Thermococcus litoralis - Thermococcus litoralis
| Thermococcus litoralis | |
|---|---|
| Ilmiy tasnif | |
| Domen: | |
| Filum: | |
| Sinf: | |
| Buyurtma: | |
| Oila: | |
| Tur: | |
| Turlar: | T. litoralis |
| Binomial ism | |
| Thermococcus litoralis[1] Noyner va boshq. 2001 yil | |
Thermococcus litoralis (T. litoralis) bir turidir Arxeya bu dengiz tubida joylashgan gidrotermal teshiklar shuningdek, sayoz suv osti termal buloqlari va neft quduqlari.[2][3][4] Bu anaerob organotrof gipertermofil diametri 0,5-3,0 µm orasida.[2] Termokokkallarning boshqa turlari singari, T. litoralis tartibsiz gipertermofildir kokk 55-100 ° S gacha o'sadi.[2] Boshqa ko'plab termokokklardan farqli o'laroq, T. litoralis bu harakatsiz. Uning hujayra devori faqat bittadan iborat S-qavat olti burchakli panjaralarni hosil qilmaydi.[2] Bundan tashqari, ko'plab termokokklar oltingugurtni metabolizmada majburiy ravishda elektron akseptori sifatida ishlatsa ham, T. litoralis o'sishni rag'batlantirish uchun faqat oltingugurt kerak va u holda yashay oladi.[3] T. litoralis yaqinda ilmiy jamoatchilik tomonidan keng qo'llaniladigan alternativ DNK polimeraza ishlab chiqarish qobiliyati uchun ommalashtirildi Taq polimeraza. The T. litoralis polimeraza deb atalgan polimeraza xato darajasi Taqdan pastroq ekanligi isbotlangan, ammo tuzatish 3’-5’ ekzonukleaz qobiliyatlar.[5]
DNK polimeraza
| DNK polimeraza | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatorlar | |||||||
| Organizm | |||||||
| Belgilar | pol | ||||||
| UniProt | P30317 | ||||||
| |||||||
The DNK polimeraza ning Thermococcus litoralis yuqori haroratlarda barqaror, a bilan yarim hayot 95 ° C da 8 soat va 100 ° C da 2 soat.[6] Shuningdek, u mutatsion chastotalarini ko'pchilik korreksiyalanmagan DNK polimerazalaridan 2-4 baravar past darajaga tushirishga qodir bo'lgan korrektorlik faoliyatiga ega.[7]
Habitat va ekologiya
T. litoralis juda issiq suvda sayoz va chuqur dengiz gidrotermal teshiklari yonida o'sadi. Uchun optimal o'sish harorati T. litoralis 85-88 ° S dir.[2] Bundan tashqari, u ozgina kislotali suvlarni afzal ko'radi, pH qiymati 4,0 dan 8,0 gacha o'sib, optimal pH qiymati 6,0-6,4 gacha.[2] Boshqa ko'plab gipertermofillardan farqli o'laroq, T. litoralis fermentatsiyadagi oxirgi elektron akseptori sifatida oltingugurtga fakultativ jihatdan bog'liq bo'lib, u yo'q bo'lganda vodorod gazini va mavjud bo'lganda vodorod sulfidini ishlab chiqaradi.[3] Qo'shimcha ravishda, T. litoralis ishlab chiqarishi ko'rsatilgan ekzopolisakkarid (EPS) uni shakllantirishga yordam berishi mumkin biofilm. U yasalgan mannoz, sulfitlar va fosfor.[3]
Fiziologiya
T. litoralis foydalanishingiz mumkin piruvat, maltoza va aminokislotalar energiya manbalari sifatida.[2][3] Laboratoriya sharoitida, T. litoralis kamaytirilmagan stavkalarda o'sishi uchun aminokislotalar bilan ta'minlanishi kerak. U talab qilmaydigan yagona aminokislotalar qushqo'nmas, glutamin, alanin va glutamat. Ushbu aminokislotalar hayotiy ahamiyatga ega bo'lmasligi mumkin T. litoralis chunki asparagin va glutamin moyil deaminat gidrotermik teshiklar va alanin va glutamat atrofida joylashgan yuqori haroratlarda, odatda, boshqa gipertermofil arxa tomonidan ishlab chiqarilishi mumkin.[3] Uchun asosiy uglerod manbai T. litoralis hujayraga maltoza orqali kiritilishi mumkin bo'lgan maltoza kabi ko'rinadi.trehaloz ABC tashuvchisi. T. litoralis o'zgartirilgan deb nomlangan ixtisoslashgan glikolitik yo'lga ega Embden – Meyerhoff (EM) yo'l. O'zgartirilgan EM yo'lining bir usuli T. litoralis umumiy EM yo'lidan chetga chiqish, o'zgartirilgan versiyada ADP ga bog'liqligini o'z ichiga oladi geksoza kinaz va PFK fermentlarning ATP ga bog'liq versiyalari o'rniga.[4]
Roman turlari
DNKning yangi tahlili bir nechta izolyatsiyani ko'rsatdi T. litoralis, MW va Z-1614, bu ehtimol yangi shtammlardir. MW va Z-1614 shtammlari ekanligi tasdiqlandi T. litoralis orqali DNK-DNKni duragaylash, C – G nisbatlari (38-41 mol%) va immunoblotirovka tahlillari. Ular morfologiyasi jihatidan ilgari ajratib olinganlardan bir oz farq qiladi T. litoralis chunki ularning barchasida flagella mavjud.[2] Xuddi shu jarayonlar orqali ilgari kashf etilganligi ko'rsatildi Caldococcus litoralis aslida edi T. litoralis.[2] Uchun genom T. litoralis hali to'liq ketma-ketlik qilinmagan.
Adabiyotlar
- ^ Neuner A, Jannasch HW, Belkin S, Stetter KO (1990). "Thermococcus litoralis sp. Nov.: Nihoyatda termofil dengiz arxebakteriyalarining yangi turi". Mikrobiologiya arxivi. 153 (2): 205–207. doi:10.1007 / BF00247822. ISSN 0302-8933.
- ^ a b v d e f g h men Kostyukova AS, Gongadze GM, Polosina YY, Bonch-Osmolovskaya EA, Miroshnichenko ML, Chernyh NA, Obraztsova MV, Svetlichny VA, Messner P, Sleytr UB, L'Haridon S, Jeanthon C, Prieur D (noyabr 1999). "Thermococcales hujayra konvertlarining tuzilishi va antigenik imkoniyatlarini o'rganish va" Caldococcus litoralis "Z-1301 ning Thermococcus litoralis Z-1301 sifatida qayta tasnifi". Ekstremofillar. 3 (4): 239–45. doi:10.1007 / s007920050122. PMID 10591013.
- ^ a b v d e f Rinker KD, Kelly RM (1996 yil dekabr). "Gipertermofil arxeon termokokk litoralis o'sish fiziologiyasi: oltingugurtsiz aniqlangan muhitni yaratish, ekzopolisakkaridning xarakteristikasi va biofilm hosil bo'lishining dalillari". Amaliy va atrof-muhit mikrobiologiyasi. 62 (12): 4478–85. PMC 1389002. PMID 16535464.
- ^ a b Bertoldo S, Antranikian G (2006). "5-bob: Termokokklar tartibi". Dvorkin M, Falkov S, Rozenberg E, Shleyfer K, Stackebrandt E (tahr.). Prokaryotlar. Springer Nyu-York. pp.69 –81. doi:10.1007/0-387-30743-5_5. ISBN 978-0-387-25493-7.
- ^ Sinnes, Marianne (2006-08-16). "Organizmlarni dengizning chuqurligidan biologik qidirish: ilmiy va ekologik jihatlar". Toza texnologiyalar va atrof-muhit siyosati. 9 (1): 53–59. doi:10.1007 / s10098-006-0062-7. ISSN 1618-954X.
- ^ Kong H, Kucera RB, Jek BIZ (yanvar 1993). "Thermococcus litoralis gipertermofil arxeyasidan DNK-polimeraza xarakteristikasi. DNK-polimeraza, turg'un holat kinetikasi, issiqlik barqarorligi, ishlov berish qobiliyati, ipning siljishi va ekzonukleaza faoliyati". Biologik kimyo jurnali. 268 (3): 1965–75. PMID 8420970.
- ^ Mattila P, Korpela J, Tenkanen T, Pitkänen K (sentyabr 1991). "Thermococcus litoralis DNK polimerazasi bilan DNK sintezining sodiqligi - bu korrektor faolligi bilan juda issiqqa chidamli ferment". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 19 (18): 4967–73. doi:10.1093 / nar / 19.18.4967. PMC 328798. PMID 1923765.
Qo'shimcha o'qish
- Gardner AF, Kumar S, Perler FB (2012 yil may). "Thermococcus litoralis NS-C gipertermofil arxeon modelining genom ketma-ketligi". Bakteriologiya jurnali. 194 (9): 2375–6. doi:10.1128 / JB.00123-12. PMC 3347054. PMID 22493191.
- Rivas-Pardo JA, Herrera-Morande A, Kastro-Fernandez V, Fernandez FJ, Vega MC, Gixe V (20 iyun 2013). "Thermococcus litoralis dan gipertermofil ADPga bog'liq glyukokinazning kristalli tuzilishi, SAXS va kinetik mexanizmi kataliz uchun saqlanib qolgan mexanizmni ochib beradi". PLOS ONE. 8 (6): e66687. Bibcode:2013PLoSO ... 866687R. doi:10.1371 / journal.pone.0066687. PMC 3688580. PMID 23818958.