TOP2B - TOP2B

TOP2B
Mavjud tuzilmalar
PDB	Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	3QX3, 4G0U, 4G0V, 4G0W, 4J3N
Identifikatorlar
Taxalluslar	TOP2B, TOPIIB, top2beta, topoizomeraza (DNK) II beta, DNK topoizomeraza II beta
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 126431 MGI: 98791 HomoloGene: 134711 Generkartalar: TOP2B
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 3 (odam)
Oxiri	25,664,907 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 14 (sichqoncha)
Oxiri	16,435,462 bp
RNK ekspressioni naqsh
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• GO: 0003918 DNK topoizomeraza turi II (ikki qatorli kesma, ATP-gidrolizlash) faolligi; • nukleotid bilan bog'lanish; • DNK bilan bog'lanish; • histon deatsetilaza bilan bog'lanish; • xromatin bilan bog'lanish; • izomeraza faolligi; • metall ionlari bilan bog'lanish; • DNK topoizomeraza faolligi; • oqsilni S-terminal bilan bog'lash; • oqsillarni heterodimerizatsiya qilish faoliyati; • fermentlarni bog'lash; • ATP majburiy; • protein kinaz S bilan bog'lanish; • ribonukleoprotein kompleksi bilan bog'lanish;
Uyali komponent	• sitozol; • nukleoplazma; • heteroxromatin; • nukleus; • hujayra yadrosi; • sitoplazma; • ribonukleoprotein; • virusli integratsiya kompleksi;
Biologik jarayon	• meiotik rekombinatsiya vositalarining rezolyutsiyasi; • aksonogenez; • DNK metabolik jarayoni; • neyron migratsiyasi; • oldingi miya rivojlanishi; • mitotik DNK yaxlitligini tekshirish punkti; • singil xromatid ajratish; • DNK topologik o'zgarishi; • ikki zanjirli DNK oralig'i orqali bitta zanjirli virusli RNK replikatsiyasini ijobiy tartibga solish;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	7155
	21974
	ENSG00000077097
	ENSMUSG00000017485
	Q02880
	Q64511
	NM_001068; NM_001330700
	NM_009409
	NP_001059; NP_001317629
	NP_033435
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

DNK topoizomeraza 2-beta bu ferment odamlarda kodlanganligi TOP2B gen.^[5]^[6]

Funktsiya

Ushbu gen DNKni kodlaydi topoizomeraza, transkripsiya paytida DNKning topologik holatini boshqaruvchi va o'zgartiruvchi ferment. Ushbu yadro fermenti xromosomalarning kondensatsiyasi, xromatidlarni ajratish va DNKning transkripsiyasi va replikatsiyasi paytida yuzaga keladigan burama stressni yumshatish kabi jarayonlarda ishtirok etadi. U dupleks DNKning ikkita zanjirining vaqtincha sinishi va birlashishini katalizlaydi, bu esa zanjirlarning bir-biridan o'tishiga imkon beradi va shu bilan DNK topologiyasini o'zgartiradi. Ushbu fermentning ikkita shakli genlarni ko'paytirish hodisasining ehtimoliy mahsuloti sifatida mavjud. Ushbu shaklni, beta-ni kodlovchi gen, 3-xromosomaga va alfa-shakl 17-xromosomaga joylashtirilgan, bu fermentni kodlovchi gen bir nechta saratonga qarshi vositalar uchun nishon vazifasini bajaradi. mitoksantron, va ushbu genning turli xil mutatsiyalari giyohvandlikka chidamliligi rivojlanishi bilan bog'liq. Ushbu fermentning pasaygan faolligi ham rol o'ynashi mumkin ataksiya-telangiektaziya. Muqobil biriktirish ushbu genning natijasi ikkita transkript variantiga olib keladi; ammo, ikkinchi variant hali to'liq tavsiflanmagan.^[7]

Neyronlar faoliyati

Yangi paytida o'rganish tajriba, to'plami genlar ichida tez ifodalanadi miya. Bunga sabab bo'ldi gen ekspressioni o'rganilayotgan ma'lumotni qayta ishlash uchun muhim deb hisoblanadi. Bunday genlar deb nomlanadi darhol erta genlar (IEG). TOP2B faoliyati sichqonlardagi assotsiativ qo'rquv xotirasi deb ataladigan o'quv tajribasida IEGsni ifodalash uchun juda muhimdir.^[8] Bunday o'rganish tajribasi TOP2B-ni tezda ikki qatorli tanaffuslarni keltirib chiqarishi mumkin promoter DNK ichida ishlaydigan IEG genlari neyroplastiklik. Ta'mirlash ushbu kelib chiqadigan tanaffuslar bilan bog'liq DNK demetilatsiyasi ushbu IEG genlarini zudlik bilan ifodalashga imkon beradigan IEG genlari promouterlari.^[8]

TOP2B va DNKning o'zaro ta'siri ham tartibga solinadi genlarning transkripsiyasi rivojlanish uchun muhim bo'lgan. Bularga genlarni kodlash kiradi akson qo'llanmasi omillar va hujayraning yopishishi molekulalar. Xususan, TOP2B uchun talab qilinadi laminat -ning aniq maqsadlari retinaning ganglion hujayrasi aksonlar va dendritlar ichida zebrafish.^[9]

O'zaro aloqalar

TOP2B ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan:

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000077097 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000017485 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Tan KB, Dorman TE, Falls KM, Chung TD, Mirabelli CK, Crooke ST, Mao J (yanvar 1992). "Topoizomerase II alfa va topoisomerase II beta genlari: 17 va 3-xromosomalar uchun odamning xarakteristikasi va xaritasi". Saraton kasalligini o'rganish. 52 (1): 231–4. PMID 1309226.
^ Jenkins JR, Ayton P, Jones T, Devies SL, Simmons DL, Harris AL, Sheer D, Hickson ID (noyabr 1992). "Odamning DNK topoizomerazasi II ning beta izozimini kodlovchi cDNA klonlarini ajratish va genni 3p24 xromosomasiga lokalizatsiyasi". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 20 (21): 5587–92. doi:10.1093 / nar / 20.21.5587. PMC 334390. PMID 1333583.
^ "Entrez Gen: TOP2B topoizomeraza (DNK) II beta 180kDa".
^ ^a ^b Li, Sian; Marshall, Pol R.; Leyton, Laura J.; Zajachkovski, Esmi L.; Vang, Ziqi; Madugalle, Sakitrani U.; Yin, Tszayu; Bredi, Timoti V.; Vey, Vey (2019). "DNKning tiklanishi bilan bog'liq bo'lgan protein Gadd45ote prelimbik prefrontal korteks ichidagi zudlik bilan erta gen ekspressionini vaqtincha kodlashni tartibga soladi va assotsiativ qo'rquv xotirasini konsolidatsiya qilish uchun talab qilinadi". Neuroscience jurnali. 39 (6): 970–983. doi:10.1523 / JNEUROSCI.2024-18.2018. PMC 6363930. PMID 30545945. (Erratum:PMID 30545945 )
^ Nevin, L. M .; Xiao, T .; Staub, V.; Baier, H. (2011). "Topoizomeraza II retinal ganglion hujayralari aksonlari va dendritlarni laminaga xos yo'naltirish uchun talab qilinadi". Rivojlanish. 138 (12): 2457–2465. doi:10.1242 / dev.060335. PMC 3100707. PMID 21610027.
^ Kitagava H, Fujiki R, Yoshimura K, Mezaki Y, Uematsu Y, Matsui D, Ogawa S, Unno K, Okubo M, Tokita A, Nakagava T, Ito T, Ishimi Y, Nagasava H, Matsumoto T, Yanagisava J, Kato S (Iyun 2003). "RECRACTED: Xromatinni qayta ishlash kompleksi WINAC promotorlarga yadro retseptorlarini yo'naltiradi va Uilyams sindromida zaiflashadi". Hujayra. 113 (7): 905–17. doi:10.1016 / s0092-8674 (03) 00436-7. PMID 12837248.
^ ^a ^b Tsay SC, Valkov N, Yang WM, Gump J, Sallivan D, Seto E (Nov 2000). "Giston deatsetilaza to'g'ridan-to'g'ri DNK topoizomeraza II bilan o'zaro ta'sir qiladi". Tabiat genetikasi. 26 (3): 349–53. doi:10.1038/81671. PMID 11062478. S2CID 19301396.
^ Jonson CA, Padget K, Ostin CA, Turner BM (fevral 2001). "Deatsetilaza faolligi topoizomeraza II bilan bog'lanadi va etopozid bilan bog'liq apoptoz uchun zarurdir". Biologik kimyo jurnali. 276 (7): 4539–42. doi:10.1074 / jbc.C000824200. PMID 11136718.
^ Cowell IG, Okorokov AL, Cutts SA, Padget K, Bell M, Milner J, Ostin CA (Fevral 2000). "Inson topoizomerazasi IIa va IIβ p53 ning C-terminal mintaqasi bilan o'zaro ta'sir qiladi". Eksperimental hujayra tadqiqotlari. 255 (1): 86–94. doi:10.1006 / excr.1999.4772. PMID 10666337.
^ Mao Y, Desai SD, Liu LF (2000 yil avgust). "SUMO-1 inson DNK topoizomeraza II izozimlariga konjugatsiyasi". Biologik kimyo jurnali. 275 (34): 26066–73. doi:10.1074 / jbc.M001831200. PMID 10862613.
^ Nakano H, Yamazaki T, Miyatake S, Nozaki N, Kikuchi A, Saito T (Mar 1996). "T hujayra retseptorlari kompleksining topoizomeraza IIβ va CD3ε zanjirining o'ziga xos o'zaro ta'siri". Biologik kimyo jurnali. 271 (11): 6483–9. doi:10.1074 / jbc.271.11.6483. PMID 8626450.

Qo'shimcha o'qish

Champoux JJ (2002). "DNK topoizomerazalari: tuzilishi, funktsiyasi va mexanizmi". Biokimyo fanining yillik sharhi. 70: 369–413. doi:10.1146 / annurev.biochem.70.1.369. PMID 11395412.
Ostin, CA, Fisher LM (iyun 1990). "HeLa hujayralaridan yangi DNK topoizomeraza gomologini kodlovchi odamning cDNA klonini ajratish va tavsifi". FEBS xatlari. 266 (1–2): 115–7. doi:10.1016 / 0014-5793 (90) 81520-X. PMID 2163884. S2CID 46581515.
Chung TD, Drake FH, Tan KB, Per SR, Crooke ST, Mirabelli CK (Dekabr 1989). "Odamning DNK topoizomerazasi II izozimlarini kodlovchi cDNA klonlarining xarakteristikasi va immunologik identifikatsiyasi". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 86 (23): 9431–5. Bibcode:1989 yil PNAS ... 86.9431C. doi:10.1073 / pnas.86.23.9431. PMC 298510. PMID 2556712.
Ostin KA, Sng JH, Patel S, Fisher LM (Mar 1993). "Novel HeLa topoizomerase II - bu II beta izoform: to'liq kodlash ketma-ketligi va boshqa II tip topoizomerazalar bilan homologiya". Biochimica et Biofhysica Acta (BBA) - Genlarning tuzilishi va ifodasi. 1172 (3): 283–91. doi:10.1016 / 0167-4781 (93) 90215-Y. PMID 8383537.
Devies SL, Jenkins JR, Xikson ID (avgust 1993). "Inson hujayralari topoizomeraza II beta mRNKning ikkita differentsial biriktirilgan shaklini ifodalaydi". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 21 (16): 3719–23. doi:10.1093 / nar / 21.16.3719. PMC 309874. PMID 8396237.
Nakano H, Yamazaki T, Miyatake S, Nozaki N, Kikuchi A, Saito T (Mar 1996). "T hujayra retseptorlari kompleksining topoizomeraza IIβ va CD3ε zanjirining o'ziga xos o'zaro ta'siri". Biologik kimyo jurnali. 271 (11): 6483–9. doi:10.1074 / jbc.271.11.6483. PMID 8626450.
Biersack H, Jensen S, Gromova I, Nilsen IS, Vestergaard O, Andersen AH (1996 yil avgust). "Faol heterodimerlar odamning DNK topoizomerazasi II alfa va II beta izoformalaridan hosil bo'ladi". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 93 (16): 8288–93. doi:10.1073 / pnas.93.16.8288. PMC 38663. PMID 8710863.
Meyer KN, Kjeldsen E, Straub T, Knudsen BR, Xikson ID, Kikuchi A, Kreipe H, Boege F (Fevral 1997). "I va II turdagi topoizomerazalarning hujayra tsikli bilan birgalikda joylashishi va katalitik fermentlar faolligini modulyatsiya qilish". Hujayra biologiyasi jurnali. 136 (4): 775–88. doi:10.1083 / jcb.136.4.775. PMC 2132491. PMID 9049244.
Fukunaga R, Hunter T (1997 yil aprel). "MNK1, yangi MAP kinaz faollashtirilgan oqsil kinazasi, oqsil kinaz substratlarini aniqlash uchun yangi ekspression skrining usuli bilan ajratilgan". EMBO jurnali. 16 (8): 1921–33. doi:10.1093 / emboj / 16.8.1921. PMC 1169795. PMID 9155018.
Ng SW, Liu Y, Schnipper LE (1997 yil dekabr). "Klonlash va insonning DNK topoizomeraza II beta geni uchun 5′ yonma ketma-ketligini tavsiflash". Gen. 203 (2): 113–9. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00500-3. PMID 9426241.
Yamane K, Kavabata M, Tsuruo T (1997 yil dekabr). "DNK-tuzatish fermentlari va hujayra tsikli regulyatoriga o'xshash sakkizta takrorlanadigan mintaqalar bilan DNK-topoizomeraza-II-biriktiruvchi oqsil". Evropa biokimyo jurnali / FEBS. 250 (3): 794–9. doi:10.1111 / j.1432-1033.1997.00794.x. PMID 9461304.
Cowell IG, Willmore E, Chalton D, Marsh KL, Jazrawi E, Fisher LM, Austin CA (sentyabr 1998). "IIbeta odamning DNK topoizomerazasining yadro taqsimoti: yadro nishonga olish signali 116 qoldiqli C-terminal dumida joylashgan". Eksperimental hujayra tadqiqotlari. 243 (2): 232–40. doi:10.1006 / excr.1998.4150. PMID 9743583.
Lang AJ, Mirski SE, Cummings HJ, Yu Q, Gerlach JH, Cole SP (oktyabr 1998). "Insonning TOP2A va TOP2B genlarining tarkibiy tuzilishi". Gen. 221 (2): 255–66. doi:10.1016 / S0378-1119 (98) 00468-5. PMID 9795238.
Sng JH, Heaton VJ, Bell M, Maini P, Ostin CA, Fisher LM (1999 yil mart). "Molekulyar klonlash va odam topoizomerazasi IIa va IIβ genlarining tavsifi: genlarni ko'paytirish orqali izoform evolyutsiyasiga dalillar". Biochimica et Biofhysica Acta (BBA) - Genlarning tuzilishi va ifodasi. 1444 (3): 395–406. doi:10.1016 / S0167-4781 (99) 00020-2. PMID 10095062.
Bjergbaek L, Jensen S, Vestergaard O, Andersen AH (1999 yil sentyabr). "Insonning DNK topoizomerazasi IIa-ning asosiy o'lchov mintaqalarini aniqlash uchun biokimyoviy yondashuvdan foydalanish". Biologik kimyo jurnali. 274 (37): 26529–36. doi:10.1074 / jbc.274.37.26529. PMID 10473615.
Cowell IG, Okorokov AL, Cutts SA, Padget K, Bell M, Milner J, Ostin CA (Fevral 2000). "Inson topoizomerazasi IIa va IIβ p53 ning C-terminal mintaqasi bilan o'zaro ta'sir qiladi". Eksperimental hujayra tadqiqotlari. 255 (1): 86–94. doi:10.1006 / excr.1999.4772. PMID 10666337.
Mao Y, Desai SD, Liu LF (2000 yil avgust). "SUMO-1 inson DNK topoizomeraza II izozimlariga konjugatsiyasi". Biologik kimyo jurnali. 275 (34): 26066–73. doi:10.1074 / jbc.M001831200. PMID 10862613.
Mirski SE, Voskoglou-Nomikos T, Young LC, Deeley RG, Campling BG, Gerlach JH, Cole SP (iyun 2000). "O'pka shishi hujayralari va normal va xavfli o'pka to'qimalarida topoizomeraza II a va b izoform mRNKlarining bir vaqtning o'zida miqdori". Laboratoriya tekshiruvi. 80 (6): 787–95. doi:10.1038 / labinvest.3780083. PMID 10879730.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000077097 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000017485 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid1309226-5] Tan KB, Dorman TE, Falls KM, Chung TD, Mirabelli CK, Crooke ST, Mao J (yanvar 1992). "Topoizomerase II alfa va topoisomerase II beta genlari: 17 va 3-xromosomalar uchun odamning xarakteristikasi va xaritasi". Saraton kasalligini o'rganish. 52 (1): 231–4. PMID 1309226.

[pmid1333583-6] Jenkins JR, Ayton P, Jones T, Devies SL, Simmons DL, Harris AL, Sheer D, Hickson ID (noyabr 1992). "Odamning DNK topoizomerazasi II ning beta izozimini kodlovchi cDNA klonlarini ajratish va genni 3p24 xromosomasiga lokalizatsiyasi". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 20 (21): 5587–92. doi:10.1093 / nar / 20.21.5587. PMC 334390. PMID 1333583.

[entrez-7] "Entrez Gen: TOP2B topoizomeraza (DNK) II beta 180kDa".

[Li2019-8] Li, Sian; Marshall, Pol R.; Leyton, Laura J.; Zajachkovski, Esmi L.; Vang, Ziqi; Madugalle, Sakitrani U.; Yin, Tszayu; Bredi, Timoti V.; Vey, Vey (2019). "DNKning tiklanishi bilan bog'liq bo'lgan protein Gadd45ote prelimbik prefrontal korteks ichidagi zudlik bilan erta gen ekspressionini vaqtincha kodlashni tartibga soladi va assotsiativ qo'rquv xotirasini konsolidatsiya qilish uchun talab qilinadi". Neuroscience jurnali. 39 (6): 970–983. doi:10.1523 / JNEUROSCI.2024-18.2018. PMC 6363930. PMID 30545945. (Erratum:PMID 30545945 )

[9] Nevin, L. M .; Xiao, T .; Staub, V.; Baier, H. (2011). "Topoizomeraza II retinal ganglion hujayralari aksonlari va dendritlarni laminaga xos yo'naltirish uchun talab qilinadi". Rivojlanish. 138 (12): 2457–2465. doi:10.1242 / dev.060335. PMC 3100707. PMID 21610027.

[pmid12837248-10] Kitagava H, Fujiki R, Yoshimura K, Mezaki Y, Uematsu Y, Matsui D, Ogawa S, Unno K, Okubo M, Tokita A, Nakagava T, Ito T, Ishimi Y, Nagasava H, Matsumoto T, Yanagisava J, Kato S (Iyun 2003). "RECRACTED: Xromatinni qayta ishlash kompleksi WINAC promotorlarga yadro retseptorlarini yo'naltiradi va Uilyams sindromida zaiflashadi". Hujayra. 113 (7): 905–17. doi:10.1016 / s0092-8674 (03) 00436-7. PMID 12837248.

[pmid11062478-11] Tsay SC, Valkov N, Yang WM, Gump J, Sallivan D, Seto E (Nov 2000). "Giston deatsetilaza to'g'ridan-to'g'ri DNK topoizomeraza II bilan o'zaro ta'sir qiladi". Tabiat genetikasi. 26 (3): 349–53. doi:10.1038/81671. PMID 11062478. S2CID 19301396.

[pmid11136718-12] Jonson CA, Padget K, Ostin CA, Turner BM (fevral 2001). "Deatsetilaza faolligi topoizomeraza II bilan bog'lanadi va etopozid bilan bog'liq apoptoz uchun zarurdir". Biologik kimyo jurnali. 276 (7): 4539–42. doi:10.1074 / jbc.C000824200. PMID 11136718.

[pmid10666337-13] Cowell IG, Okorokov AL, Cutts SA, Padget K, Bell M, Milner J, Ostin CA (Fevral 2000). "Inson topoizomerazasi IIa va IIβ p53 ning C-terminal mintaqasi bilan o'zaro ta'sir qiladi". Eksperimental hujayra tadqiqotlari. 255 (1): 86–94. doi:10.1006 / excr.1999.4772. PMID 10666337.

[pmid10862613-14] Mao Y, Desai SD, Liu LF (2000 yil avgust). "SUMO-1 inson DNK topoizomeraza II izozimlariga konjugatsiyasi". Biologik kimyo jurnali. 275 (34): 26066–73. doi:10.1074 / jbc.M001831200. PMID 10862613.

[pmid8626450-15] Nakano H, Yamazaki T, Miyatake S, Nozaki N, Kikuchi A, Saito T (Mar 1996). "T hujayra retseptorlari kompleksining topoizomeraza IIβ va CD3ε zanjirining o'ziga xos o'zaro ta'siri". Biologik kimyo jurnali. 271 (11): 6483–9. doi:10.1074 / jbc.271.11.6483. PMID 8626450.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]