USP8 - USP8

USP8

Protein USP8 PDB 1whb.png

Mavjud tuzilmalar

Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB

PDB id kodlari ro'yxati
1WHB, 2A9U, 2GFO, 2GWF, 3N3K

Identifikatorlar

USP8, HumORF8, SPG59, UBPY, ubikitinga xos peptidaza 8, PITA4

Tashqi identifikatorlar

OMIM: 603158 MGI: 1934029 HomoloGene: 3782 Generkartalar: USP8

Gen joylashuvi (odam)

Chr.	Xromosoma 15 (odam)^[1]

Band	15q21.2	Boshlang	50,424,380 bp^[1]
Band	15q21.2	Oxiri	50,514,421 bp^[1]

Gen joylashuvi (Sichqoncha)

Chr.	Xromosoma 2 (sichqoncha)^[2]

Band	2 \| 2 F1	Boshlang	126,707,328 bp^[2]
Band	2 \| 2 F1	Oxiri	126,759,297 bp^[2]

Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• sistein tipidagi peptidaza faolligi • SH3 domenini bog'lash • tiolga bog'liq bo'lgan ubiqitinga xos proteaz faolligi • peptidaza faolligi • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish • sistein tipidagi endopeptidaza faolligi • gidrolaza faolligi • kaderin bilan bog'lash
Uyali komponent	• sitoplazma • endosoma • membrana • hujayra membranasi • endosoma membranasining tashqi komponenti • o'rtamiyona • endosoma membranasi • plazma membranasining tashqi komponenti • hujayra yadrosi • GO: 0097483, GO: 0097481 postsinaptik zichlik • dendritik orqa miya • erta endosoma • sitozol • glutamaterjik sinaps
Biologik jarayon	• oqsil K48 bilan bog'liq deubikitinatsiya • ubikuitinga bog'liq oqsil katabolik jarayoni • mitotik sitokinez • endosoma tashkiloti • proteoliz • oqsil K63 bilan bog'liq deubikitinatsiya • hujayra aylanishi • uyali proliferatsiya • oqsil deubikvitinatsiyasi • deksametazon stimuliga uyali javob • asab o'sishi omilining stimuliga uyali javob • kanonik Wnt signalizatsiya yo'lini ijobiy tartibga solish • Ras oqsil signalini o'tkazish • protein barqarorligini tartibga solish • oqsillarni lokalizatsiyasini tartibga solish • postsinapsda oqsil katabolik jarayonini tartibga solish, sinaptik uzatishni modulyatsiya qilish
Manbalar:Amigo / QuickGO

Turlar

Inson

Sichqoncha


9101


84092


ENSG00000138592


ENSMUSG00000027363


P40818


Q80U87

RefSeq (mRNA)


NM_001128610 NM_001128611 NM_001283049 NM_005154


NM_001252580 NM_019729

RefSeq (oqsil)


NP_001122082 NP_001269978 NP_005145


NP_001239509 NP_062703

Joylashuv (UCSC)

Chr 15: 50.42 - 50.51 Mb

Chr 2: 126.71 - 126.76 Mb

PubMed qidirmoq

^[3]

^[4]

Insonni ko'rish / tahrirlash

Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Ubiquitin karboksil-terminali gidrolaza 8 bu ferment odamlarda kodlanganligi USP8 gen.^[5]^[6]^[7]

O'zaro aloqalar

USP8 ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan RNF41^[8] va STAM2.^[9]^[10]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000138592 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000027363 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Puente XS, Sanches LM, Umuman CM, Lopez-Otin C (2003 yil iyul). "Odam va sichqoncha proteazalari: qiyosiy genomik yondashuv". Nat Rev Genet. 4 (7): 544–58. doi:10.1038 / nrg1111. PMID 12838346.
^ Janssen JW, Schleithoff L, Bartram CR, Schulz AS (may 1998). "Fosfatidilinozitol 3-kinaz p85beta subbirligi va HUMORF8 ning onkogen sintez mahsuloti, taxminiy deubiqitinatsiya qiluvchi ferment". Onkogen. 16 (13): 1767–72. doi:10.1038 / sj.onc.1201695. PMID 9582025.
^ "Entrez Gen: USP8 hamma joyda o'ziga xos peptidaza 8".
^ Vu, Syuli; Yen Lily; Irvin Liza; Suini Kolin; Carraway Kermit L (2004 yil sentyabr). "E3 ubikuitin ligaz Nrdp1ni deubiqitinlovchi USP8 fermenti bilan barqarorlashtirish". Mol. Hujayra. Biol. 24 (17): 7748–57. doi:10.1128 / MCB.24.17.7748-7757.2004. ISSN 0270-7306. PMC 506982. PMID 15314180.
^ Kaneko, Tomonori; Kumasaka Takashi; Ganbe Tadashi; Sato Takao; Miyazava Keyji; Kitamura Naomi; Tanaka Nobuo (2003 yil noyabr). "PXXP bo'lmagan ligandning signal uzatuvchi adapter molekulasi-2 Src homology 3 domeniga oddiy bog'lanishiga tizimli tushuncha". J. Biol. Kimyoviy. 278 (48): 48162–8. doi:10.1074 / jbc.M306677200. ISSN 0021-9258. PMID 13129930.
^ Kato, M; Miyazava K; Kitamura N (dekabr 2000). "Deubikitinatsiya qiluvchi UBPY fermenti PR (V / I) (D / N) RXXKP yangi bog'lash motifi orqali Hrs-bog'lovchi oqsilning Src homologiyasi 3 domeni bilan o'zaro ta'sir qiladi". J. Biol. Kimyoviy. 275 (48): 37481–7. doi:10.1074 / jbc.M007251200. ISSN 0021-9258. PMID 10982817.

Qo'shimcha o'qish

D'Andrea A, Pellman D (1999). "Deubikvitatsion fermentlar: biologik regulyatorlarning yangi klassi". Krit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 33 (5): 337–52. doi:10.1080/10409239891204251. PMID 9827704.
Nomura N, Nagase T, Miyajima N va boshq. (1995). "Odamning noma'lum genlarini kodlash ketma-ketligini bashorat qilish. II. KG-1 hujayra chizig'idan cDNA klonlarini tahlil qilish natijasida chiqarilgan 40 ta yangi genning (KIAA0041-KIAA0080) kodlash ketma-ketliklari". DNK rez. 1 (5): 223–9. doi:10.1093 / dnares / 1.5.223. PMID 7584044.
Naviglio S, Mattecucci C, Matoskova B va boshq. (1998). "UBPY: o'sishni tartibga soluvchi ubikuitin izopeptidaza". EMBO J. 17 (12): 3241–50. doi:10.1093 / emboj / 17.12.3241. PMC 1170662. PMID 9628861.
Kato M, Miyazava K, Kitamura N (2001). "Deubikitinatsiya qiluvchi UBPY fermenti PR (V / I) (D / N) RXXKP yangi bog'lash motifi orqali Hrs-bog'lovchi oqsilning Src homologiyasi 3 domeni bilan o'zaro ta'sir qiladi". J. Biol. Kimyoviy. 275 (48): 37481–7. doi:10.1074 / jbc.M007251200. PMID 10982817.
Gnesutta N, Ceriani M, Innocenti M va boshq. (2001). "Ras guanin nukleotid almashinuvi omili CDC25 (Mm) / Ras-GRF1 bilan o'zaro ta'sir qiluvchi deubikitinatsiya qiluvchi ferment UBPy sichqonchasini klonlash va tavsifi" (PDF). J. Biol. Kimyoviy. 276 (42): 39448–54. doi:10.1074 / jbc.M103454200. PMID 11500497.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH va boshq. (2003). "15000 dan ortiq to'liq uzunlikdagi odam va sichqonchani cDNA sekanslarini yaratish va dastlabki tahlil qilish". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002 yil PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Kaneko T, Kumasaka T, Ganbe T va boshq. (2004). "PXXP bo'lmagan ligandning signal uzatuvchi adapter molekulasi-2 Src homology 3 domeniga oddiy bog'lanishiga tizimli tushuncha". J. Biol. Kimyoviy. 278 (48): 48162–8. doi:10.1074 / jbc.M306677200. PMID 13129930.
Soares L, Seroogy C, Skrenta H va boshq. (2004). "Otubain 1 ning ikkita izoformasi GR hujayrasi orqali T hujayra anergiyasini tartibga soladi". Nat. Immunol. 5 (1): 45–54. doi:10.1038 / ni1017. PMID 14661020.
Ota T, Suzuki Y, Nishikava T va boshq. (2004). "21,243 to'liq uzunlikdagi odam cDNA-larining to'liq ketma-ketligi va tavsifi". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Vu X, Yen L, Irvin L va boshq. (2004). "E3 ubikuitin ligaz Nrdp1ni deubiqitinlovchi USP8 fermenti bilan barqarorlashtirish". Mol. Hujayra. Biol. 24 (17): 7748–57. doi:10.1128 / MCB.24.17.7748-7757.2004. PMC 506982. PMID 15314180.
Berruti G, Martegani E (2005). "Deubiqitinatsiya qiluvchi mUBPy fermenti spermatozoidlarga xos molekulyar shaperon MSJ-1 bilan o'zaro ta'sir qiladi: sichqonning erkak jinsiy hujayralaridagi proteazom, akrosoma va sentrosoma bilan aloqasi". Biol. Reproduktsiya. 72 (1): 14–21. doi:10.1095 / biolreprod.104.030866. PMID 15342353.
Gerxard DS, Vagner L, Feingold EA va boshq. (2004). "NIH to'liq metrajli cDNA loyihasining holati, sifati va kengayishi: sutemizuvchilar genlari to'plami (MGC)". Genom Res. 14 (10B): 2121-7. doi:10.1101 / gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Benzinger A, Muster N, Koch HB va boshqalar. (2005). "14-3-3 sigmaning maqsadli proteomik tahlili, p53 effektori, odatda saraton kasalligida susayadi". Mol. Hujayra. Proteomika. 4 (6): 785–95. doi:10.1074 / mcp.M500021-MCP200. PMID 15778465.
Row PE, Old IA, McCullough J va boshq. (2006). "Ubikuitin izopeptidaza UBPY endosomal ubikuitin dinamikasini tartibga soladi va retseptorlarning pastga regulyatsiyasi uchun juda muhimdir". J. Biol. Kimyoviy. 281 (18): 12618–24. doi:10.1074 / jbc.M512615200. PMID 16520378.
Mizuno E, Kobayashi K, Yamamoto A va boshq. (2006). "Deubikitinatsiya qiluvchi ferment UBPY endosomalardagi oqsilni hamma joyda boshqarish darajasini tartibga soladi". Yo'l harakati. 7 (8): 1017–31. doi:10.1111 / j.1600-0854.2006.00452.x. PMID 16771824.
Avvakumov GV, Walker JR, Xue S va boshq. (2007). "Amino-terminal dimerizatsiyasi, NRDP1-rodanese o'zaro ta'siri va ubikitinga xos proteaz 8 (USP8) ning katalitik domen konformatsiyasini inhibe qilishi". J. Biol. Kimyoviy. 281 (49): 38061–70. doi:10.1074 / jbc.M606704200. PMID 17035239.

PDB galereyasi
1whb: Rodanzaga o'xshash domenning odamning ubikuitin o'ziga xos proteaz 8 (UBP8) tarkibidagi eritma tuzilishi 2a9u: Human Ubiquitin karboksil-terminali gidrolaza 8 (USP8) ning N-terminal domenining tuzilishi 2 gfo: Ubiquitin karboksil-terminali gidrolaza 8 ning katalitik domenining tuzilishi 2gwf: USP8-NRDP1 kompleksining tuzilishi

Bu oqsil bilan bog'liq maqola a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.