Sinergin gamma - Synergin gamma

SYNRG
Mavjud tuzilmalar
PDB	Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	2MX7
Identifikatorlar
Taxalluslar	SYNRG, AP1GBP1, SYNG, sinergin, gamma, sinergin gamma
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 607291 MGI: 1354742 HomoloGene: 105680 Generkartalar: SYNRG
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	17-xromosoma (odam)
Oxiri	37,609,472 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 11 (sichqoncha)
Oxiri	84,044,578 bp
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish;
Uyali komponent	• sitoplazma; • AP-1 adapter kompleksi; • Golgi apparati; • membrana;
Biologik jarayon	• oqsillarni tashish; • hujayra ichidagi oqsillarni tashish; • endotsitoz;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	11276
	217030
	ENSG00000275066; ENSG00000274047
	ENSMUSG00000034940
	Q9UMZ2
	Q5SV85
NM_001163544; NM_001163545; NM_001163546; NM_001163547; NM_007247;
	NM_080550; NM_198882
	NM_001115009; NM_194341
NP_001157016; NP_001157017; NP_001157018; NP_001157019; NP_009178;
	NP_542117; NP_942583
	NP_919322
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Sinergin gamma shuningdek, nomi bilan tanilgan AP1 subbirligi gamma bilan bog'lovchi oqsil 1 (AP1GBP1) a oqsil odamlarda kodlanganligi SYNRG gen.^[5]^[6]

Funktsiya

Ushbu gen AP1 gamma birligi bilan o'zaro aloqada bo'lgan oqsilni kodlaydi klatrin-adapter kompleksi. AP1 kompleksi joylashgan Golgi tarmog'i va o'ziga xos oqsillarni klatrin bilan qoplangan vazikulalar bilan bog'laydi. Ushbu kodlangan oqsil AP1 kompleksini boshqa oqsillarga ulash uchun harakat qilishi mumkin. Shu bilan bir qatorda turli xil izoformlarni kodlovchi transkript variantlari ushbu gen uchun tavsiflangan.^[6]

O'zaro aloqalar

AP1GBP1 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan AP1G1^[7]^[8] va SCAMP1.^[9]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v ENSG00000274047 GRCh38: Ensembl chiqishi 89: ENSG00000275066, ENSG00000274047 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000034940 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Sahifa LJ, Sowerby PJ, Lui VW, Robinson MS (oktyabr 1999). "Gamma-sinergin: gamma-adaptin bilan o'zaro ta'sir qiluvchi EH tarkibidagi oqsil". J. Hujayra Biol. 146 (5): 993–1004. doi:10.1083 / jcb.146.5.993. PMC 2169493. PMID 10477754.
^ ^a ^b "Entrez Gen: AP1GBP1 AP1 gamma subunit majburiy oqsil 1".
^ Nogi T, Shiba Y, Kavasaki M, Shiba T, Matsugaki N, Igarashi N, Suzuki M, Kato R, Takatsu H, Nakayama K, Vakatsuki S (iyul 2002). "Gamma-adaptin qulog'i domeni bo'yicha oqsillarni qo'shimcha ravishda jalb qilishning tarkibiy asoslari". Nat. Tuzilishi. Biol. 9 (7): 527–31. doi:10.1038 / nsb808. PMID 12042876. S2CID 42630285.
^ Takatsu H, Yoshino K, Nakayama K (may 2000). "Gamma-sinergin bilan ta'sir o'tkazadigan gamma-adaptin va GGA oqsillarida saqlanadigan adapter gamma quloq homologiyasi sohasi". Biokimyo. Biofiz. Res. Kommunal. 271 (3): 719–25. doi:10.1006 / bbrc.2000.2700. PMID 10814529.
^ Fernández-Chacon R, Achiriloaie M, Janz R, Albanesi JP, Südhof TC (aprel 2000). "Endotsitozdagi SCAMP1 funktsiyasi". J. Biol. Kimyoviy. 275 (17): 12752–6. doi:10.1074 / jbc.275.17.12752. PMID 10777571.

Qo'shimcha o'qish

Peyrard M, Parveneh S, Lagercrantz S, Ekman M, Fransson I, Sahlen S, Dumanski JP (1998). "Inson gamma-adaptin genining (ADTG) 16q23 ga klonlash, ekspression shakli va xromosoma tayinlanishi". Genomika. 50 (2): 275–80. doi:10.1006 / geno.1998.5289. PMID 9653655.
Xirst J, Lui VW, Bright NA, Totty N, Seaman MN, Robinson MS (2000). "Trans-Golji tarmog'i va vakuol / lizosoma o'rtasida odam savdosini osonlashtiradigan gamma-adaptin va VHS domenlari bo'lgan oqsillar oilasi". J. Hujayra Biol. 149 (1): 67–80. doi:10.1083 / jcb.149.1.67. PMC 2175106. PMID 10747088.
Fernández-Chacon R, Achiriloaie M, Janz R, Albanesi JP, Südhof TC (2000). "Endotsitozdagi SCAMP1 funktsiyasi". J. Biol. Kimyoviy. 275 (17): 12752–6. doi:10.1074 / jbc.275.17.12752. PMID 10777571.
Takatsu H, Yoshino K, Nakayama K (2000). "Gamma-sinergin bilan ta'sir o'tkazadigan gamma-adaptin va GGA oqsillarida saqlanadigan adapter gamma quloq homologiyasi sohasi". Biokimyo. Biofiz. Res. Kommunal. 271 (3): 719–25. doi:10.1006 / bbrc.2000.2700. PMID 10814529.
Nogi T, Shiba Y, Kavasaki M, Shiba T, Matsugaki N, Igarashi N, Suzuki M, Kato R, Takatsu H, Nakayama K, Vakatsuki S (2002). "Gamma-adaptin qulog'i domeni bo'yicha oqsillarni qo'shimcha ravishda jalb qilishning tarkibiy asoslari". Nat. Tuzilishi. Biol. 9 (7): 527–31. doi:10.1038 / nsb808. PMID 12042876. S2CID 42630285.
Kent HM, McMahon HT, Evans PR, Benmerah A, Ouen DJ (2002). "Gamma-adaptin qo'shimchasi domeni: tuzilishi va Eps15 va gamma-sinergin uchun bog'lanish joyi". Tuzilishi. 10 (8): 1139–48. doi:10.1016 / S0969-2126 (02) 00801-8. PMID 12176391.
Mills IG, Praefcke GJ, Vallis Y, Piter BJ, Olesen LE, Gallop JL, Butler PJ, Evans PR, McMahon HT (2003). "EpsinR: pufakchalar savdosida qatnashadigan AP1 / klatrin bilan o'zaro ta'sir qiluvchi oqsil". J. Hujayra Biol. 160 (2): 213–22. doi:10.1083 / jcb.200208023. PMC 2172650. PMID 12538641.
Lui VW, Kollinz BM, Xirst J, Motley A, Millar S, Schu P, Ouen DJ, Robinson MS (2003). "GGA va gamma-adaptinning COOH-terminal qo'shimchalari domenlari uchun majburiy sheriklar". Mol. Biol. Hujayra. 14 (6): 2385–98. doi:10.1091 / mbc.E02-11-0735. PMC 194887. PMID 12808037.
Beausoleil SA, Jedryxovskiy M, Shvarts D, Elias JE, Vilyen J, Li J, Kon MA, Kantli LC, Gigi SP (2004). "HeLa hujayra yadroviy fosfoproteidlarining keng ko'lamdagi tavsifi". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Xirst J, Borner GH, Makon M, Robinzon MS (2005). "Aftifilin / p200 / gamma-synergin kompleksi". Mol. Biol. Hujayra. 16 (5): 2554–65. doi:10.1091 / mbc.E04-12-1077. PMC 1087257. PMID 15758025.
Theos AC, Tenza D, Martina JA, Hurbain I, Peden AA, Sviderskaya EV, Stewart A, Robinson MS, Bennett DC, Cutler DF, Bonifacino JS, Marks MS, Raposo G (2005). "Tirozinazni endosomalardan melanosomalarga saralashda adapter oqsilining (AP) -3 va AP-1 funktsiyalari". Mol. Biol. Hujayra. 16 (11): 5356–72. doi:10.1091 / mbc.E05-07-0626. PMC 1266432. PMID 16162817.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 17 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[refGRCh38Ensembl-1] v ENSG00000274047 GRCh38: Ensembl chiqishi 89: ENSG00000275066, ENSG00000274047 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000034940 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid10477754-5] Sahifa LJ, Sowerby PJ, Lui VW, Robinson MS (oktyabr 1999). "Gamma-sinergin: gamma-adaptin bilan o'zaro ta'sir qiluvchi EH tarkibidagi oqsil". J. Hujayra Biol. 146 (5): 993–1004. doi:10.1083 / jcb.146.5.993. PMC 2169493. PMID 10477754.

[entrez-6] "Entrez Gen: AP1GBP1 AP1 gamma subunit majburiy oqsil 1".

[pmid12042876-7] Nogi T, Shiba Y, Kavasaki M, Shiba T, Matsugaki N, Igarashi N, Suzuki M, Kato R, Takatsu H, Nakayama K, Vakatsuki S (iyul 2002). "Gamma-adaptin qulog'i domeni bo'yicha oqsillarni qo'shimcha ravishda jalb qilishning tarkibiy asoslari". Nat. Tuzilishi. Biol. 9 (7): 527–31. doi:10.1038 / nsb808. PMID 12042876. S2CID 42630285.

[pmid10814529-8] Takatsu H, Yoshino K, Nakayama K (may 2000). "Gamma-sinergin bilan ta'sir o'tkazadigan gamma-adaptin va GGA oqsillarida saqlanadigan adapter gamma quloq homologiyasi sohasi". Biokimyo. Biofiz. Res. Kommunal. 271 (3): 719–25. doi:10.1006 / bbrc.2000.2700. PMID 10814529.

[pmid10777571-9] Fernández-Chacon R, Achiriloaie M, Janz R, Albanesi JP, Südhof TC (aprel 2000). "Endotsitozdagi SCAMP1 funktsiyasi". J. Biol. Kimyoviy. 275 (17): 12752–6. doi:10.1074 / jbc.275.17.12752. PMID 10777571.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]