Kichik nukleolyar RNK TBR12 - Small nucleolar RNA TBR12

snoTBR12
RF02789.svg
Bashorat qilingan ikkilamchi tuzilish va ketma-ketlikni saqlash Kichik nukleolyar RNK TBR12 ning
Identifikatorlar
RfamRF02789
Boshqa ma'lumotlar
Domen (lar)Eukaryota
GOGO muddati GO bilan boshlanishi kerak:,GO muddati GO bilan boshlanishi kerak:
SOSO: 0000593
PDB tuzilmalarPDBe

Kichik nukleolyar RNK TBR12 a kodlamaydigan RNK (ncRNA) molekulasi Trypanosoma brucei boshqasini modifikatsiyalashda qaysi funktsiyalar kichik yadroli RNKlar (snRNAlar). Ushbu turdagi modifikatsiya qiluvchi RNK odatda nukleus ning eukaryotik hujayra bu snRNA biogenezining asosiy joyidir. Bu a nomi bilan tanilgan kichik nukleolyar RNK (snoRNA) va shuningdek, ko'pincha qo'llanma RNK deb nomlanadi.

snoRNA TBR12 ga tegishli C / D qutisi S box (UGAUGA) va D box (CUGA) deb nomlanuvchi konservalangan ketma-ketlik motiflarini o'z ichiga olgan snoRNAs sinfi. C / D oilaviy qutisi a'zolarining ko'pchiligi to'g'ridan-to'g'ri saytga xos 2'-O-metilatsiya substrat RNKlari.[1]

TBR12 aniqlangan o'n etti snoRNAlardan biri edi Trypanosoma brucei tomonidan immunoprecipitatsiya anti-fibrillarin antikorlari bilan.[2] Bilan birga TBR4, TBR6 va TBR2 bu snoRNA gen klasterining tandemli takrorlanadigan qismidir. Ushbu 4 snoRNA genlari polikistronik RNK transkripti sifatida transkripsiyalanadi.[3]

Boshqa snoRNAlar

Adabiyotlar

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (oktyabr 2002). "Tozalangan quti C / D snoRNP'lar, maqsadli RNKni in vitro joyga xos 2'-O-metilatsiyasini ko'paytirishga qodir". Molekulyar va uyali biologiya. 22 (19): 6663–8. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ a b Dunbar DA, Wormsley S, Lowe TM, Baserga SJ (may 2000). "Tripanosoma bruseyidagi fibrillarin bilan bog'langan quti C / D kichik nukleolyar RNKlari. Ketma-ketlikni saqlash va rRNKning 2'-O-ribozali metilatsiyasiga ta'siri". Biologik kimyo jurnali. 275 (19): 14767–76. doi:10.1074 / jbc.m001180200. PMID  10747997.
  3. ^ Dunbar DA, Chen AA, Uormsli S, Baserga SJ (avgust 2000). "Tripanosoma bruseyidagi kichik nukleolyar RNKlarning genlari klasterlarda to'plangan va polikistronik RNK sifatida transkripsiyalangan". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 28 (15): 2855–61. doi:10.1093 / nar / 28.15.2855. PMC  102681. PMID  10908346.