATP ga bog'liq yadroviy safarbarligini ochib beradi". J. Hujayra Biol. 164 (6): 843–50. doi:10.1083 / jcb.200307002. PMC 2172284. PMID 15024032.
Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (2004). "Immobilizatsiyalangan metallga o'xshashlik xromatografiyasi va tandem mass-spektrometriyasi yordamida odamning T hujayralaridan tirozin fosforillanish joylarini mustahkam fosfoproteomik profillash". Anal. Kimyoviy. 76 (10): 2763–72. doi:10.1021 / ac035352d. PMID 15144186.

Tashqi havolalar

SRRM1 Inson genlarining joylashuvi UCSC Genome brauzeri.
SRRM1 Inson geni tafsilotlari UCSC Genome brauzeri.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 1 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.