Viperin - Viperin

RSAD2
Viperin-CTP-SAH.png
Identifikatorlar
TaxalluslarRSAD2, 2510004L01Rik, cig33, cig5, vig1, tarkibida 2 bo'lgan radikal S-adenosil metionin domeni
Tashqi identifikatorlarOMIM: 607810 MGI: 1929628 HomoloGene: 10969 Generkartalar: RSAD2
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 2 (odam)
Chr.Xromosoma 2 (odam)[1]
Xromosoma 2 (odam)
RSAD2 uchun genomik joylashuv
RSAD2 uchun genomik joylashuv
Band2p25.2Boshlang6,865,806 bp[1]
Oxiri6,898,239 bp[1]
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez

91543

58185

Ansambl

ENSG00000134321

ENSMUSG00000020641

UniProt

Q8WXG1

Q8CBB9

RefSeq (mRNA)

NM_080657

NM_021384

RefSeq (oqsil)

NP_542388

NP_067359

Joylashuv (UCSC)Chr 2: 6.87 - 6.9 MbChr 12: 26.44 - 26.46 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Virus mennhibitory protein, endoplazmatik retika bilan bog'liq, mennterferonni keltirib chiqaradigan (Viperin), shuningdek, nomi bilan tanilgan RSAD2 (rodil SAM dOmin tarkibidagi 2), a oqsil bu RSAD2 tomonidan kodlangan gen. Viperin - bu virusli jarayonlarda ko'p funktsiyali oqsil interferon stimulyatsiya qilingan gen.[5] Viperinni IFNga bog'liq yoki IFNga bog'liq bo'lmagan yo'llar orqali qo'zg'atishi mumkinligi va ba'zi viruslar yuqumliligini oshirish uchun viperindan foydalanishlari mumkinligi haqida xabar berilgan.[6][7]

Funktsiya

Viperin - bu interferon bilan stimulyatsiya qilingan gen uning ifodasi ko'pchilikni inhibe qiladi DNK va RNK viruslari shu jumladan CHIKV, HCMV, HCV, DENV, WNV, SINV, gripp va OIV.[6] Dastlab an IFN-γ antiviral oqsil in inson sitomegalovirusi (HCMV) yuqtirgan makrofaglar, viperinning HCMV tomonidan qo'zg'atilishi mumkinligi haqida xabar berilgan glikoprotein B in fibroblastlar, ammo HCMV virusli infektsiyasini inhibe qiladi va pastga tartibga soladi virusli strukturaviy oqsillar. Virus oqsilining viperinni o'ziga qarshi qo'zg'atishi sababi hali ham aniq emas; ammo viperinning virusli qayta taqsimlanishi virusning antiviral ta'siridan qochish mexanizmini aks ettirishi mumkin.[8] Viperin, shuningdek, induktsiya qilinishi va HCMV virusli oqsillari bilan o'zaro ta'sir qilishi va boshqa joyga ko'chishi mumkin mitoxondriya HCMV virusli infektsiyalangan hujayralarida hujayra metabolizmini buzish orqali virusli infektsiyani kuchaytiradi.[9]

Viperin bu ishlab chiqarishga qodir radikal SAM fermentidir zanjir terminatori ddhCTP (3-deoksi-3 ′, 4 didehidro-CTP), bu virusli RNKga bog'liq bo'lgan RNK polimeraza (RdRp) ni inhibe qiladi.[10] Viperin faolligi aminokislotalarning metabolizmini va mitoxondriyal nafas olishni bekor qilgandek ko'rinadi.[11]

Ning oldini olishda gripp virusi tomurcuklanma va bo'shatish, viperinni buzish tavsiya etiladi lipidli raftlar hujayraning plazma membranasida, tarkibidagi muhim ferment bo'lgan farnesil difosfat sintaz (FPPS) ning ferment faolligini pasaytiradi. izoprenoid biosintez yo'li.[12] Viperinning HCV virusli replikatsiyasini xVAP-33 xost oqsili bilan o'zaro ta'siri orqali inhibe qilish taklif qilingan. NS5A va replikatsiya kompleksining shakllanishini buzish.[13]

Tuzilishi

Inson viperini bitta polipeptid 361 dan aminokislotalar taxmin qilingan molekulyar og'irligi 42 kDa bilan. The N-terminal Viperinning 42 ta aminokislotasi amfipatik alfa-spiral, bu turli xil turlarda nisbatan kamroq saqlanib qolgan va viperinning antiviral faolligiga ozgina ta'sir qiladi. The N-terminal domeni Viperinning ER va lipid tomchilariga joylashishi uchun talab qilinadi.[14] Viperinning 77-209 aminokislotalari radikalni tashkil qiladi S-adenosil metionin (SAM) to'rtta saqlangan motiflarni o'z ichiga olgan domen. Motif 1 uchta saqlangan sistein qoldiqlari, bo'lgan CxxCxxC Fe-S majburiy motif va antiviral faoliyat uchun juda muhimdir.[9] The C-terminali Viperinning 218-361 aminokislotalari har xil turlarda yuqori darajada saqlanib qoladi va viperinning dimerizatsiyasi uchun zarurdir. C-terminal dumi HCVga qarshi antiviral faollik uchun juda muhimdir, chunki viperin bilan belgilangan C-terminal bayrog'i virusga qarshi faolligini yo'qotdi.[15]

Viperin bog'langanida SAM va Tsitidin trifosfat (CTP) yoki uridin trifosfat (UTP) substrat sifatida ishlatiladi, turli kinetik parametrlarga erishiladi.[16] CTP substratining pastligi sababli viperin bilan juda qattiq bog'lanishi taxmin qilinmoqda Km substratning qiymati. Shu bilan birga, UTP va CTP bilan bog'langan birikmalarning umumiy tuzilishi o'xshashdir. Farqi shundaki urasil qism keyin unchalik samarasiz sitozin A va B burilishlarini bog'lash va buyurtma qilishda qism. Nukleotid - bepul viperin tarkibida (gha)6 qisman bochka va tartibsiz N-terminal kengaytmasi va qisman buyurtma qilingan C-terminal kengaytmasi mavjud.[17] C-terminal dumiga buyurtma berilganda, oltita qoldiq a-spiral, sakkiz qoldiq P-tsikli (CTP ning f-fosfatini bog'laydigan) va 310- spiral aniqlandi.

Uyali lokalizatsiya

Viperin odatda uchun lokalize qilingan endoplazmatik to'r (ER) o'zining N-terminal domeni orqali, shuningdek mahalliylashtirilgan lipid tomchisi, ular ER dan olingan.[14] Biroq, u ham topilgan mitoxondriya yuqtirilgan HCMVda fibroblastlar.[9]

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000134321 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000020641 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ Seo JY, Yaneva R, Cresswell P (dekabr 2011). "Viperin: virusning ko'payishini tartibga soluvchi ko'p funktsiyali, interferonni keltirib chiqaradigan oqsil". Cell Host & Microbe. 10 (6): 534–9. doi:10.1016 / j.chom.2011.11.004. PMC  3246677. PMID  22177558.
  6. ^ a b Mattijssen S, Pruijn GJ (may 2012). "Viperin, virusga qarshi javobning asosiy ishtirokchisi". Mikroblar va infektsiya. 14 (5): 419–26. doi:10.1016 / j.micinf.2011.11.015. PMID  22182524.
  7. ^ Helbig KJ, Soqol MR (mart 2014). "Viperinning tug'ma antiviral javobda roli". Molekulyar biologiya jurnali. Virusga qarshi tug'ma immunitet (II qism). 426 (6): 1210–9. doi:10.1016 / j.jmb.2013.10.019. PMID  24157441.
  8. ^ Chin KC, Cresswell P (2001 yil dekabr). "Viperin (cig5), to'g'ridan-to'g'ri inson sitomegalovirusi tomonidan chaqirilgan IFN-antiviral oqsil". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 98 (26): 15125–30. Bibcode:2001 yil PNAS ... 9815125C. doi:10.1073 / pnas.011593298. PMC  64994. PMID  11752458.
  9. ^ a b v Seo JY, Yaneva R, Hinson ER, Cresswell P (may 2011). "Inson sitomegalovirusi infektsiyani kuchaytirish uchun to'g'ridan-to'g'ri antiviral viperin oqsilini chaqiradi". Ilm-fan. 332 (6033): 1093–7. Bibcode:2011 yil ... 332.1093S. doi:10.1126 / science.1202007. PMID  21527675. S2CID  22293459.
  10. ^ Gizzi AS, Grove TL, Arnold JJ, Xose J, Jangra RK, Garforth SJ va boshq. (Iyun 2018). "Inson genomi tomonidan kodlangan tabiiy ravishda paydo bo'lgan antiviral ribonukleotid". Tabiat. Springer Science and Business Media MChJ. 558 (7711): 610–614. doi:10.1038 / s41586-018-0238-4. PMC  6026066. PMID  29925952.
  11. ^ Honarmand Ebrahimi K, Vowles J, Browne C, McCullagh J, Jeyms WS (mart 2020). "+ - metabolizmni modulyatsiya qilish uchun fermentlarning bog'liqligi". FEBS xatlari. n / a (n / a): 1631–1644. doi:10.1002/1873-3468.13778. PMID  32232843.
  12. ^ Vang X, Xinson ER, Kressvel P (Avgust 2007). "Viperin interferonni keltirib chiqaradigan protein lipidli raftorlarni bezovta qilish orqali gripp virusi tarqalishini inhibe qiladi". Cell Host & Microbe. 2 (2): 96–105. doi:10.1016 / j.chom.2007.06.009. PMID  18005724.
  13. ^ Helbig KJ, Eyre NS, Yip E, Narayana S, Li K, Fiches G va boshq. (2011 yil noyabr). "Antiviral oqsil viperin 5A tarkibiy bo'lmagan oqsil bilan o'zaro ta'sirlashish orqali gepatit C virusi replikatsiyasini inhibe qiladi". Gepatologiya. 54 (5): 1506–17. doi:10.1002 / hep.24542. PMC  3207276. PMID  22045669.
  14. ^ a b Hinson ER, Cresswell P (dekabr 2009). "Antiviral oqsil, viperin, lipid tomchilariga lokalizatsiya qilinadi, uning N-terminalli amfipatik alfa-spirali". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 106 (48): 20452–7. Bibcode:2009PNAS..10620452H. doi:10.1073 / pnas.0911679106. PMC  2778571. PMID  19920176.
  15. ^ Jiang D, Guo H, Xu C, Chang J, Gu B, Vang L va boshq. (2008 yil fevral). "Gepatit C virusi replikatsiyasini inhibe qiladigan uchta interferonni keltirib chiqaradigan hujayra fermentlarini aniqlash". Virusologiya jurnali. 82 (4): 1665–78. doi:10.1128 / JVI.02113-07. PMC  2258705. PMID  18077728.
  16. ^ Fenvik MK, Su D, Dong M, Lin X, Ealik SE (fevral 2020). "Viperin substratining selektivligining strukturaviy asoslari". Biokimyo. Amerika Kimyo Jamiyati (ACS). 59 (5): 652–662. doi:10.1021 / acs.biochem.9b00741. PMID  31917549.
  17. ^ Fenvik MK, Li Y, Kressvel P, Modis Y, Ealik SE (iyun 2017). "Antipirusli radikal SAM fermenti bo'lgan viperinni tarkibiy tadqiqoti". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. Milliy fanlar akademiyasi materiallari. 114 (26): 6806–6811. doi:10.1073 / pnas.1705402114. PMC  5495270. PMID  28607080.

Tashqi havolalar

  • Da mavjud bo'lgan barcha tarkibiy ma'lumotlarga umumiy nuqtai PDB uchun UniProt: Q8CBB9 (Sichqoncha Radikal S-adenosil metionin domeni o'z ichiga olgan oqsil 2) da PDBe-KB.
  • Bernxaym, A., Millman, A., Ofir, G. va boshq. Prokaryotik viperinlar turli xil antiviral molekulalarni ishlab chiqaradi. Tabiat (2020 yil, 16-sentyabr) https: doi.org/10.1038/s41586-020-2762-2