UCSC Malaria Genome brauzeri - UCSC Malaria Genome Browser

UCSC Malaria Genome brauzeri ni o'rganish uchun bioinformatik tadqiqot vositasidir bezgak genom, Xyuz bakalavriat tadqiqot laboratoriyasi va professor Manuel Ares Jr laboratoriyasi bilan birgalikda Kaliforniya universiteti, Santa-Kruz.[1]

Veb-interfeys va ma'lumotlar bazasi tuzilishi UCSC-ga asoslangan Genom brauzeri.[2][3] UCSC Malaria Genome Browser to'liq ekranda to'planadi DNK ketma-ketliklari ning bir necha turlaridan iborat bezgak paraziti (Plazmodium sp.), eksperimental natijalar va adabiyotdan to'plangan ilgari topilgan genlar bilan bir qatorda. Dastur foydalanuvchilarga bezgak paraziti genomining 14 xromosomalarini qidirish, o'zlarining ketma-ketlik ma'lumotlari va yozuvlarini kiritish va turlar bo'yicha topilmalarni taqqoslash imkonini beradi. Bezgak genomining brauzeri, shuningdek, bezgak genomiga qiziqishning har qanday mintaqasiga tezkor, aniq kirishni ta'minlaydigan matn va ketma-ketlik bo'yicha qidiruvlarni qo'llab-quvvatlaydi. Ushbu saytda quyidagilar mavjud mos yozuvlar genomi uchun ketma-ketlik va ishchi loyihani yig'ish Plazmodium falciparum dan PlasmoDb,[4] The Plazmodium genom ma'lumotlar bazasini yaratish 5.0.

Adabiyotlar

  1. ^ Chakrabarti K .; Pearson, M; Panjara, L; Sterne-Vayler, T; Dekanlar, J; Donohue, JP; Ares Jr, M (2007). "Bezgak parazitlarida qiyosiy genomika va RNK tahlillari bilan aniqlangan ma'lum va noma'lum funktsiyalarning strukturaviy RNKlari". RNK. 13 (11): 923–39. doi:10.1261 / rna.751807. PMC  2040097. PMID  17901154.
  2. ^ Mangan, M .; Uilyams J.; Torna S .; Karolchik, D .; Torna, W. (2008). "UCSC genom brauzeri: molekulyar biotibbiyot tadqiqotlarini chuqur qo'llab-quvvatlash". Biotexnologiya yillik sharhi. 14: 63–108. doi:10.1016 / S1387-2656 (08) 00003-3. ISBN  9780444532268. PMID  18606360.
  3. ^ Kun R.; va boshq. (2009). "UCSC Genom brauzerining ma'lumotlar bazasi: 2009 yil yangilanishi". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 37 (Ma'lumotlar bazasi muammosi): D755-D761. doi:10.1093 / nar / gkn875. PMC  2686463. PMID  18996895.
  4. ^ "Plasmodium genom resursi". PlasmoDB.org. Olingan 2015-05-07.

Tashqi havolalar