Tombusvirus 5, UTR - Tombusvirus 5′ UTR

Tombusvirus 5, UTR
RF00171.jpg
Bashorat qilingan ikkilamchi tuzilish va ketma-ketlikni saqlash Tombus_5
Identifikatorlar
BelgilarTombus_5
RfamRF00171
Boshqa ma'lumotlar
RNK turiCis-reg
Domen (lar)Viruslar
SOSO: 0000204
PDB tuzilmalarPDBe

Tombusvirus 5, UTR muhim ahamiyatga ega cis-tartibga soluvchi mintaqasi Tombus virusi genom.

Pomidor tupuradigan stunt virusi prototip a'zosi Tombusviridae oila. Ushbu virusning genomi ijobiy ma'no bitta zanjirli RNK. Replikatsiya salbiy RNK oralig'i orqali sodir bo'ladi. Virusli oqsillardan tashqari p33 va RNKga bog'liq bo'lgan RNK polimeraza p92 va noma'lum xost omillari, tarkibidagi konservalangan va tuzilish mintaqalari 5, tarjima qilinmagan mintaqa (5 ′ UTR) genom replikatsiyasini tartibga solish uchun muhimdir.

5 ′ UTR dagi 2 ta RNK domeni, 5 ′ T shaklidagi domen (TSD), so'ngra dastani halqasi (SL5) haqida xabar berilgan.[1][2] va quyi oqim domeni (DSD).[3] TSD-DSD o'zaro ta'sirlari virusli RNK replikatsiyasi vositachiligida ishtirok etishni taklif qiladi.[3]

Tombusvirusning qiziqarli xususiyati bu nuqsonli aralashuvchi (DI) RNKlarning replikatsiyasini qo'llab-quvvatlash qobiliyatidir. Ushbu sub-virusli replikonlar virusli genomning kichik, kodlamaydigan, o'chiruvchi mutantlari bo'lib, replikatsiya uchun zarur bo'lgan cis-ta'sir qiluvchi RNK elementlarini saqlaydi. [1]

Boshqalar kodlamaydigan RNK Tombusvirus tarkibiga quyidagilar kiradi 3, UTR mintaqasi IV[4] va an ichki replikatsiya elementi.[5]

Adabiyotlar

  1. ^ a b Vu B, Vanti JB, Oq KA (2001). "Pomidor buta stunt virusi genomining 5 g tarjima qilinmagan hududidagi RNK domeni virusli RNK replikatsiyasini modulyatsiya qiladi". J. Mol. Biol. 305 (4): 741–756. doi:10.1006 / jmbi.2000.4298. PMID  11162089.
  2. ^ Rey D, Na H, Oq KA (2004). "Pomidorning buta stunt virusi RNK replikatsiyasiga vositachilik qiladigan ko'p funktsiyali T shaklidagi RNK domenining strukturaviy xususiyatlari". J. Virol. 78 (19): 10490–10500. doi:10.1128 / JVI.78.19.10490-10500.2004. PMC  516415. PMID  15367615.
  3. ^ a b Rey D, Vu B, Oq KA (2003). "Pomidor bushy stunt virusi genomining 5 ′ UTR-dagi ikkinchi funktsional RNK domeni: ichki va domenlararo o'zaro ta'sir virusli RNK replikatsiyasida vositachilik qiladi". RNK. 9 (10): 1232–1245. doi:10.1261 / rna.5630203. PMC  1370487. PMID  13130137.
  4. ^ Fabian MR, Na H, Rey D, Oq KA (2003). "3′-terminalli RNK ikkilamchi tuzilmalari, pomidorning buta stunt virusi DI RNKlarini to'plashda muhim ahamiyatga ega". Virusologiya. 313 (2): 567–580. doi:10.1016 / S0042-6822 (03) 00349-0. PMID  12954222.
  5. ^ Monkevich, S; Lin XX; Fabian MR; Xu V; Na H; Rey D; Chernysheva OA; Nagy PD; Oq KA (2005). "P92 polimeraza kodlash hududida Tombusvirus genomini ko'paytirishning dastlabki bosqichida talab qilinadigan ichki RNK elementi mavjud". J Virol. 79 (8): 4848–4858. doi:10.1128 / JVI.79.8.4848-4858.2005. PMC  1069561. PMID  15795270.

Tashqi havolalar