Ubiqitin bilan bog'laydigan domenlar - Ubiquitin-binding domains

Ubiquitin bilan bog'laydigan domenlar (UBD) modulli protein domenlari kovalent bo'lmagan holda taniydigan va bog'laydigan hamma joyda. Bugungi kunga kelib, 20 dan ortiq UBD oilalari aniqlandi va ularning aksariyati ubikuitin bilan faqat zaif (yuzlab mM oralig'ida) bog'langan.[1] Ko'pgina UBDlar kichik o'lchamlarga ega (<50 aminokislotalar) va turli xil burmalarni qabul qiladi. Ko'pgina UBD-lar alfa domenlari (masalan, UBA, CUE, UIM, MIU, VHS, GAT, UBAN), ba'zilari esa beta-domenlar (masalan, NZF, UBC, WD40 ) va boshqalar alfa / beta domenlari (masalan, UBZ, UEV, PFU). UBDlarning aksariyati ubikuitin bilan markazida joylashgan Ile44 (ya'ni "Ile44 patch") ustida joylashgan hidrofobik patch orqali bog'lanadi,[2] boshqa yuzalar bilan biriktirilishi kuzatilgan bo'lsa ham (masalan, "Ile36 patch"[3]). Bugungi kunga qadar tavsiflangan UBDlarning aksariyati monoubikvitin bilan bog'langan va shu bilan bog'lanish afzalligini ko'rsatmaydi har xil bog'langan ubikuitin zanjirlari. Biroq, bir nechta ma'lum, bog'lanish uchun xos bo'lgan UBDlar mavjud bo'lib, ular sakkizta hamma joyda mavjud bo'lgan bog'lanishlarni ajratib turishi mumkin. Bu juda muhimdir, chunki turli xil bog'lanish turlari turli molekulyar jarayonlar uchun signal beradi va bu zanjirlarning bog'lanishiga xos tan olinishi mos keladigan uyali javobni ta'minlaydi.

Adabiyotlar

  1. ^ Dikic I, Vakatsuki S, Uolters KJ (2009). "Ubiqitin bilan bog'laydigan domenlar - tuzilmalardan funktsiyalargacha". Nat Rev Mol Hujayra Biol. 10 (10): 659–671. doi:10.1038 / nrm2767. PMC  7359374. PMID  19773779.
  2. ^ Ohno A va boshq. (2005). "Ubiquitin bilan kompleksdagi UBA domenining Dsk2p tarkibi: Ubiquitinni tanib olish uchun molekulyar determantlar". Tuzilishi. 13 (4): 521–532. doi:10.1016 / j.str.2005.01.011. PMID  15837191.
  3. ^ Reyes-Turcu FE va boshqalar. (2006). "ZnF UBP ubiqitini majburiy domeni, qo'llanilmagan ubiqitinning C-terminalli diglisin motifini taniydi". Hujayra. 124 (6): 1197–1208. doi:10.1016 / j.cell.2006.02.038. PMID  16564012. S2CID  1312137.

Qo'shimcha o'qish